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      PSMA基因沉默的前列腺癌細(xì)胞中腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因表達(dá)的芯片分析*

      2012-01-30 03:58:48曹開源馮發(fā)深關(guān)琳琳羅燕芬丘少鵬
      中國病理生理雜志 2012年6期
      關(guān)鍵詞:基因芯片前列腺癌調(diào)控

      王 鑄, 曹開源△, 何 霞, 馮發(fā)深, 徐 霖, 關(guān)琳琳, 汪 楊, 羅燕芬, 丘少鵬

      (中山大學(xué)1臨床檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化研究中心,2中山醫(yī)學(xué)院微生物教研室,3附屬第一醫(yī)院泌尿外科,廣東廣州510080)

      前列腺癌(prostate cancer)是男性泌尿生殖系統(tǒng)常見的惡性腫瘤之一。在全世界男性癌癥患者中,前列腺癌患病率居第3位[1],由于其發(fā)病隱匿,早期診斷困難,對晚期轉(zhuǎn)移癌患者尚無有效治療手段,預(yù)后較差。前列腺特異性膜抗原(prostate-specific membrane antigen,PSMA)作為前列腺癌較特異的生物學(xué)標(biāo)志物以及診斷和治療的潛在靶點(diǎn)受到了廣泛關(guān)注[2-3]。已證實(shí) PSMA具有較高的前列腺癌特異性,在前列腺癌中高表達(dá),在低分化、進(jìn)展期、激素難治性及轉(zhuǎn)移性的前列腺癌中表達(dá)進(jìn)一步增高,是前列腺癌診斷和治療研究的理想靶點(diǎn)[2]。PSMA在前列腺癌中的高表達(dá)及與其病理分級、預(yù)后因素的相關(guān)性提示PSMA在前列腺癌的發(fā)生發(fā)展以及轉(zhuǎn)移過程中可能起著調(diào)控作用。本課題組通過RNAi技術(shù)沉默PSMA基因的表達(dá),發(fā)現(xiàn)LNCaP細(xì)胞侵襲能力增強(qiáng),而生長能力沒有明顯變化,初步發(fā)現(xiàn)PSMA在前列腺癌轉(zhuǎn)移過程中起負(fù)調(diào)控作用[4]。

      本文應(yīng)用siRNA技術(shù)對前列腺癌LNCaP細(xì)胞株P(guān)SMA基因產(chǎn)生特異性沉默,并通過腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片技術(shù)對84個(gè)腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因進(jìn)行了分析。旨在了解PSMA在前列腺癌轉(zhuǎn)移過程中的作用以及其參與的相關(guān)調(diào)控信號通路,為探索前列腺癌的發(fā)病機(jī)制提供新的思路,從而為臨床腫瘤的轉(zhuǎn)移診斷、預(yù)后及治療提供理論參考。

      材料和方法

      1 細(xì)胞培養(yǎng)

      人前列腺癌細(xì)胞LNCaP購自ATCC(美國模式培養(yǎng)物集存庫),用含有10%的胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)基中于37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)。

      2 主要試劑

      Lipofectamine 2000試劑盒、Trizol以及一步法熒光定量試劑盒均購自Invitrogen。RPMI-1640培養(yǎng)基和胎牛血清購自Gibco。

      3 RNAi序列設(shè)計(jì)

      針對前列腺癌LNCaP細(xì)胞PSMA mRNA序列(M99487)利用在線設(shè)計(jì)軟件(http://jura.wi.mit.edu/bioc/siRNAext/siRNA_search.cgi?tasto =10925811)設(shè)計(jì)了3對特異性siRNA序列,見表1。

      4 RNAi序列轉(zhuǎn)染

      在轉(zhuǎn)染的前1 d,按照2.0×105cells/well的密度接種LNCaP細(xì)胞到6孔板,每孔中加入不含抗生素的培養(yǎng)基,使轉(zhuǎn)染的細(xì)胞密度達(dá)到30~50%的匯合度。轉(zhuǎn)染濃度為50 nmol/L,轉(zhuǎn)染操作步驟按照Lipofectamine 2000說明書進(jìn)行。分別培養(yǎng) 24 h、48 h、72 h 和96 h,收取細(xì)胞。

      5 RT-PCR檢測RNAi干擾PSMA的表達(dá)效果

      采用Beacon Designer 7.01 Demo設(shè)計(jì)軟件針對PSMA基因設(shè)計(jì)特異性探針和引物,見表2。以βactin作為內(nèi)參照。

      Trizol法提取各細(xì)胞樣品總RNA,取3 μL作為模板進(jìn)行RT-PCR檢測。反應(yīng)條件:50℃逆轉(zhuǎn)錄過程15 min;95℃預(yù)變性 2 min,95℃ 15 s,60℃30 s,共50個(gè)循環(huán)。

      表1 針對PSMA基因的特異siRNA序列Table 1.Nucleotide sequences of the PSMA-targeting siRNA

      表2 PSMA和β-actin的Taqman探針和引物Table 2.Taqman probe and primer for PSMA and β - actin

      6 siRNA干擾下的腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片分析

      采用SABiosciences公司腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片[PCR Array Human Tumor Metastasis(PAHS-028A),http://www.kangchen.com.cn/Product/Productmain.asp?ID=41]。該芯片采用熒光定量PCR原理,具有高靈敏度、高特異性、重復(fù)性好和線性范圍廣的特性,是研究特定信號通路或者一組功能相關(guān)基因表達(dá)量的理想方法。

      本研究采用的腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)準(zhǔn)確檢測了96個(gè)基因的表達(dá)情況,其中內(nèi)參照基因4個(gè),質(zhì)控基因8個(gè),腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因84個(gè)。

      計(jì)算每個(gè)處理組中的每個(gè)通路相關(guān)基因的ΔCt值。ΔCt(實(shí)驗(yàn)組)=靶基因平均Ct值-內(nèi)參照基因平均Ct值;ΔCt(對照組)=靶基因平均Ct值-內(nèi)參照基因平均Ct值。

      計(jì)算2個(gè)PCR Array(或2組)中每個(gè)基因的ΔΔCt。ΔΔCt= ΔCt(實(shí)驗(yàn)組) - ΔCt(對照組)。通過2-ΔΔCt計(jì)算實(shí)驗(yàn)組與對照組對應(yīng)基因的表達(dá)差異,對存在顯著差異的實(shí)驗(yàn)結(jié)果自行設(shè)計(jì)引物通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證。

      7 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

      采用SPSS 13.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。定量資料進(jìn)行單因素方差分析,方差不齊者采用秩和檢驗(yàn)分析,樣本間的兩兩比較采用LSD方法分析。數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

      結(jié) 果

      1 RNAi干擾PSMA表達(dá)效果檢測

      經(jīng)過RT-PCR檢測分析確定siRNA 3干擾序列在干擾濃度為50 nmol/L,RNA干擾時(shí)間為72 h時(shí)的效果最好,ΔΔCt為2.13,PSMA mRNA 水平干擾效果達(dá)到75%以上,Western blotting顯示PSMA在蛋白水平下調(diào)表達(dá)68%,差異顯著(P<0.05),見圖1。

      Figure 1.Results of RNAi efficiency of siRNA 3.±s.n=3.*P < 0.05 vs control.圖1 siRNA 3序列干擾效果

      2 腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片檢測結(jié)果

      siRNA干擾PSMA基因表達(dá)的LNCaP細(xì)胞組和正常對照組相比,有CDH6、CXCL12等10個(gè)基因發(fā)生顯著上調(diào)表達(dá),而MDM2、MMP2等4個(gè)基因發(fā)生顯著下調(diào)表達(dá),見圖2、表3。

      Figure 2.Tumor metastasis-related gene expression in the RNAi- PSMA LNCaP cells.圖2 腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因在siRNA干擾PSMA基因表達(dá)條件下的表達(dá)

      討 論

      PSMA 由 Horoszewicz等[5]于 1987 年用單抗7E11-C5對人各種器官的正常及惡性組織進(jìn)行免疫組織化學(xué)分析時(shí)發(fā)現(xiàn),為獨(dú)特完整的橫跨細(xì)胞膜的二型前列腺上皮細(xì)胞糖蛋白,同時(shí)還是一個(gè)大分子金屬肽酶。PSMA由750個(gè)氨基酸殘基組成,分子量約為100~120 kD,其基因定位于11q14,11號染色體短臂上,共有19個(gè)外顯子和18個(gè)內(nèi)含子[6]。PSMA和Folh1酶、轉(zhuǎn)鐵蛋白等一些基因高度同源,且存在多種剪接變異體[7-8]。PSMA具有信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和受體功能,在細(xì)胞營養(yǎng)攝取、細(xì)胞遷移過程中發(fā)揮作用[9],并和染色體穩(wěn)定性有關(guān)[10]。

      目前,和PSMA相關(guān)的調(diào)控蛋白最重要的發(fā)現(xiàn)之一是filamin A蛋白。Filamin A是PSMA和PAK之間很重要的紐帶。有報(bào)道稱PSMA與激活RAC1可能高度相關(guān)[11]。RAC1激活下調(diào)了E-鈣黏蛋白的表達(dá),使得細(xì)胞之間的黏附變得疏松從而有利于癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。PSMA受到整合素蛋白以及PAK的負(fù)反饋調(diào)節(jié)。激活的PAK和filamin相互作用,導(dǎo)致filamin A的2 152位Ser被磷酸化,導(dǎo)致PAK的進(jìn)一步激活[11]。有研究發(fā)現(xiàn)PSMA在細(xì)胞偽足結(jié)構(gòu)中有積累,但目前還不確定PSMA在細(xì)胞的轉(zhuǎn)移過程中的作用機(jī)制[12]。

      本課題組通過RNAi技術(shù)沉默PSMA基因表達(dá)后發(fā)現(xiàn)LNCaP細(xì)胞侵襲能力增強(qiáng),但是對細(xì)胞生長影響不大,初步發(fā)現(xiàn) PSMA在前列腺癌的侵襲中起負(fù)向調(diào)節(jié)作用[4]。那么PSMA在前列腺癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移過程中究竟起著什么樣的作用,又是通過什么樣的途徑來進(jìn)行調(diào)控的呢?通過本研究我們發(fā)現(xiàn),在PSMA基因的表達(dá)顯著下調(diào)后,有CDH6、CXCL12、IL-18、IL8RB、IGF1、MMP13、MMP3、MTSS1、TSHR 和ITGA7 10個(gè)基因的表達(dá)發(fā)生顯著上調(diào);而CCL7、ITGB3、MDM2和MMP2 4個(gè)基因表達(dá)顯著下調(diào),其中尤以MDM2下調(diào)最為明顯。MDM2為細(xì)胞增殖負(fù)調(diào)控蛋白在前列腺癌中高表達(dá),和前列腺癌惡性程度以及存活率相關(guān)。MDM2和P53結(jié)合,通過泛素化降解P53蛋白,維持細(xì)胞中P53蛋白的量的平衡。但是前列腺癌中MDM2基因的高表達(dá)打破這種平衡,導(dǎo)致抑癌蛋白P53過度降解,促進(jìn)了癌癥的發(fā)生并和其侵襲能力有關(guān)[13]。推測PSMA可能參與調(diào)控MDM2的表達(dá),前列腺癌細(xì)胞中PSMA的高表達(dá)和MDM2的高表達(dá)存在相關(guān)性。

      腫瘤的轉(zhuǎn)移是一個(gè)復(fù)雜連續(xù)的過程,包括瘤細(xì)胞的脫落,侵襲和遷移、黏附、局部生長等,這一過程涉及許多復(fù)雜因素,在腫瘤的進(jìn)展過程中調(diào)控這些過程基因的表達(dá)也在相應(yīng)變化著影響其進(jìn)展,使腫瘤向周圍侵襲轉(zhuǎn)移。目前報(bào)道的與腫瘤轉(zhuǎn)移調(diào)控有關(guān)的基因有很多種,在這些基因共同作用下促進(jìn)腫瘤不同進(jìn)程的發(fā)生。因此,需要系統(tǒng)地分析這些基因才能闡明腫瘤轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制?;蛐酒夹g(shù)具有高通量的特點(diǎn),可以同時(shí)檢測大量基因,進(jìn)行平行分析,并且還具有快速、準(zhǔn)確、敏感等特點(diǎn),顯示了分析疾病相關(guān)基因方面的優(yōu)越性。

      本研究通過腫瘤轉(zhuǎn)移基因芯片對84個(gè)腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)在下調(diào)PSMA基因表達(dá)后,CDH6、CXCL12等10個(gè)基因發(fā)生顯著上調(diào),而CCL7、MDM2等4個(gè)基因發(fā)生顯著下調(diào),研究結(jié)果將為更深入地研究PSMA的功能及調(diào)控途徑奠定一定的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。這些表達(dá)差異的基因在前列腺癌轉(zhuǎn)移的發(fā)生及進(jìn)展過程中所起的作用及相互關(guān)系還有待進(jìn)一步研究。我們將構(gòu)建PSMA基因亞克隆以及LNCaP細(xì)胞cDNA文庫,通過酵母雙雜交技術(shù)從蛋白水平篩選PSMA相互作用蛋白,進(jìn)一步揭示PSMA的功能以及在前列腺癌轉(zhuǎn)移過程中的作用機(jī)制。

      表3 PSMA在RNAi沉默條件下腫瘤轉(zhuǎn)移芯片分析Table 3.Fold of up- or down-regulation after treatment with RNAi targeting PSMA

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