張 艷,來茂德,朱益民 綜述
(浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院1.流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)系;2.病理學(xué)與病理生理學(xué)系,浙江杭州 310058)
結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是最常見的惡性腫瘤之一,全球結(jié)直腸癌患病人數(shù)估計有280萬,每年新增病例超過100萬,發(fā)病率居于惡性腫瘤第三,死亡率處于第四位[1]。我國隨著飲食結(jié)構(gòu)和生活方式的改變,結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率呈不斷上升趨勢,2007年結(jié)直腸癌的發(fā)病率居惡性腫瘤第三位,死亡率居于第五[2]。結(jié)直腸癌已經(jīng)嚴重威脅到居民的健康生活,并成為我國的社會負擔。因此進一步研究結(jié)直腸癌的發(fā)病機制,降低結(jié)直腸癌的死亡率顯得尤為重要。
結(jié)直腸癌是由環(huán)境和遺傳因素共同起作用的結(jié)果,其中遺傳因素在結(jié)直腸癌的發(fā)病中起重要的作用。研究發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌在一級親屬的發(fā)病率是普通人群的2到3倍,基于雙生子研究發(fā)現(xiàn),大約35%結(jié)直腸癌的發(fā)生與遺傳易感性有關(guān)[3]。經(jīng)過多年的研究已發(fā)現(xiàn)了許多易感基因,然而,很多潛在的結(jié)直腸癌易感基因仍然沒有被發(fā)現(xiàn)。近十年來,家系連鎖分析已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些引起孟德爾疾病(如家族性腺瘤性息肉病)的罕見高?;颍?]。但是,連鎖分析的關(guān)鍵是遺傳因素完全或幾乎完全決定疾病的發(fā)生,致病基因具有很高的外顯率等。而結(jié)直腸癌作為復(fù)雜疾病被認為是受到多種基因的影響,每種基因的效應(yīng)微弱,因此連鎖分析在研究結(jié)直腸癌致病基因方面作用有限。比較大規(guī)模病例和對照人群之間某個基因型頻率差異的關(guān)聯(lián)研究被認為更適合用來識別復(fù)雜疾病(包括結(jié)直腸癌)的易感位點。全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)是利用高通量的基因芯片技術(shù),主要對個體中數(shù)以百萬計的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進行檢測研究,在全基因組的水平上、在大樣本人群中進行病例對照關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的陽性位點,然后將此陽性位點在獨立的樣本中進行驗證,從而發(fā)現(xiàn)影響復(fù)雜性疾病發(fā)生的遺傳易感變異[5]。迄今為止,利用GWAS已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些與結(jié)直腸癌相關(guān)聯(lián)的疾病易感位點和區(qū)域,為進一步研究結(jié)直腸癌的遺傳機制,有必要對結(jié)直腸癌GWAS研究進展作一綜述。
從2007年開始許多國家對結(jié)直腸癌開展了多項GWAS,在結(jié)直腸癌遺傳學(xué)研究方面取得了一定的進展,發(fā)現(xiàn)了一些與之相關(guān)的易感位點與區(qū)域(表1)。
1.1 歐美人群的結(jié)直腸癌GWAS
1.1.1 結(jié)直腸癌遺傳性(colorectal cancer genetics,COGENT)研究 COGENT研究小組在英格蘭、蘇格蘭、加拿大人群中通過多中心大規(guī)模樣本的重復(fù)驗證,先后發(fā)現(xiàn)了11個結(jié)直腸癌的易感位點:rs6983267(8q24)[6]、rs10505477(8q24)[7]、rs719725(9p24)[7]、rs4939827(SMAD7)[8,11]、 rs4779584 (GREM1)[9]、rs16892766 (EIF3H )[10]、 rs10795668(10p14)[10]、rs3802842(11q23)[11]、rs7014346(8q24)[11]、rs1957636(BMP4)[16]、rs4813802(BMP2)[16]。這些位點效應(yīng)都較弱,OR 值大部分在1.10~1.30之間。為了發(fā)現(xiàn)效應(yīng)更小的易感位點,對英國人群的GWAS數(shù)據(jù)進行Meta分析,以及病例對照的驗證,發(fā)現(xiàn)了另外8個新的易感位點:rs10411210(RHPN2)、rs4444235(BMP4)、 rs961253(BMP2)、rs9929218(CDH1)[12]、rs10936599(3q26.2)、rs11169552(12q13.13)、rs4925386(20q13.33)、rs6691170(1q41)[14]。然而,這些位點效應(yīng)更弱,OR值在1.10左右。
1.1.2 歐洲其他人群研究 Lascorz[13]等2010年對德國371家族性結(jié)直腸癌病例和1263例對照進行GWAS分析,經(jīng)過4個獨立的病例對照研究驗證,新發(fā)現(xiàn)了rs12701937(GLI3/INHBA)在顯性模型中與結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險存在關(guān)聯(lián)(OR=1.14),且此關(guān)聯(lián)在家族性結(jié)直腸癌病例中的效應(yīng)更強(OR=1.36)。另外,GWAS篩選出的不同位點已成功地在不同歐美人群中得到驗證,如rs16892766[17]、rs6983267[18-22]、rs10505477[7]、rs3802842[17,21,23]、rs4444235[24]、rs4779584[21]和 rs4939827[18,25]。
1.2 亞洲人群的結(jié)直腸癌GWAS 2011年,Cui[15]等首次報道了在亞洲人群的結(jié)直腸癌GWAS結(jié)果。該小組在6q26~q27區(qū)域發(fā)現(xiàn)了新位點,SLC22A3基因上的rs7758229與遠端結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險存在顯著關(guān)聯(lián)(P=7.92×10-9)。該研究結(jié)果提示,在歐洲和亞洲人群之間結(jié)直腸的發(fā)病機制存在一定的種族差異。
1.3 結(jié)直腸癌易感位點在非洲黑人人群的重復(fù)驗證研究 結(jié)直腸癌的GWAS在非洲人群中尚未進行,但是He[21]等在一個多種人群中對11個GWAS發(fā)現(xiàn)的結(jié)直腸癌易感位點進行重復(fù)驗證研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在美國黑人中rs6983267(8q24)和rs961253(20p12)與結(jié)直腸癌/腺癌存在顯著關(guān)聯(lián)。
表1 結(jié)直腸癌GWAS篩選出的SNP標志Table 1 Loci associated with colorectal cancer risk from GWAS
總之,GWAS發(fā)現(xiàn)的與結(jié)直腸癌有關(guān)的易感位點效應(yīng)都較弱,OR值大部分都在1.10~1.20之間。所有位點均位于非編碼內(nèi)含子區(qū)域,一些缺乏編碼序列或是轉(zhuǎn)錄活性的區(qū)域稱為基因沙漠[26]。比如最早發(fā)現(xiàn)與結(jié)直腸癌有關(guān)的易感位點rs6983267[6-7]位于距離最近的基因330 kb之外的基因沙漠區(qū)。另外,在已報道的易感位點中有5個位點標記的連鎖不平衡區(qū)塊包含或鄰近轉(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)超家族信號通路中的基因,它們是SMAD7[12,16]、GREM1[9]、骨形成蛋白 BMP2 和 BMP4 以及RHPN2[14,20]。眾所周知,TGF-β 超家族蛋白與細胞的增殖、分化和遷移有關(guān),提示TGF-β超家族在結(jié)直腸癌中有一定的作用[27],這也說明雖然這些易感位點對結(jié)直腸癌的效應(yīng)較小,但是它們的功能效應(yīng)可能很大。還有3個易感位點位于或鄰近某基因,分別為 rs7758229(SLC22A3)、rs16892766(EIF3H)和 rs9929218(CDH1)。SLC22A3是有機陽離子轉(zhuǎn)運家族的一員,該家族在轉(zhuǎn)運陽離子藥物、毒物和內(nèi)源性代謝物中起關(guān)鍵的作用[15],而許多毒物或內(nèi)源性代謝物能引起腫瘤的形成;EIF3H調(diào)節(jié)細胞的生長和發(fā)育[10],然而在 1q41、3q26.2、8q24、9p24、10p14、11q23、12q13.13 和 20q13.33 上的位點都位于沒有已知生物學(xué)關(guān)聯(lián)的基質(zhì)間隔區(qū),所在區(qū)域都沒有明顯的候選基因。因此,仍然需要大量的研究探尋這些關(guān)聯(lián)的生物學(xué)機制。
2.1 結(jié)直腸癌GWAS的優(yōu)點 GWAS是一種具有高通量、高保真度、無假設(shè)的分析方法,對于結(jié)直腸癌這類復(fù)雜疾病的研究中,具有很大的優(yōu)勢。之前的研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些已知基因的高外顯性,種系突變只能用于解釋小于5%的結(jié)直腸癌病例[28],剩余的遺傳變異則歸功于大量常見的、遺傳效應(yīng)很弱的易感位點。相較于候選基因法和連鎖分析,GWAS通過對全基因組進行掃描比較大規(guī)模病例和對照人群之間某個基因型頻率差異,不需要先有候選基因,再分析基因與遺傳標志的變異,可以發(fā)現(xiàn)大量的常見變異,以及一些對結(jié)直腸癌遺傳效應(yīng)極小的遺傳變異,甚至能發(fā)現(xiàn)未知的基因。另外,大樣本量的采用、多階段的重復(fù)驗證以及強大的統(tǒng)計分析方法極大地提高了檢出結(jié)直腸癌相關(guān)易感位點的效能。
另外,相對于一般GWAS選擇少量的峰值位點進行后期驗證,雖然降低了假陽性率,但也掩蓋了許多其他易感位點,提高了假陰性率。目前幾例結(jié)直腸癌GWAS為了發(fā)現(xiàn)更多的易感位點,通過擴大驗證位點的數(shù)量,降低檢驗水平等手段,取得了不錯的成效[10-11]。
2.2 GWAS自身的局限性 同其他方法一樣,GWAS不可避免地會存在一些不足,由于GWAS自身的局限性,使得在結(jié)直腸癌遺傳易感性的研究中存在了一些問題。我們要正視GWAS存在的問題,采取合理的措施盡可能彌補這些不足,進一步優(yōu)化GWAS和后續(xù)的研究,發(fā)現(xiàn)更多的與結(jié)直腸癌致病機制相關(guān)的易感位點。
2.2.1 GWAS檢出的易感位點功能多不明確
盡管GWAS發(fā)現(xiàn)了許多與結(jié)直腸癌相關(guān)的易感位點,但是所有位點均位于非編碼區(qū),有的甚至遠離基因編碼區(qū),即使有的易感位點所在的連鎖不平衡區(qū)塊包含或鄰近某基因,但是這些基因?qū)Y(jié)直腸癌的具體功能也多不明確。因此需對這些區(qū)域進行重測序、精細作圖尋找其他關(guān)聯(lián)或致病位點,并對關(guān)聯(lián)或致病位點進行體內(nèi)外的功能驗證,最終把GWAS的研究結(jié)果與生物學(xué)研究聯(lián)系起來。
2.2.2 GWAS對低頻 SNPs檢出效能不夠
GWAS發(fā)現(xiàn)的結(jié)直腸癌相關(guān)變異均是常見變異(MAF平均值在0.39左右)。低頻變異(MAF<0.05)很難被檢出,針對這個問題,增加GWAS的樣本量是最直接的方法,但鑒于GWAS的巨大花費,現(xiàn)有的樣本量難以識別出這些低頻SNPs。Meta分析通過合并多個研究數(shù)據(jù)增加樣本量,提高統(tǒng)計效能,不僅有利于發(fā)現(xiàn)新的常見變異,也能發(fā)現(xiàn)一些遺傳效應(yīng)強的罕見變異[29]。通過充分利用一些信息,如數(shù)量性狀位點的表達分析等,候選基因法漸漸被認為是一種可以發(fā)現(xiàn)低頻變異的方法[16]。特定區(qū)域的重測序和精細作圖以及全基因組測序研究也可能發(fā)現(xiàn)一些罕見變異[30]。
2.2.3 GWAS對遺傳變異的研究主要集中在SNPs 目前結(jié)直腸癌GWAS研究的主要對象為SNPs,對于其他的變異研究較少,如拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs),小片段的缺失,串聯(lián)重復(fù)序列和其他結(jié)構(gòu)的變異等。有研究發(fā)現(xiàn),位于3q26的CNV區(qū)域可能與APC基因突變陰性的家族性結(jié)直腸癌發(fā)病有關(guān)[31],這也提示CNVs可能是另一結(jié)直腸癌的易感變異。一項基因表達變異研究發(fā)現(xiàn),SNPs和CNVs分別與83%和18%的基因表達變異有關(guān)[32],相較于 SNPs我們對 CNVs的了解還很不全面,有可能低估CNVs的作用。隨著千人基因組計劃的推進,有望使人類基因組CNVs的圖譜更加清晰;隨著檢測分析技術(shù)的不斷發(fā)展,有望為闡明CNVs在結(jié)直腸癌遺傳機制中的作用提供平臺[33],在結(jié)直腸癌GWAS中加入CNVs的檢測,有利于進一步解釋結(jié)直腸的遺傳易感機制。
2.2.4 GWAS 忽略或淡化了基因-基因和基因-環(huán)境的交互作用 目前結(jié)直腸癌GWAS更多關(guān)注的仍是遺傳因素對結(jié)直腸癌的影響,許多研究者簡化了結(jié)直腸癌的發(fā)病機制的復(fù)雜性,把此主要歸結(jié)為多個易感位點或基因的影響,對基因-基因、基因-環(huán)境聯(lián)合作用研究的較少。將不同的暴露人群混合后尋找遺傳易感位點,由于暴露的混雜效應(yīng)會削弱發(fā)現(xiàn)關(guān)聯(lián)的能力,降低研究效能,從而導(dǎo)致大量的遺傳變異被掩蓋[34]。在一個移民及時間趨勢的研究中顯示環(huán)境因素對結(jié)直腸癌的發(fā)病有很強的作用[35]。所以在研究遺傳與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)時,應(yīng)關(guān)注遺傳-環(huán)境之間的交互作用。另外可以采用全基因組單倍體分析研究基因-基因作用與結(jié)直腸癌的關(guān)系。
2.3 結(jié)直腸癌GWAS的不足 在研究結(jié)直腸癌遺傳易感性的過程中,除了GWAS自身的局限性造成的問題外,針對結(jié)直腸癌這一特定病種還存在其他的不足之處。目前結(jié)直腸癌GWAS主要集中在歐美人群,只有一例在亞洲人群中進行,而且與結(jié)直腸癌相關(guān)的易感位點在其他種族的重復(fù)驗證研究也較少。由于不同種族間結(jié)直腸癌的發(fā)病率、遺傳變異的頻率、連鎖不平衡的模式存在很大的差別,因此與結(jié)直腸癌相關(guān)的易感位點可能也會不同。比如在亞洲人群中[15]發(fā)現(xiàn)SLC22A3基因上的rs7758229與遠端結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險存在顯著關(guān)聯(lián),而該位點在此前多個歐美人群中均未報道。另外GWAS發(fā)現(xiàn)的一些結(jié)直腸癌易感位點存在部位特異性:rs3802842(11q23.1)[11]、rs4939827(18q21.1)[11,18]和 rs6691170(1q41)[36]與直腸癌的發(fā)病風(fēng)險有關(guān),而與結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險增加無關(guān);在亞洲的 GWAS[15]中發(fā)現(xiàn),SLC22A3基因上的rs7758229只與遠端結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險存在顯著關(guān)聯(lián)。提示遺傳因素對直腸癌、遠端結(jié)腸癌、近端結(jié)腸癌的發(fā)病機制貢獻不同。因此在研究結(jié)直腸癌遺傳變異的過程中部位特異性的研究也是非常必要的,而目前的GWAS中相關(guān)的數(shù)據(jù)則很有限。針對這些問題,迫切需要更多亞洲和非洲人群的結(jié)直腸癌GWAS數(shù)據(jù),以及針對腫瘤不同部位、類型的研究。
3.1 結(jié)直腸癌GWAS的應(yīng)用
3.1.1 結(jié)直腸癌GWAS與公共衛(wèi)生 單個位點的檢測對結(jié)直腸癌的預(yù)測貢獻很小,攜帶遺傳易感位點個體與未攜帶者相比患結(jié)直腸癌的風(fēng)險也只是略有不同。但是通過GWAS對全基因組進行掃描,識別一連串與結(jié)直腸癌相關(guān)的易感位點,形成結(jié)直腸癌遺傳易感譜,通過檢測多個易感位點,根據(jù)多個位點的數(shù)據(jù)建立一個風(fēng)險預(yù)測模型,對結(jié)直腸癌進行預(yù)測分析,從而將易感人群從一般人群中篩選出來,這對結(jié)直腸癌的防治有積極的作用[34]。但是必須指出的是遺傳因素只是發(fā)病機制中一個重要的部分,并不是引起疾病的唯一原因,所以用于疾病預(yù)測的觀點目前只是屬于研究階段,并沒有想象的簡單,要真正地上升到公共健康這一層面還需要很大的努力。
3.1.2 結(jié)直腸癌GWAS與臨床應(yīng)用 結(jié)直腸癌患者中攜帶的易感位點不同,其腫瘤類型也可能不同,Lubbe等[36]在3146名結(jié)腸癌患者中對易感位點與腫瘤分型進行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)一些位點與特定的腫瘤類型顯著相關(guān),臨床上可根據(jù)患者易感位點不同采用不同的治療方法。Xing[37]等對GWAS識別出的易感基因進行了疾病預(yù)后的關(guān)聯(lián)研究,得出10p14上的rs10795668與結(jié)直腸癌的復(fù)發(fā)風(fēng)險率降低有關(guān)(HR=0.55,P=0.05),并提示該位點可能是作為識別化療后復(fù)發(fā)的標志物;另外,15q31上的rs4779584則與結(jié)直腸癌的生存率有關(guān),可用于疾病預(yù)后研究。
3.2 結(jié)直腸癌GWAS的展望 盡管GWAS發(fā)現(xiàn)的結(jié)直腸癌的易感位點和區(qū)域只是冰山一角,對于闡明結(jié)直腸癌的遺傳特性的作用似乎微乎其微,大部分發(fā)現(xiàn)的SNPs只能輕度地增加結(jié)直腸癌的風(fēng)險[38],但是結(jié)直腸癌GWAS的發(fā)現(xiàn)能夠促進基因組學(xué)中一些基礎(chǔ)研究(如功能學(xué)研究)的進行,進一步了解結(jié)直腸癌的易感機制,探討結(jié)直腸癌的發(fā)病機制。隨著技術(shù)的進步,GWAS的優(yōu)化,在未來可能會發(fā)現(xiàn)更多的新的基因、位點、通路,結(jié)合后續(xù)的功能研究,從而發(fā)現(xiàn)真正的結(jié)直腸癌的致病基因,把研究結(jié)果與實際應(yīng)用相結(jié)合,進而降低結(jié)直腸癌的人群患病率和死亡率。
[1]BOYLE P,LEVIN B.World cancer report 2008[M].Lyon:International Agency for Research on Cancer(IARC),2008:380-384.
[2]CHEN Wanqing,ZHANG Siwei,ZHENG Rongshou,et al(陳萬青,張思維,鄭榮壽,等).A report of cancer incidence and mortality from 38 cancer registries in China,2007 [J].China Cancer(中國腫瘤),2011,20(3):162-169.(in Chinese)
[3]LICHTENSTEIN P,HOLM N V,VERKASALO P K,et al.Environmental and heritable factors in the causation of cancer-analyses of cohorts of twins from Sweden,Denmark,and Finland [J].New England Journal of Medicine,2000,343(2):78-85.
[4]LE MARCHAND L.Genome-wide association studiesand colorectalcancer [J].Surgical Oncology Clinics of North America,2009,18(4):663-668.
[5]HARDY J,SINGLETON A.Genomewide association studies and human disease [J].New England Journal of Medicine,2009,360(17):1759-1768.
[6]TOMLINSON I,WEBB E,CARVAJALCARMONA L,et al.A genome-wide association scan of tag SNPs identifiesa susceptibilityvariantforcolorectal cancer at 8q24.21 [J].Nature Genetics,2007,39(8):984-988.
[7]ZANKE B W,GREENWOOD C M T,RANGREJ J,et al.Genome-wide association scan identifies a colorectal cancer susceptibility locus on chromosome 8q24 [J].Nature Genetics,2007,39(8):989-994.
[8]BRODERICK P, CARVAJALCARMONA L,PITTMAN A M,et al.A genome-wide association study showsthatcommon allelesofSMAD7 influence colorectalcancerrisk [J].Nature Genetics,2007,39(11):1315-1317.
[9]JAEGER E,WEBBE,HOWARTHK,etal.Common genetic variants at the CRAC1(HMPS)locus on chromosome 15q13.3 influence colorectal cancer risk [J].Nature Genetics,2008,40(1):26-28.
[10]TOMLINSON I P M, WEBB E,CARVAJALCARMONA L,et al.A genome-wide association study identifies colorectal cancer susceptibility loci on chromosomes 10p14 and 8q23.3 [J].Nature Genetics,2008,40(5):623-630.
[11]TENESA A,F(xiàn)ARRINGTON S M,PRENDERGAST J G D,etal.Genome-wideassociationscan identifies a colorectal cancer susceptibility locus on 11q23 and replicates risk loci at 8q24 and 18q21[J].Nature Genetics,2008,40(5):631-637.
[12]HOULSTON R S,WEBB E,BRODERICK P,et al.Meta-analysis ofgenome-wide association data identifies four new susceptibility loci for colorectal cancer[J].Nature Genetics,2008,40(12):1426-1435.
[13]LASCORZ J,F(xiàn)ORSTI A,CHEN B,et al.Genomewide association study for colorectal cancer identifies risk polymorphisms in German familial cases and implicates MAPK signalling pathways in disease susceptibility[J].Carcinogenesis,2010,31(9):1612-1619.
[14]HOULSTON R S,CHEADLE J,DOBBINS S E,et al.Meta-analysis of three genome-wide association studies identifies susceptibility loci for colorectal cancer at 1q41,3q26.2,12q13.13 and 20q13.33[J].Nature Genetics,2010,42(11):973-978.
[15]CUI R,OKADA Y,JAGN S G,et al.Common variant in 6q26-q27 is associated with distal colon cancer in an Asian population [J].Gut,2011,60(6):799-805.
[16]TOMLINSON I P M,CARVAJALCARMONA L,DOBBINS S E, et al.Multiple Common Susceptibility Variants near BMP Pathway Loci GREM1,BMP4,and BMP2 explain part of the missing heritability of colorectal cancer[J].Plos Genetics,2011,7(6):1-11.
[17]WIJNEN J T,BROHET R M,VAN EIJK R,et al.Chromosome 8q23.3 and 11q23.1 variants modify colorectal cancer risk in Lynch Syndrome[J].Gastroenterology,2009,136(1):131-137.
[18]CURTIN K,WEI Y L,GEORGE R,et al.Meta association ofcolorectalcancerconfirmsrisk allelesat8q24 and 18q21 [J].Cancer Epidemiology Biomarkers& Prevention,2009,18(2):616-621.
[19]YEAGER M,XIAO N Q,HAYES R B,et al.Comprehensive resequence analysis of a 136 kb region of human chromosome 8q24 associated with prostate and colon cancers [J].Human Genetics,2008,124(2):161-170.
[20]SCHAFMAYER C,BUCH S,VOELZKE H,et al.Investigation of the colorectal cancer susceptibility region on chromosome 8q24.21 in a large German case-control sample [J].International Journal of Cancer,2009,124(1):75-80.
[21]HE J,WILKENS L R,STRAM D O,et al.Generalizability and epidemiologic characterization of eleven colorectal cancer GWAS hits in multiple populations [J].Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention,2011,20(1):70-81.
[22]HAERIAN M S,BAUM L,HAERIAN B S.Association of 8q24.21 loci with the risk of colorectal cancer:a systematic review and metaanalysis[J].Journal of Gastroenterology and Hepatology,2011,26(10):1475-1484.
[23]PITTMAN A M,WEBB E,CARVAJALCARMONA L,et al.Refinement of the basis and impact of common 11q23.1 variation to the risk of developing colorectal cancer [J].Human Molecular Genetics,2008,17(23):3720-3727.
[24]LIJ,SUN C,YUAN Y R,etal.Bone morphogenetic protein-4 polymorphism and colorectal cancer risk:a meta analysis [J].Molecular Biology Reports,2012,39(5):5239-5251.
[25]PITTMAN A M,NARANJO S,WEBB E,et al.The colorectal cancer risk at 18q21 is caused by a novel variant altering SMAD7 expression [J].Genome Research,2009,19(6):987-993.
[26]GOEL A,BOLAND C R.Recent insights into the pathogenesis of colorectal cancer[J].Current Opinion in Gastroenterology,2010,26(1):47-52.
[27]TENESA A,DUNLOP M G.New insights into the aetiology of colorectal cancer from genome-wide association studies [J].Nature Reviews Genetics,2009,10(6):353-358.
[28]AALTONEN L,JOHNS L,JAERVINEN H,et al.Explaining the familialcolorectalcancerrisk associated with mismatch repair(MMR)-deficient and MMR-stable tumors[J].Clinical Cancer Research,2007,13(1):356-361.
[29]QUAN Sheng,ZHANG Xuejun(權(quán) 晟,張學(xué)軍).Research strategies for the next step of genome-wide association study[J].Hereditas(遺傳),2011,33(2):100-108.(in Chinese)
[30]CIRULLI E T,GOLDSTEIN D B.Uncovering the roles of rare variants in common disease through whole-genome sequencing [J].Nat Rev Genet,2010,11(6):415-425.
[31]THEAN L F,LOI C,HO K S,et al.Genome-wide scan identifies a copy number variable region at 3q26 that regulates PPM1L in APC mutationnegative familial colorectal cancer patients[J].Genes Chromosomes Cancer,2010,49(2):99-106.
[32]STRANGER B E,F(xiàn)ORREST M S,DUNNING M,et al.Relative impact of nucleotide and copy number variation on gene expression phenotypes[J].Science,2007,315(5813):848-853.
[33]XI Bo,MI Jie(席 波,米 杰).Study on genome wide association in patients with human obesity[J].Chin J Epidemiol(中華流行病學(xué)雜志),2010,31(12):1425-1428.(in Chinese)
[34]YANG Ying,LU Xiangfeng(楊 英,魯向鋒).Advances in genome-wide association study of coronary heart disease[J].Hereditas(遺傳),2010,32(2):97-104.(in Chinese)
[35]LE MARCHANDL,WILKENSLR.Design considerations for genomic association studies:Importance of gene-environment interactions[J].Cancer Epidemiology Biomarkers &Prevention,2008,17(2):263-267.
[36]LUBBE S J,WHIFFIN N,CHANDLER L,et al.Relationship between 16 susceptibility loci and colorectal cancer phenotype in 3146 patients[J].Carcinogenesis,2012,33(1):108-112.
[37]XING J,MYERS R E,HE X,et al.GWAS-identified colorectal cancer susceptibility locus associates with disease prognosis[J].European Journal of Cancer,2011,47(11):1699-1707.
[38]TU Xin,SHI Lisong,WANG Fan,et al(涂 欣,石立松,汪 樊,等).Genomewide association study:advances,challenges and deliberation [J].Progress in Physiological Sciences(生理科學(xué)進展),2010,41(2):87-94.(in Chinese)