宋光魯, 郭小麗, 孫 浩, 凱撒兒·阿吉, 安尼瓦爾·牙生, 王玉杰
(新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿中心, 烏魯木齊 830054)
尿路結(jié)石是由基因、環(huán)境和激素等相互作用而引起的多因素疾病。伴隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展及人們對(duì)尿路結(jié)石研究的深入,遺傳基因?qū)δ蚵方Y(jié)石形成的影響越來(lái)越引起眾多研究者的關(guān)注。目前的研究顯示,與尿路結(jié)石有關(guān)的維生素D受體(VDR)基因多態(tài)性位點(diǎn)較多,主要是限制性?xún)?nèi)切酶BsmI、ApaI、TaqI、FokI的酶切位點(diǎn)[1]。從人種學(xué)來(lái)說(shuō),漢族、蒙古族等屬于蒙古人種,而維吾爾族、哈薩克族等屬于高加索人種,不同的人種,VDR基因多態(tài)性的分布頻率存在差異[2-3]。本研究采用PCR-RFLP及DNA測(cè)序技術(shù),對(duì)新疆南疆地區(qū)的維吾爾族小兒上尿路含鈣結(jié)石患兒的VDR基因多態(tài)性進(jìn)行研究,探討維吾爾族小兒患者VDR基因型頻率分布特點(diǎn)及規(guī)律,試圖揭示其與維吾爾族小兒上尿路結(jié)石發(fā)病的關(guān)系和遺傳機(jī)制。
1.1研究對(duì)象選擇2011年3月-2013年6月在新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科住院治療的南疆地區(qū)維吾爾族上尿路結(jié)石患兒為病例組(n=89),年齡6個(gè)月~7歲,男性57例,女性32例。所有患兒經(jīng)CT、靜脈尿路造影(IVP)和B超檢查明確診斷為“上尿路結(jié)石”,常規(guī)行血尿液樣本檢查、血肝腎功能檢查、血電解質(zhì)檢查。所有患兒結(jié)石樣本進(jìn)行紅外光譜結(jié)石成分分析證明含有鈣鹽的成分。選擇同期同一地區(qū)健康維吾爾族兒童作為對(duì)照組(n=121),生活習(xí)慣和飲食習(xí)慣均相近,男性67例,女性54例,所有兒童無(wú)家族性結(jié)石病史,經(jīng)泌尿系超聲檢查無(wú)尿路結(jié)石、腎鈣化等異常病變,常規(guī)行血尿樣本檢查、血肝腎功能檢查、血電解質(zhì)檢查。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)尿路結(jié)石的診斷標(biāo)準(zhǔn)參考第9版《坎貝爾泌尿外科學(xué)》及第7版人民衛(wèi)生出版社出版的《外科學(xué)》教科書(shū),且均行CT、IVP和B超確診為“上尿路結(jié)石”即“腎及輸尿管結(jié)石”;(2)維吾爾族患兒及父母均出生于新疆南疆地區(qū);(3)所有患兒的結(jié)石樣本經(jīng)分析為含鈣成分的結(jié)石類(lèi)型如草酸鈣、磷酸鈣、碳酸鈣等。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)患有鈣磷代謝有關(guān)其他疾病者如佝僂病、甲狀腺功能障礙、甲狀旁腺功能障礙者;(2)有臨床表現(xiàn)的尿路感染并正接受治療的患兒。(3)患尿路結(jié)石的患兒伴隨有腎盂輸尿管狹窄、腎功能不全、腎小管酸中毒癥、腫瘤疾病、骨質(zhì)疏松等。(4)補(bǔ)充維生素D及服用含鈣成分的藥品、補(bǔ)品等兒童。本研究通過(guò)新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)同意批準(zhǔn)。抽血前均告知所有研究對(duì)象的合法家長(zhǎng)并簽署標(biāo)本收取知情同意書(shū)。
1.2主要試劑紅細(xì)胞裂解液、細(xì)胞核裂解液、蛋白沉淀液、DNA溶解液、1×TAE緩沖液、5×TBE緩沖液(北京百泰克生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)),外周血基因組DNA提取試劑盒(美國(guó)Gentra公司),Agarose(美國(guó)sigma 公司),EDTA(北京化學(xué)試劑公司生產(chǎn)),內(nèi)切酶(MBI Fermentas公司),引物(上海生工生物公司)。
1.3方法
1.3.1 提取基因組DNA 抽取外周靜脈血2 mL,用外周血基因組DNA提取試劑盒提取分離。DNA產(chǎn)物-80℃保存。
1.3.2 PCR 擴(kuò)增 查Genebank數(shù)據(jù)庫(kù)確定基因型及序列[rs:2228570,rs7975232rs731236],VDR基因FokI酶切位點(diǎn)引物序列為:上游引物:5’-AGC TGG CCC TGG CAC TGA CTC TGC TCT-3’,下游引物:5’-ATG GAA ACA CCT TGC TTC TTC TCC CTC-3’;ApaI酶切位點(diǎn)引物序列為:上游引物:5’-CAG AGC ATG GAC AGG GAG CAA-3’,下游引物:5’-GCA ACT CCT CAT GGC TGA GGT CTC-3’;TaqI酶切位點(diǎn)引物序列為:上游引物:5’-CTC AGT GAT CAC GAT ACT GTG-3’,下游引物:5’-ATT CAG TGG AAC CAG CGT TGG-3’。采用聚合酶鏈反應(yīng)方法,擴(kuò)增回收所需的DNA片段產(chǎn)物。
1.3.3 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析 采集10 μL PCR產(chǎn)物分別加入2單位ApaI、TaqI、FokI內(nèi)切酶,在37℃過(guò)夜進(jìn)行內(nèi)切后,經(jīng)3%瓊脂糖凝膠跑電泳,因酶切后的條帶片段較小,且2個(gè)條帶的距離較近,需低電壓長(zhǎng)時(shí)間跑電泳,保證條帶充分分開(kāi)。電泳初始進(jìn)膠電壓為100 V,持續(xù)電壓為60 V,跑60 min,之后在紫外燈下觀察及拍照記錄。
1.3.4 結(jié)果鑒定 VDR基因的目的片段經(jīng)相應(yīng)內(nèi)切酶內(nèi)切以后電泳條帶會(huì)出現(xiàn)3種情況:有內(nèi)切位點(diǎn)的純合子出現(xiàn)2個(gè)條帶,以ff/tt/aa表示;沒(méi)有內(nèi)切位點(diǎn)的純合子出現(xiàn)1個(gè)條帶,以FF/TT/AA表示;雜合子出現(xiàn)3個(gè)條帶,用Ff/Tt/Aa表示。
1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)處理使用Microsoft Excel建立數(shù)據(jù)庫(kù),使用SPSS11.5軟件分析數(shù)據(jù)。采用χ2檢驗(yàn)分析等位基因頻率、基因型頻率和病例組與對(duì)照組之間基因型分布差異,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。由Hardy-Weinberg定律可知,等位基因A1和等位基因A2的頻率分別為p和q,(p+q)2=p2+2pq+q2=1,p2、2pq、q2分別為野生型、雜合型和變異型3種基因型的理論頻率,并由此推算出其理論頻數(shù),并將理論數(shù)與觀察數(shù)進(jìn)行χ2檢驗(yàn)。當(dāng)P>0.05時(shí),認(rèn)為觀察所得的基因頻率符合Hardy-Weinberg定律,該基因多態(tài)性在人群中已達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性。對(duì)病例組和對(duì)照組研究對(duì)象的性別和年齡進(jìn)行χ2檢驗(yàn)和t檢驗(yàn),當(dāng)P>0.05時(shí),該基因多態(tài)性在人群中已達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性。
2.1酶切后VDR基因的電泳結(jié)果VDR基因的FokI位點(diǎn)酶切后產(chǎn)生3種情況:265 bp 1個(gè)條帶,以FF表示;196 、69 bp 2個(gè)條帶,以ff表示;265、196和69 bp 3個(gè)條帶,以Ff表示,見(jiàn)圖1。
VDR基因的ApaI位點(diǎn)酶切后產(chǎn)生3種情況:1 700 、300 bp的2個(gè)條帶,以AA表示;2 000、1 700和300 bp 3個(gè)條帶,以Aa表示;2 000 bp 1個(gè)條帶,以aa表示,見(jiàn)圖2。
VDR基因的TaqI位點(diǎn)酶切后產(chǎn)生3種情況:495、245 bp的2個(gè)條帶,以TT表示;495、290、245和205 bp的4個(gè)條帶,以Tt表示;290、245和205 bp的3個(gè)條帶,以tt表示,見(jiàn)圖3。
圖1 VDR基因FokI位點(diǎn)酶切后條帶分布
圖2 VDR基因ApaI位點(diǎn)酶切后條帶分布
圖3 VDR基因TaqI位點(diǎn)酶切后條帶分布
2.2VDR基因的基因型和等位基因的頻數(shù)分布
2.2.1 VDR基因型的Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn) 由Hardy-Weinberg定律可知,對(duì)VDR基因多態(tài)性中3個(gè)基因型觀察所得的基因頻率符合Hardy-Weinberg定律,該基因多態(tài)性在人群已達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性,見(jiàn)表1。
2.2.2 病例組與對(duì)照組VDR等位基因的分布 在病例組和對(duì)照組的VDR基因多態(tài)性中,F(xiàn)okI的等位基因差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=15.040;P<0.001),攜帶f等位基因的人群患上尿路含鈣結(jié)石的危險(xiǎn)性是攜帶F等位基因的人群的2.208倍(OR:2.208,95%CI:1.480~3.295)。病例組和對(duì)照組ApaI的等位基因A/a和TaqI的等位基因T/t差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.350,P=0.552;χ2=2.930,P=0.093),見(jiàn)表2。
2.2.3 病例組與對(duì)照組VDR基因型的分布 在病例組和對(duì)照組的VDR基因多態(tài)性中,F(xiàn)okI的基因型差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=11.621,P<0.001),攜帶Ff基因型和攜帶ff基因型的人群患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)有明顯的增加(OR:1.084,95%CI:0.501~2.345;OR:4.259,95%CI:1.851~9.797);病例組和對(duì)照組ApaI的基因型Aa、aa差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.287,P=0.592),攜帶Aa基因型和攜帶aa基因型的人群無(wú)明顯差異(OR:0.966,95%CI:0.497~1.878;OR:0.826,95%CI:0.410~1.664);病例組和對(duì)照組TaqI的基因型Tt、tt差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=2.483,P=0.115),攜帶Tt基因型和攜帶tt基因型的人群患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)無(wú)明顯增加(OR:0.568,95%CI:0.293~1.101;OR:0.547,95%CI:0.258~1.158),見(jiàn)表3。
2.2.4 病例組與對(duì)照組不同性別VDR基因型的分布FokI的基因型在男性患上尿路含鈣結(jié)石患者中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.497,P=0.004),F(xiàn)okI的基因型Ff和ff的男性患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)較高(OR:0.984,95%CI:0.370~2.618;OR:4.846,95%CI:1.677~14.006),F(xiàn)okI的基因型在女性患上尿路含鈣結(jié)石患者中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.230,P=0.072);ApaI的基因型在男性和女性患上尿路含鈣結(jié)石患兒中差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.938,P=0.164;χ2=0.828,P=0.363);TaqI的基因型在男性和女性患上尿路含鈣結(jié)石患兒中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.667,P=0.197;χ2=0.937,P=0.333),見(jiàn)表4。
表1 VDR基因型的Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)
表2 病例組與對(duì)照組VDR等位基因的分布/例(%)
表3 病例組與對(duì)照組VDR基因型的分布/例(%)
表4 病例組與對(duì)照組不同性別VDR基因型的分布/例(%)
尿路結(jié)石是泌尿外科常見(jiàn)的一種疾病,也是世界上發(fā)病率較高的疾病,其人群患病率為1%~5%。通過(guò)各種結(jié)石分析方法的應(yīng)用,人們發(fā)現(xiàn)在尿路結(jié)石中約有90%以上含有鈣的成分,病因?qū)W的研究充分證實(shí)了尿路結(jié)石形成過(guò)程中體內(nèi)鈣的代謝異常是含鈣結(jié)石的重要因素,因此影響體內(nèi)鈣的新陳代謝改變的因素都可能導(dǎo)致機(jī)體患結(jié)石病[4]。尋找正確的基因標(biāo)記物對(duì)于監(jiān)測(cè)和預(yù)防尿路結(jié)石有深遠(yuǎn)的影響。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)作為繪制復(fù)雜疾病的工具的出現(xiàn),使尋找引起結(jié)石疾病中鈣離子新陳代謝異常原因的候選基因成為可能。其中含鈣尿路結(jié)石的可能候選基因之一被認(rèn)為是維生素D受體(VDR)基因、降鈣素受體基因(CTR)和CaSR等,其中VDR基因?qū)}尿路結(jié)石形成的影響越來(lái)越引起學(xué)者們的關(guān)注[5]。
VDR是一組類(lèi)固醇受體家族,基因位于第12染色體上,大約全長(zhǎng)5.6 kb。其為介導(dǎo)活性1,25-二羥維生素-D3發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)的核受體,而許多不同的細(xì)胞內(nèi)基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控著1,25-二羥維生素-D3的活性代謝產(chǎn)物?;钚?,25-二羥維生素-D3激素信號(hào)分子與靶細(xì)胞核內(nèi)的VDR結(jié)合形成激素受體復(fù)合物,后者再與靶基因特定的DNA序列結(jié)合,從而對(duì)結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)產(chǎn)生調(diào)節(jié)作用。維生素D在目標(biāo)細(xì)胞的效果被維生素D的活性代謝產(chǎn)物和它的細(xì)胞內(nèi)受體(VDR)的相互作用所調(diào)節(jié)。VDR在維持機(jī)體鈣磷代謝等方面起著重要作用。在VDR基因中有幾個(gè)基因多態(tài)性已被分離,它們?cè)诠δ苌厦黠@的或潛在的在疾病易感性的效果也已經(jīng)被查明[1]。
1999年Scott等[6]運(yùn)用特殊的微衛(wèi)星、核苷內(nèi)切酶FokI和Tru91等技術(shù)發(fā)現(xiàn)位于維生素-D受體(VDR)基因的12q12-14位點(diǎn)與結(jié)石的形成有明顯的關(guān)聯(lián)性,認(rèn)為VDR基因參與尿路結(jié)石的形成。有關(guān)研究通過(guò)對(duì)有遺傳性高尿鈣癥的大鼠分析發(fā)現(xiàn)大鼠體內(nèi)具有較高的VDR濃度水平與其結(jié)石的形成有密切關(guān)系[7]。2001年Chen等[8]報(bào)道在臺(tái)灣人群中VDRFokI基因多態(tài)性與草酸鈣尿路結(jié)石的形成有明顯的關(guān)聯(lián)性。Bid等[9]發(fā)現(xiàn)VDR中FokI基因多態(tài)性與草酸鈣腎結(jié)石有明顯聯(lián)系。Bid等[10]和Mittal等[11]對(duì)健康和患尿路結(jié)石的印度兒童進(jìn)行的研究結(jié)果顯示,病例組與對(duì)照組維生素D受體基因FokI位點(diǎn)多態(tài)性分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,認(rèn)為FokI基因多態(tài)性與印度兒童腎結(jié)石的形成有相關(guān)。但是Wang等[12]對(duì)464例漢族尿路結(jié)石患者及450例正常人群進(jìn)行維生素D受體基因多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)FokI基因多態(tài)性與含鈣尿路結(jié)石的形成不存在相關(guān)性。Relan等[13]也報(bào)道維生素D受體BsmI和FokI基因多態(tài)性與尿路結(jié)石沒(méi)有聯(lián)系。王勤章等[14]對(duì)新疆南部地區(qū)90例維吾爾族尿路結(jié)石患者基因多態(tài)性研究的結(jié)果顯示:對(duì)照組與病例組FokI酶切位點(diǎn)FF、Ff、ff 3種基因型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),其中維生素D受體基因FokI位點(diǎn)多態(tài)性將來(lái)可能成為尿路結(jié)石檢測(cè)和篩選的一項(xiàng)指標(biāo)。本研究發(fā)現(xiàn)病例組與對(duì)照組FokI的等位基因差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),攜帶f等位基因的人群患上尿路含鈣結(jié)石的危險(xiǎn)性是攜帶F等位基因的人群的2.208倍(OR:2.208,95%CI:1.480~3.295)。說(shuō)明FokI的等位基因F是避免人群患上尿路含鈣結(jié)石的保護(hù)基因,而等位基因f是人群患上尿路含鈣結(jié)石的易感基因。還發(fā)現(xiàn)病例組與對(duì)照組FokI的基因型差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),攜帶Ff基因型和攜帶ff基因型的人群患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)有明顯的增加(OR:1.084,95%CI:0.501~2.345;OR:4.259,95%CI:1.851~9.797)。FokI的基因型在男性患上尿路含鈣結(jié)石患者中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.004),F(xiàn)okI的基因型Ff和ff的男性患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)較高(OR:0.984,95%CI:0.370~2.618;OR:4.846,95%CI:1.677~14.006),F(xiàn)okI的基因型在女性患上尿路含鈣結(jié)石患者中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.072)。說(shuō)明VDR的FokI基因多態(tài)性和維吾爾族小兒上尿路含鈣結(jié)石的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能存在相關(guān)性,F(xiàn)okI基因多態(tài)性在不同種族的含鈣尿路結(jié)石的形成中起著不同的作用,VDR的FokI基因可能作為篩選新疆維吾爾族小兒上尿路含鈣結(jié)石的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)候選基因。
在目前的研究中,對(duì)VDR基因中ApaⅠ基因多態(tài)性與含鈣尿路結(jié)石的形成是有爭(zhēng)議的。Wang等[12]研究結(jié)果顯示VDR基因中的ApaⅠ基因多態(tài)性與漢族含鈣尿路結(jié)石的形成有密切關(guān)系,攜帶ApaⅠ的A等位基因的人群患尿路結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)是對(duì)照組的1.4倍。但是Nishijima等[15]報(bào)道在日本人人群中病例組和對(duì)照組VDR基因的ApaⅠ基因型無(wú)明顯差異;病例組TaqⅠ的Tt和tt基因型的發(fā)生頻率明顯增高,并且TaqⅠ的t等位基因患含鈣尿路結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)是對(duì)照組的5.2倍。Jackman等[16]的研究提出對(duì)于家族性含鈣尿路結(jié)石的患者中有35% 表現(xiàn)為VDR基因中的TaqⅠTT基因型,并且攜帶TaqⅠTT基因型的患者在尿路結(jié)石發(fā)病和疾病進(jìn)展等方面具有遺傳性和結(jié)石復(fù)發(fā)高的特點(diǎn)。但是Gunes等[17]分別對(duì)110例結(jié)石患者和150例對(duì)照者通過(guò)PCR對(duì)基因多態(tài)區(qū)運(yùn)用電鏡放大分析了VDR基因中TaqⅠ、BsmⅠ和ApaⅠ基因多態(tài)性區(qū)域,計(jì)算基因型和等位基因與尿路結(jié)石、家族病史以及結(jié)石復(fù)發(fā)等的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)相鄰的限制性?xún)?nèi)切酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性的單倍體結(jié)構(gòu)在尿路結(jié)石患者中過(guò)度表達(dá)。但是,雜合子和純合子攜帶者差異卻無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,僅發(fā)現(xiàn)基因多態(tài)性和家族性尿路結(jié)石病史有聯(lián)系。因此,他們認(rèn)為VDR基因中TaqⅠ、BsmⅠ和ApaⅠ基因多態(tài)性對(duì)尿路結(jié)石疾病的發(fā)生的危險(xiǎn)性無(wú)意義。本研究結(jié)果顯示,病例組和對(duì)照組ApaI的等位基因A/a和TaqI的等位基因T/t差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.552;P=0.093),兩組ApaI的基因型Aa、aa差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.592);兩組TaqI的基因型Tt、tt差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.115),攜帶Tt基因型和攜帶tt基因型的人群患上尿路含鈣結(jié)石的風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有明顯增加(OR:0.568,95%CI:0.293~1.101;OR:0.547,95%CI:0.258~1.158)。ApaI的基因型在男性和女性患上尿路含鈣結(jié)石患者中均沒(méi)有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.164;P=0.363);TaqI的基因型在男性和女性患上尿路含鈣結(jié)石患者中沒(méi)有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.197;P=0.333)。說(shuō)明維生素D受體(VDR)的TaqⅠ和ApaⅠ基因多態(tài)性和新疆維吾爾族小兒含鈣上尿路結(jié)石之間可能不存在相關(guān)性,不能作為新疆維吾爾族小兒含鈣尿路結(jié)石的篩選基因。這種維生素D受體(VDR)基因中等位基因多態(tài)性的表現(xiàn)頻率的不平衡可能與種族不同有關(guān)。
總之,通過(guò)對(duì)新疆南部地區(qū)維吾爾族小兒尿路結(jié)石與維生素D受體基因多態(tài)性的研究顯示:維生素D受體的FokI基因多態(tài)性與維吾爾族上尿路含鈣結(jié)石有相關(guān)性,F(xiàn)等位基因是尿路結(jié)石的保護(hù)基因,f基因型則是尿路結(jié)石的易感基因,而VDR的ApaI和TaqI基因多態(tài)性與含鈣尿路結(jié)石的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能不存在相關(guān)性。因此,維生素D受體的FokI基因多態(tài)性將來(lái)可能成為維吾爾族小兒上尿路含鈣結(jié)石檢測(cè)和篩選的指標(biāo)。
參考文獻(xiàn):
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