周健,吳曉雪
(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)
·研究簡報·
湖南地區(qū)漢族人群20個非CODIS STR基因座多態(tài)性
周健,吳曉雪
(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)
法醫(yī)遺傳學;多態(tài)現象,遺傳;短串聯重復序列;湖南;漢族
本研究采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒,對湖南湘西自治州300名漢族無關個體的20個非CODIS STR基因座進行群體遺傳學調查,以獲取20個STR基因座在該地區(qū)的相關群體遺傳學數據,為該地區(qū)的法醫(yī)學應用提供基礎數據,現報道如下。
湖南漢族人群血樣在知情同意原則下采自健康志愿者,包括男性180名,女性120名。采用Chelex-100法[1]提取DNA。Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒購自基點認知(北京)公司。PCR反應體系為10 μL,循環(huán)條件:95℃11 min;94℃30 s,60℃60s,70℃60s,30個循環(huán);60℃30min。PCR產物變性后在3130XL型遺傳分析儀(美國AB公司)上進行毛細管電泳,用GeneMapper ID v3.2.1軟件對STR基因座進行分型。對基因型頻率進行Hardy-Weinberg平衡檢驗。采用PowerStats軟件分別計算20個基因座的雜合度(H)、個人識別率(DP)、非父排除率(PE)、多態(tài)信息含量(PIC)等群體遺傳學參數。
目前市場上的商業(yè)化試劑盒中大多數基因座是CODIS基因座結合個別非CODIS基因座,由于STR基因座的突變率較高,在親權鑒定中對于非CODIS基因座的需求比較大。本研究采用的Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒則涵蓋了20個非CODIS基因座,這20個STR基因座的群體遺傳學參數見表1。
經對每個基因座的基因型分布進行χ2檢驗,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。20個STR基因座的DP值均大于0.85,在群體中的累積個體識別率為1-3.2264×10-26。該20個STR基因座在二聯體和三聯體中的累積非父排除率均大于0.99999。以上表明,這20個STR基因座在湖南漢族人群中具有良好的多態(tài)性,能夠用于日常法醫(yī)學實踐。
表1 20個STR基因座在湖南漢族人群中的群體遺傳學參數(n=300)
[1]Walsh PS,Metzger DA,Higushi R.Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material.BioTechniques 10(4):506-513(April 1991)[J].Biotechniques,2013,54(3):134-139.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.017
1004-5619(2015)06-0478-01
2015-08-24)
(本文編輯:李成濤)
周健(1982—),男,法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學鑒定;E-mail:45159121@qq.com