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      PCR方法特異性鑒定獅源性制品

      2010-11-18 06:29:18徐君怡曹際娟
      中國動(dòng)物檢疫 2010年7期
      關(guān)鍵詞:骨粉特異性引物

      徐君怡,曹際娟,于 珂,徐 楊

      (遼寧出入境檢驗(yàn)檢疫局,遼寧大連 116015)

      地球上目前存在的食肉動(dòng)物大概有11個(gè)科,而最有特點(diǎn)并最重要的就是貓科動(dòng)物。獅,俗稱獅子,就是一種生存在非洲和亞洲的大型貓科動(dòng)物。獅屬于哺乳綱(Mammalia),食肉目(Carnivora),貓科(Felidae),豹屬(Panthera),獅種(P.leo)。獅種中約有13~14個(gè)亞種,其中,歐洲獅、巴巴里獅、斑點(diǎn)獅、開普獅、喀啦哈里獅等五個(gè)亞種已經(jīng)在地球上絕跡,剩下的大部份亞種都生活在薩哈拉沙漠南的非洲[1]。

      為了野生動(dòng)物貿(mào)易能夠持續(xù)發(fā)展,各國制定了相應(yīng)的野生動(dòng)物保護(hù)法規(guī),禁止瀕危動(dòng)物的捕殺和貿(mào)易。對一些受到絕滅威脅的物種限制其貿(mào)易量,以防止因狩獵和貿(mào)易對野生動(dòng)物生存和持續(xù)利用造成威脅。國際上于1975年簽署了《瀕危野生動(dòng)植物種國際貿(mào)易公約(CITES)》,我國于1981年加入該公約。盡管公約的成員國已達(dá)160個(gè),野生動(dòng)物非法狩獵和野生動(dòng)物走私活動(dòng)在世界各地仍非常猖獗,繼續(xù)威脅著野生動(dòng)物的生存。一些對獅虎豹皮和器官或制品有傳統(tǒng)需求的民族通過新近的發(fā)展獲得了新的經(jīng)濟(jì)水平,使得他們有足夠的財(cái)力來獲得摯愛的皮革、器官及其制品,這種需求極大地刺激了貓科動(dòng)物的非法貿(mào)易,而國際間監(jiān)管、執(zhí)法艱難讓保護(hù)力量顯得過于蒼白。

      在野生動(dòng)物取證過程中,有些情況下其產(chǎn)品經(jīng)加工處理后失去了可辨認(rèn)的形態(tài)特征,使獅產(chǎn)品的鑒定工作十分困難。為了更有效地加強(qiáng)獅的保護(hù)工作,建立一種可以對獅DNA進(jìn)行特異性檢測的準(zhǔn)確性高、實(shí)用性強(qiáng)的方法,從分子水平對可疑來自于獅的樣品(例如食品、藥品、皮毛等)進(jìn)行特異性檢測鑒定,都是十分急需和必要的。有關(guān)獅DNA的特異性檢測研究,在國外僅見于Wetton等對貓科動(dòng)物骨DNA進(jìn)行特異性檢測的相關(guān)報(bào)道。國內(nèi)對于該領(lǐng)域的研究幾乎未見報(bào)道。本研究通過篩選獅與其它動(dòng)物在線粒體細(xì)胞色素b(Cyt b)基因片段的堿基差異合成特異引物,經(jīng)過PCR擴(kuò)增和凝膠電泳,達(dá)到了特異性檢測鑒定獅DNA的目的,并由此建立了一種靈敏、特異、簡便、快速、穩(wěn)定性好的獅DNA檢測方法。

      1 研究方法

      1.1 樣品種類及來源

      本研究所用動(dòng)物源性實(shí)驗(yàn)樣品及其來源見表1,其中獅、虎、豹、熊等珍貴動(dòng)物血液、毛發(fā)標(biāo)本由大連森林動(dòng)物園動(dòng)物飼養(yǎng)研究保護(hù)基地提供,亞洲獅肉為因病死亡動(dòng)物標(biāo)本,經(jīng)遼寧省林業(yè)局批準(zhǔn)由大連森林動(dòng)物園動(dòng)物飼養(yǎng)研究保護(hù)基地提供。為確保樣品來源明確可靠,所采集的各種動(dòng)物的毛發(fā)樣品均直接取自于動(dòng)物體表或單獨(dú)飼養(yǎng)的籠舍。

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      1.2 儀器

      高速離心機(jī) 5804(Eppendorf,德國),普通 PCR 儀,(PE24000,美國),核酸蛋白分析儀(Beckman DU640),恒溫干燥箱(SANYO mov-213F,日本)。

      1.3 引物合成

      根據(jù)獅與其它多種貓科動(dòng)物和哺乳動(dòng)物mtDNA細(xì)胞色素 b基因序列的差異,及引物設(shè)計(jì)有關(guān)原則[2-4],設(shè)計(jì)合成引物。引物序列由寶生物工程(大連)有限公司合成。引物序列為F:5'-CAAACCTGAATGGTACTTCCTA-3',R:5'-AGATGGGTATTAGGATTA GAAGA-3'。

      1.4 樣品制備

      稱約100 g獅的肌肉組織,切碎,于120℃烘烤過夜,用組織研磨器研磨成粉末狀。將獅肉粉和牛肉骨粉樣品進(jìn)行混合以得到系列百分比(100%,10%,1%,0.5%,0.1%)的獅肉粉和牛肉骨粉混合物。

      1.5 模板DNA制備

      提取血液類試驗(yàn)樣品基因組DNA用的Blood Genome DNA Extraction Kit試劑盒,購自寶生物工程(大連)有限公司,貨號D9081。其它組織類和骨粉類樣品采用動(dòng)物源性植物飼料基因組DNA提取試劑盒,購自天根生化科技(北京)有限公司,貨號DP323-03。從動(dòng)物毛中提取總DNA主要參照公安部物證鑒定中心人的毛發(fā)提取方法進(jìn)行[5]。

      1.6 PCR擴(kuò)增條件

      反應(yīng)采用25μL體系,按下列組分配置PCR反應(yīng)液:10×PCR緩沖液2μL、引物(10μmol/L)各1μL、dNTP(10 mmol/L)2μL、Taq DNA 聚合酶(5 U/μL)0.2μL、模板 DNA 1μL,加dH2O補(bǔ)足25μL。反應(yīng)條件如下:94℃ 3 min;94℃ 1 min,66℃1 min,72 ℃1 min,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min結(jié)束反應(yīng);4℃保存反應(yīng)產(chǎn)物。

      1.7 PCR檢測的特異性分析

      以表1中所列各物種的基因組DNA為模板,按照1.6 PCR擴(kuò)增條件進(jìn)行獅源性制品的PCR檢測鑒定特異性試驗(yàn)。

      1.8 PCR檢測的靈敏度分析

      將1.4中制備的獅肉粉和牛肉骨粉系列百分比(100%,10%,1%,0.5%,0.1%)混合物,按照1.5模板DNA制備中的骨粉DNA提取方法進(jìn)行混合物基因組DNA的提取。系列混合物DNA用于檢測靈敏度分析。

      2 結(jié)果

      2.1 肌肉和血液樣品中PCR檢測特異性試驗(yàn)

      取表1中所列的17種血液、組織和骨粉類樣品的DNA進(jìn)行PCR檢測。獅種特異性檢測結(jié)果的PCR產(chǎn)物電泳圖譜如圖1所示。試驗(yàn)結(jié)果顯示,獅種中亞洲獅亞種的血液、肌肉組織和毛發(fā)DNA樣本,東非獅亞種的血液DNA樣本經(jīng)過PCR擴(kuò)增,得到陽性擴(kuò)增產(chǎn)物。而虎、豹、熊的6種血液DNA樣本,牛、羊、馬、豬、狗、兔、驢、鹿等8種哺乳動(dòng)物骨粉DNA樣本以及空白水對照的檢測結(jié)果均為陰性。上述結(jié)果表明:試驗(yàn)所設(shè)計(jì)引物為獅DNA的特異性擴(kuò)增引物,而且對來自于不同個(gè)體和不同組織的DNA具有同樣的擴(kuò)增效果。

      2.2 毛干中PCR檢測特異性試驗(yàn)

      對亞洲獅、東北虎、金錢豹、波斯貓脫落毛發(fā)進(jìn)行DNA提取和擴(kuò)增。圖2顯示僅亞洲獅樣本出現(xiàn)特異性的擴(kuò)增條帶,而東北虎、金錢豹和波斯貓的毛發(fā)檢測結(jié)果均為陰性。上述結(jié)果可證明引物僅對獅特異。

      2.3 靈敏度試驗(yàn)

      將1.4中制備的獅肉粉和牛肉骨粉系列百分比(100%,10%,1%,0.5%,0.1%)混合物,按照1.5模板DNA制備中的骨粉DNA提取方法進(jìn)行混合物基因組DNA的提取。該系列的混合物DNA用于進(jìn)行檢測靈敏度分析。按照1.6 PCR擴(kuò)增條件進(jìn)行試驗(yàn)。結(jié)果顯示,使用1.6中的擴(kuò)增條件,可在含量為100%獅肉粉、10%獅肉粉、1%獅肉粉、0.5%獅肉粉中擴(kuò)增出特異性的PCR擴(kuò)增條帶(圖3)。表明本試驗(yàn)設(shè)計(jì)的特異性PCR引物可檢出骨粉中0.5%的獅源成分。

      3 討論

      檢測鑒定獅屬制品可靠的反應(yīng)體系建立在合適的基因片段選擇上,所選的基因必需種屬特異性強(qiáng),而在物種內(nèi)變異性要小。為了選擇一個(gè)合適的鑒定獅的基因片段,我們使用了歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的數(shù)據(jù)庫(gene databanks,EMBL),比較其中足夠多的種間數(shù)據(jù)。在一些侯選基因片段中,選擇了線粒體細(xì)胞色素b(Cyt b)基因片段。在互聯(lián)網(wǎng)上數(shù)據(jù)比對的結(jié)果表明,這段基因序列有足夠的特異性可以滿足設(shè)計(jì)種屬特異性的引物對。線粒體細(xì)胞色素b(Cyt b)基因片段在脊椎動(dòng)物中有很高的變異性。這里我們所設(shè)計(jì)的用來定性檢測獅源物質(zhì)的引物,在獅血、獅肉、獅毛樣品中均可以出現(xiàn)特異性PCR擴(kuò)增條帶,而且對來自于不同個(gè)體和不同組織的DNA具有同樣的擴(kuò)增效果。其他14種非獅源樣品(虎、豹、熊、牛、羊、馬、豬、狗、兔、驢、鹿)PCR反應(yīng)中沒有出現(xiàn)擴(kuò)增條帶。

      本研究所建立的對獅DNA進(jìn)行特異性檢測方法,是國內(nèi)少數(shù)正在進(jìn)行的獅 DNA檢測方法的研究,除具有高特異性、靈敏性外,因其具有簡便易行、快速、成本低等的特點(diǎn)而更具有實(shí)用性。此方法為海關(guān)、動(dòng)植物檢疫以及動(dòng)物保護(hù)組織提供了快速檢測鑒定獅制品的有效方法。

      [1]Bauer H,Nowell K,Packer C.Panthera leo[M].3rd ed.UK:IUCN Red List of Threatened Species,2008.

      [2]Driscoll C A,Menotti-Raymond M,Nelson G,et al.Genomic microsatellites as evolutionary chronometers:a test in wild cats[J].Genome Res,2002,12:414–423.

      [3]Burger J,Rosendahl W,Loreille O,et al.Molecular phylogeny of the extinct cave lion Panthera leo spelaea[J].Mol Phylogenet Evol,2004,30:841–849.

      [4]Dubach J,Patterson B,Briggs M,et al.Molecular genetic variation across the southern and eastern geographic ranges of the African lion Panthera leo[J].Cons Genet,2005,6(1):15–24.

      [5]鄭秀芬.法醫(yī)DNA分析 [M].北京:中國人民公安大學(xué)出版社,2002:53.

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