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      基于Java的藥代動力學(xué)計(jì)算軟件的實(shí)現(xiàn)

      2015-10-12 17:34:50蔣理錢家好陳曉東王利軍
      數(shù)字技術(shù)與應(yīng)用 2015年9期
      關(guān)鍵詞:藥代動力學(xué)微分方程曲線圖

      蔣理++錢家好++陳曉東++王利軍

      摘要:開發(fā)藥代動力學(xué)計(jì)算軟件可以利用現(xiàn)在非常普及的個人計(jì)算機(jī)解決二次微分方程計(jì)算和曲線繪圖的問題。本項(xiàng)目開發(fā)的軟件可以提高相關(guān)檢測部門在相關(guān)計(jì)算上的速度與準(zhǔn)確度。

      國內(nèi)外比較多見的相關(guān)軟件主要有NONLIN,NONMEN,3P87/3P97,NDST,ABE等。均為非開源軟件,使用的計(jì)算方法不一。其中3P97對樣本數(shù)據(jù)的擬合,計(jì)算房室模型參數(shù)計(jì)算部分可以做到免費(fèi)。本次研究的藥代動力學(xué)計(jì)算軟件可以與3P97配合使用,可以滿足大部分相關(guān)科研院所,學(xué)校師生的需求。

      關(guān)鍵詞:藥代動力學(xué) 計(jì)算 微分方程 曲線圖

      中圖分類號:TP313 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1007-9416(2015)09-0000-00

      1 項(xiàng)目背景

      在畜牧業(yè)、漁業(yè)養(yǎng)殖領(lǐng)域,用藥物防治動物疾病目前是一種最直接、最有效和最經(jīng)濟(jì)的措施,但藥物殘留對人類健康和生態(tài)環(huán)境存在著嚴(yán)重的威脅。如何控制藥物在動物體內(nèi)中的殘留,以保證產(chǎn)品在上市時能符合相關(guān)標(biāo)準(zhǔn),是相關(guān)質(zhì)量檢測部門必須要解決的問題。動物在給藥后,藥物在動物體會按一定的規(guī)律消除。掌握藥物在生物體內(nèi)的消除時間,是解決動物產(chǎn)品質(zhì)量安全的重要科學(xué)方法,也是科學(xué)發(fā)展觀在畜牧業(yè)、漁業(yè)養(yǎng)殖上的具體體現(xiàn)。只有嚴(yán)格遵守休藥期,遵循藥物代謝動力學(xué),才能做到科學(xué)用藥、安全用藥。

      描述某種藥物的代謝動力學(xué)特征,最常用的方法是將機(jī)體看成由房室組成,藥物在這些房室間的運(yùn)轉(zhuǎn)及從房室中消除的速率符合一級過程或線性動力學(xué)。只要機(jī)體內(nèi)某些部位吸收、運(yùn)轉(zhuǎn)或消除藥物的速率常數(shù)相似,即可歸入一個房室,而不受解剖學(xué)位置和學(xué)功能的限制。

      本項(xiàng)目開發(fā)的軟件可以提高相關(guān)檢測部門在相關(guān)計(jì)算上的速度與準(zhǔn)確度。國內(nèi)外比較多見的相關(guān)軟件主要有NONLIN,NONMEN,3P87/3P97,NDST,ABE等。均為非開源軟件,使用的計(jì)算方法不一。其中3P97對樣本數(shù)據(jù)的擬合,計(jì)算房室模型參數(shù)計(jì)算部分可以做到免費(fèi)。本次研究的藥代動力學(xué)計(jì)算軟件與3P97配合使用,可以滿足大部分相關(guān)科研院所,學(xué)校師生的需求。目前市面上實(shí)現(xiàn)相關(guān)功能的軟件也沒有實(shí)現(xiàn)免費(fèi),相關(guān)技術(shù)的實(shí)現(xiàn)也沒有做到開源,所以本軟件的開發(fā)具有實(shí)際的市場價值。

      2 主要算法分析

      一般藥代動力學(xué)的計(jì)算都涉及到二房室模型,休藥期二房室計(jì)算公式為:二次微分方程 ,手動解指數(shù)方程無疑會給科研人員帶來比較大的麻煩,同時殘留量的衰減曲線圖的繪制也很麻煩,手工繪圖也難免帶來誤差。開發(fā)藥代動力學(xué)計(jì)算軟件可以利用現(xiàn)在非常普及的個人計(jì)算機(jī)解決休藥期計(jì)算的問題。

      解二次微分方程的算法主要思想是通過迭代的方法,選擇適當(dāng)?shù)牟介L和精確度ε,將微分方程的計(jì)算值與漸出現(xiàn)檢出限進(jìn)行比較,使得出的理論休藥期x盡量趨近真值,同時也要兼顧到少或避免發(fā)生得不到值的情況或由于循環(huán)時間過長而產(chǎn)生死循環(huán)的假象。同時在每次計(jì)算的時候描點(diǎn)作圖,將整個計(jì)算結(jié)果直接顯示在曲線圖上,使結(jié)果反映更加直觀。迭代求解流程如圖1。

      在求解二次微分方程時,先將x設(shè)為0,然后進(jìn)入循環(huán),循環(huán)內(nèi)計(jì)算 的值,將得到的值與最低殘留限值作比較,誤差小于設(shè)置誤差值時,判定X為所求值,否則X+=b,b為步長,繼續(xù)循環(huán),在下一期計(jì)算前,判斷X是否小于3000*b,如小于繼續(xù)計(jì)算,否則判定X無解,根據(jù)大量的實(shí)際數(shù)值的計(jì)算,3000次循環(huán)足夠得到X值。

      圖1 迭代求解二階微分方程流程圖

      3 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)

      藥代動力學(xué)計(jì)算軟件主要有四個模塊:計(jì)算與繪圖,數(shù)據(jù)管理,數(shù)據(jù)報(bào)表與打印,用戶管理。

      在計(jì)算與繪圖模塊,用戶輸入分布相的零時截距A, 消除相的零時截距B, 分布速率常數(shù)α,消除速率常數(shù)β,最低殘留限量Y,允許誤差大小ε,置信度σ,可以計(jì)算出理論置信時間范圍,并畫出圖像。同時要求輸入平均溫度,以方便數(shù)據(jù)分析。對不能算出置信時間范圍的數(shù)據(jù)會提示無法算出,輸入數(shù)據(jù)有明顯問題的,程序也會給予提醒。

      數(shù)據(jù)管理模塊主要完成數(shù)據(jù)從Excel表格中導(dǎo)入導(dǎo)出。經(jīng)調(diào)研,科研機(jī)構(gòu)現(xiàn)階段數(shù)據(jù)模型的數(shù)量并不是特別巨大,而且研究人員也習(xí)慣于將數(shù)據(jù)存儲在Excel表格內(nèi),所以軟件不再另外建立數(shù)據(jù)庫,直接對Excel表格中的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。通過數(shù)據(jù)導(dǎo)入功能,可以直接將Excel表中的數(shù)據(jù)導(dǎo)入到計(jì)算軟件的面板,點(diǎn)擊某一行時會將該行的數(shù)據(jù)導(dǎo)入到參數(shù)輸入欄中并計(jì)算繪制曲線。如果新算的數(shù)據(jù)要加入到Excel表中,只需要使用新增功能即可。對于行列不符合規(guī)范的表格,系統(tǒng)會提醒數(shù)據(jù)格式不符合規(guī)范,無法打開。

      數(shù)據(jù)報(bào)表與打印主要支持?jǐn)?shù)據(jù)計(jì)算后生成報(bào)告,幫助科研人員迅速生成文檔,除了參數(shù),計(jì)算結(jié)果和圖片外,用戶可以自己編輯備注信息加到報(bào)表中。

      在用戶管理模塊,為了方便用戶安裝使用,也不需要加裝其他數(shù)據(jù)庫軟件,用戶名和密碼經(jīng)加密后存儲在本地文件中。

      在系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)過程中,擴(kuò)展實(shí)現(xiàn)了藥代動力學(xué)三房室模型與一房室模型的計(jì)算與繪制曲線圖的方法,三房室模型的實(shí)現(xiàn)方法與二房室類似,增加了一個計(jì)算因子,一房室模型在時間軸上用對數(shù)表示,曲線圖為一條直線。在系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)時重新繪制了相關(guān)面板,可以在計(jì)算模型選擇菜單欄中靈活切換這幾種模型。系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)效果如圖2。

      圖2 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)效果圖

      參考文獻(xiàn)

      [1]芮建中,盧建豐,凌樹森.NONMEN程序及其在臨床藥理學(xué)中的應(yīng)用.藥學(xué)進(jìn)展,1997.21.

      [2]謝海棠,黃曉暉,孫瑞元.中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué),2001.4.

      [3]Y. Daniel Liang Java.語言程序設(shè)計(jì).基礎(chǔ)篇(原書第8版),2011.6.

      收稿日期:2015-08-05

      作者簡介:蔣理(1982—),男,江蘇南京人,南京信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院教師,碩士研究生,研究方向:數(shù)據(jù)交換技術(shù)。錢家好(1995—),男,江蘇南京人,南京信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)生,專業(yè):移動互聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用技術(shù)。陳曉東(1994—),男,江蘇宿遷人,南京信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)生,專業(yè):移動互聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用技術(shù)。王利軍(1995—),女,河南商丘人,南京信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)生,專業(yè):移動互聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用技術(shù)。

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