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      電子鼻在芒果采后病原菌種類(lèi)判別中的應(yīng)用研究

      2014-04-29 03:35:52李敏胡美姣張正科梁秋南楊冬平陳亮鄭淑英高兆銀
      熱帶作物學(xué)報(bào) 2014年12期
      關(guān)鍵詞:電子鼻聚類(lèi)分析主成分分析

      李敏 胡美姣 張正科 梁秋南 楊冬平 陳亮 鄭淑英 高兆銀

      摘 要 利用電子鼻對(duì)膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.)4種芒果采后病害病原菌發(fā)酵液的揮發(fā)性氣味進(jìn)行檢測(cè),以評(píng)估電子鼻用于芒果不同真菌病原菌種類(lèi)判別的可行性。結(jié)果表明,對(duì)氣味響應(yīng)值進(jìn)行的主成分分析(PCA)、線(xiàn)性判別分析(LDA)及聚類(lèi)分析均能夠正確區(qū)分不同病原菌種類(lèi)。多因素方差分析(MANOVA)結(jié)果顯示,不同病原菌之間的差異顯著(p<0.05)。結(jié)果為芒果采后病原菌種類(lèi)判別提供新的方法,為其他病原菌的種類(lèi)判別提供參考。

      關(guān)鍵詞 芒果;電子鼻;病原菌;主成分分析;線(xiàn)性判別分析;聚類(lèi)分析;多因素方差分析

      中圖分類(lèi)號(hào) S667.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

      通常病原真菌的種類(lèi)鑒定以觀察其形態(tài)學(xué)特征為主,另外可通過(guò)病菌rDNA-ITS序列對(duì)比分析做進(jìn)一步驗(yàn)證。然而利用形態(tài)學(xué)進(jìn)行種類(lèi)判斷時(shí),常出現(xiàn)因培養(yǎng)條件不適合或培養(yǎng)時(shí)間短,造成病菌產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)和孢子缺失現(xiàn)象,給鑒定工作帶來(lái)一定的困難和限制。利用對(duì)比rDNA-ITS序列等分子生物學(xué)手段進(jìn)行輔助驗(yàn)證也需要一定周期。然而有研究發(fā)現(xiàn),真菌可以釋放出多種揮發(fā)性有機(jī)化合物(VOC)[1-2],GC-MS分析表明其包含如單萜,倍半萜,醇類(lèi)、醛、芳香族化合物,碳?xì)浠衔?,酯,酮,呋喃,氮和含硫化合物等[3-5]。而電子鼻可以分析、識(shí)別和檢測(cè)復(fù)雜嗅味及大多數(shù)揮發(fā)性成份。其通常由若干氣敏傳感器組成傳感器陣列進(jìn)行氣體揮發(fā)性物質(zhì)的復(fù)合檢測(cè)和識(shí)別,陣列中每一個(gè)傳感器對(duì)某些特定種類(lèi)的氣體成分敏感,使得整個(gè)電子鼻能夠?qū)怏w中不同的成分進(jìn)行識(shí)別并給出總體評(píng)價(jià)。目前已廣泛用于農(nóng)畜產(chǎn)品的品質(zhì)檢測(cè)和分級(jí)。在水果成熟度監(jiān)控、貨架期判斷、水果種類(lèi)鑒定等方面均有一定的應(yīng)用價(jià)值[6-8]。有研究結(jié)果表明,電子鼻技術(shù)能夠?qū)λ{(lán)莓[9]和草莓[10]是否早期感染病害做出較準(zhǔn)確的判斷。膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.)[11]是芒果采后病害主要病原菌,本研究擬以芒果采后病害主要病原菌為研究對(duì)象,應(yīng)用電子鼻測(cè)定這4種病原菌發(fā)酵液的氣味響應(yīng)值,通過(guò)主成分分析、線(xiàn)性判別式分析等方法探討基于電子鼻區(qū)分不同芒果采后病原菌的可行性,為芒果采后病原菌種類(lèi)判斷提供有效的輔助手段。

      1 材料與方法

      1.1 病原菌

      芒果采后常見(jiàn)4種病原真菌:膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides Penz.,CG)(3株菌株,編號(hào)分別為CG1、CG2、CG3)、可可球二孢(Botryodiplodia theobromae Pat.,BT)(3株菌株,編號(hào)BT1、BT2、BT3)、芒果小穴殼(Dothiorella dominicana Pet. et Cif.,DD)(3株菌株,編號(hào)DD1、DD2、DD3)和芒果擬莖點(diǎn)霉(Phomopsis mangiferae Ahmad.,PM)(3株菌株,編號(hào)PM1、PM2、PM3),均由中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境與植物保護(hù)研究所采后病害及貯運(yùn)保鮮實(shí)驗(yàn)室分離、鑒定、保存。

      1.2 傳感器響應(yīng)值測(cè)定

      將12株菌株分別置于PDA培養(yǎng)基28 ℃培養(yǎng) 5 d后,取6塊病菌菌餅(Φ=5 mm)接種到含100 mL PDB培養(yǎng)基的三角瓶中,置于28 ℃,150 r/min振蕩培養(yǎng)3 d。再應(yīng)用德國(guó)AIRSENSE公司PEN3便攜式電子鼻獲取菌株發(fā)酵液氣味的響應(yīng)值。電子鼻傳感器陣列包含10個(gè)傳感器(見(jiàn)表1)。測(cè)定時(shí),傳感器涂層吸附樣品中的揮發(fā)性物質(zhì)產(chǎn)生電導(dǎo)率變化,記錄傳感器吸附樣品揮發(fā)物后的電導(dǎo)率G與傳感器吸附經(jīng)活性碳過(guò)濾的空氣后的電導(dǎo)率G0的比值G/G0(即相對(duì)電導(dǎo)率),響應(yīng)氣體濃度越大,G/G0的值越偏離1,如果濃度低于檢測(cè)限或者沒(méi)有感應(yīng)氣體,則該比值接近甚至等于1。

      1.3 傳感器響應(yīng)值數(shù)據(jù)處理

      采用電子鼻自帶的 Winmuster 軟件進(jìn)行主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)、線(xiàn)性判別分析(Linear Discriminant Analysis,LDA)、載荷分析(loading Analysis)。利用軟件SPSS進(jìn)行多因素方差分析、聚類(lèi)分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 主成分分析(PCA)

      利用48、49、50 s時(shí)的響應(yīng)值進(jìn)行主成分分析(PCA),結(jié)果表明,第一主成分(PC1)區(qū)分貢獻(xiàn)率為98.98%,區(qū)分貢獻(xiàn)率大于90%,表明第一主成分已經(jīng)基本代表了樣品的主要信息特征(圖1)。第二主成分(PC2)區(qū)分貢獻(xiàn)率僅為0.63%,但在區(qū)分不同病菌種類(lèi)中起重要作用。通過(guò)PCA分析發(fā)現(xiàn),相同的病原菌分別聚在相近的位置,從而可以將4種病原菌較好的區(qū)分開(kāi)來(lái)。其中B. theobromae和其它3種病菌的距離最遠(yuǎn),且3株B. theobromae的距離也相對(duì)較大。C. gloeosporioides、D. dominicana和P.mangiferae在第一主成分上差異較小,三者之間的區(qū)別主要體現(xiàn)在第二主成分上。

      2.2 線(xiàn)性判別(LDA)分析

      利用傳感器第48、49、50 s時(shí)的響應(yīng)值進(jìn)行線(xiàn)性判別式(LDA)分析,結(jié)果表明, 第一判別式(LD1)的貢獻(xiàn)率為98.95%,大于90%,已經(jīng)基本代表了樣品的主要信息特征(圖2)。第二判別式(LD2)的貢獻(xiàn)率僅為0.83%,但在區(qū)分不同病菌種類(lèi)中起關(guān)鍵作用。利用線(xiàn)性判別式分析,可以將BT、CG、DD、PM這4種不同的病原菌很好的區(qū)分開(kāi),相同的病原菌分別落在相近的位置(圖1,2),B. theobromae和其它3種病菌的區(qū)別較大,而C. gloeosporioides、D. dominicana和P.mangiferae的區(qū)別主要體現(xiàn)于第二判別式。

      2.3 載荷(loading)分析

      通過(guò)載荷分析,可以得出電子鼻的10個(gè)傳感器分別對(duì)樣品的PCA主成分分析的貢獻(xiàn)率。其中S7號(hào)傳感器對(duì)第一主成分區(qū)分和第二主成分區(qū)分貢獻(xiàn)率最大。S2、S6、S8、S9號(hào)傳感器對(duì)第一主成分貢獻(xiàn)率較大;S2、S7、S8號(hào)3個(gè)傳感器對(duì)應(yīng)的點(diǎn)在第一象限中距離很近,說(shuō)明這3個(gè)傳感器的響應(yīng)值并不是菌株揮發(fā)性氣體的特征信號(hào),S1、S3、S4、S5、S10這5個(gè)傳感器對(duì)第一主成分區(qū)分和第二主成分區(qū)分貢獻(xiàn)率均很?。▓D3)。

      2.4 響應(yīng)值方差分析

      利用病原菌對(duì)電子鼻傳感器第50 s的響應(yīng)值進(jìn)行多因素方差分析,結(jié)果如表2所示。其中 Wilks'Lambda表示組內(nèi)變異與總變異的比值,在0~1之間; Wilks' Lambda值越接近1,表示各個(gè)組間的差異越?。籛ilks'Lambda越接近0,表示組間差異越大。由表2可知,4種病原菌間響應(yīng)值的Wilks'Lambda均接近0,說(shuō)明不同病菌間有明顯差異,差異水平顯著(p<0.05)。

      2.5 不同病原菌響應(yīng)值的聚類(lèi)分析

      利用12株病原真菌對(duì)電子鼻傳感器第50s的特征響應(yīng)值,按照系統(tǒng)聚類(lèi)的歐氏距離ward法進(jìn)行系統(tǒng)聚類(lèi),結(jié)果表明(圖4),同種的3株病原真菌分別聚成一類(lèi)。不同病原菌之間關(guān)系有差別。其中C. gloeosporioides和D. dominicana的距離最近,其次是P. mangiferae;B. theobromae與其它3種病原菌的距離較遠(yuǎn)。

      3 討論與結(jié)論

      真菌可以釋放出多種揮發(fā)性物質(zhì)[1-2],但揮發(fā)物的氣味特征和種類(lèi)之間是否有相關(guān)性、是否能根據(jù)氣味特征進(jìn)行種類(lèi)的識(shí)別等尚未見(jiàn)報(bào)道。本文利用電子鼻對(duì)不同芒果4種病原真菌發(fā)酵液進(jìn)行氣味的測(cè)定,并對(duì)10組傳感器的響應(yīng)值進(jìn)行了PCA分析、LDA分析、方差分析和聚類(lèi)分析,每種分析結(jié)果均可把同種病原菌的3株菌株劃為一組,從而較好區(qū)別不同的病原菌,初步證明同種病菌的發(fā)酵液具有相似的揮發(fā)性氣味,且有區(qū)別于其他病菌。聚類(lèi)分析的結(jié)果表明,C. gloeosporioides和D. dominicana的距離最近,說(shuō)明其發(fā)酵液氣味較相近,B. theobromae與其它病原菌的氣味差異較大。筆者利用Genebank上rDNA-ITS序列構(gòu)建4種病原菌系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的聚類(lèi)結(jié)果表明,C. gloeosporioides和P.mangiferae關(guān)系較近,而B(niǎo). theobromae和D. dominicana的關(guān)系較近。該結(jié)果與電子鼻傳感器響應(yīng)值的聚類(lèi)結(jié)果有很大差異。說(shuō)明供試病菌的氣味差異與其親緣關(guān)系的親疏沒(méi)有相關(guān)性。

      朱娜等[10]利用電子鼻特征傳感器響應(yīng)值,構(gòu)建了草莓感染3種霉菌類(lèi)型的判別模型,判別準(zhǔn)確率達(dá) 95%以上。本研究中由于沒(méi)有足夠的實(shí)驗(yàn)樣本量,無(wú)法運(yùn)用Fisher 線(xiàn)性判別分析等方法構(gòu)建判別模型,在后期研究中,增加每種病菌的實(shí)驗(yàn)樣本量,建立準(zhǔn)確的病菌類(lèi)型判別數(shù)學(xué)模型,從而實(shí)現(xiàn)利用電子鼻進(jìn)行4種芒果采后病害種類(lèi)的準(zhǔn)確區(qū)分和判別。為芒果采后病原菌種類(lèi)的判斷提供有效的輔助手段。

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