程晉霞,周熙誠,馬 丹,劉 莉,曾 靜,*
(1.北京出入境檢驗檢疫局,北京 100026;2.北京農(nóng)學(xué)院,北京 102206)
食品中芥末過敏原成分LAMP檢測方法的建立
程晉霞1,2,周熙誠1,馬 丹1,劉 莉1,曾 靜1,*
(1.北京出入境檢驗檢疫局,北京 100026;2.北京農(nóng)學(xué)院,北京 102206)
目的:建立食品過敏原芥末成分環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)檢測方法,并與實時熒光-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)檢測方法比對。方法:針對白芥的主要過敏原基因Sin A1,設(shè)計LAMP引物并建立反應(yīng)體系,在特異性和靈敏度方面與RT-PCR檢測方法比對。結(jié)果:建立的LAMP檢測方法,經(jīng)特異性驗證,與所測試的13 種植物,無交叉反應(yīng)。通過添加實驗,方法的檢測靈敏度為0.5%,與RT-PCR方法檢測靈敏度相當(dāng)。檢測了25 份實際樣品,檢測結(jié)果與RT-PCR檢測結(jié)果一致。結(jié)論:建立的食品過敏原芥末成分LAMP檢測方法簡單經(jīng)濟(jì),檢測結(jié)果可靠,可有效縮短檢測時間,適用于芥末過敏原成分的檢測,具有良好的應(yīng)用前景。
芥末;過敏原;環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增;實時熒光-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
過敏性疾病發(fā)病率呈逐年上升趨勢,已成為重要的食品安全問題。據(jù)文獻(xiàn)報道40%的兒童被診斷出在某種程度上患有過敏性疾病,1990—2000年在英國和愛爾蘭有8 人死于此病。發(fā)達(dá)國家超過20%的人受過敏性疾病的困擾[1],而且食物過敏目前只能預(yù)防,不能治愈[2]。芥末是常見的過敏原之一。芥末屬于被子植物門,十字花科植物。芥末種子及其粉末在世界各地被廣泛地用作調(diào)味料來使用。芥末中的致敏物質(zhì)主要是一種由二硫鍵連接的重鏈和輕鏈組成的蛋白,它耐高溫和消化酶的作用,從而使其在加工過程中不易受影響,而且在加工過程中,致敏蛋白很可能被某些成分隱藏,從而增加檢測的難度。芥末致敏可引起過敏性皮膚炎、神經(jīng)性水腫、支氣管哮喘等疾病,成人和兒童都可能發(fā)病[3]。迄今,食品過敏原性的主要檢測方法有皮膚實驗、雙盲安慰劑對照激發(fā)實驗、血清IgE檢測和組胺釋放實驗等;國內(nèi)外學(xué)者近幾年在不斷研究建立食品中致敏原成分的快速有效檢測方法。Mustorp[4]、邵娟[5]等采用實時熒光-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)方法檢測食品中的芥末成分,Lee等[6]運用雙抗體夾心法檢測了沙拉和灌腸中殘留的芥末。
近年來,隨著核酸快速檢測技術(shù)的研究發(fā)展,普通PCR及RT-PCR等快速、特異方法被引入食品過敏原成分的檢驗[7-9],但這類方法均需要特殊儀器,不適于在廣大基層實驗室實施開展,使其應(yīng)用受到了極大的限制。直至近年來出現(xiàn)的 LAMP方法[10],具有簡單、特異、快速、靈敏等優(yōu)點,尤其適合在基層實驗室應(yīng)用與開展。已有報道采用LAMP方法檢測過敏原大豆、花生等成分[11-12]。本實驗采用通過熒光信號判斷LAMP反應(yīng)的技術(shù)和設(shè)備,建立芥末過敏原成分LAMP檢測方法,并與RT-PCR方法比對,旨在建立切實可行的芥末過敏原成分LAMP檢測技術(shù),檢測時間只需45~60 min即可。通過這一檢測方法的建立,有助于解決我國食品安全中的過敏問題,有助于為預(yù)防芥末食品過敏的發(fā)生提供預(yù)警技術(shù)手段,保障人民群眾的身體健康,有利于促進(jìn)我國芥末食品國際貿(mào)易,并為規(guī)范我國食品過敏原標(biāo)簽管理提供一定的技術(shù)參考。
1.1 材料、試劑與儀器
實驗樣品包括芥末、小米、芝麻、花生、青豆、芹菜、麥片、玉米、紅豆、杏仁、核桃、大米、土豆和5 類市售樣品(調(diào)料類、小食品類、蔬菜類、農(nóng)作物類、堅果類)均為市購。
甜菜堿(5 mol/L) 美國Sigma公司;dNTP(10 mmol/L) 上海生工生物工程有限公司;MgSO4(50 mmol/L) 北京索萊寶科技有限公司;Bst DNA聚合酶(8 U/μL)、10×ThermoPol緩沖液(1×ThermoPol緩沖液含0.1% TritonX-100、10 mmol/L (NH4)2SO4、10 mmol/L KCl、20 mmol/L Tris-HCl) 美國NEB公司;鈣黃綠素?zé)晒馊玖?廣州迪澳生物技術(shù)有限公司;TaqMan Gene Expression Master Mix(2×) 美國Life公司;十六烷基三甲基溴化銨(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)提取液:100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0),20 mmol/L Na2EDTA,1.4 mol/L NaCl,20 g/L CTAB;CTAB沉淀液:5 g/L CTAB,40 mmol/L NaCl;1×TE緩沖液 生工生物工程(上海)股份有限公司;三氯甲烷 國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;蛋白酶K(20 mg/mL) 天根生化科技有限公司;10×PBS緩沖溶液(NaCl 80 g、NaHPO4×12H2O 29 g、KCl 2 g、KH2PO42 g、先溶于900 mL去離子水,待充分溶解后再加去離子水至1 L,室溫保存)使用時進(jìn)行1∶10稀釋;DL 2000 DNA Marker 日本TakaRa公司。
LAMP擴(kuò)增儀 德國Qiagen公司;7900實時熒光定量PCR儀 美國Life公司;凝膠電泳成像儀 美國Bio-Rad公司;恒溫加熱塊、微量移液器(10、100、200、1 000 μL) 德國Eppendorf公司。
1.2 方法
1.2.1 DNA的提取
芥末DNA提取方法主要參考王瑋[13]、Scaravelli[14]等的方法,即CTAB法,稍作修改,具體步驟如下:稱取200 mg樣品于2 mL離心管中,加入1.5 mL CTAB提取緩沖液和10 μL 20 mg/mL蛋白酶K溶液,60 ℃振蕩孵育過夜。將上述裂解物于12 000×g 離心10 min,小心轉(zhuǎn)移上清液至新的2 mL 離心管中;加入750 μL三氯甲烷后用力振蕩,12 000×g 離心15 min,將上清液轉(zhuǎn)移到新的2 mL 離心管中;加入2 倍體積的CTAB沉淀液,室溫靜置1 h 后,12 000×g 離心15 min,棄去上清液;加入350 μL 1.2 mol/L NaCl溶液將沉淀充分懸浮,再加入350 μL三氯甲烷,渦旋振蕩混勻,12 000×g離心10 min;小心轉(zhuǎn)移上清液至新的1.5 mL 離心管中后加入0.8 倍體積異丙醇,-20 ℃靜置1 h,12 000×g離心10 min,棄去上清液;用70%乙醇溶液洗滌沉淀2~3次后,12 000×g離心10 min,小心傾倒乙醇,沉淀揮發(fā)干燥,加100 μL TE溶液溶解沉淀DNA,立即使用或-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 LAMP方法
1.2.2.1 LAMP引物設(shè)計
引物設(shè)計靶基因選擇白芥管家基因Sin A1基因[5,13](GenBank No.S54101)。應(yīng)用引物設(shè)計軟件PrimerExplorer 4.0設(shè)計的引物序列包括:外側(cè)上游引物F3(5’-CCGGCCCATTTAGGATTCC-3’)、外側(cè)下游引物B3(5’- ACTGCTGGAGTAGTGGTGG 3’)、內(nèi)側(cè)上游引物FIP(5’-CTGCATTGCCTGCTT GTGGAGGTTTCAGCAAGCACAACACC-3’)、內(nèi)側(cè)下游引物BIP(5’-CCGGTAGTGGTCCAAGCTGG ATCTGCTGTGGTCCCTGTG-3’)、環(huán)狀上游引物L(fēng)F(5’-CCATTGTTGGCAAGCTCTCA-3’)、環(huán)狀下游引物L(fēng)B(5’-CCCTCGACGATGAGTTTGATTT -3’)。
1.2.2.2 LAMP 檢測體系初步建立
配制反應(yīng)體系25 μL,包括:MgSO4、dNTPs、甜菜堿、內(nèi)引物、外引物、環(huán)引物、Bst DNA聚合酶、1×ThermoPol緩沖液以及適量的DNA模板;混勻,于65 ℃溫育60 min。
1.2.2.3 反應(yīng)體系的優(yōu)化
選擇Mg2+、dNTPs和甜菜堿這幾個參數(shù),進(jìn)行反應(yīng)體系的優(yōu)化。Mg2+濃度選擇2、4、6、8、10 mmol/L,dNTPs濃度選擇1.4、1.6、1.8、2.0、2.2 mmol/L、甜菜堿濃度選擇0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 mol/L,進(jìn)行LAMP反應(yīng),于65 ℃溫育60 min,反應(yīng)結(jié)束后電泳觀察擴(kuò)增效果,確定最佳反應(yīng)體系。
1.2.2.4 結(jié)果判定
實時熒光曲線變化:若有“S”型擴(kuò)增曲線且擴(kuò)增值超過設(shè)定的閾值為陽性(有核酸擴(kuò)增),若擴(kuò)增曲線的擴(kuò)增值未超過設(shè)定的閾值為陰性(無核酸擴(kuò)增)。
電泳檢測:LAMP法的擴(kuò)增產(chǎn)物是各種不同長度的莖-環(huán)狀結(jié)構(gòu)DNA,因此陽性反應(yīng)通過2%瓊脂糖電泳檢測呈梯形條帶,而陰性反應(yīng)則沒有梯形擴(kuò)增條帶出現(xiàn),可作為輔助檢測方法。
1.2.3 RT-PCR方法
1.2.3.1 RT-PCR引物設(shè)計
同樣選擇白芥管家基因Sin A1基因,應(yīng)用引物設(shè)計軟件Primer Express 3.0設(shè)計引物序列包括:上游引物P1(5’-CACCTGAGAGCTTGCCAACA -3’)、下游引物P2(5’-GACCACTACCGGACTGCATTG-3’)、探針P(5’-FAM-TGGCTCCACAAGCAG -TAMRA-3’)。
1.2.3.2 RT-PCR反應(yīng)體系
25 μL反應(yīng)體系中包括2×TaqMan Gene Expression Master Mix 12.5 μL;其他成分終濃度依次為上游引物P1、下游引物P2各0.4 μmol/L,探針P為0.2 μmol/L;D N A模板3 μ L;其余體系用焦磷酸二乙酯(diethypyrocarbonate,DEPC)水補(bǔ)足。反應(yīng)程序為:第一步,預(yù)變性進(jìn)行一個循環(huán),95 ℃、10 min;第二步,PCR反應(yīng),進(jìn)行40個循環(huán),95 ℃變性15 s;后60 ℃延伸1 min,設(shè)DEPC水為陰性對照。
1.2.3.3 結(jié)果判定
在陰性對照無Ct值顯示或Ct值為40,且陽性對照的Ct值不大于30的前提下判斷此次實驗有效,若檢測樣本Ct值不大于35,判斷為陽性,否則判斷為陰性。
1.2.4 LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳檢測
取2 μL擴(kuò)增產(chǎn)物和0.4 μL上樣緩沖液混勻點樣于含0.8 μg/L溴化乙錠的2%~3%瓊脂糖凝膠中,電壓150 V約20~30 min后置于凝膠成像系統(tǒng)中成像,電泳圖片顯示LAMP特征性梯狀條帶為陽性,無任何條帶為陰性。
1.2.5 特異性實驗
采用本方法所建立的LAMP和RT-PCR檢測方法對芥末、小米、芝麻、花生、青豆、芹菜、麥片、玉米、紅豆、杏仁、核桃、大米、土豆共13 種植物進(jìn)行檢測,并對結(jié)果進(jìn)行判斷,比較兩種檢測方法的特異性。
1.2.6 靈敏度實驗
取不含芥末成分的玉米粉為基質(zhì)樣品,進(jìn)行人工添加實驗,添加水平分別為0.1%、0.5%、1%和2%。按1.2.1節(jié)中提供的核酸提取方法提取核酸,用純芥末核酸作為陽性對照模板,DEPC水作為陰性對照模板,然后分別用LAMP方法和RT-PCR方法進(jìn)行檢測。
1.2.7 實際食品樣品的檢測
采購5 類市售樣品包括調(diào)料類、小食品類、蔬菜類、農(nóng)作物類、堅果類,總共25 份樣品。采用本實驗所建立的LAMP和RT-PCR檢測方法對其進(jìn)行檢測,并對結(jié)果進(jìn)行判斷。
2.1 反應(yīng)體系的優(yōu)化
通過對LAMP反應(yīng)體系中的Mg2+、dNTPs和甜菜堿進(jìn)行優(yōu)化,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Mg2+濃度在4~8 mmol/L的范圍內(nèi)對檢測效果沒有明顯影響,可以獲得較強(qiáng)的擴(kuò)增效率,選用4 mmol/L(圖1);dNTPs濃度在1.4~2.2 mmol/L范圍內(nèi)所得的檢測效果沒有明顯差異,選用1.4 mmol/L(圖2);甜菜堿濃度對反應(yīng)體系影響不大(圖3),在選0.8 mol/L條件下,反應(yīng)體系更穩(wěn)定,于65 ℃反應(yīng)60 min時所得效果最佳,故此作為本研究所推薦的反應(yīng)體系。
圖1 Mg2+濃度對LAMP反應(yīng)的影響Fig.1 Effect of Mg2+concentration on the LAMP reaction
圖2 dNTPs濃度對LAMP反應(yīng)的影響Fig.2 Effect of dNTPs concentration on the LAMP reaction
圖3 甜菜堿濃度對LAMP反應(yīng)的影響Fig.3 Effect of betaine concentration on the LAMP reaction
2.2 檢測特異性
采用本實驗所建立的LAMP和RT-PCR檢測方法對芥末、小米、芝麻、花生、青豆、芹菜、麥片、玉米、紅豆、杏仁、核桃、大米和土豆共13 種植物進(jìn)行檢測,結(jié)果見表1。該結(jié)果表明本研究所建立的LAMP檢測方法具有良好的特異性,該結(jié)果與RT-PCR結(jié)果相同。LAMP檢測圖譜見圖4A,RT-PCR檢測圖譜見圖4B。
表1 LAMP與RT-PCR檢測特異性Table1 Specificity of LAMP and RT-PCR
圖4 LAMP(A)和RT-PCR(B)特異性實驗結(jié)果Fig.4 Amplification curves showing the specificity of LAMP (A) and RT-RT-PCR (B)
2.3 檢測靈敏度
取不含芥末成分的玉米粉為基質(zhì)樣品,進(jìn)行人工添加實驗,添加水平分別為0.1%、0.5%、1%和2%。分別用LAMP方法和RT-PCR方法進(jìn)行靈敏度檢測,檢測結(jié)果見圖5。該結(jié)果表明,LAMP檢測方法與RT-PCR檢測方法具有相同的檢測靈敏度,均達(dá)到0.5%。
圖5 LAMP(A)和RT-PCR(B)靈敏度實驗結(jié)果Fig.5 Sensitivity of LAMP (A) andRT-PCR (B)
2.4 實際食品樣品的檢測
表2 實際樣品檢測結(jié)果Table2 LAMP and PCR results for real samples
購買不同種類的實際樣品進(jìn)行LAMP、RT-PCR兩種方法的檢測,檢測結(jié)果如表2所示。5 類食品樣品包括調(diào)料類、小食品類、蔬菜類、農(nóng)作物類、堅果類,總共25 份樣品,兩種檢測方法的檢測結(jié)果一致,均與樣品標(biāo)示相符,準(zhǔn)確率達(dá)到100%。
食物過敏已成為重要的食品安全問題[15-17]。芥末是常見的食品過敏原之一。本研究根據(jù)白芥管家基因Sin A1基因設(shè)計6 條LAMP引物,優(yōu)化并建立了LAMP反應(yīng)體系和反應(yīng)條件。在反應(yīng)體系中加入含有MnCl2的鈣黃綠素?zé)晒馊玖?,反?yīng)結(jié)果可在白光下肉眼觀察否產(chǎn)生綠色鈣錳復(fù)合物來判斷靶基因存在與否,亦可通過LAMP實時熒光信號直接判定結(jié)果。
采用本實驗所建立的LAMP和RT-PCR檢測方法對芥末、小米、芝麻、花生、青豆、芹菜、麥片、玉米、紅豆、杏仁、核桃、大米和土豆共13 種植物進(jìn)行檢測,結(jié)果表明本研究所建立的LAMP檢測方法具有良好的特異性,該結(jié)果與RT-PCR結(jié)果相同。芥末在世界各地被廣泛地用作調(diào)味料來使用,按種子的顏色又分為白芥末、棕芥末和黑芥末,為了進(jìn)一步驗證芥末LAMP引物的特異性,對白芥、棕芥、黑芥多份樣品進(jìn)行了特異性驗證,發(fā)現(xiàn)均有擴(kuò)增。表明其特異性良好。在靈敏度實驗中,取不含芥末成分的玉米粉為基質(zhì)樣品,進(jìn)行人工添加實驗,添加水平分別為0.1%、0.5%、1%和2%。分別用LAMP方法和RT-PCR方法進(jìn)行靈敏度檢測,結(jié)果表明,LAMP檢測方法與RT-PCR檢測方法具有相同的檢測靈敏度,均達(dá)到0.5%。為了進(jìn)一步驗證本研究建立的過敏原芥末LAMP檢測方法的應(yīng)用性,對5 類食品樣品包括調(diào)料類、小食品類、蔬菜類、農(nóng)作物類、堅果類,共25 份實際樣品進(jìn)行檢測,其檢測結(jié)果與實時熒光PCR檢測結(jié)果一致,均與樣品標(biāo)示相符,準(zhǔn)確率達(dá)100%??傊狙芯拷⒌氖称愤^敏原芥末成分LAMP檢測方法簡單經(jīng)濟(jì),檢測結(jié)果可靠,可有效縮短檢測時間,適用于芥末過敏原成分的檢測,具有良好的應(yīng)用前景。但LAMP 是近年來興起的一種新型的核酸擴(kuò)增技術(shù),所以必然伴隨著某些不足:LAMP法只能有兩種結(jié)果:擴(kuò)增和不擴(kuò)增。靶序列長度控制在300 bp以下,一旦產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增,則不易鑒別。這些都無法同PCR媲美,故改進(jìn)和完善LAMP必將成為科研人員的新目標(biāo)。
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Establishment of a Loop-Mediated Isothermal Amplification Method for Detection of Mustard Allergen in Foods
CHENG Jin-xia1,2, ZHOU Xi-cheng1, MA Dan1, LIU Li1, ZENG Jing1,*
(1. Beijing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Beijing 100026, China; 2. Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China)
Objective: A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method was established for the detection of mustard allergen in foods and was compared with real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). Methods: The Sin A1 gene of Sinapis alba was used to design LAMP primers. The specificity and sensitivity of LAMP were compared with those of RT-PCR. Results: The specificity of LAMP method was tested with 13 different crops. The results showed that the LAMP method was highly specific to mustard. No cross-reaction was found. The limit of detection (LOD) for LAMP was 0.5% in base-material addition test, which was consistent with that of the RT-PCR method. For 25 real food samples, the LAMP results were consistent with the RT-PCR results. Conclusion: The LAMP method of established in this study was simple, economical and reliable and could effectively reduce the detection time.
mustard; allergen; loop-mediated isothermal amplification (LAMP); real-time polymerase chain reaction (RT-PCR)
TS207.3
A
1002-6630(2014)20-0148-05
10.7506/spkx1002-6630-201420030
2013-10-31
“十二五”國家科技支撐計劃項目(2011BAK10B03)
程晉霞(1988—),女,碩士研究生,研究方向為食品安全與控制。E-mail:cjx19881031@sina.cn
*通信作者:曾靜(1963—),女,研究員,博士,研究方向為食品安全檢測。E-mail:zengj@bjciq.gov.cn