盧雪梅, 黃演婷, 汪 潔, 金小寶, 朱家勇
(1. 廣東藥學(xué)院藥用生物活性物質(zhì)研究所,廣州 510006; 2. 廣東省生物活性藥物研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 廣州 510006)
基因工程菌株的遺傳穩(wěn)定性主要是指工程菌株的質(zhì)粒穩(wěn)定性,即宿主細(xì)胞在繁殖分裂過(guò)程中質(zhì)粒丟失的程度[1]。工程菌的遺傳穩(wěn)定性對(duì)于大規(guī)模發(fā)酵和產(chǎn)物制備至關(guān)重要,是高水平發(fā)酵的基本條件,研究其穩(wěn)定性對(duì)進(jìn)一步的藥物開(kāi)發(fā)具有指導(dǎo)作用[2]。
干擾素(Interferon,IFN)是慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)抗病毒治療的首選藥物之一[3-7]。其中IFNα2b是FDA批準(zhǔn)的第一個(gè)抗HBV藥,但是臨床治療時(shí)IFNα2b在體內(nèi)容易擴(kuò)散降解,未能在肝臟形成有效的抗病毒作用濃度[8]。為了達(dá)到抗病毒效果,藥物劑量常要加大,藥物劑量的加大也加重了其不良反應(yīng),又容易產(chǎn)生耐藥性HBV,從而影響療效[9]。重組肝靶向干擾素是將來(lái)源于瘧原蟲(chóng)環(huán)子孢子蛋白的肝靶向肽CSP I-plus與IFNα2b進(jìn)行融合,利用CSP I-plus高效特異的肝細(xì)胞靶向性將IFNα2b導(dǎo)向肝臟[10-12],使其在肝臟富集,從而提高了干擾素治療慢性HBV感染的特異性,減少全身用量,降低毒副反應(yīng),提高量效比,具有良好的應(yīng)用前景。本實(shí)驗(yàn)室成功克隆了肝靶向干擾素(IFN-CSP)基因,并將其轉(zhuǎn)入原核表達(dá)系統(tǒng)菌株E.coliBL21,構(gòu)建了肝靶向干擾素工程菌株E.coliBL21/pET32a-IFN-CSP,并申請(qǐng)了專利。本文旨在研究該菌株的遺傳穩(wěn)定性,按照國(guó)家醫(yī)藥監(jiān)督管理局對(duì)基因重組產(chǎn)品的要求,對(duì)該菌株在傳代過(guò)程中的生長(zhǎng)特性、遺傳和表達(dá)穩(wěn)定性等進(jìn)行鑒定。
含IFN-CSP基因的重組工程菌株E.coliBL21/pET32a-IFN-CSP為本實(shí)驗(yàn)室保存。限制性內(nèi)切酶KpnI、Hind Ⅲ,Taq DNA 聚合酶,DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)購(gòu)自TaKaRa公司;TIANpure Midi Plasmid Kit為北京TIANGEN公司產(chǎn)品;蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)購(gòu)自Fermentas公司;氨芐青霉素購(gòu)自Amresco公司,酵母提取物和蛋白胨為Oxiod 公司產(chǎn)品;丙烯酰胺、N,N′-亞甲基雙丙烯酰胺、SDS購(gòu)自Sigma公司;TEMED為自北京鼎國(guó)生物公司產(chǎn)品。其他化學(xué)試劑為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純。
1.2.1 菌株傳代方法及質(zhì)粒穩(wěn)定性鑒定
將凍存-80 ℃ 冰箱中的第 0 代工程菌菌種劃線接種于LB (AMP+) 固體平板上,37 ℃培養(yǎng)16~18 h 后,挑取單菌落繼續(xù)劃線培養(yǎng),每傳1 次記為1 代。采用復(fù)制平板法,分別挑取傳代過(guò)程中第0、10、20、30、40、50 代的單菌落100個(gè)復(fù)制到含AMP 和不含AMP的LB 固體平板上,37℃培養(yǎng)14~16 h,記數(shù)菌落數(shù),計(jì)算工程菌在有抗生素選擇壓力下傳代時(shí)質(zhì)粒的穩(wěn)定性。
質(zhì)粒穩(wěn)定性(%)= LB ( AMP+) 固體平板上的菌落數(shù)/LB (AMP-) 固體平板上的菌落數(shù)。
1.2.2 菌落形態(tài)和生長(zhǎng)觀察
與從原代種子接出的培養(yǎng)物對(duì)比,觀察上述平板上傳代工程菌菌落形態(tài)變化。菌體用生理鹽水洗3次后,用少量生理鹽水懸浮,按革蘭染色方法,光學(xué)顯微鏡下觀察。同時(shí)接種單菌落到含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)12 h,用 LB 培養(yǎng)基作為對(duì)照,測(cè)定OD600,確定生長(zhǎng)速度的變化。
1.2.3 目的基因的PCR 鑒定
分別挑取第0、10、20、30、40 和50 代工程菌菌種接種于LB 培養(yǎng)基中,培養(yǎng)過(guò)夜,用質(zhì)粒小提試劑盒提取質(zhì)粒。根據(jù)肝靶向干擾素基因的DNA 序列,應(yīng)用Primer Premier 5.0 引物設(shè)計(jì)軟件設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物,以質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增鑒定,1.5% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
1.2.4 質(zhì)粒酶切鑒定
挑取第0、10、20、30、40 和50 代單菌落,LB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)過(guò)夜,提取質(zhì)粒進(jìn)行KpnI、Hind Ⅲ 雙酶切,1.5% 瓊脂糖電泳鑒定酶切片段。
1.2.5 插入片段DNA 序列測(cè)定
取第50 代重組工程菌菌株委托Invitrogen公司進(jìn)行序列鑒定。
1.2.6 肝靶向干擾素在工程菌的誘導(dǎo)表達(dá)
挑取工程菌單菌落到5 mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)過(guò)夜,然后將此菌液按1∶100比例接種到新鮮的LB液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至OD600=0.8時(shí),加入終濃度為0.4 mmol/L的異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo)6 h。離心收集菌沉進(jìn)行15% SDS-PAGE電泳。
在LB(AMP+)固體平板上生長(zhǎng)的各代工程菌菌落呈典型的大腸桿菌菌落形態(tài):白色,外表濕潤(rùn)光滑,直徑1 ~1.5 mm 的圓形隆起;無(wú)雜菌生長(zhǎng)。對(duì)各代工程菌進(jìn)行革蘭染色,光鏡下均為革蘭陰性、兩端呈鈍圓的短小桿菌,與原代工程菌形態(tài)相同。原代和第10、20、30、40 和50 代菌株在LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)12 h時(shí)的生長(zhǎng)情況見(jiàn)表1,結(jié)果顯示工程菌株在傳代過(guò)程中生長(zhǎng)情況沒(méi)有顯著差別。
表1 工程菌株在不同傳代次數(shù)時(shí)的生長(zhǎng)量
表2 工程菌株傳代時(shí)的質(zhì)粒穩(wěn)定性
工程菌株在有AMP選擇壓力情況下,在LB 固體平板上傳代過(guò)程中質(zhì)粒穩(wěn)定性接近100%(表2)。
以提取的各代菌種重組質(zhì)粒作為模板,對(duì)肝靶向干擾素基因進(jìn)行PCR 特異擴(kuò)增, 結(jié)果(圖1)顯示各代的PCR 結(jié)果與0 代一致,均在約570 bp 處有清晰的條帶,大小與目的片段相符,說(shuō)明各代工程菌中的肝靶向干擾素基因未丟失。
圖1 IFN-CSP 的PCR擴(kuò)增
瓊脂糖電泳顯示第0、10、20、30、40、50 代工程菌的重組質(zhì)粒經(jīng)KpnI和Hind Ⅲ 雙酶切后,均可以切出約570 bp 的片段,與原始工程菌的目的基因大小一致 (圖2) ,進(jìn)一步說(shuō)明了各代工程菌中的肝靶向干擾素基因未丟失。對(duì)第50代工程菌進(jìn)行DNA 序列測(cè)定,結(jié)果顯示插入的DNA 序列與原始序列一致,沒(méi)有發(fā)生突變。
圖2 重組質(zhì)粒的酶切圖譜
圖3 誘導(dǎo)表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析
表達(dá)產(chǎn)物經(jīng)15% SDS-PAGE電泳染色后,可見(jiàn)在大小約39 kDa (因載體pET32a具有Trx標(biāo)簽蛋白,分子量約為17.6 kDa;而肝靶向干擾素分子量約為21.5 kDa) 處出現(xiàn)蛋白條帶,原代菌種和傳代10,20,30,40,50代后的菌種在總蛋白電泳中所有蛋白條帶位置和表達(dá)水平無(wú)明顯差別 (圖3) 。
基因工程菌株的遺傳穩(wěn)定性在整個(gè)生產(chǎn)質(zhì)控過(guò)程中起到關(guān)鍵的作用,是高水平發(fā)酵的基本條件,直接影響重組蛋白的表達(dá)、純化乃至產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)[13]。國(guó)內(nèi)外學(xué)者通過(guò)從不同角度研究大腸桿菌、酵母菌等不同類工程菌的遺傳穩(wěn)定性發(fā)現(xiàn)基因工程菌中重組質(zhì)粒的不穩(wěn)定性一般表現(xiàn)為兩種形式,一種是分離分配不穩(wěn)定性,一般在細(xì)胞分裂時(shí)引起,指整個(gè)重組質(zhì)粒分子從受體細(xì)胞中丟失或逃逸的現(xiàn)象,這一種是質(zhì)粒丟失的主要原因;另一種是結(jié)構(gòu)序列不穩(wěn)定性,即重組質(zhì)粒上某一區(qū)域的序列發(fā)生缺失、修飾、重排和插入等現(xiàn)象導(dǎo)致的表觀生物學(xué)功能喪失,這種對(duì)質(zhì)粒主要遺傳標(biāo)記丟失影響較小[14,15]。遺傳穩(wěn)定性高,目的基因量多,表達(dá)產(chǎn)物含量也高;反之,遺傳穩(wěn)定性低時(shí),目的基因量少,基因產(chǎn)物的量也少[16]。因此,菌種的遺傳穩(wěn)定性差異決定了菌種的保存方式和傳代次數(shù),具有重要的實(shí)際指導(dǎo)意義。
本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建凍存-80℃ 冰箱中的重組工程菌E.coliBL21/pET32a-IFN-CSP,經(jīng)連續(xù)劃線傳代50 代以后,仍然保持與原代菌株具有相同的菌落大小和形態(tài),顯微鏡下特征亦無(wú)明顯差異,表明該工程菌株傳代后形態(tài)特征是穩(wěn)定的。工程菌株連續(xù)傳代質(zhì)粒穩(wěn)定性接近100%,在LB液體培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)情況基本一致,表明該工程菌株具有質(zhì)粒的分裂穩(wěn)定性。PCR鑒定、雙酶切電泳鑒定和測(cè)序結(jié)果顯示該工程菌株菌中攜帶的重組質(zhì)粒在傳代前后的限制性內(nèi)切酶圖譜沒(méi)有發(fā)生變化,基因序列亦未突變,表明該工程菌株具有質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。經(jīng)誘導(dǎo)培養(yǎng)后,目的蛋白在原代和第10、20、30、40、50代中都有表達(dá),且表達(dá)量沒(méi)有明顯差別,它們?cè)赟DS-PAGE中的帶型也基本一致,表明該工程菌株具有表達(dá)穩(wěn)定性。
綜上所述,本研究通過(guò)對(duì)工程菌E.coliBL21/pET32a-IFN-CSP連續(xù)傳代50 代后生長(zhǎng)特性,pET32a-IFN-CSP質(zhì)粒的PCR鑒定、酶切圖譜、測(cè)序和菌株蛋白表達(dá)水平的分析,結(jié)果顯示重組工程菌經(jīng)50次傳代后以上指標(biāo)均與原始菌株相同,證明該工程菌株遺傳穩(wěn)定性良好,為其將來(lái)應(yīng)用于大規(guī)模的發(fā)酵提供了有利保障,也為重組肝靶向干擾素的應(yīng)用開(kāi)發(fā)奠定了基礎(chǔ)。
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