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      尿素-SDS-PAGE測(cè)定小分子多肽相對(duì)分子質(zhì)量方法的建立

      2013-05-03 10:15:48王麗榮程福亮
      飼料博覽 2013年9期
      關(guān)鍵詞:超純水遷移率丙烯酰胺

      王麗榮,程福亮,陳 雷,谷 巍

      (山東寶來(lái)利來(lái)生物工程股份有限公司,山東 泰安 271000)

      蛋白質(zhì)的生化分析和基因表達(dá)產(chǎn)物的分離純化中,難免會(huì)需要分離某種或某些小分子蛋白質(zhì)成分。近年來(lái),用電泳法測(cè)定小分子多肽分子量的研究報(bào)道較少。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDSPAGE)方法用作蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量測(cè)定的技術(shù)最早由Shapiro等于20世紀(jì)60年代建立,隨后Weber等進(jìn)行了改進(jìn),顯示出了該方法在分離鑒定和純化蛋白質(zhì)方面的優(yōu)越性。隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展和基因工程藥物的大量涌現(xiàn),具有高生物活性小分子多肽的分離、純化和鑒定已顯得尤為突出,而小分子多肽相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定,目前多采用Tricine-SDS-PAGE系統(tǒng),但系統(tǒng)中的Tricine價(jià)格昂貴,電泳時(shí)間較長(zhǎng),且由于小分子多肽相對(duì)分子質(zhì)量小,易受電泳緩沖系統(tǒng)、凝膠濃度、電泳時(shí)間、染色和脫色等的影響,極易引起條帶擴(kuò)散、不易著色,使分辨率降低,因而直接影響多肽相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定[1-2]?,F(xiàn)有多肽相對(duì)分子質(zhì)量的3層膠電泳測(cè)定方法操作復(fù)雜。張曉楠等采用尿素SDS-PAGE法快速測(cè)定相對(duì)分子質(zhì)量為2 500~17 000的多肽[3]。石繼紅等也分別對(duì)小分子肽類進(jìn)行測(cè)定[4]。

      轉(zhuǎn)移因子(TF)屬于淋巴因子,可特異或非特異性地調(diào)節(jié)機(jī)體免疫狀態(tài)、增強(qiáng)其細(xì)胞免疫和骨髓造血功能,已在臨床應(yīng)用多年,在原發(fā)性免疫缺陷病或慢性病毒感染疾病中作為免疫治療藥物作用,目前已得到肯定,特別是對(duì)病毒性上呼吸道感染治療取得良好效果[5]。主要成分為小分子多肽和核苷酸,為免疫調(diào)節(jié)劑。本研究根據(jù)小分子多肽條帶分辨率高、操作簡(jiǎn)便、分析時(shí)間少、低成本等原則,改進(jìn)低相對(duì)分子質(zhì)量蛋白——轉(zhuǎn)移因子的尿素-SDS-PAGE方法,并為小分子多肽相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定提供有效方法。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      垂直電泳儀及其配件、Power PAC200穩(wěn)壓穩(wěn)流電源由Bio-Rad公司生產(chǎn);GDS28000凝膠圖像處理系統(tǒng)由英國(guó)UVP公司生產(chǎn)。低分子量蛋白Marker購(gòu)自北京天恩澤基因科技有限公司;小分子多肽樣品由山東寶來(lái)利來(lái)生物工程股份有限公司研究院保存。

      1.2 試劑及配制

      30%丙烯酰胺:稱取丙烯酰胺29 g和N,N'-亞甲雙丙烯酰胺1 g溶于超純水80mL中,定容至100 mL。0.45μm濾膜過(guò)濾后,測(cè)定pH。10%SDS:稱取SDS 10 g溶于超純水80mL中,定容至100 mL。1.5 mol·L-1Tris-CL:稱取 Tris-Base 18.171 g溶于超純水80mL中,用濃鹽酸調(diào)整pH至8.8,定容至 100 mL。0.5 mol·L-1Tris-CL:稱取Tris-Base 6.057 g溶于超純水80mL中,用濃鹽酸調(diào)整pH至6.8,定容至100mL。10%APS:稱取過(guò)硫酸銨2.282 g溶于超純水8 mL中,定容至10mL。Running Buffer:稱取 Tris-Base 3.03 g, Glycine 18.8 g, SDS 5 g溶解,定容至1 000mL。1×SDS上樣緩沖液: 0.05mol·L-1Tris-HCL,100mM β-巰基乙醇,2%(m/V)SDS,0.1%(m/V)溴酚藍(lán),10%(V/V)甘油。染色液:0.1%(m/V)考馬斯亮藍(lán)R-250,25%(V/V)甘油,10%(V/V)冰醋酸。脫色液:10%(V/V)醋酸,5%(V/V)乙醇量取醋酸100mL、乙醇50mL溶于超純水800mL中,定容至1 000mL。

      1.3 試驗(yàn)方法

      1.3.1 試驗(yàn)準(zhǔn)備及樣品處理

      用自來(lái)水清洗燒杯、電泳儀及其配件,蒸餾水沖洗干凈,晾干備用,玻璃板先用自來(lái)水清洗,擦干,酒精棉球擦干,自然晾干備用。

      1.3.2 配膠

      15%分離膠和5%濃縮膠的配制方法見表1。

      表1 尿素-SDS-PAGE法制膠配方

      5%分離膠:在燒杯中依次加入超純水2.3mL、30%丙烯酰胺5 mL、1.5 mol·L-1Tris-CL 2.5 mL、10%SDS 0.1 mL、10%APS 0.1 mL、TEMED 0.004 mL,加入TEMED混合均勻后,立即用吸管加入膠板中(倒膠時(shí),以梳子齒端為參照,預(yù)留1 cm濃縮膠空間),膠上加滿蒸餾水封閉,以防蒸發(fā),分離膠室溫約30min即可完全凝固。5%濃縮膠:燒杯中依次加入合適量的超純水2.1mL、30%丙烯酰胺0.5 mL、0.5 mol·L-1Tris-CL 0.38 mL、10%SDS 0.03 mL、10%APS 0.03mL,先將分離膠上的超純水倒掉,并用濾紙小心吸干殘留水分,再將TEMED 0.003mL加入燒杯中,混合均勻立即用移液槍滴加到分離膠上,插入合適的梳子,積層膠約20min可完全凝固。

      1.3.3 加樣

      小心拔掉梳子,組裝好電泳儀。然后倒入1×Running Buffer。將蛋白Marker和處理好的樣品按順序加入膠孔,并做好記錄。

      1.3.4 跑膠

      加樣完畢即可跑膠,可固定電壓進(jìn)行跑膠。Bio-Rad電泳儀可固定在200V,君意電泳儀固定在150V,當(dāng)染帶剛剛跑出膠板時(shí),跑膠完成。

      1.3.5 卸膠

      小心拆卸膠板,用分離器小心將兩層玻璃板分離,切去積層膠。

      1.3.6 染色

      將分離膠放于染色盒中,倒入染色液20mL,放在搖床上慢慢搖動(dòng)。染色20min即可。

      1.3.7 脫色

      將分離膠取出,放于脫色盒,倒入脫色液30 mL,放在搖床上慢慢搖動(dòng)過(guò)夜,或隨時(shí)觀察,直至分離膠除有蛋白的地方為藍(lán)色其余部分變?yōu)闊o(wú)色即可。

      1.3.8 小分子多肽樣品中蛋白遷移率的測(cè)定及其相對(duì)分子質(zhì)量的計(jì)算

      用倍率計(jì)讀出照片上各樣品色帶中心與溴酚藍(lán)前沿的距離,按標(biāo)記變化比率換算出實(shí)際尺寸進(jìn)行計(jì)算。電泳遷移率為Rf,即樣品遷移距離與溴酚藍(lán)遷移距離的比值。以標(biāo)準(zhǔn)組多肽的遷移率為橫坐標(biāo),以其對(duì)應(yīng)的相對(duì)分子質(zhì)量對(duì)數(shù)為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。然后根據(jù)未知樣品的遷移率在曲線上查出其對(duì)應(yīng)的相對(duì)分子質(zhì)量。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 小分子多肽樣品的尿素-SDS-PAGE結(jié)果

      小分子多肽樣品的尿素-SDS-PAGE結(jié)果見圖1。

      圖1 小分子多肽的尿素-SDS-PAGE蛋白電泳結(jié)果

      由圖1可知,小分子蛋白樣品中蛋白濃度較高,SDS-PAGE電泳結(jié)果顯示,蛋白相對(duì)分子質(zhì)量<14.4 kD,樣品純度較高,無(wú)其他蛋白雜帶,陰性對(duì)照無(wú)特定條帶。

      2.2 不同稀釋濃度小分子多肽樣品的尿素-SDSPAGE結(jié)果

      不同稀釋濃度小分子多肽樣品的尿素-SDSPAGE結(jié)果見圖2。

      圖2 小分子多肽樣品不同稀釋濃度的尿素-SDS-PAGE結(jié)果

      通過(guò)10倍稀釋小分子多肽樣品,進(jìn)行尿素-SDS-PAGE電泳,圖2顯示獲得了較好的結(jié)果,A1~A5小分子蛋白樣品濃度逐漸降低,呈現(xiàn)較好的規(guī)律變化。

      2.3 尿素-SDS-PAGE中蛋白條帶遷移率及分子量標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制

      尿素-SDS-PAGE中蛋白條帶遷移率及相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制見表2。

      表2 尿素-SDS-PAGE中蛋白條帶遷移率的測(cè)定

      由表2中的數(shù)據(jù)繪制完成可進(jìn)行測(cè)定小分子蛋白相對(duì)分子質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)曲線,見圖3,其中相關(guān)系數(shù)R2>0.99,表明建立的標(biāo)準(zhǔn)曲線可以用來(lái)測(cè)定小分子多肽的相對(duì)分子質(zhì)量。

      圖3 標(biāo)準(zhǔn)曲線

      2.4 小分子多肽樣品中蛋白遷移率的測(cè)定及其相對(duì)分子質(zhì)量的計(jì)算

      測(cè)定尿素-SDS-PAGE電泳中小分子多肽樣品的遷移率為23.5,將此數(shù)值帶入到相對(duì)分子質(zhì)量測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)曲線方程中,計(jì)算得到待測(cè)小分子多肽樣品的相對(duì)分子質(zhì)量為9.212 977 277 kD。

      3 討論

      隨著生物活性多肽物質(zhì)的發(fā)現(xiàn)和多肽類藥物的研制,小分子多肽電泳已成為生物活性物質(zhì)純化分析過(guò)程中經(jīng)常使用的快速鑒定方法。凝膠電泳操作簡(jiǎn)單、分辨率高,廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定。蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定通常采用非連續(xù)的SDS-PAGE緩沖系統(tǒng),緩沖液采用Tris-HCl;而多肽相對(duì)分子質(zhì)量的測(cè)定采用Tris-Tricine緩沖液,可使小相對(duì)分子質(zhì)量多肽在濃縮膠中有效地濃縮,從而提高分辨率。SDSPAGE的有效分離范圍取決于聚丙烯酰胺的濃度和交聯(lián)度,其孔徑隨著雙丙烯酰胺與丙烯酰胺比值的增加而減小,相對(duì)分子質(zhì)量<10 000的小分子肽,即使用較高濃度的聚丙烯酰胺凝膠的SDSPAGE也不能完全分離。本研究建立的雙層膠尿素-SDS-PAGE測(cè)定小分子多肽相對(duì)分子質(zhì)量的方法操作簡(jiǎn)便,將常規(guī)的3層膠改為2層膠(分離膠和濃縮膠),濃縮膠與分離膠采用同一緩沖體系,簡(jiǎn)化操作步驟,減少由于凝膠制備而引起的諸多影響電泳的因素;分辨率高,將3層膠改為2層膠后,分離膠的有效長(zhǎng)度增加,可使單位凝膠長(zhǎng)度下容納的電泳條帶數(shù)增加,從而使分辨率提高;成本低,替代了昂貴的Tris-Tricine緩沖系統(tǒng),電極緩沖液可以重復(fù)利用;電泳時(shí)間短,由原來(lái)5~6 h縮短為2.5 h,達(dá)到了快速檢測(cè)的目的。

      本試驗(yàn)用含6mol·L-1尿素的SDS-PAGE方法,不需銀染而直接用考馬斯亮藍(lán)R2250染色1.5~2 h,即可把標(biāo)準(zhǔn)品中的條帶顯示清楚,且簡(jiǎn)單方便,試驗(yàn)范圍內(nèi)多肽相對(duì)分子質(zhì)量的對(duì)數(shù)與遷移率呈良好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.993 8。該方法的建立為小分子多肽分子量的估算提供了一種較好方法。

      [1]鄒毅,祝沛平,趙曉麗,等.用一種改進(jìn)的電泳方法測(cè)定抗凍蛋白的分子量[J].生物技術(shù),1999,9(4):37-40.

      [2]楊聯(lián)萍,孔祥平,易學(xué)瑞.SDS-PAGE電泳對(duì)小分子多肽的分析[J].生物工程進(jìn)展,1998,18(6):48-50.

      [3]張曉楠,張延鳳,曹云新,等.尿素-SDS-PAGE快速測(cè)定多肽的相對(duì)分子質(zhì)量[J].細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志,2001,17(1):87-97.

      [4]石繼紅,趙永同,王俊樓,等.SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分析小分子多肽[J].第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào),2000,21(6):761-763.

      [5]馮來(lái)坤,黃超美,楊洪群,等.轉(zhuǎn)移因子口服給藥國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展[J].中國(guó)生化藥物雜志,1999,20(5):265-267.

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