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      魚腥藻鐵調蛋白基因(alr0957)表達和Fe3+對藻生長的影響

      2014-08-06 01:17:54陳思禮龔鳳嬌
      關鍵詞:魚腥葉綠素克隆

      陳思禮,龔鳳嬌,田 申

      (中南民族大學 生命科學學院, 武漢 430074)

      在魚腥藻PCC7120中,鐵元素的代謝途徑由基因fur(furric uptake regulator)編碼的鐵吸收調節(jié)蛋白Fur調控.PCC7120基因組中有3種同源Fur基因,分別編碼3種蛋白:FurA, FurB和FurC. FurC不與啟動子結合,而是通過影響前兩種蛋白與DNA靶位點結合的能力[1],從轉錄水平調節(jié)與鐵代謝相關基因的表達[2].Fur是典型的負調控因子.當亞鐵離子富足時,為避免過量金屬對細胞產(chǎn)生毒性,F(xiàn)ur與亞鐵離子結合成聚合物,占據(jù)調控區(qū)域,阻遏該基因表達;當亞鐵離子貧乏時,未結合到亞鐵離子的Fur蛋白不能順利結合到DNA調控序列,則相關的基因表達開啟.此外,F(xiàn)ur還對異形胞分化,轉錄調節(jié)和氧化還原平衡等功能相關的基因有重疊調控作用[3],還能抵御氧化脅迫和其它環(huán)境脅迫[4].

      此次研究克隆出魚腥藻PCC7120FurC基因(alr0957),成功構建表達載體pET-fur,并在大腸桿菌BL21中表達出了帶有組氨酸標簽的融合蛋白,并通過設計不同F(xiàn)e3+濃度梯度,探討不同鐵離子濃度對藻類生長的影響,為進一步該蛋白研究奠定了基礎.

      1 材料與方法

      1.1 藻種和細菌菌株

      魚腥藻Anabaenasp.PCC 7120購于中科院水生生物研究所淡水藻種庫(FACHB).大腸桿菌DH5α、BL21(DE3)均為本實驗室保藏菌種.

      1.2 載體質粒及其他試劑

      pET-28a(+)載體為本實驗室構建并保存,pMD18-T載體(Takara公司),DNA聚合酶(Fermentas公司),限制性內切酶、T4 DNA連接酶(Takara公司),瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質粒DNA提取試劑盒(Axygene公司), PCR引物合成和基因序列測定由南京金斯瑞生物科技有限公司完成.

      1.3 基因組DNA提取

      PCC7120基因組DNA提取對傳統(tǒng)酚氯仿作了改進.離心收集對數(shù)期藻細胞,無菌水清洗1次,重懸于100 mmol/L EDTA(pH 8.0),80 μL 50 mg/mL溶菌酶至終濃度2 mg/mL,37 ℃水浴約37 min,置于-20 ℃冰柜冷藏約30 min,反復數(shù)次直至溶液呈藍綠色.加入SDS至終濃度1.5%,60 ℃水浴10 min至溶液變黃以充分裂解.再利用酚氯仿法對DNA進一步分離純化.嚴格按照分子生物學標準方法進行操作[5].

      1.4 引物設計與基因克隆

      為便于克隆,在引物F1:5′-CGGGATCCTATGCAGCAACAGGCAATATC-3′和R1:5′-CCCAAGCTTCTACTCTTCATCTTGAGGATGC-3′中分別添加BamH I和Hind III酶切位點.PCR反應體系中含2.5μL 10×Taq buffer,引物各1μL,1μL dNTPs,2μL模板DNA,1μL DNA聚合酶,ddH2O補足到25 μL.PCR反應程序如下: 95 ℃預變性5 min; 95 ℃變性40 s,65 ℃~50 ℃復性40 s(每循環(huán)下降0.5 ℃),72 ℃延伸1 min,30個循環(huán);95 ℃變性40 s, 50 ℃退火40 s,72℃延伸1 min, 15個循環(huán);72 ℃延伸10 min.DNA凝膠回收層析柱純化回收目的片段.與載體pMD18-T連接過夜,轉化E.coliDH5α,轉化子涂布于含氨芐青霉素LB平板上,并用藍白斑篩選陽性克隆.經(jīng)菌液PCR、質粒提取、雙酶切等初步鑒定,送測序通過序列比對得以確定.

      1.5 重組表達載體的構建

      測序正確后,分別對pMD18-T-fur、pET-28a(+)提質粒,并由雙酶切、回收目的片段在T4 DNA連接酶的作用下連接,轉化到E.coliBL21感受態(tài)細胞中,涂布于卡那抗性LB平板上,篩選陽性克隆,送測序以確定.

      1.6 重組蛋白的體外表達

      將含pET-fur的重組菌BL21接種于含50 μg/mL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)約3 h至OD600≈0.5,加入1 mmol/L的IPTG于37℃下?lián)u床培養(yǎng)18 h,誘導目的蛋白表達.離心收集沉淀,加入2×SDS凝膠緩沖液和還原性保護劑β-巰基乙醇,沸水浴5 min,離心取上清,用SDS-PAGE電泳檢測外源蛋白質的分子量.

      1.7 蛋白的純化

      用鎳柱層析純化pET系列載體表達產(chǎn)物.IPTG誘導后離心收集菌體,用Binding Buffer(BB)溶解,超聲裂解30 min后離心去除雜質,取上清,離心后得包涵體.用含尿素的BB洗包涵體,將上清溶解液上柱,平衡柱子后進行柱層析,分管收集,每管2 mL.

      1.8 Fe3+對魚腥藻生長的影響

      1.8.1 藻生長密度的測定

      配制200 mL培養(yǎng)基,每個濃度設3個平行樣品(配方略).接種10 mL對數(shù)期Anabaenasp.PCC 7120藻培養(yǎng)液至培養(yǎng)基中,使初始濃度在OD730≈0.5.接種好的藻液在25℃光照培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),設置培養(yǎng)箱光照強度為2000 lux、光暗比為14 h︰10 h,每日輕輕震蕩數(shù)次,從次日起,每天同一時間測定OD730,觀察其生長情況.以生理鹽水為參比溶液,測定魚腥藻Anabaenasp.PCC 7120生長曲線.每個濃度的測量最終值取3個平行樣品的均值.

      1.8.2 葉綠素含量的測定

      取10 mL藻細胞培養(yǎng)液,用0.45μm微孔濾膜抽濾,轉移藻細胞至研缽中,加入6 mL 90%乙醇溶液,冰上充分研磨,將研磨液轉入刻度試管中,4 ℃靜置12 h進行暗反應, 4000 r/min離心15 min;轉移上清至10 mL試管,向沉淀中加4 mL 90 %乙醇,靜置1h后再4000 r/min離心15 min,合并兩次提取的上清.以90 %乙醇作參比,在波長664 nm下測吸光度值,取每組平均值.計算葉綠素含量的公式為[6]:葉綠素濃度(mg/L)=(OD664×1000)/34.5。

      1.8.3 蒽酮比色法測定總糖含量

      制作葡萄糖標準曲線,620 nm比色得到葡萄糖標準曲線的公式(y=1.0093x-0.0177,y為蒽酮比色法測得的OD620,如表1).離心管收集培養(yǎng)至第7天的藻液,4 ℃ 9000 r/min離心10 min,棄上清,加入0.5 mol/L、pH 6.8的Tris-HCl緩沖液3 mL懸浮洗滌沉淀,4 ℃ 9000 r/min離心5 min,重復一次.菌體重懸于5 mL預冷的超聲破碎細胞緩沖液中充分破碎細胞,取1 mL細胞破碎液,加4 mL蒽酮試劑混合均勻,沸水中煮沸10 min,取出后流水冷卻,室溫放置10 min,使之顯色穩(wěn)定,620 nm比色.根據(jù)測得OD620值,由葡萄糖標準曲線的公式計算藻的糖含量.

      表1 葡萄糖標準溶液稀釋梯度

      2 結果

      2.1 FurC(alr0957)基因的克隆

      用touchdown PCR的方法從魚腥藻Anabaenasp.PCC 7120基因組DNA中成功擴增得到450 bp的目的片段,如圖1所示.將目的片段連接到pMD18-T載體上,再進行轉化和重組子篩選.經(jīng)鑒定測序,證明成功克隆了FurC基因.通過序列分析比對,可知該基因含有450 bp的開放閱讀框,編碼149個氨基酸,其相對分子量為17380.

      M:DNA Marker 2000;1~3) PCR產(chǎn)物圖1 PCR擴增產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Electrophoresis identification of PCR product

      2.2 重組表達載體pET-Fur的構建與鑒定

      pMD-Fur經(jīng)過BamH I/Hind III雙酶切后,與pET-28a(+)相連接,轉化表達菌株BL21,篩選陽性表達質粒.通過PCR、酶切初步鑒定均成陽性.經(jīng)測序與NCBI公布的序列完全一致,說明成功構建了pET-Fur. IPTG對其在體外進行誘導表達.

      2.3 融合蛋白的表達檢測及純化

      樣品經(jīng)超聲破碎并離心后,分別對上清和沉淀作SDS-PAGE電泳檢測,結果表明:表達出的蛋白可溶性較低,大部分存在于離心后的沉淀部分,因為目的蛋白位于破碎的細胞膜上或產(chǎn)生了包涵體,在上清中濃度很低.FurC含17328個氨基酸,由于pET-FurC所表達的融合蛋白其N端帶有T7-tag的11個氨基酸殘基序列MASMTGGQQMG和1個多聚組氨酸標簽,故預測該融合蛋白大小約為19 kD.如圖2所示,融合蛋白pET-Fur獲得了成功表達.經(jīng)過一系列蛋白表達條件的優(yōu)化,基本滿足蛋白純化的條件,利用鎳柱層析法純化FurC.

      M:蛋白質分子量標準;1) 普通菌株BL21;2) 含pET-28 a (+)空載體的BL21;3) 未誘導的重組質粒pET-Fur;4) 經(jīng)0.5 mmol/L IPTG誘導的重組質粒;5) 經(jīng)1 mmol/L IPTG誘導的重組質粒圖2 重組蛋白pET-Fur的SDS-PAGE檢測 Fig.2 The SDS-PAGE assay of expressed pET-Fur

      2.4 Fe3+對魚腥藻生長的影響

      通過設計不同F(xiàn)e3+濃度對魚腥藻PCC7120的生長影響實驗,研究藻細胞在生長過程中葉綠素和可溶性糖含量的變化,結果見圖3.圖3a中不同濃度的Fe3+影響下,PCC7120生長速率有較明顯差異.在0.1 ~0.5 mg/L時低濃度Fe3+對魚腥藻PCC 7120的生長有較明顯的促進作用,藻的生長在第3天出現(xiàn)轉折點,斜率增加進入對數(shù)期,且Fe3+濃度越高,藻的生長狀況越好,0.5 mg/L濃度為適合生長濃度.當Fe3+濃度大于0.9 mg/L時,隨濃度的升高,藻的生長速率逐漸減慢,生長量減少;當Fe3+濃度為4.0 mg/L時,藻的生長率與低濃度Fe3+藻培養(yǎng)液相比,生長速率明顯低于后者,甚至低于缺鐵組,7d后生長量依然最低,故高濃度的鐵對其生長有明顯的抑制作用.

      a~c)不同F(xiàn)e3+濃度下PCC 7120生長曲線、葉綠素a含量和可溶性糖含量圖3 不同F(xiàn)e3+濃度下魚腥藻Anabaena sp. PCC 7120生長指標的變化 Fig.3 Growth index changes in Anabaena sp.PCC 7120 treated with different concentrations of Fe3+

      圖3b中,當Fe3+濃度小于 0.5 mg/L,隨Fe3+濃度的增加,葉綠素含量遞增;但當Fe3+濃度大于0.9 mg/L時,鐵離子對葉綠素a的合成受到了高濃度鐵的脅迫作用,此時葉綠素a含量隨著Fe3+濃度的增大而減少,與藻培養(yǎng)液顏色變化一致. 圖3c中, Fe3+濃度梯度對糖含量影響與生長趨勢和葉綠素a含量的變化非常類似.由于Fe是糖分解、合成代謝途徑中的功能蛋白(如異檸檬酸脫氫酶)的重要組分,故糖含量在低Fe3+時隨其濃度升高而增加,一旦超出需要的范圍,則糖合成代謝被抑制,表現(xiàn)為隨Fe3+濃度增加而遞減.

      3 討論

      目前證實在E.coli中,F(xiàn)ur基因控制90多種鐵依賴性基因的表達,包括降解/合成鐵載體的有關的酶類、鐵載體受體、調控蛋白、膜載體、金屬還原酶等基因[7].而Fur蛋白調節(jié)細胞內鐵的生理代謝過程.

      本文成功地將魚腥藻PCC7120的alr0957(FurC)基因克隆并構建到表達載體pET-28a(+)上得到重組質粒pET-Fur,在37℃下經(jīng)1 mmol/L誘導18 h,成功表達了融合蛋白,表達產(chǎn)物的SDS-PAGE電泳檢測圖與預期一致,大小約19 KD.通過優(yōu)化表達條件實現(xiàn)了FurC蛋白的純化,為FurC基因的功能進一步研究奠定了基礎.

      鐵是藻類生長代謝的必需元素,但鐵濃度過高又會導致藻細胞滲透性增加,甚至引起藻類形態(tài)的變異[8].不同F(xiàn)e3+濃度影響魚腥藻Anabaenasp. PCC7120的生長,其生長量和生長速率、葉綠素a含量、可溶性糖含量隨Fe3+濃度變化先增后減,說明低濃度鐵對藻的生長起促進作用,而超過一定濃度(本實驗為0.9 mg/L)則為抑制作用.故治理藻類污染時,除了要注意控制氮、磷等大量元素外,還要考慮鐵等微量元素的調控作用.

      參 考 文 獻

      [1] Hernández J A, López-Gomollón S, Bes M T, et al. Three fur homologues from Anabaena sp. PCC7120: exploring reciprocal protein-promoter recognition[J]. FEMS Microbiol Lett, 2004, 236(2):275-282.

      [2] 李俊峰.有益菌A18菌株鐵載體的研究和鐵吸收調節(jié)蛋白(Fur)基因的克隆和表達[D].青島:中國海洋大學, 2005.

      [3] López-Gomollón S, Hernóndez J A, Pellicer S, et al. Cross-talk between iron and nitrogen regulatory networks in anabaena(Nostoc)sp.PCC 7120: identification of overlapping genes in FurA and NtcA regulons[J]. J Mol Biol, 2007,3741(1):267-281.

      [5] 薩姆布魯克J, 拉塞爾D W.分子克隆實驗指南精編版[M].黃培堂,王恒木梁,周曉巍,等譯.北京:化學工業(yè)出版社,2007.

      [6] 張麗彬, 王啟山, 徐新惠, 等.乙醇法測定浮游植物葉綠素a含量的討論[J].中國環(huán)境監(jiān)測, 2008, 24(6):9-10.

      [7] Hantke K. Members of the Fur protein family regulate iron and zinc transport inE.coliand characteristics of the Fur-regulated fhuF protein [J]. J Mol Microbiol Biotechnol, 2002, 4(3):217-222.

      [8] 劉曉海, 高云濤, 杜 剛, 等.鐵離子對滇池藻類生長的影響[J].環(huán)境污染與防治, 2006, 28(5):324-326.

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