熊 川, 李小林, 李 強, 楊志榮, 鄭林用
(1.四川省農(nóng)業(yè)科學院土壤肥料研究所 四川 成都 610066;2.四川大學生命科學學院 四川 成都 610065)
?
一株采自四川南充的羊肚菌生境調查與鑒定
熊 川2, 李小林1, 李 強1, 楊志榮2, 鄭林用1
(1.四川省農(nóng)業(yè)科學院土壤肥料研究所 四川 成都 610066;2.四川大學生命科學學院 四川 成都 610065)
為調查四川南充羊肚菌資源并考察其發(fā)生地環(huán)境,于2014年3月31日在南充市西充縣金泉鄉(xiāng)雙橋子村采集到1株羊肚菌.通過菌絲體培養(yǎng),鏡檢觀察完成形態(tài)鑒定,基于ITS、LSU、ef1-α、rpb1和rpb2序列分析構建的系統(tǒng)發(fā)育樹完成分子鑒定,確定為Morchellasp. (Mes-16),歸入黃色羊肚菌支系(Esculenta Clade),進一步結合樣地環(huán)境及土壤理化性質分析了羊肚菌在當季發(fā)生的可能的機制.
形態(tài)鑒定; 分子鑒定; 系統(tǒng)發(fā)育關系
羊肚菌Morchella俗稱羊肚子、羊肚菜、陽雀菌、包谷菌,隸屬子囊菌亞門Ascomycota、盤菌綱Discomycetes、盤菌目Pezizales、羊肚菌科Morchellaceae、羊肚菌屬Morchella,因其菌蓋有不規(guī)則的凹陷且多有褶皺,外形似羊肚而得名[1].作為享譽世界的美味食用菌和藥用菌,位居世界四大野生名菌之首,是目前價格最為昂貴的野生菌之一.
真菌物種的形態(tài)特征有限且具有可塑性,僅依靠傳統(tǒng)的外部形態(tài)、內部結構及生理生化指標等特征,很難準確把握真菌的系統(tǒng)親緣關系,進而對真菌進行定位.伴隨著分子生物學的高速發(fā)展,通過基因分子手段來鑒定大型真菌的方法日臻完善.近年來,DNA序列分析已經(jīng)被真菌研究人員廣泛應用于真菌的系統(tǒng)發(fā)育學研究,目前,真菌DNA研究多集中在rDNA上,其中基因間隔序列(ITS序列)已用于許多真菌的屬內種間或種內群體的系統(tǒng)學研究.最初,依據(jù)ITS序列的長度可以將羊肚菌分為黑羊肚菌系(black morles)和黃羊肚菌系(yellow morles)[2].進一步的研究將羊肚菌分為黃色羊肚菌支系(Esculenta Clade)、黑色羊肚菌支系(Elata Clade)和變紅羊肚菌支系(Rufobrunnea Clade)等3個支系.之后,運用ITS序列已詳細分類鑒定了北美的羊肚菌[3].
隨著羊肚菌系統(tǒng)發(fā)育學研究的深入,僅僅依靠ITS序列已不能準確鑒定羊肚菌種屬關系.多基因系譜一致性系統(tǒng)發(fā)育種識別法(GCPSR)作為一種更完備的方法在近年來被廣泛應用[4].在中國,已有學者基于多基因系譜一致性系統(tǒng)發(fā)育種識別法(GCPSR),選取ITS、LSU、ef1-α、rpb1和rpb2共5個基因標記分析了中國大部分地區(qū)羊肚菌種屬分類與起源[5].
1.1 材料
羊肚菌子實體于2014年3月31日采集于四川省南充市西充縣金泉鄉(xiāng)雙橋子村.采樣地位于東經(jīng)105°54′11.28″,北緯31°35′28.54″,海拔361m,共采集羊肚菌1株,憑證標本存放于四川省農(nóng)業(yè)科學院微生物標本保藏中心(保藏號:Cyl170).
采用組織分離法獲得羊肚菌菌絲體.將采集到的新鮮子實體表面用濃度為0.1%的升汞消毒,挑取菌柄頂端內部組織,將分離到的組織接種在已經(jīng)準備好的改良PDA培養(yǎng)基(每升PDA培養(yǎng)基中添加2 g蛋白胨)的試管斜面上.在28 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),長滿后備用.實驗最終成功分離到羊肚菌菌絲體7份,菌株編號分別為NC1-7.
1.2 生境調查
1.2.1 土樣采集及理化性質測定 在處樣地分別選定5處樣點,除去地表枯枝落葉層,采集土樣,深度20 cm,混勻用于理化性質測定[6].參照鮑士旦《土壤農(nóng)化分析》第3版(2000)的方法[7],對土壤氮磷鉀和有機質進行測定.速效磷——鉬銻抗比色法;速效鉀——火焰光度法;速效氮——CaCl2浸提流動注射分析儀法;有機質——重鉻酸鉀容量法(稀釋熱法)[8].
1.2.2 植被生境 采用GPS定位法獲取羊肚菌分布區(qū)準確地理坐標并拍攝照片.詳細調查區(qū)域植物種類組成、郁閉度,地貌類型、海拔、坡度、坡向、坡位等生境因子,逐項填記在相應調查表內[9].
1.3 形態(tài)觀察
第二,在歷史人物形象和性格塑造上,民間口承敘事可以拋開正史中片面、單一的刻板記錄,從多側面豐富人物性格和人物形象,使歷史人物更為飽滿真實。以努爾哈赤的傳說為例,在遼寧滿族民間口承敘事中,將收錄到的罕王傳說按講述內容的縱向時間羅列,可以清晰地勾畫出努爾哈赤從出生、童年、歷練,一直到成為一代帝王、建功立業(yè)的生命周期和“英雄式”敘事程式。
1.3.1 子實體觀察 將采集到的子實體用無菌水輕輕沖洗兩遍,去除泥土灰塵.觀察菌蓋、菌柄的顏色,脊脈的特征,凹陷的形狀,菌蓋與菌柄的著生情況.同時測量菌蓋、菌柄的大小[10].
1.3.2 菌絲體觀察 將組織分離獲得的菌絲體試管斜面接種到新的平板上,觀察菌絲體生長情況.挑取不同時期生長狀態(tài)較好的羊肚菌的菌絲,采用壓片法制片,光學顯微鏡下觀察菌絲體顯微形態(tài).
1.4 菌絲體分子鑒定
1.4.1 菌絲體DNA的提取 采用OMEGA公司的D3390-02 E. Z. N. A. TM Fungal DNA Kit(200)試劑盒提取菌絲體DNA.提取的DNA通過0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,于-20 ℃冰箱中保存?zhèn)溆?
1.4.2 序列擴增及檢測 5個標記基因的序列擴增引物見表1.PCR采用50 μL體系,其中2×Taq PCR Master Mix 25 μL,10μmol·L-1的引物各2 μL,DNA模板2 μL,ddH2O補齊至50 μL.ITS序列PCR反應程序為:94 ℃變性4 min,94 ℃變性1 min,57 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,完成35個循環(huán),72 ℃延伸10 min.LSU、ef1-α、rpb1和rpb2的PCR反應程序為:94 ℃初始變性3 min;94 ℃變性1 min,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,完成35個循環(huán);72 ℃最終延伸10 min.PCR產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的條帶送Invitrogen公司(中國,廣州)測序.
1.4.3 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 相關序列從MorchellaMLST(Multilocus Sequence Typing.http://www.cbs.knaw.nl/morchella/)[11]下載.輔助運用GenBank的BLAST,采用MEGA 5.0軟件計算并作圖.采用Neighbor-joining聚類分析方法構建系統(tǒng)發(fā)育樹,采用Maximum-parsimony法構建聯(lián)合矩陣系統(tǒng)發(fā)育樹,并進行分析[12].
2.1 樣地環(huán)境概述
2.1.1 植被情況概述 樣地為疏林地,郁閉度較低為0.2,坡向東偏南12°.高大喬木為柏樹(Cupressusfunebris)和杜梨(Pyrussp.),地表有苔蘚Bryophyta覆蓋,其上長有腎蕨Nephrolepissp.,扁竹根Irisjaponica,苔蘚和草本植物的生長有效阻擋了陽光的直射,同時使得小區(qū)域內濕度較大.
2.1.2 土壤理化性質分析 樣地的pH為6.76,中偏酸性,適于羊肚菌的發(fā)生.樣地土壤為沙棕壤,保水性較差,約有0.6 cm的褐色腐殖質層,土壤有機質含量8.78%,全氮含量0.29%,全磷含量0.16%,全鉀含量2.43%,每千克土壤中堿解氮含量316 mg,有效磷含量28.7 mg,速效鉀含量376 mg.
表1 PCR和測序引物
2.2 形態(tài)描述
2.2.1 子實體形態(tài) 西充羊肚菌子實體小,菌蓋近似長卵圓形,長2.7 cm,寬1.8 cm(圖1A).表面多凹坑,凹坑長圓形,棕黃色至褐色,棱紋窄,不規(guī)則.菌柄近白色,短且較細,長2.4 cm,粗0.7 cm,圓柱狀,表面光滑,基部未見膨大.
2.2.2 顯微結構 西充羊肚菌子囊孢子橢球狀(圖1B),長徑最小12.5 μm,最大16.9 μm,平均14.3 μm,短徑最小7.9 μm,最大10.6 μm,平均8.4 μm.匍匐菌絲分枝狀(圖1C),直徑最小6.8 μm,最大11.0 μm,平均7.9 μm.氣生菌絲竹節(jié)狀(圖1D),內部有大量球狀體,直徑最小9.2 μm,最大14.3 μm,平均11.7 μm.
A-D為西充羊肚菌、子囊孢子、匍匐菌絲、氣生菌絲.
經(jīng)形態(tài)觀察,可以初步確定西充羊肚菌是黃色羊肚菌支系的一種,可能為羊肚菌Morchellaesculenta(L.) Pers.或者小羊肚菌MorchelladeliciosaFr..
2.3 聯(lián)合矩陣分析
采用ITS,LSU,ef1-α、rpb1和rpb2序列聯(lián)合矩陣分析.羊肚菌被清晰的分成3個類群.變紅羊肚菌Morchellarufobrunnea作為羊肚菌的基部支系,歸入變紅羊肚菌支系.其余則分為黃色羊肚菌支系和黑色羊肚菌支系,分別對應于傳統(tǒng)分類中的黃色系和黑色系.
圖2 基于ITS-LSU-ef1-α-rpb1-rpb2序列聯(lián)合矩陣的羊肚菌系統(tǒng)發(fā)育樹
3.1 羊肚菌的分子鑒定
從形態(tài)學上看,試驗樣品更接近于羊肚菌Morchellaesculenta(L.) Pers.或者小羊肚菌MorchelladeliciosaFr.,但是聯(lián)合矩陣將其鑒定為Mes-16.前人基于形態(tài)鑒定和ITS序列分析給出了羊肚菌的分類,但僅僅依靠ITS序列無法鑒定出羊肚菌所有的種,還出現(xiàn)了同物異名、異物同名的情況[16],采用多基因系譜一致性系統(tǒng)發(fā)育種識別法(GCPSR)可有效鑒定,通過多個基因的DNA 核苷酸序列,構建系統(tǒng)發(fā)育樹,比較其拓撲學關系,完成物種界定.在同一屬內的物種間,同一物種的不同基因的系統(tǒng)發(fā)育拓撲結構應是一致的,而在同一種內不同個體間因為發(fā)生基因重組,不同基因的系統(tǒng)發(fā)育拓撲結構則可能會發(fā)生沖突[17].該方法為羊肚菌的分類研究提供了新的思路,并且有了成功的應用.但目前尚無法確定依據(jù)ITS序列命名的樣本在聯(lián)合矩陣系統(tǒng)樹中具體所在的系統(tǒng)位置,也無法核對前人所命名的名稱是否在分子系統(tǒng)學研究中是一個自然類群.新舊命名系統(tǒng)中的對應問題有待研究.
3.2 羊肚菌發(fā)生機制探討
羊肚菌大多在春季發(fā)生,少數(shù)也存在秋季出菇的現(xiàn)象.已有的報道顯示[1],Mes-16在中國是少見的秋季出菇的品種,出菇需要一個越夏的高溫刺激.本實驗樣品為春季采集,說明羊肚菌的萌發(fā)完成了一個越冬的低溫刺激.同一種羊肚菌在不同的環(huán)境下春秋兩季都有可能萌發(fā),這拓寬了羊肚菌有利刺激的范圍,在生活史周期中,需要一個極端溫度的刺激,高溫和低溫都可以達到促進萌發(fā)的效果.
3.3 羊肚菌的營養(yǎng)類型
通過對采樣地環(huán)境的觀察,未發(fā)現(xiàn)羊肚菌的發(fā)生與周圍的植物有明顯的關系.關于羊肚菌是腐生營養(yǎng)型還是共生營養(yǎng)型的爭論由來已久.目前已有的成功栽培實例一部分涉及到與高大喬木的伴生,諸如在廢棄的蘋果園中栽培,與圓葉楊、榆樹共生等[18].很早就有學者提出羊肚菌的生活史周期中,既有腐生階段,又有菌根真菌生長的階段[19].并且菌根階段出現(xiàn)在春季菌核萌發(fā)長出菌絲后,隨著菌絲的生長,其會與某些特殊的樹木形成共生關系.一些學者又觀察到另外的現(xiàn)象,即菌核發(fā)育到一定的階段,需要切斷其與宿主的聯(lián)系,這樣利于子囊果的發(fā)生[20].李青連等[21]基于穩(wěn)定同位素的分析方法對羊肚菌的營養(yǎng)方式進行了研究,最后得出結論菌蓋呈黑色、有縱脈的羊肚菌為腐生營養(yǎng)型,菌蓋呈污黃色的羊肚菌為菌根營養(yǎng)型.目前人工栽培成功的也大都是黑色系羊肚菌[22],可能是腐生營養(yǎng)型更容易實現(xiàn)人工干預.但本實驗樣品為黃色系,未能觀察到共生關系,可能是羊肚菌是一種階段性的共生,子囊果出現(xiàn)后,不再顯示共生關系.
[1] 杜習慧,趙琪,楊祝良.羊肚菌的多樣性、演化歷史及栽培研究進展[J].菌物學報,2014,33(2):183-197.
[2] WIPF D, FRIBOURG A, MUNCH J C. Diversity of the internal transcribed spacer of rDNA in morels[J]. American Journal of Botany, 1999,45(9):769-778.
[3] KUO M, DEWSBURY D R, O′Donnell K, et al. Taxonomic revision of true morels (Morchella) in Canada and the United States[J]. Mycologia, 2012,104(5):1159-1177.
[4] TAYLOR J W, JACOBSON D, KROKEN S, et al. Phylogenetic species recognition and species concepts in fungi[J]. Fungal Genetics and Biology, 2000,31(1):21-32.
[5] DU XH, ZHAO Q, O′DONNELL K, et al. Multigene molecular phylogenetics reveals true morels (Morchella) are especiallyspecies-rich in China[J]. Fungal Genetics and Biology, 2012a,49:455-469.
[6] 王昭艷,左長清,曹文洪,等.2011紅壤丘陵區(qū)不同植被恢復模式土壤理化性質相關分析[J].土壤學報,48(4):715-724.
[7] 鮑士旦.土壤農(nóng)化分析(第三版)[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,2000,34-35,81-83,106-107.
[8] 邵蕾,王麗霞,張民,等.控釋肥類型及氮素水平對氮磷鉀利用率的影響[J].水土保持學報,2009,23(4):170-175.
[9] 孟珍貴,李永,趙琪,等.滇西北松口蘑菌塘的生態(tài)因子調查[J].食用菌學報,2011,18(1):12-17.
[10] Kuo M.Morchellatomentosa, a new species from western North America, and notes onM.rufobrunnea[J]. Mycotaxon, 2008,105:441-446.
[11] DU X H, ZHAO Q, YANG Z L, et al. How well do ITS rDNA sequences differentiate species of true morels (Morchella)?[J]. Mycologia, 2012b,104(6):1351-1368.
[12] TAMURA K, PETERSON D, PETERSON N, et al. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods[J]. Molecular Biology and Evolution, 2011,28(10):2731-2739.
[13] KAUSERUD H, SCHUMACHER T. Outcrossing or inbreeding: DNA markers provide evidence for type of reproductive mode inPhellinusnigrolimitatus(Basidiomycota)[J]. Mycological Research, 2001,105:676-683.
[14] WTITE T J, BRUNS T, LEE S, et al. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA for phylogenetics[J]. PCR Protocols. Academic Press, San Diego, 1990:315-322.
[15] O′DONNELL K, CIGELNIK E, WEBER N S, et al. Phylogenetic relationships among ascomycetous truffles and the true and false morels inferred from 18 S and 28 S ribosomal DNA sequence analysis[J]. Mycologia, 1997,89:48-65.
[16] MORTIMER P E, KARUNARATHNA S C, LI Q H, et al. Prized edible Asian mushrooms: ecology, conservation and sustainability[J]. Fungal Diversity, 2012,56:31-47.
[17] O′DONNELL K, ROONEY A P, MILLS G L, et al. Phylogeny and historical biogeography of true morels (Morchella) reveals an early Cretaceous origin and high continental endemism and provincialism in the Holarctic[J]. Fungal Genetics and Biology, 2011,48(3):252-265.
[18] 趙琪,徐中志,程遠輝,等.尖頂羊肚菌仿生栽培技術[J].西南農(nóng)業(yè)學報,2009,22(6):1690-1693.
[19] BUSCOT F. Field observations on growth and development ofMorchellarotundaandMitrophorasemiliberain relation to forest soil temperature[J]. Canadian Journal of Botany, 1989,67(11):589-593.
[20] MILLER S C. Cultivation ofMorchella: United States, 6951074[P]. 2002-06-26.
[21] 李青連,丁翠,范黎.羊肚菌營養(yǎng)方式的穩(wěn)定碳同位素研究[J].菌物學報,2013,32(Z1):213-223.
[22] 王波,鮮靈.人工栽培羊肚菌的鑒定[J].西南農(nóng)業(yè)學報,2013,26(5):1988-1991.
(責任編輯:吳顯達)
Habitat investigation and identification of a morel strain from Nanchong, Sichuan
XIONG Chuan2, LI Xiao-lin1, LI Qiang1, YANG Zhi-rong2, ZHENG Lin-yong1
(1.Soil and Fertilizer Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Chengdu, Sichuan 610066, China;2.School of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, Sichuan 610065, China)
In order to investigate the resource and habitat of morel in Nanchong, Sichuan, 1 strain of morel was collected from Shuangqiaozi Village, Nanchong, Sichuan, China, in March 2014. According to morphological evidence and DNA sequences of ITS, LSU,ef1-α,rpb1 andrpb2 sequences, all samples were characterized asMorchellasp. (Mes-16), belonging to Esculenta Clade. Further analysis of the environment of morels habitat and the local soil sample indicated the possible mechanism for this autumn occurrence of morels.
morphological identification; molecular identification; phylogenetic relationship
2014-08-17
2014-09-28
四川省科技支撐計劃項目(2013NZ0029、2012NZ0003、2014FZ0004);四川省財政創(chuàng)新能力提升工程青年基金項(2014CXSF-030).
熊川(1990-),男,碩士.研究方向:珍稀食(藥)用菌栽培.Email:xiongchuan1234@126.com.通訊作者鄭林用(1965-),男,研究員.研究方向:珍稀食(藥)用菌栽培.Email:zly6559@126.com.
Q939.5
A
1671-5470(2015)04-0414-05
10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2015.04.014