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      家蠶核型多角體病毒蛋白質(zhì)組學的研究進展

      2014-03-25 13:42:41袁運張和禹
      蠶桑茶葉通訊 2014年2期
      關(guān)鍵詞:衣殼家蠶組學

      袁運 張和禹

      (安徽農(nóng)業(yè)大學生命科學學院 230036)

      家蠶核型多角體病毒蛋白質(zhì)組學的研究進展

      袁運 張和禹

      (安徽農(nóng)業(yè)大學生命科學學院 230036)

      家蠶核型多角體病毒(BmNPV)屬于桿狀病毒,是一類對家蠶具有高致病性的病原體。對家蠶BmNPV的生物學特性以及新的BmNPV蛋白的鑒定和抗BmNPV的研究發(fā)現(xiàn)進行綜述,并指出當前Bm-NPV蛋白質(zhì)組學的研究階段,為BmNPV的蛋白質(zhì)組學的進步發(fā)展提供參考。

      家蠶;核型多角體病毒;蛋白質(zhì)組

      2009年8月家蠶基因組計劃的結(jié)束,標志著在物種基因組計劃中家蠶跑到了前沿和領(lǐng)先地位,家蠶后基因組時代已經(jīng)到來。作為家蠶的主要病原體之一的核型多角體病毒(NPV),自然也是目前研究的主要對象。家蠶核型多角體病毒(BmNPV)病是養(yǎng)蠶業(yè)上最常見危害最嚴重的蠶病之一,以春蠶期和晚秋期發(fā)生較多。BmNPV感染會引發(fā)血液型膿病,感染后期常流出膿汁,俗稱膿病,是一種急性傳染病。在感染大約12~18小時后,BmNPV觸發(fā)宿主家蠶基因表達和蛋白質(zhì)合成的總體關(guān)閉。該病傳染性極強,常呈爆發(fā)態(tài)勢,難以控制,致死率很高,常造成巨大的經(jīng)濟損失。筆者對家蠶BmNPV的生物學特性,以及BmNPV的蛋白和抗BmNPV的研究進展進行綜述,以促進對BmNPV的深入了解。

      1 BmNPV的生物學特性

      BmNPV為環(huán)狀雙鏈DNA病毒,屬于桿狀病毒科。由囊膜、衣殼和髓核組成,衣殼與髓核構(gòu)成核衣殼。BmNPV有兩種形式:一種為包含體衍生病毒(ODV),另一種為細胞外芽生病毒(BV)。ODV和BV的囊膜是由不同途徑產(chǎn)生的,ODV的囊膜能結(jié)合多角體蛋白,它能保護病毒顆粒在外界傳播過程中免遭環(huán)境因素的破壞而失活以及保證病毒顆粒在適當?shù)奈恢冕尫?,引起感染。ODV能特異性感染中腸上皮的柱狀細胞,而BV則與血腔和體腔內(nèi)許多組織細胞發(fā)生特異性作用。ODV和BV進入宿主細胞的方式也不同,ODV主要借助柱狀細胞的微絨毛與病毒囊膜的膜融合作用,而BV主要是通過吸附,胞飲作用進入細胞。

      核型多角體病毒的基因表達分為4個階段:立即早期基因表達、早期基因表達、晚期基因表達和極晚期基因表達。BV病毒產(chǎn)生于感染早期,僅為單個病毒粒子形式,在細胞核內(nèi)產(chǎn)生后轉(zhuǎn)移到質(zhì)膜,并從質(zhì)膜“出芽”而獲得囊膜。BV病毒是個體內(nèi)細胞間的感染形式,進入血淋巴系統(tǒng)中感染其它部位的細胞或直接在臨近細胞內(nèi)感染。ODV病毒產(chǎn)生于感染極晚期,在感染的細胞核內(nèi)形成有囊膜蛋白包被的ODV,然后多角體蛋白包裹ODV,形成包含體(OB)。自然界中,BmNPV以包含體OB的形式存在。ODV病毒是昆蟲間水平感染的病毒形式,昆蟲往往是食入污染了OB的食物后引起感染。感染早期,復制的核衣殼會從被感染的細胞中釋放出來,形成BV。感染極晚期后,新形成的核衣殼在細胞核內(nèi)形成有囊膜蛋白包被的ODV,然后多角體蛋白包裹ODV形成OB。在家蠶死亡和液化后,釋放在環(huán)境的OB重新啟動新一輪感染。

      2 BmNPV內(nèi)最新的蛋白質(zhì)組鑒定

      在2011年,Katsuma,S等對BmNPV基因組的轉(zhuǎn)錄單位進行了大量的鑒定。從感染BmNPV的BmN細胞構(gòu)建了全長cDNA文庫。從4 679個BmNPV來源的轉(zhuǎn)錄單位,隨機測序了11 520個克隆。發(fā)現(xiàn)了一系列早期或晚期啟動子基序有關(guān)的新轉(zhuǎn)錄以及預測了非編碼RNAs。這些為復雜轉(zhuǎn)錄調(diào)控提供了新視野。此外,在單個蛋白質(zhì)研究中也取得了不少的成果[1]。

      2.1 Bm134

      BmNPV的ORF134[2]是苜蓿銀紋夜蛾(Ac-NPV)ORF5的一個同源物。RT-PCR和Western印跡顯示,Bm134的蛋白表達和轉(zhuǎn)錄直到感染24小時后,才被檢測到,說明Bm134是一個晚期基因。Western印跡還顯示,Bm134編碼一個12.4kDa結(jié)構(gòu)蛋白,關(guān)聯(lián)ODV而不是BV。免疫熒光顯示,Bm134在感染24小時后,先出現(xiàn)在細胞質(zhì),感染晚期轉(zhuǎn)運到細胞核。在易感菌株306感染后48~72小時,檢測到Bm134的轉(zhuǎn)錄和對應(yīng)蛋白,而在抗BmNPV菌株NB中則沒有。這些結(jié)論顯示,Bm134是一個BmNPV的晚期基因,可能作為ODV的結(jié)構(gòu)蛋白。

      2.2 Bm61

      BmNPV的ORF61[3]在所有鱗翅類桿狀病毒都存在同源物。研究者構(gòu)建了一個Bm61敲除病毒,發(fā)現(xiàn)Bm61缺失的桿粒,導致BV產(chǎn)物的缺陷。進一步電子顯微鏡分析顯示,核衣殼沒有從細胞核轉(zhuǎn)運到細胞質(zhì)。這表明,在BV路徑,Bm61對核衣殼從細胞核到細胞質(zhì)轉(zhuǎn)運至關(guān)重要。

      2.3 Bm71

      BmNPV的ORF71[4]不是核心基因,是苜蓿銀紋夜蛾(AcNPV)ORF88的一個同源物。研究者構(gòu)建了一個中斷的Bm71-D病毒,檢測整個病毒生命周期,Bm71中斷物對病毒復制和病毒的表型的影響。結(jié)果顯示,Bm71-D桿粒能成功轉(zhuǎn)染Bm5細胞系,產(chǎn)生BV。但是感染期間,BV滴度比野生型病毒低10~100倍。同時幼蟲的生物測定顯示,Bm71-D病毒比野生型要長7.5小時殺死家蠶幼蟲。用透射電子顯微鏡觀察到感染Bm71-D的細胞有典型的病毒基質(zhì),一束束核衣殼蛋白和多面體。這些結(jié)果顯示,盡管Bm71對BmNPV的復制不是必需基因,但是對BV的產(chǎn)量和毒性有重要影響。因此,推測Bm71可能與控制病毒增殖的調(diào)控有關(guān)。

      2.4 Bm54

      BmNPV的ORF54[5]是苜蓿銀紋夜蛾(Ac-NPV)ORF66的一個同源物。是病毒橋粒斑蛋白N末端超家族成員,是核衣殼蛋白從細胞核的高效出口和包含體形成的必需物。研究者構(gòu)建了一個缺失Bm54的基因桿粒,用透射電子顯微鏡分析顯示,轉(zhuǎn)染缺失Bm54的病毒的細胞產(chǎn)生非感染性的BVs。另外電子顯微鏡顯示,雖然Bm54的缺失不影響核衣殼蛋白的組裝和釋放,但是它嚴重影響多面體的形成。總而言之,Bm54的缺失導致非感染性的BV和缺陷的多面體。這與AcNPV66在病毒生命周期的調(diào)控截然不同。

      2.5 Bm65

      BmNPV的ORF65[6]是一個高度保守基因,編碼一個104個氨基酸的蛋白質(zhì)。用同源重組構(gòu)建一個Bm65敲除桿粒。熒光顯微鏡顯示在BmN細胞內(nèi),Bm65敲除病毒不能產(chǎn)生感染性的BV。另外實時定量PCR分析證實Bm65缺失不影響病毒DNA的復制。結(jié)論是Bm65對BmNPV的增殖是必需的,但是對病毒的DNA復制不是必需的。

      2.6 其他蛋白

      BmNPV的ORF75[7]的晶體結(jié)構(gòu)是一個非典型的巰基氧化酶的偽二聚化結(jié)構(gòu),基因組序列分析顯示FAD輔基關(guān)聯(lián)類似人源重組靜息巰基氧化酶的巰基氧化酶結(jié)構(gòu)域,催化二硫鍵的形成,是病毒粒子組裝與病毒傳播所必需的。BmNPV的ORF8[8]是早期基因表達,Bm8蛋白和IE 1共定位到特定細胞核聚集點,已經(jīng)證實IE 1和BmNPV hr促進Bm8的定位。另外Bm8還關(guān)聯(lián)膜結(jié)合蛋白和分泌蛋白,是一個涉及多個信號通路的多功能蛋白。ORF91[9]是ODV的包膜組分,但是它的缺失沒有顯著影響NPV的傳染性,而是延長了半數(shù)致死時間。IE 2[10]的二聚化和適當?shù)慕到鈱λ拗鲀?nèi)病毒的高效生長是關(guān)鍵步驟。但是在人工培養(yǎng)細胞內(nèi)對BmNPV影響很小。

      3 抗BmNPV病毒的最新研究

      2013年為了研究家蠶對BmNPV抗性的分子機制,Chen,KP等[11]用高度抗性菌株NB和高度易感菌株306構(gòu)建了一個攜帶BmNPV抗性的近等基因系BC8。然后用微陣列研究感染12小時后,BC8和306的中腸內(nèi)基因表達的變化,鑒定了92個差異表達基因。實時熒光定量PCR分析證實,在BC8和NB的中腸相比,10個基因顯著上調(diào)或者下調(diào)。5個基因(Bm123,Bm122,COP beta',aquaporin,glycoside hydrolases)的抗病毒作用也被證實。研究還發(fā)現(xiàn)絲氨酸蛋白酶與之前報道的數(shù)據(jù)不是完全一致。這些結(jié)果給BmNPV免疫反應(yīng)的分子機制提供了新的視野。此外,在同時期還有很多其他關(guān)于抗BmNPV的研究。

      3.1 Caspase-1和絲氨酸蛋白酶

      通過蛋白質(zhì)組學方法和遺傳雜交[12],總體識別在親本家蠶NB和306以及他們F1代雜交內(nèi)的蛋白的差異表達。在正交組(NB母本,306父本,F(xiàn)1代雜交)有53個差異蛋白,在反交組(306母本,NB父本,F(xiàn)1代雜交)有21個。通過GO(Gene ontology)和KEGG pathway分析顯示,大部分差異蛋白定位在細胞質(zhì),并且涉及一些重要的新陳代謝。Western印跡進一步證實,Caspase-1和絲氨酸蛋白酶僅僅表達在抗BmNPV家蠶。這些數(shù)據(jù)顯示,Caspase-1和絲氨酸蛋白酶在抗BmNPV感染中起到關(guān)鍵作用。另外[13]證實在感染BmNPV后,絲氨酸蛋白酶抑制基因(SPIs)有3個明顯上調(diào),9個明顯下調(diào)。

      3.2 泛素蛋白酶體系統(tǒng)

      在細胞內(nèi)蛋白的降解中泛素蛋白酶體系統(tǒng)[14]起到關(guān)鍵作用,同時在高效病毒感染也被需要。研究發(fā)現(xiàn)在NPV感染的BmN4細胞內(nèi),特定的蛋白酶體抑制子MG-132顯著地減少了BV的產(chǎn)物和多角體蛋白的表達。Western印跡分析顯示用MG-132處理的細胞導致延遲和/或異常調(diào)節(jié)病毒基因產(chǎn)物表達。感染12小時后MG-132顯著地降低BV產(chǎn)物,然而在感染6小時后,多角體蛋白表達的抑制幾乎廢除。這些顯示在早期感染階段需要病毒和/或宿主蛋白質(zhì)的蛋白酶體降解,實現(xiàn)高效多角體蛋白表達。進一步研究,BmNPV感染內(nèi)泛素信號的作用,在BmNPV基因組刪除泛素基因(v-ubi)。v-ubi的缺失既不影響B(tài)V產(chǎn)物也不影響多角體蛋白的表達。此外,western印跡也顯示,泛素蛋白酶體系統(tǒng)內(nèi)一個目標病毒蛋白IE2的降解不需要vubi。總之,宿主內(nèi)的泛素蛋白酶體系統(tǒng)與高效的病毒增殖有關(guān)。

      3.3 氯化鈰(CeCl3)

      小劑量的稀土能增加動物免疫能力。添加氯化鈰(CeCl3)[15]到人工飼料,顯著降低BmNPV引起的五齡幼蟲的生長抑制和死亡率。此外,在感染BmNPV五齡幼蟲內(nèi)添加CeCl3明顯減少脂質(zhì)過氧化水平和活性氧的累積[例如:O(2)(-),H2O2,(OH)-O-center dot,和NO],還能增加抗氧化酶的活性,包括:超氧化物歧化酶、過氧化氫酶、抗壞血酸過氧化物酶、谷胱甘肽過氧化物酶、抗壞血酸和谷胱甘肽。另外,在感染BmNPV五齡幼蟲內(nèi)添加CeCl3能顯著促進乙酰膽堿酯酶活性和減弱誘導型一氧化氮合酶的活性。這些發(fā)現(xiàn)暗示添加CeCl3通過增加抗氧化能力和乙酰膽堿酯酶活性,可能減輕BmNPV感染引起的氧化損傷和家蠶的神經(jīng)中毒。

      3.4 二氧化鈦微粒

      感染BmNPV的家蠶幼蟲吸收二氧化鈦微粒[16](TiO2NPs),減少活性氧和NO累積,反過來減少他們的生長抑制和死亡率。另外,TiO2NPs顯著促進抗性相關(guān)基因的表達,包括那些編碼超氧化物歧化酶、過氧化氫酶、谷胱甘肽過氧化物酶、乙酰膽堿酯酶、羧酸酯酶、熱激蛋白21、谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶O1、P53、細胞色素p302和一氧化氮合成酶。這些發(fā)現(xiàn)對明白添加TiO2NPs的家蠶幼蟲對BmNPV的抗性機制是一個有用的補充。在養(yǎng)蠶方面,這些信息也提供TiO2NPs應(yīng)用的一個理論基礎(chǔ)。

      3.5 其他抗病毒研究

      肌動蛋白對病毒粒子轉(zhuǎn)運和病毒基因表達至關(guān)重要。A3肌動蛋白[17]第一個內(nèi)含子里面一個隱藏的啟動子控制著一個罕見亞基的表達。不同抗性菌株的A3肌動蛋白基因的第一個內(nèi)含子的大小和核苷酸組成不同。這些內(nèi)含子啟動子的不同結(jié)構(gòu)和BmNPV抗性相關(guān)。用RT-PCR和實時定量PCR鑒定NB、306、BC8菌株內(nèi)家蠶精氨酸激酶[18](BmAK)的表達譜,結(jié)果顯示在NB和BC8菌株內(nèi),BmAK的表達水平在接種后24小時增長了十倍以上,而306則沒有。

      4 結(jié)語

      目前為止,已經(jīng)從DNA、RNA、蛋白質(zhì)水平對家蠶和BmNPV展開了細致的研究。鑒定了許多家蠶和BmNPV基因,在表達蛋白質(zhì)組學上有很大進展,為后基因組時代奠定了堅實的基礎(chǔ)。但是這些鑒定出來的基因都成發(fā)散存在的形式。在細胞圖譜蛋白質(zhì)組學上,仍然沒有蛋白與蛋白或者蛋白與基因的相互作用的相關(guān)研究,沒有提出類似Lac等關(guān)于基因調(diào)控的操縱子模型等,沒有形成清晰的、系統(tǒng)的生物學機理,沒有建立細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導通路的復雜網(wǎng)絡(luò)圖。酵母雙雜交實驗或者熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù),今后應(yīng)該常用在家蠶和BmNPV的研究中,幫助找到基因或蛋白上下游的作用因子,解釋家蠶和BmNPV的詳細表達機制,另外,蛋白晶體的分子結(jié)構(gòu)測定,對解釋分子的相互作用機制必不可少??傊?,目前的研究,還處于早期的蛋白質(zhì)功能測定,要形成系統(tǒng)的蛋白質(zhì)組學,還需要更加深入系統(tǒng)的研究。

      [1]Katsuma,S,Kang,W,Shin-i,T,etal.Mass identification of transcriptional units expressed from the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus genome[J].JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY,2011,92(1):200~203

      [2]Lin,F(xiàn),Chen,KP,Xia,HC,etal.Characterization of a Late Gene,ORF134,from Bombyx mori Nucleopolyhedrovirus[J].INTERVIROLOGY,2011,54(3):113~121

      [3]Shen,HX,Chen,KP.BM61of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus:Its involvement in the egress of nucleocapsids from the nucleus[J].FEBS LETTERS 2012,586(7):990~995

      [4]Zhang,MJ,Cheng,RL,Lou,YH,etal.Disruption of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ORF71(Bm71)results in inefficient budded virus production and decreased virulence in host larvae[J].VIRUS GENES,2012,45(1):161~168

      [5]Zhang,MJ,Tian,CH,F(xiàn)an,XY,etal.Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ORF54,a viral desmoplakin gene,is associated with the infectivity of budded virions[J].ARCHIVES OF VIROLOGY,2012,157(7):1241~1251

      [6]Tang,Q,Li,GH,Yao,Q,etal.Bm65is Essential for the Propagation of Bombyx mori Nucleopolyhedrovirus[J].CURRENT MICROBIOLOGY,2013,66(1):22~29

      [7]Hou,Y,Xia,QY,Yuan,YA.Crystal structure of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ORF75reveals a pseudo-dimer of thiol oxidase domains with a putative substratebinding pocket[J].JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY,2012,93(10):2142~2151

      [8]Kang,W,Katsuma,S,Matsuda-Imai,N,etal.Identification and Characterization of Host Factors Interacting with Bombyx mori Nucleopolyhedrovirus ORF8[J].JOURNAL OF MICROBIOLOGY,2012,50(3):469~477

      [9]Tang,Q,Li,GH,Yao,Q,etal.Bm91is an envelope component of ODV but is dispensable for the propagation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus[J].JOURNAL OF INVERTEBRATE PATHOLOGY,2013,113(1):70~77

      [10]Tsuchida,A,Ishihara,G,Shimada,T,et al.Dimerization and proper degradation of BmNPV IE2are required for efficient virus growth in larvae of Bombyx mori(Lepidoptera:Bombycidae)[J].APPLIED ENTOMOLOGY AND ZOOLOGY,2013,48(2):125~130

      [11]Zhou,Y,Gao,L,Shi,HF,etal.Microarray analysis of

      gene expression profile in resistant and susceptible Bombyx mori strains reveals resistance-related genes to nucleopolyhedrovirus[J].GENOMICS,2013,101(4):256~262

      [12]Qin,LG,Xia,HC,Shi,HF,etal.Comparative proteomic analysis reveals that caspase-1and serine protease may be involved in silkworm resistance to Bombyx mori nuclear polyhedrosis virus[J].JOURNAL OF PROTEOMICS,2012,75(12):3630~3638

      [13]Zhao,P,Dong,ZM,Duan,J,etal.Genome-Wide Identification and Immune Response Analysis of Serine Protease Inhibitor Genes in the Silkworm,Bombyx mori[J].PLOS ONE,2012,7(2)

      [14]Katsuma,S,Tsuchida,A,Matsuda-Imai,N,etal.Role of the ubiquitin-proteasome system in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection[J].JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY,2011,92(3):699~705

      [15]Li,B,Xie,Y,Cheng,Z,etal.Effects of Added CeCl3on Resistance of Fifth-Instar Larvae of Silkworm to Bombyx mori Nucleopolyhedrovirus Infection[J].BIOLOGICAL TRACE ELEMENT RESEARCH,2012,146(3):318~324[16]Li,B,Xie,Y,Cheng,Z,etal.BmNPV Resistance of Silkworm Larvae Resulting from the Ingestion of TiO2Nanoparticles[J].BIOLOGICAL TRACE ELEMENT RESEARCH,2012,150(1-3):221~228

      [17]Tavares,JBravo,JP Gimenes,F(xiàn),etal.Differential structure of the intronic promoter of the Bombyx mori A3actin gene correlated with silkworm sensitivity/resistance to nucleopolyhedrovirus[J].GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH,2011,10(1):471~481

      [18]Kang,LQ,Shi,HF,Liu,XY,etal.Arginine kinase is highly expressed in a resistant strain of silkworm(Bombyx mori,Lepidoptera):Implication of its role in resistance to Bombyx mori nucleopolyhedrovirus[J].COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY B-BIOCHEMISTRY &MOLECULAR BIOLOGY,2011,158(3):230~234

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