紀(jì)貝貝 ,張鵬,徐小潔,梁迎春,黃蓉,范忠義,李玲,郭靖,洪甜,,葉棋濃,杜楠
1.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 生物工程研究所,北京 100850;2.解放軍總醫(yī)院 第一附屬醫(yī)院,北京 100048;3.解放軍302醫(yī)院 普外診療中心,北京 100039
人自噬相關(guān)基因12(autophagy related gene 12,ATG12)是自噬相關(guān)基因家族成員,對(duì)自噬的形成至關(guān)重要[1]。自噬是細(xì)胞維持穩(wěn)態(tài)的一種機(jī)制,細(xì)胞內(nèi)多數(shù)衰老長(zhǎng)半衰期蛋白質(zhì)可通過自噬途徑降解,從而維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定[2]。研究發(fā)現(xiàn)自噬參與腫瘤、病原體免疫的過程,自噬可通過一系列機(jī)制將腫瘤細(xì)胞[3]、入侵的病原體[4]等降解,其機(jī)制為,來自高爾基復(fù)合體或粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的單層或雙層膜將抗原包裹后形成自噬泡,自噬泡的外膜與溶酶體膜融合,內(nèi)膜及其包裹的物質(zhì)進(jìn)入溶酶體腔,被溶酶體中的酶水解,從而維持機(jī)體穩(wěn)定。
ATG12 可以和ATG5、ATG16 結(jié)合形成復(fù)合物,該復(fù)合物參與自噬體的形成[5],在自噬過程中發(fā)揮重要作用[6-7]。ATG3 蛋白是一種泛素樣綴合酶,它和ATG10 是促進(jìn)ATG8 和ATG12 泛素樣蛋白結(jié)合的2種E2 樣酶[8]。有文獻(xiàn)報(bào)道稱,在自噬過程中ATG12可與ATG3 相互作用[9]。鑒于ATG12 在自噬中的重要作用,我們擬構(gòu)建ATG12 的真核表達(dá)載體,并驗(yàn)證表達(dá)的myc-ATG12 融合蛋白與ATG3 的相互作用,為進(jìn)一步研究ATG12與自噬的關(guān)系奠定基礎(chǔ)。
人胚腎293T細(xì)胞由本室傳代培養(yǎng);pXJ-40-myc載體為本實(shí)驗(yàn)室保存;Flag-ATG3 質(zhì)粒為本實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建;VigoFect 為威格拉斯生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;限制性內(nèi)切酶、DNA 連接酶、PCR 試劑均購自TaKaRa 公司;上、下游引物由北京賽百盛生物技術(shù)有限公司合成;質(zhì)粒提取、膠回收、PCR 回收試劑盒購自Promega公司;HRP標(biāo)記的抗myc標(biāo)簽鼠單克隆抗體(myc-HRP)和抗Flag標(biāo)簽鼠單克隆抗體(Flag-HRP)購自Sigma公司;DMEM及小牛血清購自Gibco公司;測(cè)序由北京奧科生物技術(shù)有限責(zé)任公司完成。
以本實(shí)驗(yàn)室保存的人乳腺文庫為模板,根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道[10]的ATG12 編碼序列合成上游引物(5'-CG GGATCCATGGCGGAGGAGCCGCAGTCTG-3')和下游引物(5'-CCGCTCGAGTCATCCCCACGCCTGAG ACTTGC-3'),PCR 擴(kuò)增人ATG12 的編碼序列(擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72℃延長(zhǎng)7 min),用膠回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物。
用BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切pXJ-40-myc 載體,經(jīng)10 g/L 瓊脂糖凝膠電泳后,膠回收載體大片段;將PCR片段回收后再用BamHⅠ/XhoⅠ酶切,形成帶有粘端的雙鏈,用T4DNA 連接酶連接入pXJ-40-myc載體;轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,挑選克隆,振蕩培養(yǎng)并提質(zhì)粒,用BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切鑒定,酶切鑒定正確的克隆送北京奧科生物公司測(cè)序。
按常規(guī)方法進(jìn)行轉(zhuǎn)染,用不含雙抗、含100 mL/L 胎牛血清的DMEM 培養(yǎng)基將293T 細(xì)胞接種于6 cm 皿中,接種量以轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞密度達(dá)80%為宜,培養(yǎng)24 h 后進(jìn)行轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染前1 h 換液。將4 μL VigoFect與200 μL NaCl混合,再將總量為10 μg的重組質(zhì)粒與200 μL NaCl 混合,然后將上述2 種溶液輕輕混合,室溫放置15 min,加入6 cm皿中,并以同樣方法轉(zhuǎn)染空pXJ-40-myc 載體作為對(duì)照,37℃、5% CO2常規(guī)培養(yǎng),4~6 h換液。質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞24 h 后收集細(xì)胞蛋白,加入2×SDS 加樣緩沖液,煮沸10 min,高速離心2 min,取上清液進(jìn)行SDSPAGE后電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上;用5%脫脂奶粉于4℃封閉過夜,加入用5%脫脂奶粉以1∶5000稀釋的用HRP 標(biāo)記的抗myc 標(biāo)簽鼠單克隆抗體,室溫輕搖1 h,TBST洗膜3次,每次5 min;用化學(xué)發(fā)光法顯色5 min,壓片顯影。
將人胚腎293T 細(xì)胞接種于6 cm 皿中,用重組myc-ATG12 與Flag-ATG3 共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后4~6 h 換液,常規(guī)培養(yǎng)24 h 后收集細(xì)胞,加入中鹽(0.25 mol/L)IP 緩沖液后與myc-beads 于4℃結(jié)合4~6 h,3000 r/min 離心5 min,經(jīng)中鹽IP 緩沖液再次漂洗后,加入與myc-beads 等量的2×SDS 加樣緩沖液,煮沸10 min,12 000 r/min 離心2 min,取上清液進(jìn)行SDS-PAGE后電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,用5%脫脂奶粉于4℃封閉1 h,加入用5%脫脂奶粉以1∶5000稀釋的用HRP標(biāo)記的抗myc和Flag標(biāo)簽鼠單克隆抗體,室溫輕搖1 h,TBST 洗膜3 次,每次5 min,用化學(xué)發(fā)光法顯色,5 min后壓片顯影。
以實(shí)驗(yàn)室保存的人乳腺文庫為模板,PCR 擴(kuò)增人ATG12 的編碼序列,獲得約420 bp 的DNA 片段,與預(yù)期一致(圖1)。將PCR 產(chǎn)物用BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切后,與經(jīng)同樣雙酶切的pXJ-40-myc 載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,挑選陽性克隆提質(zhì)粒,經(jīng)酶切鑒定,可切出2條長(zhǎng)度分別約為5000和420 bp的條帶,而相應(yīng)的空載體酶切只見大片段,符合預(yù)期結(jié)果(圖2)。測(cè)序結(jié)果表明,插入片段的DNA 序列與人ATG12基因的編碼序列完全一致(數(shù)據(jù)略)。
圖1 PCR擴(kuò)增人ATG12的編碼序列
圖2 重組質(zhì)粒myc-ATG12的BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切電泳圖譜
將構(gòu)建的myc-ATG12 重組質(zhì)粒和空載體分別轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞,24 h 后提取蛋白進(jìn)行SDS-PAGE,Western 印跡檢測(cè)myc-ATG12 蛋白的表達(dá)。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒后,用myc-HRP 抗體能夠在相對(duì)分子質(zhì)量約17×103處檢測(cè)到明顯的特異性條帶,而空載體則無條帶(圖3)。說明myc-ATG12重組蛋白在293T細(xì)胞中能夠正確表達(dá)。
根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,ATG12 可與ATG3 蛋白相互作用。為進(jìn)一步證實(shí)構(gòu)建的myc-ATG12 重組質(zhì)粒正確,且能夠表達(dá)正確的融合蛋白,將重組myc-ATG12 質(zhì)粒與Flag-ATG3 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞,24 h常規(guī)培養(yǎng)后收集蛋白,免疫共沉淀分析觀察顯示,myc-ATG12 融合蛋白與Flag-ATG3 蛋白具有相互作用,而myc 空載體在同一位置無此條帶,表明ATG12 與ATG3 蛋白能夠在體內(nèi)特異地相互作用,而myc 標(biāo)簽不影響ATG12 的結(jié)構(gòu)及其生物學(xué)功能(圖4)。進(jìn)一步證明構(gòu)建的重組myc-ATG12質(zhì)粒正確,且能夠正常表達(dá)。
自噬是一種普遍而又重要的生命現(xiàn)象,廣泛參與多種生理和病理過程,特別是與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)。目前,自噬的調(diào)控作用被廣泛關(guān)注并加以研究,以求從分子水平上對(duì)腫瘤進(jìn)行治療,從而達(dá)到根治的目的[11-13]。針對(duì)ATG的調(diào)控是現(xiàn)在自噬研究的熱點(diǎn)。根據(jù)其在自噬過程的不同階段發(fā)揮作用的不同,可將ATG 分為以下三類:一是ATG1-ATG11-ATG17-ATG20-ATG24-ATG29-ATG31 和ATG13-ATG8 復(fù)合體,二是ATG6-ATG14-Vps34-Vps15 復(fù)合體,三是ATG12-ATG5-ATG16和LC3-II-PE泛素樣蛋白系統(tǒng)[14]??梢夾TG12與自噬體的形成密切相關(guān)。有研究顯示ATGl2缺失的小鼠胚胎干細(xì)胞前自噬體結(jié)構(gòu)和自噬體的數(shù)量明顯減少[15]。
圖3 Western印跡檢測(cè)myc-ATG12的表達(dá)
圖4 免疫共沉淀分析驗(yàn)證重組ATG12與ATG3在蛋白水平上具有相互作用
ATG12 定位于細(xì)胞質(zhì)和自噬體中,同時(shí)介導(dǎo)自噬和凋亡兩條通路[16],在自噬過程中和ATG5的結(jié)合是不可逆的,同時(shí)與ATG3 的結(jié)合區(qū)域也有很多疑惑待解決[17]。本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建的myc-ATG12在真核細(xì)胞中獲得了表達(dá),且表達(dá)的融合蛋白能夠與ATG3 蛋白相互作用。ATG12 在真核細(xì)胞中的成功表達(dá),是繼續(xù)深入研究其在自噬中的作用機(jī)制,以及探討其利用價(jià)值的基礎(chǔ)。
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