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      角蛋白降解菌分離、鑒定及其降解機(jī)制研究

      2012-08-09 02:38:22齊志國張鐵鷹董杰麗杜家菊
      飼料工業(yè) 2012年17期
      關(guān)鍵詞:亞硫酸鹽二硫鍵角蛋白

      齊志國 張鐵鷹 董杰麗 杜家菊

      (1.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,動物營養(yǎng)學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100193;2.山東理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東淄博 255049)

      羽毛和羊毛是自然界中最主要的角蛋白資源,然而其內(nèi)部含硫氨基酸豐富,二硫鍵多,致使結(jié)構(gòu)極穩(wěn)定。傳統(tǒng)物理化學(xué)處理角蛋白的方法存在諸多不足,而利用微生物和酶等生物學(xué)方法處理角蛋白,條件溫和、污染小、氨基酸破壞低,對合理利用角蛋白資源和緩解蛋白資源短缺具有現(xiàn)實(shí)意義。細(xì)菌、真菌、放線菌等多種微生物可降解角蛋白,其破壞角蛋白二硫鍵的假說較多,主要包括硫解理論[1]、物理壓力理論[2]和酶解理論[3]等。近年來,二硫鍵還原酶在角蛋白降解中的作用日益受到關(guān)注。Yamamura等[4]于嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌發(fā)酵液中分離出了二硫鍵還原酶和蛋白水解酶,并證實(shí)二硫鍵還原酶對角蛋白的降解具有較強(qiáng)促進(jìn)作用。Prakash 等[5]、Ramnani等[6]和 Ghosh 等[7]亦先后在水解角蛋白的微生物發(fā)酵液中檢測到了二硫鍵還原酶,進(jìn)一步證實(shí)了二硫鍵還原酶在微生物降解角蛋白中的關(guān)鍵作用。本實(shí)驗(yàn)通過篩選獲得高效羽毛角蛋白降解菌,對其胞內(nèi)與胞外酶活組成、發(fā)酵液中含硫離子、巰基和可溶性蛋白含量測定分析,探討其降解羽毛角蛋白的機(jī)制,為提高其對角蛋白生物降解提供理論指導(dǎo)。

      1 材料與方法

      1.1 羽毛粉的制備和培養(yǎng)基

      分別將雞羽毛和羊毛用洗滌劑揉搓洗凈,121℃高壓滅菌1 h,再用清水洗凈,然后80℃烘48 h,冷卻后粉碎過100目篩,用于培養(yǎng)基制備和微生物發(fā)酵。

      選擇培養(yǎng)基:羽毛粉 10 g、瓊脂 20 g、NaCl 0.5 g、K2HPO41 g、KH2PO40.4 g、蒸餾水 1 000 ml,pH 值 7.4~7.6,121℃滅菌 20 min。

      種子培養(yǎng)基:牛肉膏5 g、蛋白胨 10 g、NaCl 0.5 g、K2HPO41 g、KH2PO40.4 g、蒸餾水 1 000 ml,pH 值7.4~7.6,121℃滅菌 20 min。

      發(fā)酵培養(yǎng)基:羽毛粉 10 g、NaCl 0.5 g、K2HPO40.7 g、KH2PO40.35 g、蒸餾水 1 000 ml,pH 值 7.4~7.6,121 ℃滅菌20 min。

      1.2 菌株的分離篩選、鑒定

      1.2.1 菌株的分離篩選

      采集腐爛羽毛及其周圍土壤,稱取適當(dāng)樣品,將其梯度稀釋后涂布于以羽毛粉為唯一碳氮源基礎(chǔ)平板上,37℃倒置培養(yǎng)3 d左右,挑取有明顯水解圈的菌落進(jìn)行傳代培養(yǎng)和馴化,并保存菌株。將菌株富集培養(yǎng),取對數(shù)期種子液(0.6<OD600<0.8)接種于僅含有完整羽毛的無菌生理鹽水中搖瓶發(fā)酵,觀察羽毛降解情況,篩選降解羽毛速度最快菌株。

      1.2.2 篩選菌形態(tài)觀察與分子鑒定

      取分離的菌株于牛肉膏蛋白胨平板上劃線培養(yǎng),37℃恒溫培養(yǎng)48 h,觀察菌落的形狀、顏色、光學(xué)特性、表面特性等。之后利用細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒提取基因組,運(yùn)用16S rDNA通用引物F27:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',R1429:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3'擴(kuò)增16S rDNA序列。PCR產(chǎn)物經(jīng)測序后,結(jié)果在NCBI中運(yùn)用Blast進(jìn)行序列同源性搜索,應(yīng)用Clustal X1.83進(jìn)行多序列比對,采用MEGA4中Neighbor-joining方法建樹(Bootstrap重復(fù)數(shù)為 1 000)。

      1.3 篩選菌對羽毛角蛋白的降解與機(jī)制研究

      1.3.1 篩選菌發(fā)酵產(chǎn)物分析

      取對數(shù)期(0.6<OD600<0.8)微生物種子液接種到50 ml/250 ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,接種量4%,然后37℃、150 r/min 搖床分別培養(yǎng) 6、12、24、48、72、96 h,實(shí)驗(yàn)處理均為3個(gè)重復(fù)。檢測上述不同發(fā)酵時(shí)間發(fā)酵液的胞外上清液中角蛋白酶活性、可溶性蛋白與巰基含量,對菌株CP-7發(fā)酵過程中的產(chǎn)物進(jìn)行分析。

      1.3.2 發(fā)酵上清液中含硫離子檢測

      取發(fā)酵48 h菌株發(fā)酵液,離心制備上清液,檢測上清液中亞硫酸鹽和硫代硫酸鹽。硫代硫酸鹽采用兩種方法進(jìn)行定性檢測。一是將上清液酸化至pH值3.0,若出現(xiàn)渾濁則為有硫代硫酸鹽產(chǎn)生;二是觀察上清液中加入FeCl3后是否會出現(xiàn)紫色。若有紫色出現(xiàn)表明有硫代硫酸鹽產(chǎn)生,反之則無。亞硫酸鹽則采用BaCl2檢測,若發(fā)酵過程產(chǎn)生亞硫酸鹽,當(dāng)加入BaCl2溶液后,上清液則出現(xiàn)白色沉淀,且沉淀可以使KMnO4脫色,反之則無亞硫酸鹽產(chǎn)生。

      1.3.3 胞內(nèi)、胞外液酶活性分析

      取發(fā)酵48 h菌株發(fā)酵液,制備胞外、胞內(nèi)和混合粗酶液。分別以10mg羽毛、羊毛和酪蛋白為底物,檢測角蛋白和酪蛋白水解活性。同時(shí)檢測不同發(fā)酵時(shí)間胞內(nèi)、胞外上清液中二硫鍵還原酶活性,探討不同酶液組分在角蛋白降解中的作用。

      1.4 酶活性及相關(guān)生化指標(biāo)分析方法

      1.4.1 粗酶液制備

      發(fā)酵液于 4 ℃、10 000×g離心 10 min,經(jīng) 0.22 μm過濾器過濾后即為胞外粗酶液。收集胞體,懸浮于0.05 mol/l pH值10.0甘氨酸-氫氧化鈉緩沖液中,用3倍磷酸鹽緩沖液洗脫3次,然后用1%的溶菌酶溶解1 h,再用超聲波破碎儀冰浴條件下破碎10 min,4℃下10 000×g離心10 min,上清液經(jīng)過濾后為胞內(nèi)粗酶液?;旌厦敢和ㄟ^1 ml的胞外粗酶液與1 ml胞內(nèi)粗酶液混合得到。

      1.4.2 角蛋白酶活性測定

      采用Gradisar[8]所描述的方法為基礎(chǔ),并加以修改。具體操作步驟:10mg羽毛粉與2.0 ml Tris/HCl(pH值 8.0,濃度0.05 mol/l)緩沖液混合,加入1.0 ml上清液,180 r/min、40℃保溫處理1 h,每隔10 min取出用力震蕩。反應(yīng)結(jié)束時(shí)添加2.0 ml的6%三氯乙酸(TCA)終止反應(yīng),靜止 5 min,10 000×g 離心 15 min,上清液于280 nm下測定其吸光值,采用保溫前添加TCA的反應(yīng)管作為對照。酶活定義:pH值8.0、40℃保溫處理1 h后,A280值升高0.01個(gè)單位為1 U。

      1.4.3 酪蛋白水解活性測定

      酪蛋白水解活性參照蛋白酶活性(紫外分光光度法)測定方法。

      1.4.4 二硫鍵還原酶活性測定

      二硫鍵還原酶活性結(jié)合Ellman[9]和Brown[10]的方法進(jìn)行測定。1 ml由粗酶液、0.1 mol/l pH值8.0磷酸緩沖溶液和蒸餾水按3:2:5比例混合組成的酶混合液與1 ml含有5 mmol/l氧化型谷胱甘肽(GSSG)、5 mmol/l苯甲基磺酰氟(PMSF)的磷酸鹽緩沖溶液(pH值7.0)混合,在40℃恒溫水浴鍋中反應(yīng)1 h。2 000×g離心10 min,取1.5 ml上清液與2.5 ml含有1 mM EDTA的pH值8.0磷酸緩沖液混合,加入100 μl Ellman試劑,靜置5 min待顏色穩(wěn)定時(shí)于412 nm下測定吸光度并計(jì)算巰基含量。酶對照組為加入1 ml pH值7.0的磷酸緩沖溶液取代氧化型谷胱甘肽的處理組。酶活定義:1 kU二硫鍵還原酶活性相當(dāng)于每毫升酶在40℃下每分鐘釋放出1 μmol巰基。

      圖1 菌株CP-7完整羽毛降解

      1.4.5 巰基與可溶性蛋白含量測定

      巰基測定參考Ellman的方法并適當(dāng)修改,可溶性蛋白含量運(yùn)用Bradford法測定。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 菌株的分離、鑒定

      2.1.1 菌株的分離篩選

      對采集的樣品富集稀釋并涂布羽毛選擇平板培養(yǎng),共挑取27株平板產(chǎn)水解圈能力較強(qiáng)的菌株。將其于羽毛選擇平板上傳代馴化,并進(jìn)行完整羽毛降解實(shí)驗(yàn)。最終得到1株能夠完全降解羽毛的菌株CP-7,其在5 d內(nèi)徹底降解完整羽毛(見圖1),故對其深入研究。

      2.1.2 菌株鑒定

      菌株CP-7生長于營養(yǎng)平板培養(yǎng)基,24 h后菌落直徑可達(dá)4 mm,菌落呈白色扁平狀,表面褶皺且多顆粒,粘稠,邊緣不整齊并伴有絲狀外延(見圖2)。

      圖2 菌株CP-7菌群形態(tài)

      經(jīng)PCR手段擴(kuò)增得到菌株CP-7的部分16S rDNA序列(見圖3),測序發(fā)現(xiàn)其長度為1 422 bp,序列提交至Genbank數(shù)據(jù)庫,接收號JN628975。將序列進(jìn)行Blast比對,在GenBank數(shù)據(jù)庫中獲得相關(guān)菌株16S rDNA序列,應(yīng)用Clustal X1.83進(jìn)行多序列比對,采用MEGA4中Neighbor-joining方法建樹進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。如圖4所示,CP-7與地衣芽孢桿菌位于同一分支,同源性可達(dá)99%,初步判定該菌株為地衣芽孢桿菌,命名為Bacillus licheniformis CP-7。

      圖3 菌株16S rDNA電泳圖譜

      圖4 菌株CP-7系統(tǒng)發(fā)育樹

      2.2 篩選菌對羽毛角蛋白的降解與機(jī)制分析

      2.2.1 發(fā)酵液中可溶性蛋白含量與角蛋白酶活性

      發(fā)酵液中可溶性蛋白含量和角蛋白酶活性檢測發(fā)現(xiàn)(見圖5、圖6),空白對照發(fā)酵液中可溶性蛋白產(chǎn)量低、變化小,而CP-7發(fā)酵液中可溶性蛋白含量在48 h最高,可達(dá)0.26mg/ml,之后隨發(fā)酵時(shí)間呈現(xiàn)逐漸下降趨勢。角蛋白酶活性隨發(fā)酵時(shí)間而逐漸增加,96 h酶活達(dá)到最高(8.43 U/ml),但72 h酶活性明顯近于穩(wěn)定,可見角蛋白酶是該菌降解羽毛的基礎(chǔ)。

      圖5 發(fā)酵液中可溶性蛋白變化

      2.2.2 發(fā)酵液中巰基和含硫離子

      CP-7發(fā)酵液中巰基濃度隨發(fā)酵時(shí)間逐漸升高(見圖7),96 h達(dá)到119 μM,這與角蛋白酶活力的變化趨勢一致,而空白對照發(fā)酵液中的巰基濃度幾乎無變化,這說明該菌株在降解羽毛角蛋白過程中有大量二硫鍵被還原。

      圖6 發(fā)酵產(chǎn)酶情況

      圖7 發(fā)酵液中巰基濃度變化

      對菌株CP-7發(fā)酵液中亞硫酸鹽和硫代硫酸鹽等含硫離子檢測發(fā)現(xiàn),上清液添加氯化鐵后并不顯紫色,酸化至pH值3.0后未出現(xiàn)渾濁,表明硫代硫酸鹽檢測呈陰性。當(dāng)加入BaCl2溶液后,上清液出現(xiàn)白色沉淀,并且沉淀可以使KMnO4脫色,表明菌體在代謝過程中有亞硫酸鹽產(chǎn)生。這說明發(fā)酵液中的巰基可能被進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為了亞硫酸鹽。

      2.2.3 胞內(nèi)、胞外液中酶活組成

      分別以羽毛、羊毛和酪蛋白為底物檢測胞內(nèi)酶液、胞外酶液和胞內(nèi)胞外混合酶液中蛋白酶活性。結(jié)果表明,以羽毛粉為底物時(shí)混合酶液角蛋白酶活性(7.13 U/ml)約為胞外酶液角蛋白酶活性(2.9 U/ml)2.5倍(P<0.01),以羊毛為底物時(shí)兩者差異亦極顯著(P<0.01),但酪蛋白水解活性差異不顯著(P>0.05)(見圖8、圖9)。胞內(nèi)酶液僅在以羊毛為底物時(shí)檢測到微弱角蛋白酶活性(0.25 U/ml),以羽毛和酪蛋白為底物時(shí)均未檢測到蛋白酶活性。

      圖8 胞內(nèi)、胞外、混合酶液角蛋白水解活性

      圖9 胞內(nèi)、胞外、混合酶液酪蛋白水解酶活性

      該菌胞內(nèi)、胞外酶液二硫鍵還原酶活性隨發(fā)酵時(shí)間的變化情況見圖10。胞外酶液各時(shí)間點(diǎn)均未檢測到二硫鍵還原酶活性,而胞內(nèi)酶液均檢測到二硫鍵還原酶活性,表明胞內(nèi)二硫鍵還原酶可能是胞外角蛋白酶活性提高的主要原因。其在發(fā)酵初始就達(dá)到較高水平,并在36 h達(dá)到最大,隨后迅速降低,這與胞外角蛋白酶產(chǎn)生規(guī)律不同。

      圖10 胞內(nèi)、胞外液二硫鍵還原酶活性

      3 討論

      角蛋白降解菌的篩選通常以產(chǎn)透明圈大小和酶活性高低為篩選標(biāo)準(zhǔn),本實(shí)驗(yàn)則以透明圈和完整羽毛降解法,獲得了1株可高效降解角蛋白菌株,經(jīng)鑒定命名為Bacillus licheniformis CP-7。該菌可在5 d內(nèi)將完整羽毛徹底降解,較之多數(shù)已知菌株降解角蛋白的能力強(qiáng)。地衣芽孢桿菌PWD-1為研究最為深入的降解菌,但其徹底降解羽毛需6 d[11]。吳小倫[12]和Suntornsuk[13]用透明圈法分別分離到短黃桿菌ZDM(Flavobacterium breve ZDM)和Bacillus sp.FK46,兩者搖瓶發(fā)酵5 d后羽毛被強(qiáng)烈降解,但均無法完全利用羽軸。由此可見,利用透明圈和完整羽毛降解相結(jié)合的方法篩選角蛋白降解菌更為有效。

      當(dāng)前關(guān)于角蛋白降解假說較多,但其核心均為二硫鍵的裂解。菌株CP-7發(fā)酵過程中還原得到大量巰基,同時(shí)伴有可溶性蛋白、角蛋白酶的產(chǎn)生。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),CP-7胞內(nèi)液具有二硫鍵還原酶活性,并對胞外角蛋白酶活性具有顯著地促進(jìn)作用,這表明其胞內(nèi)的二硫鍵還原酶參與了角蛋白降解過程。Yamamura等[4]在嗜麥芽窄食單胞菌D-1中分離到了蛋白水解酶和二硫鍵還原酶。研究表明,兩種酶并不獨(dú)立起作用,而同時(shí)用于羽毛降解時(shí),其蛋白酶水解活性比單獨(dú)使用提高約50多倍。另外,在蠟樣芽孢桿菌[5]、B.licheniformis RG1[6]和Bacillus halodurans PPKS-2[7]發(fā)酵液中也檢測到了二硫鍵還原酶活性,且對角蛋白酶具有激活作用。此外,二硫鍵還原酶可明顯提高枯草芽孢桿菌蛋白酶、胰蛋白酶以及蛋白酶K水解角蛋白的活性[4]。本研究還發(fā)現(xiàn),二硫鍵還原酶活性在角蛋白降解初期較高,這或許與二硫鍵的早期斷裂相關(guān)。因此,二硫鍵還原酶在CP-7羽毛角蛋白降解中具有重要作用,促進(jìn)了二硫鍵的裂解。

      角蛋白二硫鍵的還原不僅與二硫鍵還原酶有關(guān),其它化學(xué)因素也可能是破壞二硫鍵的重要原因。Onifade[14]發(fā)現(xiàn)幾種角蛋白降解真菌產(chǎn)生的亞硫酸鹽可以對角蛋白進(jìn)行硫解。Kunert[1]也認(rèn)為代謝產(chǎn)生的亞硫酸鹽和硫代硫酸鹽可能加速了二硫鍵裂解。王玲[15]發(fā)現(xiàn)在羽毛發(fā)酵過程中加入適當(dāng)濃度的亞硫酸鹽和硫代硫酸鹽可以促進(jìn)角蛋白降解。本研究在CP-7發(fā)酵液中也檢測到了亞硫酸鹽,但未檢測到硫代硫酸鹽。因此,CP-7裂解角蛋白二硫鍵與硫解作用可能具有密切關(guān)系。

      4 結(jié)語

      基于上述研究可知,運(yùn)用透明圈和完整羽毛降解相結(jié)合的方法篩選角蛋白降解菌更為有效。篩選菌CP-7胞內(nèi)二硫鍵還原酶顯著促進(jìn)胞外角蛋白水解活性,這可能與二硫鍵還原酶裂解二硫鍵有關(guān)。此外,代謝產(chǎn)生的亞硫酸鹽與角蛋白降解亦可能密切相關(guān)。

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