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      應(yīng)用多肽芯片研究非小細(xì)胞肺癌患者血清中的EGFR自身抗體

      2010-09-03 02:04:48李元岳文濤王玥張麗娜顧勐許紹發(fā)
      中國(guó)肺癌雜志 2010年7期
      關(guān)鍵詞:表位多肽結(jié)構(gòu)域

      李元 岳文濤 王玥 張麗娜 顧勐 許紹發(fā)

      肺癌是全球范圍內(nèi)最常見(jiàn)和最致命的惡性腫瘤之一,對(duì)人類的生命和健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅。研究[1]顯示臨床上無(wú)法發(fā)現(xiàn)的早期腫瘤即可以出現(xiàn)血清中自身抗體陽(yáng)性,因而血清自身抗體有望作為肺癌早期診斷的分子標(biāo)志。目前常用ELISA方法進(jìn)行血清自身抗體檢測(cè),但是傳統(tǒng)的ELISA方法使用蛋白作為抗原,只能檢測(cè)到血清中有無(wú)自生抗體而并不能確定抗體所識(shí)別的抗原表位,因而臨床應(yīng)用意義有限,而目前抗原表為已被廣泛地應(yīng)用于疾病診斷、預(yù)后評(píng)價(jià)和疫苗的研發(fā)[2-4]。多肽芯片是近年發(fā)展起來(lái)的一種新技術(shù),所謂多肽芯片就是將蛋白質(zhì)分解成肽段合成到纖維素膜上組成密集的點(diǎn)陣,與傳統(tǒng)的ELISA方法相比,多肽芯片不僅能檢測(cè)到血清中的自身抗體,而且能夠確定自身抗體所識(shí)別的抗原表位,為進(jìn)一步研究自身抗體的功能提供線索,因此多肽芯片已被廣泛地應(yīng)用于抗體研究[5-7]。本研究利用多肽芯片檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌者血清中表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor, EGFR)的自身抗體,并確定其識(shí)別的抗原表位,為進(jìn)一步研究EGFR自身抗體與肺癌的早期診斷和預(yù)后之間的關(guān)系提供線索。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 血清 肺癌患者血清共20例,其中腺癌和鱗癌各10例,所有肺癌患者均經(jīng)術(shù)后病理明確診斷,同時(shí)取10例健康人血清作為正常對(duì)照,所有上述血清均取自北京胸科醫(yī)院細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室標(biāo)本庫(kù)2008年2月-2009年2月收集的標(biāo)本。

      1.1.2 試劑 Fmoc-基團(tuán)保護(hù)的20種天然氨基酸干粉(德國(guó),Intavis公司),1-甲基-2-吡咯烷酮(1-methyl-2-pyrrolidone,NMP,Sigma公司),溴酚藍(lán)(Bromphenol blue,BPB,Sigma公司),1-羥基苯并三唑(Hydroxybenzotriazole,HOBt,上海吉爾生化),二異丙基碳二亞胺(Diisopropyl carbodiimide,DIC,Sigma公司),二甲基甲酰胺(Dimethylformamide,DMF,Sigma公司),乙酸酐(Acetic anhydride,國(guó)藥集團(tuán)),哌啶(Piperidine,國(guó)藥集團(tuán)),乙醇(Ethanol,Sigma公司),三氟乙酸(Trifluoroacetic acid,TFA,Sigma公司),三異丙基硅烷(Triisopropylsilane,Sigma公司),二氯甲烷(Dichlormethane,DCM,Sigma公司)。

      1.1.3 儀器 多肽芯片合成儀ASP SL(德國(guó),Intavis公司)

      1.2 方法

      1.2.1 EGFR蛋白胞外段肽庫(kù)合成 此肽庫(kù)共包括204個(gè)肽段,每個(gè)肽段的長(zhǎng)度為12個(gè)氨基酸(aa),相鄰兩個(gè)肽段之間重疊9個(gè)氨基酸,使用Fmoc-保護(hù)的20種氨基酸,按照Intavis公司ASP SL多肽芯片合成儀說(shuō)明書進(jìn)行多肽合成,將該204個(gè)肽段按6行×34列的順序合成到纖維素膜上,即構(gòu)成了多肽芯片。

      1.2.2 多肽芯片質(zhì)量控制 多肽芯片合成過(guò)程中,每完成一個(gè)循環(huán)均用乙酸酐進(jìn)行Caping,封閉未反應(yīng)的NH2-基團(tuán);同時(shí)用哌啶Deprotecting脫去Fmoc-保護(hù)基團(tuán),使被保護(hù)的NH2-基團(tuán)暴露,以便進(jìn)行下一個(gè)循環(huán);哌啶Deprotecting之后,用染色劑溴酚藍(lán)(BPB)進(jìn)行染色,以確定未反應(yīng)的NH2-基團(tuán)已被封閉同時(shí)被保護(hù)的NH2-基團(tuán)已經(jīng)游離,以便進(jìn)行下一個(gè)循環(huán)。如此完成12個(gè)循環(huán)。待芯片合成結(jié)束后進(jìn)行紫外照相,進(jìn)一步觀察芯片合成質(zhì)量。

      1.2.3 混合血清中EGFR自身抗體的檢測(cè) 使用EGFR多肽芯片分別檢測(cè)8例肺癌患者混合血清和10例健康對(duì)照者混合血清,以確定EGFR自身抗體在肺癌患者血清中是否存在。步驟如下:首先將膜水化(100% ETOH×10 min→75%ETOH×10 min→50% ETOH×10 min→PBS×30 min),用含有0.2% Tween-20和5%脫脂牛奶的PBST溶液室溫封閉3 h,按照1:1 000的比例稀釋混合血清與多肽芯片共同孵育,4oC孵育過(guò)夜,PBST洗膜20 min×4次,抗人HRP-標(biāo)記山羊抗人IgG(1:10 000稀釋)室溫孵育2 h,最后用PBST洗膜15 min×3次,PBS洗膜15 min×3次,ECL(普利萊公司)化學(xué)發(fā)光檢測(cè)。

      1.2.4 檢測(cè)EGFR自身抗體識(shí)別的抗原表位 使用EGFR多肽芯片分別檢測(cè)20例肺癌患者血清,以確定EGFR自身抗體在多肽芯片上所識(shí)別的特異性位點(diǎn)即抗原表位。步驟同混合血清檢測(cè)。

      1.3 數(shù)據(jù)分析 用Excel進(jìn)行數(shù)據(jù)整理。高頻位點(diǎn)的確定,以頻率(F)>2×中位數(shù)(Md)為判斷依據(jù)。

      2 結(jié)果

      2.1 質(zhì)量控制 在合成過(guò)程中,每一個(gè)循環(huán)去保護(hù)后經(jīng)溴酚藍(lán)染色發(fā)現(xiàn):芯片背景無(wú)著色;芯片上的點(diǎn)著色均勻、無(wú)重疊,質(zhì)量良好。芯片合成后紫外照相,結(jié)果如圖1所示,共204各點(diǎn),以6行×34列的方式排列,單點(diǎn)圓形無(wú)缺失,點(diǎn)和點(diǎn)之間無(wú)重疊,符合實(shí)驗(yàn)要求。

      2.2 混合血清檢測(cè)結(jié)果 芯片檢測(cè)結(jié)果顯示在肺癌患者混合血清中存在EGFR自身抗體,而在健康對(duì)照者混合血清中不存在EGFR自生抗體。如圖2A所示黑色位點(diǎn)即為肺癌患者混合血清中EGFR自生抗體所識(shí)別的抗原表位即陽(yáng)性位點(diǎn);而在健康對(duì)照者混合血清中則無(wú)陽(yáng)性位點(diǎn)存在如圖2B所示。

      2.3 EGFR自身抗體識(shí)別的抗原表位 使用EGFR多肽芯片檢測(cè)20例肺癌患者血清,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有6例陽(yáng)性,陽(yáng)性率30%,其中4例腺癌,2例鱗癌。將該6例陽(yáng)性患者血清中EGFR自身抗體所識(shí)別的抗原表位作成頻率分布圖,如圖3所示,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有9個(gè)高頻位點(diǎn)存在,該9個(gè)高頻位點(diǎn)的頻率(F)>2×中位數(shù)(Md=16.66%)。其中A9、D4、D10、D13、E29的頻率為33.33%;D14、E28的頻率為50%;E9、E27的頻率為66.67%。9個(gè)高頻位點(diǎn)在EGFR蛋白胞外段的位置分布如圖4所示,高頻位點(diǎn)主要集中在EGFR蛋白胞外段的第III和第IV結(jié)構(gòu)域,此外第I結(jié)構(gòu)域也有1個(gè)高頻位點(diǎn)出現(xiàn)。位于第III結(jié)構(gòu)域的高頻位點(diǎn)為D4、D10、D13、D14、E9;位于第IV結(jié)構(gòu)域的高頻位點(diǎn)為E27、E28、E29;位于第I結(jié)構(gòu)域的高頻位點(diǎn)為A9。高頻位點(diǎn)所對(duì)應(yīng)的多肽序列即相應(yīng)的抗原表位見(jiàn)表1。

      3 討論

      非小細(xì)胞肺癌患者約占肺癌患者總數(shù)的80%,絕大部分患者在就診時(shí)已處于晚期,因而發(fā)展新的非小細(xì)胞肺癌早期診斷方法便成為解決這一問(wèn)題的關(guān)鍵。研究[8]顯示臨床上無(wú)法發(fā)現(xiàn)的早期腫瘤即可以出現(xiàn)血清中自身抗體陽(yáng)性,因而血清自身抗體有望作為肺癌早期診斷的分子標(biāo)志。

      圖 1 EGFR多肽芯片合成后紫外照相結(jié)果。Fig 1 UV photogram after peptide-array of EGFR synthesized.The library consists of 12 amino acids long peptides with 9 amino acids overlapping with the adjacent peptides immmobilised on a cellulose membrane. Letters on left-side hand of the array indicate rows. Numbers on the upper side of the array indicate columns.

      圖 2 混合血清檢測(cè)結(jié)果。A:8例肺癌混合血清檢測(cè)結(jié)果,圖中黑色位點(diǎn)即為陽(yáng)性位點(diǎn);B:10例健康人混合血清檢測(cè)結(jié)果,無(wú)陽(yáng)性位點(diǎn)。Fig 2 The result of mixed serums which is tested by peptide-array. A: The result of mixed serums of 8 NSCLC patients which is tested by peptidearray; B: The result of mixed serums of 10 nomral subjects which is tested by peptide array.

      圖 3 陽(yáng)性位點(diǎn)頻率分布圖。將多肽芯片上的204個(gè)點(diǎn)作為橫坐標(biāo),將這些位點(diǎn)在6例陽(yáng)性患者中出現(xiàn)的頻率作為縱坐標(biāo)。若一位點(diǎn)若在6例陽(yáng)性患者中均出現(xiàn)則頻率為100%,一位點(diǎn)若在6例陽(yáng)性患者中均不出現(xiàn)則頻率為0.00%。Fig 3 Frequency distribution of positive spots. Abscissa is the 204 sites in peptide array, Ordinate is the frequencies of the 204 sites in the 6 positive patients. One site is positive in all 6 patients, its frequency is 100%; One site is negative in all 6 patients, its frequency is 0.00%.

      圖 4 高頻位點(diǎn)在EGFR胞外區(qū)位置分布圖。EGFR胞外區(qū)共包括621個(gè)氨基酸,分成I、II、III、IV 4個(gè)結(jié)構(gòu)域。 代表的頻率為33.33%, 代表的頻率為50%, 代表的頻率為66.67%。Fig 4 Distribution of high frequency spots in the extracellular domain of EGFR. The extracellular domain of EGFR consists of 621 amino acids and includes Ⅰ, Ⅱ, Ⅲ, Ⅳ structural domains. The frequency of is 33.33%,The frequency of is 50%, The frequency of is 66.67%.

      表 1 EGFR自身抗體識(shí)別的高頻位點(diǎn)及其對(duì)應(yīng)的多肽序列Fig 1 The high frequency spots and the sequence of these spots

      EGFR在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和侵襲中發(fā)揮了重要作用,研究[9]表明多種人類腫瘤的發(fā)生與人體EGFR的過(guò)度表達(dá)有關(guān),Nakamura等[10]進(jìn)行了大量的回顧性分析發(fā)現(xiàn)在39%的肺腺癌和58%的肺鱗癌中存在EGFR的過(guò)度表達(dá),過(guò)度表達(dá)的EGFR為腫瘤的生長(zhǎng)提供了生存信號(hào)使腫瘤避免凋亡。1996年,Glushkov等[11]發(fā)現(xiàn)在肺癌病人血清中存在EGFR自身抗體;隨后Bei等[12]的研究顯示不僅在肺癌病人血清中存在EGFR自身抗體,在乳腺癌、胃癌、前列腺癌病人血清中也存在著EGFR自身抗體,這些研究表明EGFR自身抗體存在于多種腫瘤中。然而上述研究只是簡(jiǎn)單地檢測(cè)了EGFR自身抗體的有無(wú),并未對(duì)EGFR自身抗體所識(shí)別的抗原表位進(jìn)行研究,因而其對(duì)基礎(chǔ)科研和臨床應(yīng)用的意義有限。

      本研究使用EGFR多肽芯片對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者血清中的EGFR自身抗體進(jìn)行研究,不僅能檢測(cè) EGFR自身抗體是否存在,同時(shí)還能確定EGFR自身抗體所識(shí)別的抗原表位,為進(jìn)一步研究EGFR自身抗體的功能提供了新的依據(jù)。混合血清檢測(cè)結(jié)果顯示在肺癌患者血清中存在EGFR自身抗體,而在健康對(duì)照者血清中不存在EGFR自身抗體,這與Bei等[8]使用Western方法得到的結(jié)果相同,這說(shuō)明多肽芯片這一方法可以用于非小細(xì)胞肺癌患者血清中EGFR自身抗體的檢測(cè),同時(shí)也提示EGFR自身抗體有望作為非小細(xì)胞肺癌的標(biāo)志物用于肺癌的早期診斷。

      EGFR多肽芯片無(wú)論是在檢測(cè)肺癌患者混合血清還是檢測(cè)肺癌患者單個(gè)血清時(shí),均發(fā)現(xiàn)了EGFR自身抗體所識(shí)別的抗原表位,目前關(guān)于EGFR自身抗體研究的報(bào)道很少,而關(guān)于EGFR自身抗體所識(shí)別抗原表位的研究這應(yīng)該還是第一次,因而EGFR自身抗體所識(shí)別的抗原表位的發(fā)現(xiàn)將對(duì)后續(xù)的研究提供新的線索。

      單個(gè)血清檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)在20例非小細(xì)胞肺癌患者中有6例陽(yáng)性,EGFR自身抗體在這6例陽(yáng)性患者中所識(shí)別的抗原表位不完全相同,但是也有一些抗原表位被這些陽(yáng)性患者同時(shí)識(shí)別,因而便產(chǎn)生了一些高頻位點(diǎn)。這9個(gè)高頻位點(diǎn)在6例陽(yáng)性肺癌患者中出現(xiàn)的頻率為33.33%-66.67%,高頻位點(diǎn)的存在提示在EGFR蛋白胞外區(qū)存在著一些重要的功能位點(diǎn),阻斷這些功能位點(diǎn)就有可能影響EGFR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的功能。通過(guò)做高頻位點(diǎn)結(jié)構(gòu)分布圖發(fā)現(xiàn)這些高頻位點(diǎn)主要集中在EGFR蛋白胞外段的第III和第IV結(jié)構(gòu)域,此外第I結(jié)構(gòu)域也存在1個(gè)高頻位點(diǎn)。晶體結(jié)構(gòu)研究[13,14]發(fā)現(xiàn)EGFR與其配體的結(jié)合部位主要由EGFR胞外區(qū)的第I和III結(jié)構(gòu)域組成;第IV結(jié)構(gòu)域主要調(diào)節(jié)第II結(jié)構(gòu)域的功能,而第II結(jié)構(gòu)域?yàn)镋GFR胞外段的二聚化臂。高頻位點(diǎn)集中在這些結(jié)構(gòu)域,可能是通過(guò)影響這些區(qū)域的功能,而進(jìn)一步影響EGFR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的功能。高頻位點(diǎn)和高頻位點(diǎn)集中分布這兩個(gè)現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn),為我們進(jìn)一步研究EGFR和EGFR自身抗體的功能提供了新的線索。

      綜上所述,本研究利用多肽芯片檢測(cè)到了肺癌患者血清中存在EGFR自身抗體,同時(shí)發(fā)現(xiàn)了EGFR自身抗體識(shí)別的高頻位點(diǎn)和高頻位點(diǎn)的集中分布,為進(jìn)一步研究EGFR自身抗體的作用機(jī)制提供了理論基礎(chǔ),同時(shí)也為疫苗的研發(fā)指明了方向,隨著研究的不斷深入EGFR自身抗體將對(duì)肺癌的診斷、治療和預(yù)后評(píng)價(jià)提供更大的幫助。

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