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      有機(jī)溶劑輔助封閉式電噴霧離子源的設(shè)計(jì)及其在痕量蛋白質(zhì)組樣品分析中的應(yīng)用

      2015-11-03 06:56朱旭東等
      分析化學(xué) 2015年10期

      朱旭東等

      摘 要 將康達(dá)效應(yīng)應(yīng)用于電噴霧離子源,設(shè)計(jì)了氣氛可調(diào)康達(dá)效應(yīng)電噴霧離子源(Coanda effect electrospray ionization source, CEESI)。考察了不同飽和蒸氣壓、不同極性的有機(jī)溶劑對(duì)標(biāo)準(zhǔn)肽段在質(zhì)譜上信號(hào)響應(yīng)的影響。結(jié)果表明,輔助氣中添加乙醇后,標(biāo)準(zhǔn)肽段質(zhì)譜信號(hào)提高約1000倍,而且對(duì)于1 ng BSA酶解產(chǎn)物,蛋白序列覆蓋率提高約10%。在最佳條件下,采用nano-HPLC-CEESI-LTQ XL MS系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了6, 10, 20和50 ng HeLa細(xì)胞全提蛋白質(zhì)酶解產(chǎn)物的定性分析,與常用的開(kāi)放式nano-ESI相比,肽段和蛋白質(zhì)的可鑒定數(shù)目分別提高20%~360%和20%~200%。本研究表明,采用CEESI源有利于痕量蛋白質(zhì)組樣品的高靈敏度分析。

      關(guān)鍵詞 康達(dá)效應(yīng); 電噴霧離子源; 蛋白質(zhì)組; 痕量分析

      1 引 言

      高效液相色譜-電噴霧離子化質(zhì)譜(HPLC-ESI MS)技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組樣品分析[1,2]。由于蛋白質(zhì)組樣品具有組成復(fù)雜、蛋白含量動(dòng)態(tài)范圍寬、物理化學(xué)性質(zhì)各異等特點(diǎn),因此對(duì)分析方法的靈敏度提出了越來(lái)越高的要求。提高ESI過(guò)程的離子化效率、降低離子間相互抑制作用已成為一種有效途徑[3]。眾所周知,當(dāng)HPLC的流速降低至納升級(jí)時(shí),電噴霧可產(chǎn)生更小的霧滴,離子化效率得到明顯改善[4],同時(shí)離子抑制和基質(zhì)效應(yīng)也會(huì)被顯著抑制[5,6]。因此,納噴離子源已被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)樣品分析[1,2]。

      在改善檢測(cè)靈敏度的前提下,提高ESI源的噴霧穩(wěn)定性也至關(guān)重要。目前,最常用的開(kāi)放式納噴離子源容易受到外界環(huán)境的影響,會(huì)出現(xiàn)噴霧不穩(wěn)定的情況[7]。然而,封閉式電噴霧離子源[8]在噴針和質(zhì)譜采樣錐之間的空腔形成低壓,可獲得穩(wěn)定噴霧; 同時(shí)通過(guò)增加輔助氣,如空氣或氮?dú)?,可改善離子傳輸效率。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道[9~12],輔助氣中添加氣化的有機(jī)溶劑可以顯著改變肽段電荷分布,并提高肽段離子化效率。Li等[9]在輔助氣中添加醇類或羧酸類蒸汽,可將肽段的MS信號(hào)增強(qiáng)3~4倍,鑒定的大腸桿菌蛋白質(zhì)數(shù)目增加14%。Asperger等[12]發(fā)現(xiàn),輔助氣中添加乙腈可提高糖肽電荷數(shù),使其在電子轉(zhuǎn)移解離(Electrontransfer dissociation,ETD)中獲得更高的碎裂效率。此外,有機(jī)溶劑添加的輔助氣還可以降低基質(zhì)干擾。de Muth等[13]發(fā)現(xiàn),有機(jī)溶劑添加的輔助氣,尤其是乙腈,可以有效降低金屬離子干擾。上述研究表明,氣氛輔助封閉式納噴離子源在獲得穩(wěn)定噴霧、高效離子化的同時(shí),還可以提高質(zhì)譜響應(yīng),因此有望用于痕量蛋白質(zhì)組樣品的高靈敏度分析。

      康達(dá)效應(yīng)亦稱附壁作用,即流體(水流或氣流)有離開(kāi)本來(lái)的流動(dòng)方向,改為隨著凸出物體流動(dòng)的傾向。結(jié)合康達(dá)效應(yīng),本研究設(shè)計(jì)了新型CEESI源,評(píng)價(jià)了不同輔助氣氣氛對(duì)標(biāo)準(zhǔn)肽段的質(zhì)譜信號(hào)強(qiáng)度的影響; 在最佳輔助氣類型和分壓條件下,實(shí)現(xiàn)了痕量HeLa細(xì)胞蛋白質(zhì)組的定性分析。同時(shí)與開(kāi)放式nano-ESI源進(jìn)行了比較,結(jié)果表明,采用新型CEESI可將肽段和蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目分別提高20%~360%和20%~200%。

      2 實(shí)驗(yàn)部分

      2.1 儀器與試劑

      毛細(xì)管高效液相色譜-電噴霧-線性離子阱質(zhì)譜儀(美國(guó)Thermo Fisher公司); 康達(dá)效應(yīng)電噴霧離子源(浙江好創(chuàng)生物技術(shù)有限公司); Milli-Q超純水系統(tǒng)(美國(guó)Millipore公司)。

      磷酸化標(biāo)準(zhǔn)肽段(序列:STSSDQPSpYSLE,上海強(qiáng)耀生物科技有限公司); 甲酸(FA)、二硫蘇糖醇(Dithiothreitol,DTT)、碘代乙酰胺(Iodoacetamide,IAA)、牛血清白蛋白(BSA)、尿素、NH4HCO3(美國(guó)Sigma公司); 乙腈(ACN,德國(guó)Merck公司); 乙醇、甲醇、乙酸、二甲基亞砜(DMSO)、異丙醇、丙酮、乙二醇、乙二胺、乙酸乙酯和環(huán)己烷等(天津科密歐公司); 蛋白酶抑制劑(瑞士Roche公司); C18反相填料(10 孔徑,5 μm粒徑, 天津博納艾杰爾科技有限公司); 石英毛細(xì)管(美國(guó)Polymicro Technologies公司)。實(shí)驗(yàn)用水為超純水(18.2 MΩ cm)

      2.2 樣品制備

      2.2.1 HeLa細(xì)胞培養(yǎng)及蛋白質(zhì)提取 在37℃、5% CO2條件下,用含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)HeLa細(xì)胞。當(dāng)細(xì)胞的融合度達(dá)到90%時(shí),收集并用冷的PBS洗滌3次。將HeLa細(xì)胞沉淀分散于裂解液(1%蛋白酶抑制劑的8 mol/L尿素溶液),在冰浴中超聲破碎240 s(超聲10 s,間歇10 s),在4℃, 20000 r/min高速離心10 min, 去除細(xì)胞碎片,收集上清液。最后用基于BCA法的試劑盒(上海碧云天生物技術(shù)有限公司)測(cè)定蛋白質(zhì)濃度。

      2.2.2 BSA及HeLa蛋白質(zhì)樣品處理 蛋白質(zhì)酶解:取1 mg蛋白質(zhì)(HeLa細(xì)胞提取蛋白或BSA)溶于100 μL 8 mol/L尿素中,加入8 μL 100 mmol/L DTT,56℃反應(yīng)2 h; 冷卻至室溫,加入8 μL 200 mmol/L IAA,避光反應(yīng)40 min; 用50 mmol/L NH4HCO3將溶液稀釋10倍后,加入胰蛋白酶(酶與底物的質(zhì)量比為1∶25); 37℃酶解24 h,加入甲酸終止反應(yīng)。

      除鹽:使用HPLC的流動(dòng)相A(98% H2O + 2% ACN + 0.1% FA)將酶解液上樣至C18反相色譜柱(10 mm×4.6 mm),沖洗5 min后,用80% 的流動(dòng)相B(98% ACN+2% H2O + 0.1% FA)進(jìn)行洗脫。收集洗脫液,冷凍干燥后,保存于-80℃待用。

      2.3 質(zhì)譜及電噴霧離子源分析條件

      2.3.1 考察不同溶劑、輔助氣對(duì)標(biāo)準(zhǔn)肽段質(zhì)譜響應(yīng)信號(hào)的影響 負(fù)離子模式下,使用進(jìn)樣針直接進(jìn)樣(1 μg/mL)。改變標(biāo)準(zhǔn)肽段溶劑、輔助氣中有機(jī)添加劑的種類及比例,每種條件均直接采集1 min,對(duì)比不同條件下標(biāo)準(zhǔn)肽段離子峰強(qiáng)度。

      2.3.2 BSA及HeLa蛋白酶解產(chǎn)物的分離和鑒定 采用nano-HPLC-ESI-MS/MS分離分析酶解產(chǎn)物,色譜柱: C18反相色譜柱(50 μm×15 cm),末端為拉制噴針,可直接插入封閉式電噴霧離子源,如圖1所示。液相色譜分離采用梯度洗脫方式,BSA酶解產(chǎn)物:0~5 min,2%~6% B; 5~35 min,6%~35% B; HeLa細(xì)胞蛋白質(zhì)酶解產(chǎn)物:0~75 min,5%~25% B; 75~90 min,25%~80% B。流速均為120 nL/min。

      分別考察空氣和乙醇兩種氣氛下的質(zhì)譜鑒定信號(hào)。質(zhì)譜掃描范圍為m/z 300~1800,正離子模式采集,歸一化碰撞能量為35%。質(zhì)譜采集產(chǎn)生的原始文件通過(guò)pXtract[14]轉(zhuǎn)換為.mgf文件后,使用Mascot(2.4.0版本,英國(guó)MatrixScience)搜索引擎對(duì)Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫(kù)中序列進(jìn)行檢索。參數(shù)設(shè)置為:母離子質(zhì)量容差2 Da; 碎片離子質(zhì)量容差1 Da; 蛋白水解酶:Trypsin; 最多允許2個(gè)漏切位點(diǎn); 固定修飾: carbamidomethyl (C); 可變修飾:oxidation (M)和acetyl (protein N-term)。

      3 結(jié)果與討論

      3.1 離子源設(shè)計(jì)

      結(jié)合康達(dá)效應(yīng),設(shè)計(jì)了CEESI源(圖1)。特殊設(shè)計(jì)的離子傳輸管的內(nèi)表面具有康達(dá)效應(yīng)功能,氣流會(huì)沿著管壁旋轉(zhuǎn)向質(zhì)譜方向流動(dòng),旋轉(zhuǎn)的氣流將帶電液滴在離子傳輸管的中心流向質(zhì)譜儀,降低了液滴與管壁的碰撞幾率,從而提高離子傳輸效率。

      輔助氣流進(jìn)入低壓空腔后,繞軸線旋轉(zhuǎn),形成以發(fā)射針為軸的三維軸對(duì)稱回轉(zhuǎn)體。此結(jié)構(gòu)可以簡(jiǎn)化為二維流動(dòng)進(jìn)行模擬(圖2)。在回轉(zhuǎn)體內(nèi)可形成氣流穩(wěn)定均勻的區(qū)域,即流場(chǎng)駐點(diǎn)。

      將色譜柱末端的噴針直接插入電噴霧離子源內(nèi)的駐點(diǎn)位置,在電場(chǎng)驅(qū)動(dòng)下,即可形成特別穩(wěn)定泰勒錐,進(jìn)而獲得穩(wěn)定噴霧。此外,由于質(zhì)譜內(nèi)的高真空,噴針與質(zhì)譜采樣錐之間的空腔處于低壓,流動(dòng)的輔助氣可帶走泰勒錐形成的霧滴,清潔噴針表面,有效防止結(jié)碳,有助于延長(zhǎng)噴針使用壽命。霧滴在密閉腔內(nèi)不斷蒸發(fā),當(dāng)達(dá)到瑞利極限時(shí),即發(fā)生庫(kù)侖爆炸。分析物基于荷電殘余模型、離子蒸發(fā)模型及鏈彈射模型等機(jī)理[15]實(shí)現(xiàn)離子化。進(jìn)入腔體的輔助氣,即被有機(jī)溶劑飽和的空氣,可有效避免空氣中污染物的進(jìn)入,降低干擾離子的信號(hào)。在輔助氣和霧滴的作用下,分析物離子化效率顯著提高,有助于實(shí)現(xiàn)肽段的高靈敏度檢測(cè)。

      3.2 輔助氣氣氛對(duì)標(biāo)準(zhǔn)肽段質(zhì)譜檢測(cè)信號(hào)的影響

      輔助氣作為CEESI源的重要組成部分,可以促進(jìn)噴霧穩(wěn)定性、改善離子傳輸效率,而且輔助氣中添加氣化的有機(jī)溶劑可以顯著改變肽段電荷分布,提高肽段離子化效率[9,10]。因而首先考察了不同輔助氣對(duì)肽段的質(zhì)譜信號(hào)強(qiáng)度及電荷分布的影響(圖3)。

      在負(fù)離子模式下,酸可明顯抑制負(fù)離子生成。蒸氣壓較低的有機(jī)試劑(如DMSO、乙二醇)由于進(jìn)入離子化室較少,對(duì)信號(hào)強(qiáng)度基本無(wú)影響。而飽和蒸氣壓較大的乙腈、乙醇、甲醇、丙酮、乙酸乙酯等極性分子可明顯提高多肽離子化效率。此結(jié)果與冷卻焓理論一致[16,17],即高濃度的極性分子冷凝在霧滴表面的同時(shí),釋放一定的能量; 此能量被霧滴表面的分析物分子吸收,最終激發(fā)分析物離子化[15]。但在研究的輔助氣氣氛中,乙醇、丙酮、乙酸乙酯及乙二胺等都能顯著提高標(biāo)準(zhǔn)肽段的信號(hào)強(qiáng)度; 與空氣為輔助氣相比,信號(hào)強(qiáng)度可以提高1000倍。相比之下,乙醇可更明顯提高多價(jià)離子響應(yīng),有利于多肽質(zhì)譜鑒定,因此,采用乙醇作為輔助氣進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

      3.3 痕量BSA酶解產(chǎn)物分析

      基于nano-RPLC-ESI-MS/MS系統(tǒng),對(duì)1 ng BSA酶解產(chǎn)物進(jìn)行分離分析。輔助氣中添加乙醇后,在CEESI空腔內(nèi),乙醇與霧滴在離子傳輸管內(nèi)相互作用,肽段譜圖匹配(PSM)、肽段數(shù)目、序列覆蓋率均提高約10%(表1)。比較肽段的峰面積發(fā)現(xiàn),添加乙醇的輔助氣提高了大部分肽段的質(zhì)譜響應(yīng),與文獻(xiàn)\[16\]結(jié)果相似。但是并未觀察到標(biāo)準(zhǔn)肽段信號(hào)的改善,這可能是因?yàn)楦邼舛纫掖驾o助氣會(huì)抑制流動(dòng)相揮發(fā)。

      由于高濃度乙醇?xì)夥諘?huì)抑制霧滴中有機(jī)溶劑揮發(fā),不同樣品溶劑對(duì)標(biāo)準(zhǔn)肽段靈敏度有較大的影響。在相同的乙醇分壓下,純水為溶劑時(shí)信號(hào)改善效果最顯著(圖4); 溶劑中僅加入乙腈時(shí),隨著溶劑中乙腈加入量增大,信號(hào)改善效果變差,甚至降低肽段的質(zhì)譜響應(yīng); 加入0.1% FA,獲得更顯著的改善效果。然而,隨著有機(jī)相比例增大,會(huì)抑制乙醇對(duì)標(biāo)肽質(zhì)譜響應(yīng)的改善效果。以上結(jié)果說(shuō)明,乙醇分壓太高會(huì)抑制有機(jī)溶劑的揮發(fā),不利于樣品離子化,因而實(shí)際應(yīng)用時(shí),應(yīng)選擇輔助氣中的有機(jī)添加劑的最佳分壓。

      采用LC-ESI-MS/MS分析痕量BSA酶解產(chǎn)物時(shí),多肽的色譜峰主要分布于有機(jī)相為10%~35%的條件下,即僅在有機(jī)相濃度較低時(shí),出峰的肽段信號(hào)得到改善,進(jìn)一步證實(shí)了高濃度乙醇?xì)夥諘?huì)抑制霧滴溶劑揮發(fā)。當(dāng)乙醇分壓下降時(shí),抑制效果減弱,質(zhì)譜響應(yīng)顯著增強(qiáng)。

      3.4 痕量HeLa細(xì)胞提取蛋白酶解產(chǎn)物分析

      在最佳分壓的乙醇?xì)夥罩?,肽段和蛋白鑒定數(shù)目明顯增多。當(dāng)HeLa酶解產(chǎn)物的上樣量為6 ng和10 ng時(shí),乙醇?xì)夥障码亩魏偷鞍阻b定數(shù)目較空氣氣氛約提高了20%; 當(dāng)上樣量為20 ng時(shí),多肽和蛋白鑒定數(shù)目分別提高360%和200%(圖5)。此結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)乙醇?xì)夥湛梢蕴岣叻治鑫镫x子化效率,促進(jìn)多肽質(zhì)譜響應(yīng)。當(dāng)進(jìn)樣量增大到50 ng時(shí),乙醇?xì)夥障码亩魏偷鞍阻b定數(shù)目較空氣氣氛分別提高280%和158%; 相對(duì)20 ng進(jìn)樣量的鑒定結(jié)果提高較少。因而,氣氛輔助CEESI源更適于痕量蛋白質(zhì)組樣品的分析。

      與開(kāi)放式離子源比較, CEESI特殊設(shè)計(jì)的離子傳輸管的內(nèi)表面具有康達(dá)效應(yīng)功能,可改善離子傳輸效率。同時(shí),結(jié)合輔助氣添加劑與噴霧的相互作用,促進(jìn)肽段離子化。在考察的上樣量范圍內(nèi),采用CEESI源可將鑒定的肽段和蛋白數(shù)目分別提高58%~320%和50%~180%。

      采用空氣作為輔助氣,當(dāng)樣品量較小(小于20ng)時(shí),CEESI鑒定的肽段和蛋白數(shù)目較開(kāi)放式nano-ESI分別提高30%和12%。但是隨著樣品量增加,采用開(kāi)放式nano-ESI可以獲得更多的肽段和蛋白鑒定數(shù)目。這可能是因?yàn)樯蠘恿枯^小時(shí),空氣氣氛下的封閉式離子源具有更高的離子傳輸效率,因而可以比開(kāi)放源鑒定更多的肽段和蛋白數(shù)目。當(dāng)樣品量增大時(shí),高效離子化產(chǎn)生更多的離子,但是受離子傳輸管離子傳輸效率的限制,進(jìn)入質(zhì)量分析器的肽段離子受限,因此開(kāi)放源具有更顯著的優(yōu)勢(shì)。

      乙醇?xì)夥詹粌H改善離子傳輸效率、促進(jìn)多肽離子化,而且可以改善噴霧穩(wěn)定性。以上樣量20 ng為例(圖5C),空氣氣氛封閉式離子源、乙醇?xì)夥辗忾]式離子源和開(kāi)放式離子源三針共同鑒定到的蛋白質(zhì)比例分別是25.0%, 30.6%和19.5%,證實(shí)CEESI源比開(kāi)放納噴源具有更好的噴霧穩(wěn)定性。

      4 結(jié) 論

      針對(duì)開(kāi)放式電噴霧離子源噴霧穩(wěn)定性差、離子化效率低及噴針壽命短等問(wèn)題,設(shè)計(jì)了氣氛可調(diào)CEESI源。通過(guò)考察具有不同飽和蒸氣壓的有機(jī)小分子作為輔助氣對(duì)電噴霧效果的影響,發(fā)現(xiàn)乙醇能夠顯著提高標(biāo)準(zhǔn)肽段信號(hào)強(qiáng)度。在最佳的乙醇分壓下,不僅HeLa細(xì)胞提取蛋白質(zhì)酶解產(chǎn)物的肽段和蛋白鑒定數(shù)目顯著提高,而且噴霧穩(wěn)定性得到了改善。上述結(jié)果初步說(shuō)明,CEESI源在痕量蛋白質(zhì)組樣品分析方面具有很大的應(yīng)用潛力。

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