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      不同地區(qū)取樣點(diǎn)土壤中木質(zhì)素降解優(yōu)勢(shì)菌株的篩選及生長(zhǎng)特性比較

      2013-12-20 06:09:02別春雨蔣曉云章世元
      關(guān)鍵詞:變色木質(zhì)素菌落

      別春雨 姜 濤 蔣曉云 章世元

      (揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,揚(yáng)州 225009)

      農(nóng)作物秸稈是人類從事作物栽培生產(chǎn)過(guò)程中大量產(chǎn)生的一類含有一定數(shù)量木質(zhì)素的纖維類可再生資源。據(jù)統(tǒng)計(jì),1998年我國(guó)秸稈總產(chǎn)量為7.9億 t[1]。通過(guò)對(duì)秸稈中木質(zhì)素的降解,提高農(nóng)作物秸稈的飼用率,對(duì)畜禽養(yǎng)殖中飼料資源的開(kāi)發(fā)具有重要意義。秸稈中的木質(zhì)素和植物細(xì)胞壁中的纖維素、半纖維素緊密結(jié)合在一起,使纖維素降解酶不易與纖維素分子接觸,限制了各種來(lái)源的消化酶對(duì)植物體成分的消化[2]。白腐菌能夠分泌胞外木質(zhì)素過(guò)氧化物酶(lignin peroxidase,LiP)、錳過(guò)氧化物酶(manganese-dependent peroxidase,MnP)、漆酶(laccase)[3-4],具有降解木質(zhì)素的特性,且被認(rèn)為是目前主要的木質(zhì)素降解微生物[5-6]。而不同地區(qū)的氣候類型、植被種類和土壤成分等因素都會(huì)影響到土壤中微生物的種類、數(shù)量、群系結(jié)構(gòu)和產(chǎn)酶性能。為此,本文旨在通過(guò)探討不同取樣點(diǎn)土壤中的真菌密度及木質(zhì)素降解菌的生長(zhǎng)特性,探討植被類型、土壤成分對(duì)木質(zhì)素降解菌生長(zhǎng)特性的影響,擬為后續(xù)從土壤中篩選高效木質(zhì)素降解菌提供研究依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 培養(yǎng)基

      馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA)綜合培養(yǎng)基:PDA 37 g、KH2PO43.0 g、MgSO4·H2O 1.5 g、尿素0.01 g、維生素 B1微量,初始 pH 7.0,加蒸餾水至1 000 mL[7]。

      選擇培養(yǎng)基:愈創(chuàng)木酚 1.0 g、尿素 0.02 g、酒石酸 0.05 g、蛋白胨 2.6 g、KH2PO41.0 g、MgSO4·7H2O 0.5 g、Na2HPO40.2 g、瓊脂 18 g,初始 pH 7.0,加蒸餾水至 1 000 mL[8]。

      PDA-RB亮藍(lán)培養(yǎng)基(過(guò)氧化酶鑒定培養(yǎng)基):將RB亮藍(lán)單獨(dú)滅菌后按625μg/mL的濃度加入到PDA培養(yǎng)基中。

      PDA-Bavendamm培養(yǎng)基(漆酶鑒定培養(yǎng)基):在PDA培養(yǎng)基中加入鞣酸至終濃度為0.001 g/L。

      1.2 土壤主要成分測(cè)定

      在揚(yáng)州大學(xué)文匯路校區(qū)農(nóng)學(xué)院實(shí)驗(yàn)基地、南京師范大學(xué)仙林校區(qū)、臨沂市蘭山區(qū)、濰坊市、連云港市選定5個(gè)采樣點(diǎn),采集枯枝敗葉下10 cm左右的深層土壤,每個(gè)取樣點(diǎn)取10份土樣,共50份土壤樣品。測(cè)定土壤中的總有機(jī)碳(total organic carbon,TOC)和氮、磷、鉀等主要成分的含量。土壤中TOC含量的測(cè)定采用K2Cr2O7-H2SO4氧化法,總磷含量的測(cè)定采用分光光度計(jì)法,總氮含量的測(cè)定采用凱氏定氮法,全鉀含量的測(cè)定則采用火焰光度計(jì)法。

      1.3 菌落總數(shù)測(cè)定及菌株初選

      在取得的土壤樣品中各取1 g土壤,分別用無(wú)菌水按倍比稀釋的方法稀釋為10-1~10-1010個(gè)濃度梯度的土壤懸浮液。結(jié)合涂布法在PDA綜合培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng),觀察并記錄每個(gè)平板培養(yǎng)基上的菌落總數(shù)。然后將前面培養(yǎng)所得的菌落接種到選擇培養(yǎng)基上,同時(shí)通過(guò)不斷挑取單個(gè)菌株劃線分離直至獲得多個(gè)純菌株,觀察并測(cè)量記錄各個(gè)菌株在選擇培養(yǎng)基上培養(yǎng)6 d時(shí)的菌絲直徑(d1)、棕色變色圈直徑(d2),計(jì)算兩者比值(d1/d2)。

      1.4 菌株復(fù)選及生長(zhǎng)量測(cè)定

      菌株生長(zhǎng)量的高低一般用其在PDA固體培養(yǎng)基上的菌絲生長(zhǎng)速度來(lái)表示,而菌絲生長(zhǎng)速度的測(cè)定常采用菌落直徑測(cè)定法[9]。

      將初選菌株變色圈外圍形成的菌絲接種于PDA-Bavendamm平板上,在溫度30℃、濕度80%條件下培養(yǎng)。觀察并記錄產(chǎn)生變色圈的情況及時(shí)間,如果能夠產(chǎn)生棕褐色變色圈則為陽(yáng)性(+),反之則為陰性(-)[10]。選擇變色圈直徑大的顯色快的菌株接種到PDA-RB亮藍(lán)培養(yǎng)基上進(jìn)一步選擇,在溫度30℃、濕度80%條件下培養(yǎng)5 d。觀察并記錄產(chǎn)生橙黃色變色圈的直徑及時(shí)間。通過(guò)上述2個(gè)變色反應(yīng)可篩選出具有產(chǎn)生木質(zhì)素降解酶的優(yōu)勢(shì)菌株,并可對(duì)不同取樣點(diǎn)優(yōu)勢(shì)菌株的產(chǎn)酶特性進(jìn)行比較。

      1.5 統(tǒng)計(jì)分析

      試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用Excel建立數(shù)據(jù)庫(kù),采用SPSS 18.0軟件中的單因素方差分析法(one-way ANOVA,LSD)進(jìn)行分析,并進(jìn)行數(shù)據(jù)間的相關(guān)性分析,結(jié)果以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 不同取樣點(diǎn)土壤成分及真菌密度

      2.1.1 土壤成分

      由表1可見(jiàn),5個(gè)取樣點(diǎn)土壤的TOC、總氮、總磷和全鉀含量差異較大。連云港取樣點(diǎn)土壤的TOC、總氮和全鉀含量最高。其中TOC含量比揚(yáng)州取樣點(diǎn)高3.09%(P <0.05),比南京、臨沂和濰坊這 3個(gè)取樣點(diǎn)分別高 191.90%、86.57%和77.63%(P<0.01)。南京取樣點(diǎn)土壤的 TOC含量最低,極顯著低于其他取樣點(diǎn)(P<0.01)。連云港取樣點(diǎn)土壤總氮含量分別比揚(yáng)州、南京、臨沂和濰坊取樣點(diǎn)高 51.72%、225.93%、266.67% 和64.49%(P<0.01),臨沂取樣點(diǎn)土壤總氮含量最低,揚(yáng)州與濰坊及南京與臨沂取樣點(diǎn)土壤總氮含量間差異不顯著(P>0.05)。揚(yáng)州取樣點(diǎn)土壤總磷含量最高,分別比南京、臨沂、濰坊和連云港取樣點(diǎn)高 144.44%、52.78% 、69.23% 和 103.70%(P<0.01),南京取樣點(diǎn)土壤總磷含量最低。連云港、濰坊和南京3個(gè)取樣點(diǎn)土壤全鉀含量相近(P>0.05),并極顯著高于臨沂和揚(yáng)州2個(gè)取樣點(diǎn)(P<0.01)。各取樣點(diǎn)土壤成分間的相關(guān)性分析結(jié)果表明,土壤中TOC含量與總氮(r=0.84,P<0.01)、總磷(r=0.52,P < 0.05)的含量相關(guān)關(guān)系顯著。

      2.1.2 真菌及木質(zhì)素降解菌密度比較

      由表2可知,揚(yáng)州取樣點(diǎn)土壤中真菌和木質(zhì)素降解菌的密度均極顯著大于其他各取樣點(diǎn)(P<0.01)。臨沂取樣點(diǎn)土壤中的真菌密度居中,連云港、濰坊、南京3地土壤中的真菌密度較低,且這3地間無(wú)顯著差異(P>0.05);而另外4地土壤中木質(zhì)素降解菌的密度則較低。對(duì)各指標(biāo)間的相關(guān)性分析表明,土壤中TOC含量分別與真菌(r=0.52)、木質(zhì)素降解菌(r=0.57)密度有顯著正相關(guān)(P <0.05),總磷含量與真菌(r=0.88)、木質(zhì)素降解菌(r=0.85)密度呈顯著的強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01),真菌密度與木質(zhì)素降解菌的密度呈顯著的正相關(guān)(r=0.64,P <0.05)。

      表1 各個(gè)取樣點(diǎn)土壤主要成分的比較Table 1 The comparison of soil main components in each sampling point mg/g

      表2 不同地區(qū)土壤中真菌及木質(zhì)素降解菌密度的比較Table 2 The comparison of fungi and lignin-degradating bacteria densities in soil of different areas

      2.2 各地優(yōu)勢(shì)菌株的比較

      2.2.1 菌株初選

      (2)此工件左側(cè)有階梯和槽,在中間還有M24的螺紋,故左側(cè)不方便裝夾,須先加工右側(cè),再調(diào)頭裝夾右側(cè),加工左側(cè)。

      利用選擇培養(yǎng)基初步挑選出10個(gè)菌株培養(yǎng)6 d后的菌絲直徑(d1)和變色圈直徑(d2)的測(cè)定及d1/d2計(jì)算結(jié)果見(jiàn)表3。可以看出,所選菌株的d1/d2均小于1。部分菌株在選擇培養(yǎng)基上生長(zhǎng)與變色圈的出現(xiàn)情形如圖1(表及圖中的編號(hào)為:Y——揚(yáng)州,N——南京,L——臨沂,W——濰坊,G——連云港)。

      表3 初選10株菌株培養(yǎng)6 d后菌株菌絲直徑(d1)與變色圈直徑(d2)比值Table 3 The ratio of colony diameter(d1)and discoloration circle diameter(d2)of 10 strains after 6 days of culture

      圖1 部分菌株選擇培養(yǎng)基上棕色變色圈Fig.1 Part of the bacterial strains produce brown discoloration circles in selection medium

      2.2.2 菌株復(fù)選及各優(yōu)勢(shì)菌株產(chǎn)酶特性比較

      將初選所得的10個(gè)菌株接種到PDA-Bavendamm培養(yǎng)基和PDA-RB亮藍(lán)培養(yǎng)基進(jìn)行復(fù)選,并對(duì)各地區(qū)取樣點(diǎn)土壤中優(yōu)勢(shì)菌的生長(zhǎng)特性比較。在顯微鏡下觀察,所有被選菌株的菌落均呈類似菊花狀,其菌絲體為白色絮狀,菌體為圓形絨毛狀,菌落呈現(xiàn)乳白色且均勻,扁平,有同生圓。據(jù)此菌落形態(tài),利用《真菌鑒定手冊(cè)》可初步鑒定本試驗(yàn)所選木質(zhì)素降解菌為白腐真菌屬。

      對(duì)被選5個(gè)優(yōu)勢(shì)菌株產(chǎn)酶特性的定性比較結(jié)果見(jiàn)表4。可以看出L1、Y1、G1在接種PDA-Bavendamm培養(yǎng)基后第1天即產(chǎn)生變色圈,其中Y1變色圈的表現(xiàn)最為迅速明顯,而W1和N1接種后第2天才開(kāi)始產(chǎn)生變色圈。培養(yǎng)5 d后,菌株L1、Y1、W1所產(chǎn)生的變色圈幾乎布滿整個(gè)PDA-Bavendamm平板,其中Y1在培養(yǎng)4 d后產(chǎn)生的變色圈幾乎布滿整個(gè)平板(圖2),而G1和N1培養(yǎng)后第5天產(chǎn)生的變色圈相對(duì)較小。

      表4 優(yōu)勢(shì)菌株在PDA-Bavendamm平板顯色反應(yīng)Table 4 Discoloration reaction of advantage strains in PDA-Bavendamm medium

      圖2 部分菌株P(guān)DA-Bavendamm平板黃褐色變色圈Fig.2 Part of the bacterial strains produce tan color circles in PDA-Bavendamm medium

      5株優(yōu)勢(shì)菌株接種后1~5 d的觀察結(jié)果見(jiàn)表5。5株菌株接種后第1天均產(chǎn)生脫色圈,但脫色圈直徑無(wú)顯著差異(P>0.05),而到接種后第2天菌株N1脫色圈直徑明顯增大,分別比Y1、L1、W1和 G1 直徑大 136.14%、123.27%、134.52% 和131.19%(P<0.05)。接種后第3天菌株 N1仍保持較高的優(yōu)勢(shì)(圖3)。但到接種后第5天菌株Y1和W1產(chǎn)生的脫色圈直徑則表現(xiàn)為大于菌株N1、L1 和 G1,但差異不顯著(P >0.05)。

      表5 優(yōu)勢(shì)菌株在PDA-RB亮藍(lán)平板上脫色圈直徑Table 5 The decolorizing circle diameter of advantage strains in PDA-RB bright blue plate cm

      圖3 部分菌株P(guān)DA-RB亮藍(lán)平板上淺褐色脫色圈Fig.3 Part of the bacterial strains produce shallow brown decolorizing circles in PDA-RB medium

      2.2.3 菌株生長(zhǎng)速度

      通過(guò)測(cè)量菌落在基礎(chǔ)培養(yǎng)基上的直徑確定不同菌株的生長(zhǎng)速度,試驗(yàn)結(jié)果如表6,通過(guò)初選和復(fù)選最終得到的5株優(yōu)勢(shì)菌株在溫度30℃、濕度80%條件下基礎(chǔ)培養(yǎng)基上培養(yǎng)5 d。接種后第2天菌株L1、N1和G1生長(zhǎng)速度顯著高于Y1和W1(P<0.05),接種后第5天菌落直徑最大的是W1,為7.92 cm,幾乎長(zhǎng)滿整個(gè)平板,分別比 Y1、N1、L1 和 G1 大 2.99%、9.03%、5.74% 和14.29%,G1菌落生長(zhǎng)速度最慢。

      表6 菌株生長(zhǎng)速度比較Table 6 The comparison of bacterial strain growth rates cm

      3 討論

      據(jù)研究,土壤中微生物的數(shù)量及其群系結(jié)構(gòu)受土壤有機(jī)組成、總氮、總磷、全鉀和土壤生態(tài)環(huán)境(如植被)等的影響較大[11]。在本試驗(yàn)的5個(gè)采樣地區(qū)中,南京取樣點(diǎn)土壤中真菌和木質(zhì)素降解菌密度均較低,而揚(yáng)州取樣點(diǎn)中的真菌和木質(zhì)素降解菌密度均極顯著高于其他取樣點(diǎn),分析原因可能是南京取樣點(diǎn)的土壤采于灌木叢,并沒(méi)有高大的植被覆蓋,紫外線具有強(qiáng)烈的殺菌作用且能部分透過(guò)低矮的灌木叢,故其土壤中真菌受紫外線影響較大。揚(yáng)州取樣點(diǎn)的土壤植被為常綠針葉林,對(duì)紫外線有良好的遮擋作用,從而減少了紫外線對(duì)土壤真菌的殺滅作用。土壤中真菌密度還受到土壤類型的影響,其中揚(yáng)州地區(qū)褐土中真菌密度極顯著高于另外4地。此外本試驗(yàn)中不同采樣點(diǎn)土壤中的TOC含量與木質(zhì)素降解菌的密度呈正相關(guān)(r=0.57,P <0.05),說(shuō)明木質(zhì)素降解菌的密度還受到土壤中TOC含量的影響。

      生長(zhǎng)速度較快的菌株能在短時(shí)間內(nèi)獲得大量菌絲體生物量,而大量的菌絲體生物量是產(chǎn)酶的物質(zhì)基礎(chǔ)[12]。因此,選擇一定時(shí)間內(nèi)生物量高的菌株是篩選高效菌株的重要措施之一。本試驗(yàn)以菌落生長(zhǎng)直徑代表菌絲體生物量,選擇在PDA培養(yǎng)基中菌落生長(zhǎng)直徑大的菌株作為復(fù)選的后備菌株。經(jīng)過(guò)復(fù)選每個(gè)地區(qū)最終各選留了1株生長(zhǎng)量高的菌株作為下一步產(chǎn)酶特性研究的對(duì)象,并取得了較理想的效果。這一結(jié)果表明在菌株篩選的初期,用菌落生長(zhǎng)直徑的大小來(lái)代表菌絲體生物量是可行的。

      由于木質(zhì)素結(jié)構(gòu)復(fù)雜,目前人們常利用具有木質(zhì)素類似結(jié)構(gòu)的一類化合物,如愈創(chuàng)木酚、單聚物香草酸、苯酚、磷甲基苯酚;二聚物愈創(chuàng)木基甘油-B-松柏醇醚(GGE)、1,2-二愈創(chuàng)木基丙烷-1,3-二醇、脫氫聯(lián)松柏醇(DCA)等其中的任意1種,作為唯一碳源制作成選擇培養(yǎng)基來(lái)篩選木質(zhì)素降解菌[13]。Nishida 等[14]認(rèn)為,能在以愈創(chuàng)木酚等為唯一碳源的選擇培養(yǎng)基上產(chǎn)生變色圈的微生物表明其具有降解木質(zhì)素的能力。本試驗(yàn)利用愈創(chuàng)木酚為唯一碳源的選擇培養(yǎng)基,從土壤中篩選出了具有木質(zhì)素降解能力的菌株。進(jìn)一步的研究表明:真菌在以前述化合物制作的選擇培養(yǎng)基上產(chǎn)生的變色圈有2類:一類是在菌絲圈外圍形成棕色變色圈,菌絲圈與變色圈的比值小于1;另一類則是在菌絲圈以內(nèi)形成變色圈,菌絲圈與變色圈比值大于 1[15]。Rodrguez 等[16]的試驗(yàn)表明,菌絲圈直徑與變色圈直徑的比值可作為判斷該菌是否能優(yōu)先選擇性地降解木質(zhì)素的依據(jù):比值小于1的真菌能首先選擇性降解木質(zhì)素,而比值大于1的真菌則優(yōu)先選擇降解纖維素。本試驗(yàn)選擇菌絲圈直徑與變色圈直徑比值小于1的10個(gè)菌株經(jīng)進(jìn)一步純化后作為后續(xù)復(fù)選的研究對(duì)象。

      研究表明白腐真菌對(duì)木質(zhì)素的降解是通過(guò)幾種酶共同作用的結(jié)果,其中起主要作用的有漆酶和過(guò)氧化物酶[17]。真菌分泌的漆酶能夠使鞣酸等酚類化合物聚合,其反應(yīng)特征是可在含有酚類化合物的漆酶鑒定培養(yǎng)基上形成棕褐色變色圈,并可根據(jù)變色圈的呈現(xiàn)時(shí)間及大小來(lái)定性地鑒定白腐真菌產(chǎn)生漆酶與降解木質(zhì)素的能力[18]。而具有木質(zhì)素降解能力的真菌所產(chǎn)生的過(guò)氧化物酶能夠使RB亮藍(lán)脫色,據(jù)其在PDA-RB亮藍(lán)培養(yǎng)基上出現(xiàn)淡黃色脫色圈的時(shí)間和直徑大小可定性地檢測(cè)各個(gè)菌株產(chǎn)生過(guò)氧化酶的能力。經(jīng)定性鑒定的結(jié)果表明,本試驗(yàn)篩選得到的木質(zhì)素降解菌株均具有明顯產(chǎn)生漆酶和過(guò)氧化物酶的特性,而且來(lái)自于不同地區(qū)取樣點(diǎn)土壤中的優(yōu)勢(shì)菌株木質(zhì)素降解酶產(chǎn)生的速度與持續(xù)時(shí)間差異明顯。揚(yáng)州取樣點(diǎn)土壤中木質(zhì)素降解優(yōu)勢(shì)菌產(chǎn)生漆酶的速度較快,臨沂、揚(yáng)州和連云港取樣點(diǎn)土壤中優(yōu)勢(shì)菌產(chǎn)生漆酶的能力較強(qiáng)。南京取樣點(diǎn)土壤中木質(zhì)素降解優(yōu)勢(shì)菌產(chǎn)生過(guò)氧化酶的速度較快,揚(yáng)州和濰坊取樣點(diǎn)土壤中優(yōu)勢(shì)菌產(chǎn)生過(guò)氧化物酶的能力較強(qiáng)。這些均為后續(xù)進(jìn)一步研究木質(zhì)素降解菌對(duì)秸稈的降解及飼料原料的開(kāi)發(fā)奠定了良好的基礎(chǔ)。

      4 結(jié)論

      ①不同地區(qū)土壤中木質(zhì)素降解菌的種群結(jié)構(gòu)差異較大。在有機(jī)物含量高、常綠植被覆蓋率高的褐土地區(qū)采集土壤有助于獲得理想的高效木質(zhì)素降解優(yōu)勢(shì)菌株。

      ②本試驗(yàn)篩選獲得的菌株均能夠產(chǎn)生漆酶和木質(zhì)素過(guò)氧化酶等木質(zhì)素降解酶。

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