牛偉濤
(邢臺(tái)學(xué)院化學(xué)工程與生物技術(shù)學(xué)院,河北邢臺(tái) 054001)
豬干擾素基因的克隆與原核表達(dá)載體的構(gòu)建
牛偉濤
(邢臺(tái)學(xué)院化學(xué)工程與生物技術(shù)學(xué)院,河北邢臺(tái) 054001)
干擾素(Interferon)是一種廣譜抗病毒劑,具有抗腫瘤、抗病毒和免疫調(diào)節(jié)等多種作用而被廣泛應(yīng)用于病毒性疾病的預(yù)防和治療。本實(shí)驗(yàn)以豬肝臟組織為材料,提取豬肝臟組織DNA,根據(jù)GenBank收錄的豬干擾素基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,以豬肝臟DNA為模板進(jìn)行高保真擴(kuò)增得到IFN基因的ORF片段,然后進(jìn)行了T載體克隆。再利用引入EcoRⅠ、SalⅠ酶切位點(diǎn)的特異性引物對(duì)IFN成熟肽段的基因進(jìn)行亞克隆,經(jīng)雙酶切、連接、轉(zhuǎn)化后,成功構(gòu)建了pET28a-ifn原核表達(dá)重組質(zhì)粒,為干擾素基因的原核表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。
豬干擾素基因;基因克隆;表達(dá)載體構(gòu)建
干擾素是一種細(xì)胞因子,具備免疫調(diào)節(jié)、抗病毒和抗腫瘤等作用,它是科學(xué)家在1957年研究流感病毒干擾現(xiàn)象時(shí)發(fā)現(xiàn)的[1]。干擾素是一類分泌型糖蛋白,它主要通過(guò)與細(xì)胞表面受體相互作用從而使細(xì)胞、組織或器官產(chǎn)生一種或幾種抗病毒的蛋白,這樣便可以增強(qiáng)免疫應(yīng)答[2]。干擾素主要由激活的胸腺細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞產(chǎn)生,病毒入侵時(shí),干擾素在短時(shí)間內(nèi)就能讓機(jī)體處于抗病毒形態(tài),并使機(jī)體在1~3周時(shí)間內(nèi)抵制病毒反復(fù)感染[3]。生物體中廣泛存在干擾素,人、豬、羊等哺乳動(dòng)物都產(chǎn)生干擾素。我國(guó)豬場(chǎng)眾多,大小豬病毒性傳染病隨季節(jié)變化危害較大,種類繁多,給很多養(yǎng)殖戶造成巨大損失,干擾素就成為醫(yī)藥、獸藥市場(chǎng)最具發(fā)展前景的一類生物制劑[4]。如果利用基因工程的方法將豬干擾素基因進(jìn)行原核表達(dá),可以為豬干擾素的應(yīng)用研究提供堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
1.1 實(shí)驗(yàn)器材
TC-96/G/HLife Express基因擴(kuò)增儀(杭州博日科技有限公司),BD-1000超微量核酸蛋白分析儀(北京五州東方科技發(fā)展有限公司),ZX-2020D凝膠成像分析系統(tǒng)等。
1.2 藥品試劑
2×pfu高保真Taq Mix(上海捷瑞生物工程公司);T4 DNA連接酶、DNA Marker(TaKaRa大連公司);PCR產(chǎn)物回收試劑盒、DNA提取試劑盒(上海捷瑞生物工程公司);卡納青霉素、氨芐青霉素(索萊寶生物科技有限公司)等藥品。
2.1 基因組DNA的提取
取20 mg豬肝臟組織,用冰冷生理鹽水洗3次,置于液氮中充分研磨,然后參考DNA提取試劑盒說(shuō)明書方法進(jìn)行操作,然后置-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2.2 干擾素基因的PCR擴(kuò)增
2.2.1 引物設(shè)計(jì)
根據(jù)Genbank中的豬干擾素基因序列,利用PrimerPremier5.0設(shè)計(jì)所需特異性引物。豬干擾素基因ORF序列擴(kuò)增上游引物為5’ATGGCCCCAACCTCAGCCTTC3’;下游引物為5’TCACTCCTTCTTCCTGAGTCTGTC3’。豬干擾素基因成熟肽序列擴(kuò)增上游引物為5’CGGAATTCTGCGACCTGCCTCAGAC3’,含EcoRⅠ酶切位點(diǎn);下游引物為5’GCGTCGACTCACTCCTTCTTCCTGAGTC3’,含SalⅠ酶切位點(diǎn)。
2.2.2 PCR擴(kuò)增
PCR反應(yīng)體系為:2×PfuTaq Mix,25μl;上下游引物各2μl,模板為1μl,加dd H2O補(bǔ)齊至50μl;
PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃ 5min;94℃ 30sec,52℃30sec,72℃45sec,30個(gè)循環(huán);72℃10min;4℃保存。
2.3 PCR產(chǎn)物的純化
PCR產(chǎn)物參照PCR產(chǎn)物回收試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行回收,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
2.4 連接與轉(zhuǎn)化
連接反應(yīng)體系:DNA片段3μl;載體1μl;T4 DNA連接酶0.5μl;10×Buffer 0.5μl;dd H2O,1 μl。16℃連接過(guò)夜。用CaCl2法制備DH5α感受態(tài)細(xì)胞,將連接產(chǎn)物進(jìn)行轉(zhuǎn)化。
2.5 酶切鑒定
反應(yīng)體系:重組質(zhì)粒12μl;重組質(zhì)粒12μl;EcoRⅠ1μl;SalⅠ1μl;10×Buffer 2μl;dd H2O2μl。37℃,30min。
3.1 干擾素基因的PCR擴(kuò)增
利用設(shè)計(jì)的特異性引物,以豬肝臟基因組DNA為模板,對(duì)豬干擾素基因的ORF進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)并,如圖1所示,在約570bp的位置出現(xiàn)了特異性擴(kuò)增帶。
圖1 干擾素基因ORF的PCR擴(kuò)增M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1:PCR產(chǎn)物
3.2 測(cè)序結(jié)果
將陽(yáng)性T載克隆進(jìn)行測(cè)序分析,結(jié)果顯示,成功克隆得到長(zhǎng)為570bp的豬干擾素基因的ORF片段,序列如下:
ATGGCCCCATCCTCAACTCTCCTCACGGTCCT GGTGCTGCTCAGCTGCAATGCCATCTGCTGTCTGG GCTGCAACCTGCCTCAGACCCACAGCCTGGCTCAT ACCAGGGCCCTGAGGCTCCTGGCACAAATGAGGA GAATCTCCCCCTTCTCCTGCCTGGACCACAGAAGG GACTTTGGATTCCCCCAAGAGGCCTTGGGGGGCA ACCAGGTCCAGAAGGCTCAAGCCATGGCTCTGGT GCATGAGATGCTCCAGCAGACCTTCCAGCTCTTCA GCACAGAGGGCTCGGCTGCTGCCTGGGATGAGAG CCTCCTGCACCAGTTCTGCACTGGACTGGATCAGC AGCTCAGGGACCTGGAAGCCTGTGTCATGCAGGA GGCGGGGCTGGAAGGGACCCCCCTGCTGGAGGAG GACTCCATCCTGGCTGTGAGGAAATACTTCCACAG ACTCACCCTCTATCTGCAAGAGAAGAGCTACAGC CCCTGTGCCTGGGAGATCGTCAGGGCAGAAGTCA TGAGAGTCTTCTCTTCCTCCACAAACCTGCAAGAC AGACTCAGGAAGAAGGAGTGA
3.3 干擾素成熟肽段基因序列的PCR擴(kuò)增
利用特異性引物成功擴(kuò)增到了干擾素成熟肽段基因序列片段,如圖2所示。
圖2 干擾素成熟肽段基因序列的PCR擴(kuò)增M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1:PCR產(chǎn)物
3.4 重組質(zhì)粒的鑒定
利用 EcoRⅠ與 SalⅠ限制性內(nèi)切酶對(duì)pET28a-inf重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切實(shí)驗(yàn),如圖3電泳檢測(cè)結(jié)果顯示pET28a-inf重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖3 pET28a-inf重組質(zhì)粒的鑒定M:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1:pET28a-inf質(zhì)粒的雙酶切產(chǎn)物
實(shí)驗(yàn)成功克隆得到豬干擾素基因ORF片段,序列長(zhǎng)度為570bp。豬干擾素基因ORF中含有信號(hào)肽序列,實(shí)驗(yàn)中利用特異性引物擴(kuò)增得到成熟肽的編碼序列,擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度為490bp。限制性雙酶切鑒定表明豬干擾素基因已成功插入pET28a載體,成功構(gòu)建了pET28a-inf表達(dá)載體,這為下一步豬干擾素基因能在原核表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行高效表達(dá)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
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圖4 CPU SFR Memory
圖5 Internel Memory
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A
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2015-6-29
邢臺(tái)市科學(xué)計(jì)劃項(xiàng)目(2014ZC019);邢臺(tái)學(xué)院科學(xué)研究項(xiàng)目(2014)
牛偉濤(1982-),男,講師,博士在讀,主要從事分子生物學(xué)與基因工程研究.