蘇學(xué)軍,劉存海,張 勇
(海軍航空工程學(xué)院基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)部,山東煙臺264001)
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三(2-氯乙基)乙基胺的密度泛函理論研究
蘇學(xué)軍,劉存海,張 勇
(海軍航空工程學(xué)院基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)部,山東煙臺264001)
本文應(yīng)用密度泛函理論的B3LYP方法,在3-21G和6-31+G(d,p)基組水平上對三(2-氯乙基)乙基胺分子進(jìn)行了理論計(jì)算,得到了分子的穩(wěn)定構(gòu)型及其紅外光譜。分析后發(fā)現(xiàn),根據(jù)分子振動(dòng)類型的不同可將紅外光譜劃分為0~1000、1000~1500、1500~3000和3000~4000cm-14個(gè)區(qū)域,由于存在簡并和無紅外活性的現(xiàn)象致使紅外譜中實(shí)際譜線的數(shù)目小于簡正振動(dòng)的數(shù)目。
三(2-氯乙基)乙基胺;密度泛函理論;紅外光譜;紅外活性
氮芥(Chlormethine)也叫氮化芥子氣,從第一次世界大戰(zhàn)起至今一直是擁有化學(xué)武器國家的主要裝備毒劑,其毒性和危害巨大,屬于糜爛性毒劑的一種,它是在研究芥子氣的基礎(chǔ)上被發(fā)現(xiàn)地[1]。氮芥純品無色無味,工業(yè)品呈黃色,有魚腥味,難溶于水,易溶于有機(jī)溶劑,沸點(diǎn)230~233℃,凝固點(diǎn)-4℃。它是一種接觸性、吸入性及眼睛傷害的毒劑。它的糜爛性作用比芥子氣小,但潛伏期長,容易被忽視,能引起皮膚紅腫起泡,以致潰爛,嚴(yán)重時(shí)會(huì)引起各器官或全身中毒。氮芥還是最早被用于臨床并取得突出療效的抗腫瘤藥物,為雙氯乙胺類烷化劑的代表,它是以高度活潑的化合物,進(jìn)入體內(nèi)后,通過分子內(nèi)成環(huán)作用,形成高度活潑的乙烯亞胺離子,在中性或弱堿性條件下迅速與多種有機(jī)物質(zhì)的親核基團(tuán)(如蛋白質(zhì)的羥基、氨基、核酸的氨基和羥基、磷酸根)結(jié)合,進(jìn)行烷基化作用。氮芥最重要的反應(yīng)是與鳥嘌呤第7位共價(jià)結(jié)合,產(chǎn)生DNA的雙鏈內(nèi)的交叉聯(lián)結(jié)或DNA的同鏈內(nèi)不同堿基的交叉聯(lián)結(jié)。大劑量時(shí)對各周期的細(xì)胞和非增殖細(xì)胞均有殺傷作用。
在氮芥的分類中,三(2-氯乙基)乙基胺的糜爛性毒性最強(qiáng),使用也最廣泛,其分子式為。本文利用理論計(jì)算的方法對三(2-氯乙基)乙基胺分子的結(jié)構(gòu)和紅外光譜的特點(diǎn)進(jìn)行了研究,以期為更好的對三(2-氯乙基)乙基胺加以利用,并減小其給人類帶來的危害提供理論指導(dǎo)。
Gaussian計(jì)算軟件在化學(xué)計(jì)算領(lǐng)域應(yīng)用比較廣泛。它提供了多種泛函的密度泛函方法,可用于計(jì)算分子能量和結(jié)構(gòu)、過渡態(tài)能量和結(jié)構(gòu)、化學(xué)鍵和反應(yīng)能量、紅外和拉曼光譜反應(yīng)路徑和激發(fā)態(tài)性質(zhì)等,除了計(jì)算分子體系,還可以計(jì)算溶液體系和周期性體系[2-7]。本文對三(2-氯乙基)乙基胺的分子結(jié)構(gòu)及紅外光譜的分布規(guī)律進(jìn)行了系統(tǒng)的研究,我們先用GaussView構(gòu)型軟件構(gòu)建了三(2-氯乙基)乙基胺分子的初始結(jié)構(gòu),在B3lYP/3-21G水平上利用Gaussian09計(jì)算軟件對初始結(jié)構(gòu)進(jìn)了結(jié)構(gòu)優(yōu)化,在此基礎(chǔ)上利用B3LYP/6-31+G(d,p)的方法再次對構(gòu)型進(jìn)行了結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率計(jì)算,頻率計(jì)算沒有出現(xiàn)虛頻,故確定構(gòu)型為穩(wěn)定構(gòu)型,通過對頻率計(jì)算結(jié)構(gòu)的分析得到了三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜,并對光譜中出現(xiàn)的各條譜線進(jìn)行了指認(rèn),對譜線形成的機(jī)理進(jìn)行了分析。頻率計(jì)算采用0.9613的修正因子進(jìn)行矯正。
2.1 三(2-氯乙基)乙基胺分子的結(jié)構(gòu)
三(2-氯乙基)乙基胺分子的穩(wěn)定構(gòu)型見圖1。
圖1 三(2-氯乙基)乙基胺分子的穩(wěn)定構(gòu)型Fig.1 Stable structure of tris(2-chloroethyl)ethylamine
表1中列出了三(2-氯乙基)乙基胺分子的相關(guān)結(jié)構(gòu)參數(shù)。分析發(fā)現(xiàn),整個(gè)三(2-氯乙基)乙基胺分子的構(gòu)型具有良好的對稱性,三個(gè)氯乙基構(gòu)成三個(gè)支鏈圍繞中心的N原子對等排列。每個(gè)支鏈中均含有對等的C-H鍵、C-C鍵、C-Cl、C-N鍵四種化學(xué)鍵。在其中一個(gè)支鏈中的N1-C2為1.465?,C2-C11為1.528?,C11-Cl20為1.817?,C2-H4為1.101?,C2-H3為1.092?,鍵角∠N1-C2-C11為110.1°,∠C2-C11-Cl20為110.7°,∠H3-C2-H4為107.4°,∠H13-C2-H12為109.5°。其余兩個(gè)支鏈中鍵長、鍵角與該支鏈中的相應(yīng)參數(shù)近似相同。
表1 三(2-氯乙基)乙基胺分子的結(jié)構(gòu)參數(shù)Tab.1 Structure parameters of tris(2-chloroethyl)ethylamine
2.1 三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜
三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜見圖2。
圖2 三(2-氯乙基)乙基胺分子紅外光譜Fig.2 Infra-red specturm of tris(2-chloroethyl)ethylamine
分析發(fā)現(xiàn),分子簡正振動(dòng)的數(shù)目要大于光譜中出現(xiàn)的譜線的實(shí)際數(shù)目,這主要是由于部分分子振動(dòng)模式所引起的分子偶極矩沒有發(fā)生較大變化,并且存在簡并現(xiàn)象。此外,基本上紅外光譜的每條譜線都是由多個(gè)振動(dòng)模式疊加而成的。按分子振動(dòng)類型的不同三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜可劃分為0~1000、1000~1500、1500~3000和3000~4000cm-14個(gè)區(qū)域。
在0~1000cm-1區(qū)域,主要以分子內(nèi)各基團(tuán)的整體轉(zhuǎn)動(dòng)或擺動(dòng)為主,其中最強(qiáng)譜線出現(xiàn)在742cm-1位置,它主要是由含C17和C11的兩個(gè)CH2基團(tuán)的整體擺動(dòng)引起的,它也是整個(gè)紅外光譜的最強(qiáng)峰,振動(dòng)模式見圖3(a)。這一區(qū)域的次強(qiáng)峰出現(xiàn)在658cm-1位置,它是由含C14的CH2基團(tuán)的整體擺動(dòng)和C5-H6鍵的左右擺動(dòng)引起的,如圖3(b)所示。含C11的CH2基團(tuán)的中兩個(gè)C-H鍵的整體左右擺動(dòng)在91cm-1位置引起一共振峰,振動(dòng)模式如圖3c所示。在967cm-1位置的譜峰是由含C14的CH2基團(tuán)和含C5的CH2基團(tuán)的整體擺動(dòng)共同引起的。含C2的CH2基團(tuán)和含C8的CH2基團(tuán)的整體擺動(dòng)致使在光譜的928cm-1位置引起一共振峰。在419 cm-1位置的譜峰是由含C8的CH2基團(tuán)的整體轉(zhuǎn)動(dòng)和C2的CH2Cl基團(tuán)的整體轉(zhuǎn)動(dòng)引起的。此外,在這一區(qū)域中的36、139、309cm-13個(gè)位置的振動(dòng)模式均無紅外活性,這主要是由于分子振動(dòng)沒有引起偶極距的變化,其中36cm-1位置對應(yīng)的分子振動(dòng)模式主要是分子中3個(gè)甲基C-Cl鍵的整體左右擺動(dòng),139和309cm-1均由三(2-氯乙基)乙基胺分子整體轉(zhuǎn)動(dòng)引起的。
圖3 三(2-氯乙基)乙基胺分子的振動(dòng)模式Fig.3 Vibration modes of tris(2-chloroethyl)ethylamine
在1000~1500cm-1區(qū)域,分子的振動(dòng)模式主要為分子的面外彎曲振動(dòng)。區(qū)域的最強(qiáng)譜峰也是整個(gè)紅外光譜的次強(qiáng)峰,它出現(xiàn)在1149cm-1位置,它與由分別含有C5、C8和C17的CH2基團(tuán)中3個(gè)CH2集團(tuán)中的C-H鍵的面外彎曲振動(dòng)引起的;1143cm-1位置出現(xiàn)的譜峰是由含C11的CH2基團(tuán)中的C-H鍵的面外彎曲振動(dòng)造成的;含C14的CH2基團(tuán)中的C-H鍵的面外彎曲振動(dòng)在1273cm-1位置出現(xiàn)一較強(qiáng)譜峰;含C11和C17兩個(gè)CH2基團(tuán)的面外彎曲振動(dòng)在1308和1379cm-1兩個(gè)位置各造成一個(gè)譜峰的出現(xiàn);在1361cm-1位置出現(xiàn)的譜峰是由分子中含C17的CH2基團(tuán)的鍵的左右擺動(dòng)的復(fù)合振動(dòng)引起的面外彎曲振動(dòng)引起的。在1212cm-1位置的分子振動(dòng)模式是分子中所有CH2基團(tuán)的面外彎曲振動(dòng)的復(fù)合振動(dòng)引起的,但這一振動(dòng)模式?jīng)]有造成分子偶極矩較大變化,故在光譜的這一位置沒有對應(yīng)的共振峰出現(xiàn)。
在1500~1600cm-1區(qū)域的譜線是由分子內(nèi)各基團(tuán)的面內(nèi)彎曲振動(dòng)引起的。在這一區(qū)域出現(xiàn)的譜線與其它區(qū)域的譜線相比,存在著整體較弱且數(shù)量少的現(xiàn)象。在1529cm-1位置出現(xiàn)的譜峰是這一區(qū)域的最強(qiáng)峰,它是由含C8和C17的兩個(gè)CH2基團(tuán)中的C-H鍵的面內(nèi)彎曲振動(dòng)引起的,分子振動(dòng)模式如圖4(a)所示;區(qū)域次強(qiáng)峰出現(xiàn)在1511cm-1位置,它是由含C2和C11的CH2基團(tuán)的面內(nèi)彎曲振動(dòng)造成地,振動(dòng)模式如圖4(b)所示;含C2的CH2基團(tuán)中的兩個(gè)C-H鍵的面內(nèi)彎曲振動(dòng)在1526cm-1位置引起一共振峰;在1515cm-1位置出現(xiàn)雙重簡并峰,分別與含C5和C8的CH2基團(tuán)的面內(nèi)彎曲振動(dòng)相對應(yīng)。1502cm-1位置的分子振動(dòng)模式無紅外活性。
圖4 三(2-氯乙基)乙基胺分子的振動(dòng)模式Fig.4 Vibration modes of tris(2-chloroethyl)ethylamine
在3000~4000cm-1區(qū)域,分子的振動(dòng)類型主要為分子中C-H鍵的對稱和不對稱伸縮振動(dòng)。這一區(qū)域最強(qiáng)峰出現(xiàn)在3017cm-1位置,它是由含C5的CH2基團(tuán)中的兩個(gè)C-H鍵的對稱伸縮振動(dòng)引起的,振動(dòng)模式如圖5(a)所示。此外,這兩個(gè)C-H鍵的不對稱伸縮振動(dòng)在3059cm-1位置造成一較強(qiáng)共振峰。區(qū)域次強(qiáng)峰出現(xiàn)在3008cm-1位置,它是由C2-H4鍵的伸縮振動(dòng)引起的,如圖5(b)所示。含C14的CH2基團(tuán)中的兩個(gè)C-H鍵的對稱伸縮振動(dòng)在3102cm-1位置引起一共振峰。3108cm-1位置的共振峰是由含C11的CH2基團(tuán)中的兩個(gè)C-H鍵的對稱伸縮振動(dòng)引起的,如圖5(c)所示。含C11和C17的CH2基團(tuán)中的C-H鍵的不對稱伸縮振動(dòng)分別在3178和3169cm-1兩個(gè)位置造成兩個(gè)共振峰。此外,含C11和C17的CH2基團(tuán)中的C-H鍵的對稱伸縮振動(dòng)的復(fù)合振動(dòng)在3111cm-1位置形成一較強(qiáng)共振峰。
圖5 三(2-氯乙基)乙基胺分子的振動(dòng)模式Fig.6 Vibration modes of tris(2-chloroethyl)ethylamine
本文利用Gaussian計(jì)算軟件在B3LYP/6-31+G(d,p)和MP2/6-311+G(d,p)水平上確定出了三(2-氯乙基)乙基胺分子的穩(wěn)定構(gòu)型,并通過頻率計(jì)算析的方法得到了三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜。對分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn)進(jìn)行了詳細(xì)的分析,然后對紅外光譜中的譜線進(jìn)行了指認(rèn)歸屬。研究發(fā)現(xiàn),三(2-氯乙基)乙基胺分子的紅外振動(dòng)光譜可劃分為0~1000、1000~1500、1500~3000和3000~4000cm-14個(gè)區(qū)域,每個(gè)區(qū)域中的譜線所對應(yīng)的分子振動(dòng)模式有所不同,且由于部分振動(dòng)模式無紅外活性或存在簡并現(xiàn)象,致使光譜中的實(shí)際光譜數(shù)量小于理論數(shù)量。
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Study on characters of tris(2-chloroethyl)ethylamine by density functional theory
SU Xue-jun,LIU Cun-hai,ZHANG Yong
(Department of Basic Experiment,NAAU,Yantai 264001,China)
The tris(2-chloroethyl)ethylamine is studied at the 3-21G and 6-31+G(d,p)basis sets leve,using the B3LYP method of density functional theory,and the stable structure and its infra-red spectrum are gained. After researched,according to vibration modes,the infra-red spectrum of tris(2-chloroethyl)ethylamine mainly lies in four different regions:(0~1000)cm-1,(1000~1500)cm-1,(1500~3000)cm-1and(3000~4000)cm-1.Because there are degeneration and non-infrared activity appear in the spectrum,the practicable number of the spectral line is less than that of the normal modes.
tris(2-chloroethyl)ethylamine;density functional theory;infra-red spectrum;infrared activity
O641
A
10.16247/j.cnki.23-1171/tq.20151115
2015-07-06
蘇學(xué)軍(1967-),男,教授,碩士,主要從事激光多光子電離質(zhì)譜和光譜研究。