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      禽流感病毒M 1蛋白表(擬)位定位及免疫檢測分析

      2012-08-30 01:25:50宋建領(lǐng)張富強李華春楊仕標王金萍
      中國預防獸醫(yī)學報 2012年9期
      關(guān)鍵詞:表位噬菌體禽流感

      宋建領(lǐng),張富強,李華春*,楊仕標,王金萍

      (1.云南省熱帶亞熱帶動物病毒病重點實驗室,云南昆明 650224;2.成都軍區(qū)疾病預防控制中心,云南昆明 650032)

      禽流感(Avian influenza,AI)是由A型禽流感病毒(AIV)引起的一種禽類的感染性疾病綜合征。近年來,H5N1和H9N2亞型AIV的暴發(fā),特別是H5N1亞型AIV突破種間屏障感染人的病例[1],賦予AI全新的公共衛(wèi)生意義。AIV屬于正粘病毒科流感病毒屬A型流感病毒成員。AIV基因組由8個節(jié)段的單股負鏈RNA組成,編碼10種病毒功能蛋白。病毒第7節(jié)段RNA轉(zhuǎn)錄過程中,經(jīng)剪接、編輯合成兩條不同的mRNA,翻譯合成M 1和M 2基質(zhì)蛋白。M 1是病毒的主要結(jié)構(gòu)蛋白由252個氨基酸殘基組成,分子量約26 ku,占病毒蛋白總量的30%~40%。該蛋白具有型特異性,其抗原性差異是流感病毒分型的依據(jù)之一。M 1在病毒復制中還具有重要的調(diào)節(jié)功能[2],如控制病毒的轉(zhuǎn)錄和被感染細胞的胞核胞漿之間的物質(zhì)運輸[3]。研究表明8位~89位、80位~109位、129位~164位氨基酸區(qū)域至少各存在一個B細胞表位,89位~141位氨基酸區(qū)域內(nèi)至少存在2個B細胞表位,存在2個RNA結(jié)合位點[4],羧基端238QAYQKRMGVQMQRFK252肽構(gòu)成 CD4+T細胞表位[5],58位~66位(58GILGFVFTL66)氨基酸構(gòu)成 CD+8細胞毒性 T細胞表位[6],63位~70位(63FVFTLTVPS70)氨基酸構(gòu)成CD+4 T細胞表位[7]。

      本實驗室前期進行了AIV M1、N1和N2基因克隆、表達,獲得具有良好抗原性的表達產(chǎn)物[8-10];并應(yīng)用噬菌體展示隨機12肽庫,確定了AIV M1蛋白222位~230位氨基酸(222HPNSSARLR230)構(gòu)成一個型特異性表位[11]。在此基礎(chǔ)上,本研究采用針對AIV的M 1蛋白型特異性單克隆抗體(MAb),淘選M 13噬菌體展示的7肽隨機肽庫,獲得與MAb特異性結(jié)合的噬菌體擬位,比對分析噬菌體擬位的共有序列,在病毒M 1蛋白中鑒定相同(似)區(qū)域,結(jié)合不同噬菌體擬位與MAb的免疫反應(yīng)性分析結(jié)果,進一步進行M 1蛋白表(擬)位分析。

      1 材料和方法

      1.1 MAb、噬菌體展示隨機肽庫及主要試劑 AIV M1 MAb、陰性抗體、M 1重組蛋白由有本實驗室制備[11]。新城疫病毒(NDV)、H5N1、H9N2 AIV抗原購自哈爾濱獸醫(yī)研究所。包被重組蛋白G的磁性珠、噬菌體展示的7肽隨機肽庫(Ph.D.-7TMPhage Display Peptide Library)購自美國 Beverly New England生物實驗室;辣根過氧化物酶標記的鼠抗M 13抗體(HRP-IgG)購自Amersham-Pharmacia公司;PCR產(chǎn)物純化試劑盒購自上海華舜生物工程有限公司;OPD底物購自Sigma公司。

      1.2 肽庫庫容量滴定及評價 用TBS將待滴定肽庫作10-1~10-12稀釋,取100μL稀釋液與100μL處于對數(shù)生長期的ER2738E.coli懸液混合,室溫孵育20 min,加至3 ML 42℃的Agarose Top(頂層瓊脂糖營養(yǎng)液),立即涂布LB/Agar/Tet/X-gal/IPTG平板,37℃過夜培養(yǎng),滴定噬菌體蝕斑形成單位(PFU),計算噬菌體濃度。隨機挑選20個藍色的蝕斑對其攜帶的插入序列進行測序,評價7肽插入序列的隨機性和肽庫的庫容量。

      1.3 生物淘選 參照試劑盒說明及參考文獻[9]的方法,將5μLM 1MAb、30μL噬菌體肽庫(約含9×1010PFU)及165μL含有2%脫脂奶粉的TBS(pH7.5)混合,室溫震蕩孵育30min,與蛋白G包被磁性珠混合,室溫震蕩孵育20m in,緩沖液洗滌,用100μL 0.2 mol/L HCl(pH2.2)溶液(含 1 mg/mL BSA)洗脫結(jié)合于磁性珠上的噬菌體,并迅速中和至中性。對每一輪淘選獲得的洗脫液,除少量稀釋后按1.2方法涂布平板,其余用ER2738增殖,純化,進行下一輪淘選。第二輪和第三輪分別使用2μL和1μL M1 MAb,以增強淘選的特異性。經(jīng)3輪“淘選-擴增-淘選”,可以富集與抗體特異性結(jié)合的噬菌體。

      1.4 ELISA 在第3輪淘選后涂布的平板上分別隨機挑選48個藍色噬菌體蝕斑,增殖培養(yǎng)后,以MAb及陰性對照鼠源抗體為包被抗體或捕捉抗體,以鼠抗M 13 HRP-IgG為檢測抗體,OPD為底物,進行ELISA檢測。當樣品針對M 1 MAb的OD490nm值與針對陰性抗體的OD490nm值存在2倍或2倍以上差異時,判為陽性。

      1.5 外源插入多肽序列分析 根據(jù)野生型噬菌體p III基因(ZY40350)中對所有fd-tet衍生載體均保守的區(qū)域,設(shè)計引物FUSE-U:5'-GCAAGCTGATAAA CCGATAC-3', FUSE-D: 5'-CCATGTACCGTAACA CTGAG-3',經(jīng)PCR擴增包含外源插入多肽序列(7肽編碼序列)的基因片段(約330 bp),產(chǎn)物純化后,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進行測序。采用DNAMAN Version 5.2.2軟件進行序列比對,分析7肽序列中的共有序列。

      1.6 競爭性ELISA 以MAb為包被抗體,天然病毒抗原為競爭劑或阻斷劑,抗M 13 HRP-IgG抗體為檢測抗體,OPD為底物,對噬菌體擬位進行競爭性ELISA分析。檢測OD490nm值。按以下公式計算:抑制率(%)=(OD490nm緩沖液對照-OD490nm試驗)/OD490nm緩沖液對照×100%。設(shè)置陽性、陰性及空白對照。

      2 結(jié)果

      2.1 噬菌體展示隨機肽庫的庫容量評價 肽庫噬菌體濃度為8×1011pfu/mL。隨機挑選20個克隆的序列比對分析結(jié)果顯示,20個噬菌體克隆中有兩個無插入序列,其余18個克隆展示的7肽序列各不相同,并且無相同(相似或共有)序列。

      2.2 M1 MAb淘選獲得噬菌體克隆的ELISA分析

      M 1 MAb第3輪淘選獲得的噬菌體洗脫液,經(jīng)稀釋涂布培養(yǎng)后,隨機挑選96個蝕斑增殖培養(yǎng),經(jīng)ELISA檢測與MAb發(fā)生特異性結(jié)合的噬菌體克隆,結(jié)果78個噬菌體克隆為陽性(圖1)。

      圖1 單克隆抗體淘選后噬菌體克隆ELISA分析Fig.1 ELISA analysis of phage clones after panning by MAb

      2.3 陽性噬菌體克隆外源插入序列的PCR擴增挑選20個陽性噬菌體克隆,經(jīng)PCR擴增包含外源插入序列(7肽編碼序列)的基因片段,分別獲得大小約330 bp的擴增產(chǎn)物(圖2)。

      圖2 陽性噬菌體克隆插入序列PCR擴增Fig.2 PCR amplification of insert sequence from positive phage clones

      2.4 陽性噬菌體克隆展示的7肽序列比對分析PCR產(chǎn)物純化后測序,根據(jù)獲得的核苷酸序列推導7肽氨基酸序列,20個陽性克隆展示的7肽氨基酸序列比對結(jié)果表明,10個克隆含有MDRxL序列(10/20),其中有5個克隆序列完全相同,均為KVMDRWL;有6個克隆序列含有HPR序列(6/20);2個克隆含有PR序列。1個克隆含有MRxL序列,1個克隆無共有序列序列(表1)。在M 1蛋白氨基酸序列中查找,顯示M 1蛋白93位~95位氨基酸序列為MDR,99位氨基酸序列為L,222位~223位氨基酸序列為HP,230位氨基酸序列為R,分別與獲得MAb識別的共有序列MDRxL或HPR相似。

      表1 淘選后噬菌體展示的7肽序列比對分析Table 1 Alignment of peptide sequences displayed by phage after panning

      2.5 競爭性ELISA檢測 以M 1 MAb為包被抗體,AIV H5N1、H9N2及NDV抗原為競爭劑或阻斷劑,HRP標記的抗M 13抗體為檢測抗體,OPD為底物,對噬菌體擬位(KVMDRWL或LTHPRFH)進行競爭性ELISA分析,同時設(shè)緩沖液空白對照。結(jié)果表明,在緩沖液空白對照成立的前提下,噬菌體擬位(KVMDRWL或 LTHPRFH)與 M1 MAb間的結(jié)合,能夠被H5N1、H9N2病毒抗原特異性抑制或阻斷(H5N1病毒抗原阻斷效率高于H9N2病毒抗原的阻斷效率),抑制率隨病毒抗原濃度降低而降低,而不能被NDV抗原抑制或阻斷(圖3和圖4)。

      圖3 噬菌體擬位(KVMDRWL)競爭性ELISA分析Fig.3 Analysis of phagemimotope(KVMDRWL)by competitive ELSIA

      圖4 噬菌體擬位(LTHPRFH)競爭性ELISA分析Fig.4 Analysis of phagem imotope(LTHPRFH)by competitive ELSIA

      3 討論

      基于病毒與MAb免疫反應(yīng)性差異,篩選或構(gòu)建病毒MAb逃逸株,分析其基因序列差異,以此間接推測抗原表位分布區(qū)域及構(gòu)成表位的關(guān)鍵性氨基酸殘基,對高變異性病毒(如AI),難以獲得表位精確定位結(jié)果[9]。采用分子生物學軟件預測病毒蛋白可能的表位區(qū)域,需要進一步研究確證。采用噬菌體肽庫進行病毒表位分析,可以獲得表位及其關(guān)鍵性氨基酸準確定位結(jié)果[12-13]。

      采用針對M 1蛋白的流感病毒型特異性MAb淘選獲得共有序列MDRxL,與M 1蛋白93位~99位(93MDRAVKL99)氨基酸序列結(jié)構(gòu)基本一致。經(jīng)ELISA、競爭性ELISA分析,攜帶MDRxL基序的噬菌體能夠與MAb發(fā)生特異性結(jié)合,并且其結(jié)合能夠被天然病毒抗原特異性抑制或阻斷,表明MDRxL序列及其側(cè)翼序列真實模擬病毒蛋白上與MAb結(jié)合的抗原決定簇或表位的結(jié)構(gòu)和功能,研究提示M 1蛋白93位~99位(93MDRAVKL99)氨基酸區(qū)域構(gòu)成AIV型特異性表位,93位、94位、95位和99位是構(gòu)成表位的關(guān)鍵性氨基酸位點。

      淘選獲得第二個共有序列HPR,與本實驗室先前應(yīng)用噬菌體展示隨機12肽庫將AIVM 1蛋白型特異表位定位于222位~230位氨基酸(222HPNSSARLR230)的結(jié)果一致。一般認為一個MAb針對一個病原表位,本研究使用的AIV型特異性MAb能夠與模擬M 1蛋白93位~99位和222位~230位區(qū)域的7肽特異結(jié)合,可能表明本研究使用的MAb需要進一步克隆純化。下一步將應(yīng)用基因分段、截短或連續(xù)缺失表達技術(shù)和合成多肽進行表位精細定位,研究表位抗原性差異的分子基礎(chǔ)。

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