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      杜氏鹽藻過氧化物酶1酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建*

      2014-10-08 07:19:08龔方華張彥婷王瑞莉薛樂勛關(guān)方霞
      關(guān)鍵詞:雙雜交鞭毛杜氏

      王 靜,龔方華,張彥婷,王瑞莉,薛樂勛 ,關(guān)方霞#

      1)鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 鄭州 450001 2)鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院細(xì)胞生物學(xué)研究室 鄭州 450052

      過氧化物酶廣泛存在于真核生物中,作為一種抗氧化劑,可以催化H2O2以及脂質(zhì)氫過氧化物還原,避免細(xì)胞受損[1]。過氧化物酶1(peroxiredoxin 1,Prdx1)是過氧化物酶家族中分布最為廣泛的成員之一,廣泛分布于胞質(zhì)、胞核中,參與細(xì)胞內(nèi)多種生理過程,例如Prdx1對H2O2介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)具有調(diào)節(jié)作用[2]。Prdx1 還存在于鞭毛中[3],但是其在鞭毛中的功能未知。杜氏鹽藻是一種單細(xì)胞真核藻類,可以在極端高鹽的環(huán)境下生長,具有等長雙鞭毛,因而非常適合作為研究鞭毛內(nèi)信號通路的模式生物[4]。該實(shí)驗(yàn)首先構(gòu)建杜氏鹽藻過氧化物酶1(Dunaliella salina Prdx1,DsPrdx1)酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒pGBKT7-Prdx1,并分別轉(zhuǎn)化酵母菌株Y187和AH109,檢測其對酵母菌株有無毒性和自激活作用,為篩選DsPrdx1相互作用蛋白、研究其在鞭毛中的功能打下基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料 杜氏鹽藻藻株為UTEX-LB-1644,購自美國得克薩斯州大學(xué),大腸桿菌DH5α和杜氏鹽藻cDNA酵母文庫由作者所在的實(shí)驗(yàn)室保存,酵母菌株Y187和 AH109、載體 pGBKT7購自 Clontech公司,載體pGEM-T購自Promega公司。酵母培養(yǎng)基購自上海 Genomics公司,X-α-gal購自Sigma公司,EcoRⅠ、BamHⅠ、T4 DNA連接酶均購自大連TaKa-Ra公司,質(zhì)粒提取試劑盒、凝膠回收試劑盒購自AXYGEN公司,PCR特異性引物由Sangon公司合成,紫外分光光度計購自Thermo公司,PCR儀購自Biometra公司,電泳儀購自北京六一實(shí)驗(yàn)儀器廠,凝膠成像儀購自Synoptics公司。

      1.2 DsPrdx1開放閱讀框(ORF)的擴(kuò)增 設(shè)計上、下游分別含有EcoRⅠ與BamHⅠ位點(diǎn)的特異性引物[Prdx-ORF上游引物:5'-CCGGAATTCATGCCTG TACCCACGATT-3'(EcoRⅠ),Prdx-ORF 下游引物:5'-CGCGGATCCTTATGACAGGGTGTTGAAGT-3'(BamHⅠ)],以杜氏鹽藻cDNA為模板,PCR擴(kuò)增DsPrdx1(GenBank序列號 KC999111)的 ORF。100 μL PCR反應(yīng)體系中含 LA Taq酶0.5 μL,上、下游引物(100 μmol/L)各 1 μL,dNTPs(10 nmol/L)8 μL,10 × LA Buffer 10 μL,模板 cDNA 1 μL,加 ddH2O 至100 μL。反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸70 s,30個循環(huán);72℃延伸10 min,4℃終止反應(yīng)。PCR反應(yīng)結(jié)束后,10 g/L的瓊脂糖凝膠電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物。

      1.3 PCR產(chǎn)物克隆和鑒定 PCR產(chǎn)物膠回收后與克隆載體pGEM-T相連,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中,將菌液均勻涂布于LB固體培養(yǎng)基上進(jìn)行藍(lán)白斑篩選。挑取白色單克隆于LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)6 h后提取質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定,酶切鑒定正確后測序以分析序列的正確性。

      1.4 誘餌質(zhì)粒pGBKT7-Prdx1的構(gòu)建 將鑒定正確的pGEM-T-Prdx1質(zhì)粒與pGBKT7載體用EcoRⅠ和BamHⅠ分別雙酶切,將回收純化的酶切后片段連接并轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,擴(kuò)大培養(yǎng)并提取質(zhì)粒pGBKT7-Prdx1,測序。

      1.5 誘餌質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化

      1.5.1 制備酵母感受態(tài)細(xì)胞 挑取酵母菌Y187和AH109的單克隆,接種于5 mL YPDA液體培養(yǎng)基中,30℃恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)16~20 h(230~250 r/min)至光密度值(OD600nm)為 0.15 ~0.30 后,接種于50 mL YPDA液體培養(yǎng)基中,30℃、250 r/min振蕩培養(yǎng)至OD600nm為0.40~0.50(約3 h)。室溫下將酵母菌菌液以2700 r/min離心5 min。棄上清,加50 mL去離子水重懸沉淀,再次離心棄上清。用3 mL TE/LiAc溶液重懸,將重懸的酵母細(xì)胞分裝于1.5 mL 的離心管中,12000 r/min離心30 s,棄上清,加600 μL TE/LiAc重懸細(xì)胞,所得細(xì)胞懸浮液即為酵母感受態(tài)細(xì)胞。

      1.5.2 誘餌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母菌 在1.5 mL的離心管中加入 50 μL酵母感受態(tài)細(xì)胞、0.5 μL誘餌質(zhì)粒、500 μL PEG/LiAc溶液與5 μL 鯡魚精 DNA,渦旋混勻。將離心管置于30℃水浴鍋中孵育30 min。向離心管中加入 20 μL DMSO,混勻,42℃孵育 20 min,每5 min混勻1次。將混合液2700 r/min離心5 min,棄上清,用1 mL YPDA液體培養(yǎng)基重懸沉淀,30℃孵育90 s,離心棄上清,用9 g/L的NaCl溶液輕輕重懸沉淀。將菌液均勻涂布于SD/-Trp固體培養(yǎng)基上,30℃倒置培養(yǎng)3~5 d,直至長出單菌落。

      1.6 自激活檢測 將轉(zhuǎn)有誘餌質(zhì)粒和空載體質(zhì)粒的Y187和AH109酵母菌分別劃線于SD/-Trp、SD/-Trp/X-α-gal、SD/-Trp/-His/X-α-gal 以及 SD/-Trp/-Ade/X-α-gal固體培養(yǎng)基上。如果酵母菌株在SD/-Trp/-His/X-α-gal培養(yǎng)基上生長,則在酵母雙雜交篩選過程中需要加入組氨酸抑制劑3-AT以抑制組氨酸泄露。如果菌株在SD/-Trp/-Ade/X-α-gal培養(yǎng)基上生長,則誘餌蛋白對報告基因有自激活作用,不適合用酵母雙雜交的方法篩選相互作用蛋白。

      1.7 毒性檢驗(yàn) 將含有誘餌質(zhì)粒的 Y187和AH109酵母菌菌株分別劃線于SD/-Trp固體培養(yǎng)基上,30℃倒置培養(yǎng),挑取大小相近的克隆分別接種于SD/-Trp液體培養(yǎng)基中,30℃,250 r/min振蕩培養(yǎng)20 h,測 OD600nm。若含有誘餌質(zhì)粒的菌株OD600nm低于0.80,則說明誘餌蛋白的存在阻礙了酵母菌株的生長,該蛋白不適合用酵母雙雜交的方法篩選相互作用蛋白。

      2 結(jié)果

      2.1 DsPrdx1基因的克隆及鑒定 PCR擴(kuò)增所得片段長度約為600 bp(圖1)。提取質(zhì)粒pGEM-TPrdx1經(jīng)雙酶切后電泳顯示為兩條帶,一條約為3000 bp,為線性pGEM-T載體;另一條約為600 bp,為插入片段DsPrdx1(圖2),測序后發(fā)現(xiàn)DsPrdx1無堿基突變和移碼突變,可用于構(gòu)建酵母雙雜交誘餌質(zhì)粒。

      2.2 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建及雙酶切鑒定 將pGBKT7-Prdx1轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中并提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,電泳后顯示為兩條帶,一條約為7300 bp,為線性pGBKT7載體;另一條約為600 bp,為插入的DsPrdx1 cDNA片段(圖3),對誘餌質(zhì)粒進(jìn)行測序表明DsPrdx1沒有發(fā)生突變,誘餌質(zhì)粒構(gòu)建成功。

      圖1 DsPrdx1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

      圖2 pGEMT-T-Prdx1雙酶切結(jié)果

      圖3 誘餌質(zhì)粒雙酶切結(jié)果

      2.3 誘餌質(zhì)粒pGBKT7-Prdx1的轉(zhuǎn)化 轉(zhuǎn)化pGBKT7-Prdx1的酵母細(xì)胞 Y187和 AH109的菌落PCR鑒定結(jié)果見圖4。

      2.4 誘餌質(zhì)粒的自激活作用檢測 見表1。

      2.5 誘餌蛋白的毒性檢測 將轉(zhuǎn)化有誘餌質(zhì)粒的Y187和AH109酵母菌接種于SD/-Trp液體培養(yǎng)基,30℃恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)20 h后測得OD600nm分別為1.199 和1.233,均大于0.80,表明誘餌蛋白對酵母菌Y187和AH109無毒性。

      圖4 誘餌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母菌菌落PCR鑒定

      表1 誘餌載體的自激活作用檢測

      3 討論

      ROS(reactive oxygen species)過量積累會對細(xì)胞產(chǎn)生損傷[5]。Prdx1作為生物體內(nèi)廣泛存在的一種抗過氧化物酶,可以有效清除生物體內(nèi)產(chǎn)生的過量ROS;此外,Prdx1還具有信號傳導(dǎo)、分子伴侶等功能,并且參與了多種氧化相關(guān)的病理與生理過程[6-7]。有研究[3]表明 Prdx1存在于精細(xì)胞的尾部即鞭毛區(qū)域,但其在鞭毛中的功能尚不清楚。真核生物的鞭毛是一種細(xì)胞表面突起的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),主要由細(xì)胞微管組成[8],在細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、個體發(fā)育等過程中具有重要作用。鞭毛的組裝與去組裝過程伴隨細(xì)胞周期的進(jìn)行呈周期性動態(tài),但是其生長調(diào)控機(jī)制尚不明確。杜氏鹽藻是一種單細(xì)胞真核藻類,具有等長雙鞭毛,因而非常適合作為研究鞭毛內(nèi)信號通路的模式生物。因此,用DsPrdx1作為誘餌釣取其相互作用蛋白的方法為進(jìn)一步研究Prdx1在鞭毛中的功能提供了可能。

      酵母雙雜交技術(shù)是一種直接在真核活細(xì)胞內(nèi)檢測蛋白相互作用的方法[9]。酵母雙雜交系統(tǒng)不僅可以研究已知蛋白之間的相互作用,還可以發(fā)現(xiàn)與已知蛋白相互作用的未知蛋白。該實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了融合有DsPrdx1基因片段的誘餌質(zhì)粒pGBKT7-Prdx1,并將誘餌質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)入酵母菌Y187和AH109中,通過毒性檢驗(yàn)證明了誘餌蛋白對酵母菌的生長沒有毒害作用。另外,假陽性的存在是酵母雙雜交的最大缺點(diǎn),其主要原因是誘餌蛋白對報告基因的激活作用。該實(shí)驗(yàn)觀察了誘餌質(zhì)粒的自激活作用,結(jié)果表明誘餌蛋白對酵母菌AH109與Y187均無自激活作用,可以用于酵母雙雜交系統(tǒng)。該實(shí)驗(yàn)結(jié)果為今后篩選DsPrdx1的相互作用蛋白奠定了基礎(chǔ)。

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