• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      水二聚體間電荷轉(zhuǎn)移與分子軌道研究

      2014-01-02 06:16:36
      唐山學(xué)院學(xué)報(bào) 2014年6期
      關(guān)鍵詞:電荷分布電荷轉(zhuǎn)移氫鍵

      潘 章

      (唐山學(xué)院 教務(wù)處,河北 唐山063000)

      0 引言

      液態(tài)水體系是典型的氫鍵體系,一般認(rèn)為氫鍵能量中包含靜電能(electrostatic,ES)、電子極化能(polarization,PL)、交換互斥能(exchange repulsion,EX)、電荷轉(zhuǎn)移能(charge transfer,CT)和耦合作用能(coupling,MIX)等,其中的電荷轉(zhuǎn)移是指氫鍵供體-受體間的電荷轉(zhuǎn)移,這是一種典型的量子效應(yīng),無法用經(jīng)典力學(xué)方法準(zhǔn)確地描述。因此,對(duì)常溫下液態(tài)水體系的模擬研究采用從頭分子動(dòng)力學(xué)方法更加合適[1-2]。基于密度泛函理論的從頭分子動(dòng)力學(xué)方法(car-parrinello ab initio molecular dynamics,CPMD)早在20世紀(jì)90年代就被用于研究液態(tài)水體系,此后應(yīng)用CPMD方法的研究工作被相繼報(bào)道[3-4]。目前的研究表明,用色散修正后的BLYP(Becke-Lee-Yang-Parr)交換關(guān)聯(lián)函數(shù)進(jìn)行 CPMD 模擬,得到的模擬結(jié)果與實(shí)驗(yàn)結(jié)果符合性很好[5-6]。另據(jù)研究表明氫鍵能量強(qiáng)烈依賴于距離和角度[7],因此水二聚體間構(gòu)型發(fā)生變化必然會(huì)影響二聚體分子間的電荷分布。本文系統(tǒng)地研究了水二聚體在不同構(gòu)象時(shí)的原子電荷分布以及分子軌道的變化情況,以便使水中氫鍵的本質(zhì)特點(diǎn)表現(xiàn)得更加清晰。

      1 模擬參數(shù)與計(jì)算細(xì)節(jié)

      CPMD方法是在贗勢和平面波的基礎(chǔ)上具體實(shí)現(xiàn)的[3,8],本文應(yīng)用CPMD方法結(jié)合限定性動(dòng)力學(xué)方法對(duì)水二聚體進(jìn)行模擬。設(shè)定立方體盒子的邊長為L=18.897 3a.u.。模擬采用BLYP的交換關(guān)聯(lián)泛函和范數(shù)不變的Troullier Martins贗勢近似。Kohn-Sham軌道在平面波基組下展開,能量截?cái)酁?0Ry,虛擬電子質(zhì)量為600a.u.,時(shí)間步長設(shè)置為5a.u.(0.121fs),溫度為330(±20)K。模擬過程中限定了二聚體O-O間的距離R和角度θ。幾何參數(shù)和坐標(biāo)系參見圖1,圖1中y軸是氫鍵受體分子的角∠HOH的平分線,z軸與氫鍵受體分子所在平面垂直,z軸與連線O…H的夾角定義為角Ψ。繞x軸、y軸、z軸旋轉(zhuǎn)的角度分別定義為Ψx,Ψy和Ψz。優(yōu)化后的水二聚體幾何參數(shù)為RO…O=2.97A,rO…H=1.99A,Ψ=32°以及θ=169.42°。為了系統(tǒng)計(jì)算水二聚體在不同構(gòu)象下的電荷分布及分子軌道,通過限定性動(dòng)力學(xué)方法將距離r和角度θ限定在上述值。動(dòng)力學(xué)模擬之前計(jì)算了孤立水分子的原子電荷分布(見表1)及經(jīng)過優(yōu)化的二聚體的分子軌道(見圖2),并與文獻(xiàn)中報(bào)道的相關(guān)計(jì)算結(jié)果進(jìn)行了對(duì)比[9-11],證實(shí)了選用參數(shù)的可靠性。

      表1 孤立水分子原子電荷分布

      圖1 優(yōu)化后水二聚體及相關(guān)的距離和角度

      圖2 通過CPMD方法計(jì)算得出的孤立水分子5個(gè)占據(jù)軌道[10-11]

      2 水二聚體不同距離的原子電荷分布

      氫鍵的能量受電荷轉(zhuǎn)移的影響,且強(qiáng)烈地取決于水二聚體間的分子取向,因此分子間距離的變化必然影響水分子間的電荷轉(zhuǎn)移。根據(jù)自然鍵軌道理論(natural bond orbital,NBO)分析,電子轉(zhuǎn)移是指電子從水二聚體的受體水分子轉(zhuǎn)移到供體水分子上。為了研究電荷轉(zhuǎn)移與水二聚體氧氧間距離的關(guān)系,我們只改變氧氧間的距離,其他取向保持與優(yōu)化后的結(jié)果相同,計(jì)算不同氧氧間距離時(shí)水分子的電荷分布情況,計(jì)算結(jié)果見表2和圖3。表2中供體水分子的凈電荷是負(fù)值,即q(donor)=q(O1)+q(H1)+q(H2),受體水分子的凈電荷是正值,即q(accepter)=q(O2)+q(H3)+q(H4),從表中很容易看出它們的絕對(duì)值是相等的。從圖3可以明顯看出隨著氧氧間距離的增加,電荷轉(zhuǎn)移的程度在降低。通過數(shù)據(jù)擬合的方法可以得出電荷轉(zhuǎn)移程度與氧氧間距離的函數(shù)關(guān)系大約為CT=0.94×e-R。從圖3可以看出當(dāng)氧氧間距離大于5A時(shí),電荷轉(zhuǎn)移已經(jīng)非常弱了。

      表2 原子電荷隨氧氧間距離的分布

      圖3 電荷轉(zhuǎn)移程度隨氧氧間距離R的變化曲線

      3 水二聚體分子軌道隨氧氧間距離R的變化關(guān)系

      分子軌道可以使電荷轉(zhuǎn)移的程度可視化,并且可以更加形象地了解分子間相互作用的關(guān)系,因此分子軌道是研究電荷轉(zhuǎn)移的有效方法。水二聚體間的分子軌道是孤立水分子占據(jù)軌道的線性組合,圖4中給出了4組水二聚體間的分子軌道,其含義分別是:(b2/a1)分子軌道表示氫鍵受體水分子的3a1軌道與供體水分子的1b2軌道組合,其中1b2占主要部分,3a1占次要部分;(b2/a1)*軌道是(b2/a1)的反鍵軌道,與(b2/a1)分子軌道不同的是3a1占主要部分,1b2占次要部分。類似地,分子軌道(a1/b1)和(a1/b1)*均是由氫鍵受體水分子的3a1軌道與供體水分子的1b1軌道線性組合,(a1/b1)軌道中3a1軌道占主要部分,1b1占次要部分,而(a1/b1)*軌道中1b1軌道占主要部分,3a1占次要部分。本文計(jì)算了上述4組分子軌道隨氧氧間距離的變化情況。從圖4可以看出隨著氧氧間距離的增大,分子軌道間的重合程度顯著降低,當(dāng)氧氧間距離大于5A時(shí),水二聚體間的分子軌道已經(jīng)接近于孤立水分子的分子軌道,例如,圖4(a)的最后一個(gè)分子軌道已經(jīng)與孤立水分子的1b2軌道接近,圖4(b)的最后一個(gè)分子軌道已經(jīng)與孤立水分子的3a1軌道接近,圖4(c)、圖4(d)也表現(xiàn)出了相同的結(jié)果,即氧氧間距離大于5A時(shí)供體與受體水分子間分子軌道的線性組合已經(jīng)基本消失,電荷轉(zhuǎn)移的影響已經(jīng)非常微弱,這與上面計(jì)算的電荷分布情況一致。

      圖4 水二聚體4組分子軌道隨氧氧間距離的變化

      4 結(jié)論

      電荷轉(zhuǎn)移在氫鍵的形成中占有重要的作用,本文應(yīng)用CPMD方法并結(jié)合限定性動(dòng)力學(xué)方法系統(tǒng)計(jì)算了水二聚體電荷分布及分子軌道隨氧氧間距離的變化,計(jì)算結(jié)果可以清楚地表明電荷轉(zhuǎn)移程度隨著距離的增加而減弱,當(dāng)氧氧間的距離R≥5A時(shí),電荷轉(zhuǎn)移程度已經(jīng)非常微弱,電荷轉(zhuǎn)移隨氧氧間距離R的函數(shù)關(guān)系近似為CT=0.94×e-R。分子軌道分析清晰地反映了電荷轉(zhuǎn)移的過程,這對(duì)于分析電荷轉(zhuǎn)移的本質(zhì)有著重要的幫助。

      [1] Morokuma K.Why do molecules interact?the origin of electron donor-acceptor complexes,hydrogen bonding and proton affinity[J].Acc.Chem.Res,1977,10(8):294-300.

      [2] Steiner T.Hydrogen bond in solid state[J].Angewandte Chemie International Edition,2002,41(1):48-76.

      [3] Car R,Parrinello M.Unified approach for molecular dynamics and theory[J].Phys Rev Lett,1985,55(22):2471-2474.

      [4] Tuckerman M E,Parrinello M.Integrating the Car-Parrinello equations.I.Basic integration techniques[J].J Chem Phys,1994,101(2):1302-1315.

      [5] Grimme S.Density functional theory with London dispersion corrections[J].WIREs Comput Mol Sci,2011,1(2):211-228.

      [6] Zimmerli U,Parrinello M,Koumoutsakos P.Dispersion corrections to density functionals for water aromatic interactions[J].J Chem Phys,2004,120(6):2693-2699.

      [7] Kumar R,Schmidt J R,Skinner L.Hydrogen bonding definitions and dynamics in liquid water[J].J Chem Phys,2007,126(204107):1-12.

      [8] Lee H S,Tuckerman M E.Structure of liquid water at ambient temperature from ab initio molecular dynamics performed in the complete basis set limit[J].J.Chem.Phys,2006,125(154507):1-14.

      [9] Martin F,Zipse H.Charge distribution in the water molecule-a comparison of methods[J].J.Comput.Chem,2005,26(1):97-105.

      [10] Tachikawa H.Electron capture dynamics of the water dimer:a direct ab initio dynamics study[J].Chem.Phys.Lett,2003,370(1):188-196.

      [11] Pieniazek P A,VandeVondele J,Jungwirth P,et al.Electronic structure of the water dimer cation[J].J.Phys.Chem.A,2008,112(27):6159-6170.

      猜你喜歡
      電荷分布電荷轉(zhuǎn)移氫鍵
      揭示S型電荷轉(zhuǎn)移機(jī)理
      教材和高考中的氫鍵
      一例具有可逆熱誘導(dǎo)電荷轉(zhuǎn)移行為的二維氰基橋聯(lián)WⅤ?CoⅡ配合物
      柔性直流電纜絕緣料及電纜結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)研究
      烷基鏈長及肽鏈電荷分布對(duì)脂肽雙親分子自組裝及水凝膠化的影響
      常壓微等離子體陽極與離子溶液界面的電荷轉(zhuǎn)移反應(yīng)
      核電荷分布對(duì)類氫原子基態(tài)能量計(jì)算的影響
      水溶液中……配合物結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的DFT研究
      基于分子內(nèi)電荷轉(zhuǎn)移機(jī)制的巰基熒光比色化學(xué)傳感器
      二水合丙氨酸復(fù)合體內(nèi)的質(zhì)子遷移和氫鍵遷移
      泰州市| 榕江县| 龙门县| 宜兰县| 和平县| 湘阴县| 巨鹿县| 黔西| 韶山市| 稷山县| 南漳县| 资溪县| 白水县| 新余市| 四川省| 阜阳市| 高雄市| 泌阳县| 台中市| 积石山| 建瓯市| 广东省| 宽城| 额敏县| 铁岭县| 鞍山市| 灌阳县| 宁明县| 仙居县| 临泉县| 科技| 彭州市| 上杭县| 乌兰县| 莎车县| 宜丰县| 临泽县| 宜昌市| 青龙| 宜川县| 怀来县|