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      東北黑木耳栽培菌株的酯酶同工酶分析*

      2011-07-26 06:14:40韓增華張丕奇劉佳寧戴肖東
      黑龍江科學(xué) 2011年6期
      關(guān)鍵詞:親和性平皿同工酶

      韓增華,高 娃,張丕奇,劉佳寧,戴肖東

      (黑龍江省科學(xué)院微生物研究所,黑龍江哈爾濱150010)

      同工酶是催化功能相同而酶蛋白的分子構(gòu)型不同的酶類,同工酶結(jié)構(gòu)的相似性反映了生物間的親緣關(guān)系,因此同工酶譜資料可作為鑒定物種,研究分類、進(jìn)化、遺傳與變異的重要指標(biāo)。近十年來在真菌的分類鑒定研究中的應(yīng)用日益增多,其中用于食、藥用真菌的品種分類鑒定的同工酶主要以酯酶同工酶為主[1-3]。在黑木耳的菌株鑒別,親緣關(guān)系分析、多樣性等研究中也以酯酶同工酶研究比較多[4-6]。目前,未見有關(guān)東北主栽黑木耳菌株酯酶同工酶酶譜系統(tǒng)分析的報(bào)道。本文選用生產(chǎn)菌種為材料,研究東北地區(qū)常用栽培菌株的酯酶同工酶酶譜多樣性,通過分析,旨在為菌種的良種選育、種性鑒定及菌種管理等工作提供科學(xué)依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 供試菌株

      供試菌株共25個(gè),詳見表1

      表1 供試黑木耳菌株Table 1 Strains of Auricularia auricular tested in the study

      1.2 實(shí)驗(yàn)方法

      1.2.1 培養(yǎng)基

      母種培養(yǎng)基、親和性實(shí)驗(yàn)用培養(yǎng)基(cPDA):土豆200g煮1000 m L汁,瓊脂粉14.0g,葡萄糖20.0g,磷酸二氫鉀3.0g,硫酸鎂1.5g,蛋白胨0.5g,維生素B110.0m g,pH自然。菌絲形態(tài)觀察用培養(yǎng)基(PDA):土豆200g煮1000 m L汁,瓊脂粉14.0g,葡萄糖20.0 g。同工酶制備液體培養(yǎng)基:元蔥200g煮1000 m L汁,蔗糖10g,阿魏酸0.06g,pH值自然。

      1.2.2 菌絲形態(tài)分類

      將被試菌株分別接種于直徑為88m m盛有PDA平皿中,接種邊長為2 m m正方形菌塊,25℃下恒溫培養(yǎng),并于接種后的第十天觀察菌絲形態(tài)。

      1.2.3 親和性實(shí)驗(yàn)

      被試菌株兩兩配對(duì),分別接種于直徑為88m m盛有cPDA平皿中,接種邊長為2m m正方形菌塊,每兩個(gè)品種接種間距為25 m m,25℃下恒溫培養(yǎng),15d后觀察不同菌株菌絲相交區(qū)域的生長情況。

      1.2.4 同工酶測(cè)定

      按張丕奇等2008方法進(jìn)行[6]。

      1.3 數(shù)據(jù)處理與分析

      1.3.1 相對(duì)遷移率(R f)

      電泳結(jié)束后先在指示劑移動(dòng)的位置(前沿)作標(biāo)記,染色后,量出指示劑移動(dòng)的距離和酶帶移動(dòng)的距離。Rf=X2/X1。X1:固定染色前凝膠中指示劑的遷移距離;X2:固定染色后凝膠中酶蛋白區(qū)帶的遷移距,測(cè)量Rf時(shí),以酶帶的中部位置為準(zhǔn)。

      1.3.2 相似系數(shù)

      將凝膠上出現(xiàn)的條帶分類。按照條帶有無分別賦值,有帶記為1,無帶記為0。按Nei或Li(1997)公式計(jì)算菌株間的相似系數(shù)Se,其公式為:Se=2Mxy/(Mx+My+2Mxy),式中,Mx為x菌株所獨(dú)有的譜帶數(shù),My為y菌株所獨(dú)有的譜帶數(shù),Mxy為x和y菌株所共有的譜帶數(shù)。

      1.3.3 聚類分析

      NTSYS-PC軟件進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建黑木耳菌株相似系數(shù)樹狀圖譜。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 黑木耳不同菌株菌絲形態(tài)

      25個(gè)被試菌株按菌落形態(tài)分成6類,菌絲生長濃密、粗壯,絨毛氈狀,氣生菌絲旺,菌絲在平皿中生長分布均勻的為黑29、東A1、東A3、H W 9號(hào)菌株;菌絲生長稀疏、細(xì)弱,絨毛氈狀,氣生菌絲較弱,菌絲在平皿中生長分布不均勻,接種點(diǎn)周圍菌絲加密為 9808、東 A2、9809A、東 A4、東 A5、916、988、H W 5、958 號(hào)菌株;菌絲生長稀疏、細(xì)弱,絨毛氈狀,氣生菌絲弱,菌絲在平皿中生長分布均勻?yàn)?808、東A7、豐收2號(hào)菌株;菌絲生長較密、粗壯,成束,氣生菌絲旺,菌絲在平皿中生長分布均勻?yàn)?81、伊耳1號(hào)菌株;菌絲生長濃密、粗壯,成束,氣生菌絲旺,菌絲在平皿中生長分布不均勻?yàn)殚L白7號(hào)、延明 1 號(hào)、931、888、898 號(hào)菌株;菌絲較密、較弱,成束,氣生菌絲較弱,菌絲在平皿中生長分布均勻?yàn)闁|A6號(hào)、長城1號(hào)菌株。其中菌絲呈絨毛氈狀的菌株占實(shí)驗(yàn)菌株的64%,絨毛氈狀菌株氣生菌絲一般較弱,顏色灰白,有色素產(chǎn)生。菌絲成束的菌株氣生菌絲一般都較旺,菌絲潔白,產(chǎn)色素較絨毛氈狀弱。

      2.2 黑木耳不同菌株親和性試驗(yàn)

      親和試驗(yàn)可觀察出菌株間種、群親緣關(guān)系。對(duì)于親緣關(guān)系遠(yuǎn)、完全獨(dú)立的異緣或基因型不同的菌株來說,它們間存在著不親和性反應(yīng)。而對(duì)親緣關(guān)系近或基因型相同的菌株來說,它們之間表現(xiàn)為一定的親和性。實(shí)驗(yàn)的9809、東A3號(hào)、9809A、長城1號(hào)、931和H W 5號(hào)菌株與其他被試菌株間不親和現(xiàn)象顯著,說明它們親緣關(guān)系遠(yuǎn),為各自獨(dú)立的菌株。888、898、958號(hào)間親和,東 A4、東 A5、東A6、東A7、916號(hào)間親和,981和H W 9號(hào)間親和,說明每兩個(gè)菌株之間親緣關(guān)系近。其它各菌株間均存在不同程度的不親和性,被認(rèn)為是各自獨(dú)立的菌株,同時(shí)有些菌株間親和性較高,說明其同源性很高。

      2.3 黑木耳不同菌株的酯酶同工酶酶譜

      25個(gè)菌株酯酶同工酶酶譜見圖1,25個(gè)菌株共檢測(cè)257條酯酶同工酶譜帶,各菌株之間的遷移率分析可知,遷移率不同的譜帶有 17條,所有的譜帶均在 Rf 0.163~0.686之間,其中在Rf為0.163、0.539、0.637三處,25個(gè)菌株都有譜帶出現(xiàn)。供試的25個(gè)菌株得到了8個(gè)酶譜類型,其中黑木耳9809和東A3各為一個(gè)帶型;931為一個(gè)帶型;H W 5號(hào)為一個(gè)帶型;東 A4、東 A5、東 A6、東 A7、916、延明 1號(hào)、988、豐收2號(hào)、981、H W 9號(hào)菌株的帶型基本相同;8808、伊耳 1 號(hào)、888、898、958 號(hào)菌株帶型基本相同;黑 29、長白 7號(hào)、東 A1、東 A2號(hào)菌株的帶型基本相同;9809A、長城1號(hào)菌株的帶型基本相似。

      圖1 供試25個(gè)菌株的酯酶同工酶酶譜Fig.1 Esterase isozyme zymogram of the 25 strains tested

      2.4 酯酶同工酶的相似系數(shù)

      25個(gè)菌株兩兩間遺傳相似系數(shù)(Se)的分布范圍在0.400~1.000之間,其中 9809、東 A3號(hào)、931、H W 5號(hào)各菌株與其它被試菌株的相似系數(shù)較小,說明它們?cè)诒辉嚲曛杏H緣關(guān)系較遠(yuǎn)為各自獨(dú)立的菌株。東 A4、東 A5、東 A6、東 A7、916、延明 1 號(hào)、988、豐收2號(hào)、981、H W 9號(hào)等菌株間相似系數(shù)大,為 0.960 或 1.000;8808、伊耳 1 號(hào)、888、898、958 號(hào)菌株間相似系數(shù)為1.000,說明菌株遺傳背景相似或?yàn)橥痪辍?/p>

      2.5 聚類分析

      圖2 25個(gè)菌株的酯酶同工酶聚類分析樹狀圖Fig.2 Dendrogram based on esterase isozyme cluster analysis of the 25 strains tested

      根據(jù)同工酶電泳結(jié)果,在凝膠的某個(gè)相同的遷移率位置上有條帶的記為1,無條帶的記為0。用NTSYS軟件進(jìn)行聚類分析,得到了黑木耳菌株酯酶同工酶聚類分析圖(圖2),供試黑木耳菌株的酯酶同工酶遺傳相似性在0.53~1.00之間。從聚類分析樹狀圖可以直觀看出,當(dāng)遺傳相似水平為70%時(shí),測(cè)試的25個(gè)東北地區(qū)黑木耳菌株被聚類成三大類群。當(dāng)遺傳相似水平為80%時(shí),測(cè)試的25個(gè)黑木耳菌株可分為六大類群。第一類群:黑29、東A1、東A2、東 A3、東 A4、東 A5、東 A6、東 A7、916、延明 1號(hào)、988、豐收2號(hào)、981、H W 9號(hào)菌株;第二類群:8808、伊耳 1 號(hào)、888、898、958 號(hào);第三類群包括931、H W 5號(hào);第四類群有:9809A、長城 1 號(hào);第五類群有長白7號(hào);第六類群有9809號(hào)。

      3 討 論

      同工酶作為基因編碼的產(chǎn)物,表達(dá)的信息是DNA分子水平上的信息,作為分子遺傳標(biāo)記技術(shù)之一,它彌補(bǔ)了以菌落形態(tài)、顏色、孢子形態(tài)和子實(shí)體形態(tài)等特征傳統(tǒng)真菌分類的不足,已成為屬內(nèi)種間以及品種之間的分類鑒定的有效手段。同工酶分析已被廣泛應(yīng)用于各種食用菌的鑒別和遺傳多樣性研究[7-9]。

      從供試菌株的酶譜帶型和聚類分析可以看出,部分菌株之間的帶型相似或者相同,相似系數(shù)也很高,甚至達(dá)到1.0,初步可以確認(rèn)這些菌株之間親緣關(guān)系很近,特別都是來自同一地區(qū)的菌株,如東A5、東 A6、東 A7、916、延明 1 號(hào)、988 相似系數(shù)達(dá)1.000;東 A4、豐收 2 號(hào)、981、H W 9 號(hào)菌株間相似系數(shù)為 1.000;8808、伊耳 1 號(hào)、888、898、958 號(hào)菌株間相似系數(shù)為1.000。這可能與各地互相穿插引種、菌種管理混亂等有關(guān)。近年來,隨著黑木耳栽培產(chǎn)業(yè)不斷擴(kuò)大和研究工作的深入加強(qiáng),越來越多的新菌株、新品種通過不同選育手段獲得,積累了越來越多的在遺傳學(xué)上的新品種。但是這些新菌株也完全有可能與過去用的菌株是同一個(gè)品種,也就是同種異名,有些菌株在多年的栽培選育過程中雖有所變化,但變化不大,菌株間的相似系數(shù)就較大。這其實(shí)可能也是本試驗(yàn)中聚類結(jié)果相似度高的主要原因之一。

      菌絲形態(tài)、親和性分析及酯酶同工酶技術(shù)用于菌種鑒定研究表明,菌絲形態(tài)與同工酶譜間相關(guān)性不大,形態(tài)相同的菌株在酶帶表現(xiàn)上可能相差很遠(yuǎn)。親和性的結(jié)果與同工酶間表現(xiàn)出一定相關(guān)性,不親和菌株同工酶譜帶差異較明顯。酯酶同工酶分析技術(shù)作為鑒別種和品種以下菌株的有效分析手段在混淆菌株的區(qū)分方面顯示了它的實(shí)用性和有效性。本試驗(yàn)分析的25個(gè)菌株在Rf為0.163、0.539、0.637三處都有譜帶出現(xiàn),這可能是黑木耳的共有酯酶酶帶。25個(gè)黑木耳菌株酯酶多態(tài)性比較高,帶型類型比較豐富,菌株之間也普遍存在差異,在嚴(yán)格統(tǒng)一的條件下,其穩(wěn)定性和重復(fù)性也比較好,并且在一定程度上也可以反應(yīng)出某些菌株之間可能存在同物異名等現(xiàn)象。同時(shí)由于其操作簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì),且不需要復(fù)雜的設(shè)備,所以在黑木耳品種鑒定、種質(zhì)資源評(píng)價(jià)等方面有比較高的應(yīng)用價(jià)值。

      本實(shí)驗(yàn)采用洋蔥汁為同工酶誘導(dǎo)培養(yǎng)基,該培養(yǎng)基未人為添加其他蛋白,這為保證酶樣的純度提供優(yōu)良的誘導(dǎo)體系,可使菌株被誘導(dǎo)產(chǎn)生豐富的多態(tài)性條帶,利于菌株的準(zhǔn)確區(qū)分鑒定。

      [1]杜萍,陳艷秋.7個(gè)桑黃菌株酯酶同工酶的研究[J].中國食用菌,2006,25(2):40~42.

      [2]秦俊哲,姚艷芳,孫偉.18個(gè)靈芝菌種的酯酶同工酶分析[J].陜西科技大學(xué)學(xué)報(bào),2006,24(6):65~69.

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