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      應用套式RT-PCR快速檢測鴨坦布蘇病毒

      2011-06-08 07:03:10顏丕熙李國新吳曉剛閆麗萍滕巧泱李澤君
      中國動物傳染病學報 2011年3期
      關鍵詞:鴨坦套式布蘇

      顏丕熙,李國新,吳曉剛,閆麗萍,滕巧泱,李澤君

      (中國農業(yè)科學院上海獸醫(yī)研究所 農業(yè)部動物寄生蟲學重點開放實驗室,上海 200241)

      2010年春季以來,上海市、江蘇省、浙江省、安徽省等地相繼爆發(fā)一種導致蛋鴨減產(chǎn)、生長遲緩和死亡的一種新發(fā)病,研究證明引起該病的病原為坦布蘇病毒(Tembusu virus)[1,2]。該病毒可經(jīng)空氣傳播,對蛋鴨及肉鴨均有致病力。病鴨主要表現(xiàn)為高熱、運動障礙、食欲下降甚至廢絕、產(chǎn)蛋下降甚至停止,嚴重可導致死亡,死亡率可達5%~10%。剖檢可見脾臟明顯腫大;肝臟出血嚴重,伴有針尖狀白色壞死點;卵巢發(fā)生出血、萎縮、破裂,輸卵管有粘液[1,2]。由于該病毒為新發(fā)病原,目前尚無可靠的檢測方法。本研究組曾使用RT-PCR方法對臨床樣品進行檢測,但發(fā)現(xiàn)RT-PCR的敏感性比較差,不能有效的檢測出該病毒。近年來套式RTPCR在疾病的診斷方面顯示出靈敏、特異的優(yōu)點,在登革熱病毒[3]、蜱傳腦炎病毒[4]和西尼羅病毒[5]等黃病毒的檢測中都得到了很好應用。鑒于此,本研究建立了套式RT-PCR方法,該方法能夠快速、敏感、特異地檢測出鴨坦布蘇病毒,為該病快速診斷與流行病學調查奠定了基礎。

      1 材料與方法

      1.1 鴨坦布蘇病毒的增殖 鴨坦布蘇病毒(FX2010)由本研究室分離鑒定。取保存的病毒液100 μL接種9日齡SPF雞胚,收集24~120 h死亡雞胚胚體,胚體研磨后,7500×g離心30 min,吸取上清,滴定病毒含量后,用于后續(xù)試驗。

      1.2 引物設計 根據(jù)坦布蘇病毒(FX2010)E基因序列設計兩對特異性的重疊引物(表1),引物由上海Invitrogen公司合成,用DEPC水稀釋至終濃度為10 μmol/L,分裝后凍存于-20℃。

      1.3 病毒RNA的提取 取1.5 mL Eppendorf管,向其內加入500 μL上述病毒液、800 μL Trizol(Invitrogen),靜置5 min;加入0.2 mL氯仿,振蕩15 s,靜置2~3 min;4℃離心10 min,吸取上清并加入等體積的異丙醇,沉淀10 min;4℃ 10 800×g離心10 min,棄上清,用75%酒精清洗沉淀,混勻后,10 800×g離心10 min;倒掉上清,RNA自然干燥,用20 μL DEPC水溶解RNA。

      1.4 反轉錄 將5μL RNA提取液與2 μL Random 9(TaKaRa)混勻,70 ℃保溫10 min,迅速冰浴2 min,然 后 分 別 加 入 4 μL 5×AMV Buffer、1μL RRI、1μL AMV(Takara)、1 μL 10 umol/L dNTP、6 μL DEPC水,共20 μL,混勻后30 ℃保溫10 min,42 ℃1 h,75 ℃ 10 min。

      1.5 套式RT-PCR方法的建立 第一輪PCR采用25 μL反應體系:12.5 μL PCR Mix(東盛生物),1 μL P1(10 umol/L),1 μL P2(10 umol/L),1 μL cDNA模板,滅菌ddH2O補加至25 μL。置于PCR儀中,94 ℃預變性4 min;94 ℃變性30 s,53℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,進行25個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。1.0%瓊脂糖凝膠電泳,并用凝膠成像系統(tǒng)進行拍照。第二輪PCR采用25 μL體系:取第一輪PCR反應液1 μL為模板,12.5 μL PCR Mix、1 μL P3(10 umol/L)、1 μL P4(10 umol/L),滅菌ddH2O補加至25 μL,置于PCR儀中。94 ℃預變性 4 min;94℃變形 30 s,53 ℃退火 30 s,72 ℃延伸30 s,進行25個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。1.0%瓊脂糖電泳,并用凝膠成像系統(tǒng)進行拍照。

      1.6 套式RT-PCR與普通PCR敏感性比較 取病毒液進行10倍系列稀釋(表2)。每個稀釋度取200 μL按上述方法進行RNA提取及反轉錄,所獲得的cDNA取1 μL作為模板,用引物P1、P2進行第一輪擴增,反應結束后進行電泳檢測。以第一次PCR產(chǎn)物(1μL)為模板,用引物P3、P4進行套式RT-PCR擴增。同時利用1μL cDNA作為模板,用引物P3、P4進行普通PCR擴增。反應結束后進行凝膠電泳檢測。

      1.7 特異性實驗 以禽流感病毒、新城疫病毒、網(wǎng)狀內皮增生病病毒、鴨肝炎病毒等病毒的核酸反轉錄產(chǎn)物為模板,按上述方法對其進行PCR擴增,每次擴增設雙蒸水作陰性對照,鴨坦布蘇病毒反轉錄cDNA為模板作為陽性對照,擴增反應結束后用凝膠電泳檢測。

      1.8 臨床應用 從安徽省、河北省、山東省、 浙江省、上海市等地發(fā)病鴨場采取病鴨脾臟組織,按1g/mL PBS加入PBS進行研磨,4℃ 10 800×g離心10 min。取200 μL上清按上述方法提取病毒RNA及反轉錄,隨后進行套式RT-PCR檢測,擴增反應結束后進行凝膠電泳檢測。將陽性病料接種8日齡SPF鴨胚后分離該病毒,并應用該套式RT-PCR方法對分離病毒的鴨胚尿囊液進行檢測,以確定病毒分離結果。

      表1 PCR擴增所需特異性引物Table1 The specific primers for PCR amplication

      2 結果

      2.1 套式RT-PCR與普通PCR敏感性的比較 將毒價為105.25ELD50/100 μL的病毒液做10倍系列稀釋,每個稀釋度取200 μL提取RNA,反轉錄后取1 μL(見表2)為模板,進行第一輪擴增。凝膠電泳結果顯示,只有毒價為2×105.25/100μL的病毒可以獲得962 bp的目的條帶(圖1A)。用引物P3和P4進行第二輪擴增,結果顯示,毒價為2×103.25/100 μL的病毒可以獲得300 bp的目的條帶(圖1A)。而直接用引物P3和P4進行普通PCR擴增,病毒滴度達到2×104.25/100 μL時才可獲得特異條帶(圖2)。結果表明套式RT-PCR擴增的敏感性較常規(guī)的PCR方法高10倍 (表2)。

      表2 套式RT-PCR的敏感性Table 2 Sensitivity comparison between nested RT-PCR assay and RT-PCR

      2.2 套式RT-PCR的特異性 以禽流感病毒、新城疫病毒、網(wǎng)狀內皮增生病病毒、鴨肝炎病毒等病毒的核酸反轉錄產(chǎn)物為模板,同時以雙蒸水作陰性對照,以鴨坦布蘇病毒做陽性對照,按上述方法對其進行PCR擴增,結果見圖3。試驗結果顯示此PCR反應對鴨坦布蘇病毒具有特異性。

      2.3 臨床樣品檢測 應用該套式RT-PCR方法對浙江省、上海市、山東省、河北省、安徽省等送檢的病料進行PCR擴增,結果陽性病料可獲得了300 bp的目的片段,陽性檢出率為48/63,與病毒分離率為13/63,結果見表3。

      表3 臨床樣品檢測Table 3 The detection of clinical samples by nested RT-PCR

      3 討論

      鴨坦布蘇病毒是2010年新發(fā)現(xiàn)的一種病毒。目前所知,該病毒主要侵害鴨,尤其是蛋鴨,可使蛋鴨采食量下降、生長遲緩、體重下降、產(chǎn)蛋減少甚至停止,并能導致一定的死亡率。剖檢病理特征主要是脾臟腫大、腎臟腫大、嚴重者肝臟后期有針尖狀白色壞死點等。該病毒的致病特點和機理目前尚不十分清楚。目前中國多數(shù)地區(qū)都遭受該病的影響,給蛋鴨養(yǎng)殖業(yè)帶來了極大的損失。

      對于該病的診斷,采用傳統(tǒng)的病毒分離方法費時費力,并且敏感性低。本研究建立了RT-PCR方法和套式RT-PCR方法檢測該病毒,并對兩種方法的敏感性作了比較。結果顯示,套式RT-PCR方法比RT-PCR方法1(引物P1、P2)敏感性高100倍,比RT-PCR方法2(引物P3、P4)敏感性高10倍。在特異性試驗中陽性病料可獲得300 bp的目的條帶,而禽流感病毒、新城疫病毒、網(wǎng)狀內皮增生病病毒、鴨肝炎病毒等的擴增結果均為陰性,表明該方法具有良好的特異性。應用該套式RT-PCR對臨床病料進行檢測驗證,結果表明該套式RT-PCR是檢測鴨坦布蘇病毒的有效手段,可用于鴨坦布蘇病毒的臨床診斷和分子流行病學調查。同時,應用該方法可以對病毒分離進行檢測與驗證。綜上所述,本研究所建立的套式RT-PCR能快速、靈敏、特異地檢測出鴨坦布蘇病毒,將為該病的防治與防控發(fā)揮重要作用。

      [1]Su J, Li S, Hu X,et al. Duck egg-drop syndrome caused by BYD virus, a new Tembusu-related flavivirus[J]. PLoS One, 2011, 6(3): e18106.

      [2]滕巧泱, 顏丕熙, 張旭, 等. 一種新的黃病毒導致蛋鴨產(chǎn)蛋下降及死亡[J]. 中國動物傳染病學報, 2010, 18(6):1-4.

      [3]Bronzoni R V, Moreli M L, Cruz A C,et al. Multiplex nested PCR for Brazilian Alphavirus diagnosis[J]. Trans R Soc Trop Med Hyg, 2004, 98(8): 456-461.

      [4]Puchhammer-Stockl E, Kunz C, Mandl C W,et al.Identification of tick-borne encephalitis virus ribonucleic acid in tick suspensions and in clinical specimens by a reverse transcription-nested polymerase chain reaction assay[J]. Clin Diagn Virol, 1995, 4(4): 321-326.

      [5]Johnson D J, Ostlund E N, Pedersen D D,et al. Detection of North American West Nile virus in animal tissue by a reverse transcription-nested polymerase chain reaction assay[J]. Emerg Infect Dis, 2001, 7(4): 739-741.

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