婁佑武,吳志勇,王榮民,陳國(guó)良,寧 財(cái),雷初朝,黃永震*
(1.江西省畜牧技術(shù)推廣站,江西 南昌330046;2.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,陜西省農(nóng)業(yè)分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,陜西 楊凌712100)
牛奶和乳制品是人類一個(gè)寶貴的營(yíng)養(yǎng)來源,乳成分可以通過奶牛的營(yíng)養(yǎng)和育種選擇進(jìn)行改善和提高。二脂酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶1(acyl CoA:diacylgyeerol acyltransferase,DGAT1)是哺乳動(dòng)物體內(nèi)的一種非常重要的酶,DGAT1是催化甘油三脂(triacylgycer0l,TAG)合成的最后一步反應(yīng)的關(guān)鍵酶,也是甘油三脂合成過程中唯一的關(guān)鍵酶,其主要機(jī)制是使二酰甘油加上脂肪酸?;纬扇8视?。DGATI在大多數(shù)的組織中具有較高的表達(dá)水平,特別是在乳腺、小腸、睪丸、脂肪組織和皮膚中的表達(dá)量最高,該基因在泌乳、脂肪吸收、脂蛋白組裝和脂肪形成中發(fā)揮著重要的功能[1,12]。
DGAT1在很多物種中是一種含有500個(gè)氨基酸的蛋白,具有較強(qiáng)的疏水性[2],并具有二聚體和同源四聚體的結(jié)構(gòu)[3]。該酶參與腸道中脂肪吸收、血漿中甘油三脂濃度的調(diào)節(jié)、脂蛋白的組裝、脂肪細(xì)胞中脂肪的儲(chǔ)存、肌肉中能量代謝以及體脂的合成、禽蛋以及卵母細(xì)胞的形成[4,5]。
DGAT1是泌乳性狀候選基因,小鼠缺乏DGAT1會(huì)失去分泌乳的功能[6]。DGAT1基因K232A多態(tài)性對(duì)牛產(chǎn)乳性狀(牛奶產(chǎn)量、蛋白質(zhì)含量、脂肪含量和脂肪酸組成)有重要影響[7]。DGAT1基因位于牛的14號(hào)染色體上,研究發(fā)現(xiàn),與牛奶產(chǎn)量性狀相關(guān)的一個(gè)潛在數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)也定位在牛14號(hào)染色體上[8,9]。
在成熟的蛋白質(zhì)中,DGAT1基因外顯子8的232位氨基酸的改變,即賴氨酸突變?yōu)楸彼岬陌被嵝蛄校╬.Lys232Ala,或表示為K232A)能夠影響牛奶乳脂組成和脂肪含量[10]。奶牛DGAT1基因K232A突變產(chǎn)生的不同基因型之間在305d產(chǎn)奶量,乳脂量和乳蛋白量等差異顯著,該基因多態(tài)及其與產(chǎn)奶性狀密切相關(guān),其效應(yīng)在不同國(guó)家的奶牛群體中得到了驗(yàn)證[7-11,13-16]。
江西吉安西雜牛是乳肉兼用型西門塔爾牛與吉安黃牛雜交產(chǎn)生的后代,適應(yīng)性好,具有比吉安黃牛產(chǎn)奶量、乳脂率高的特點(diǎn),可開發(fā)高乳脂率的牛奶和生產(chǎn)黃油。關(guān)于江西吉安西雜母牛DGAT1基因K232A突變多態(tài)性及其與乳成分性狀的關(guān)系研究尚未見報(bào)道。因此,本研究采用PCR、DNA測(cè)序技術(shù),酶切和瓊脂糖凝膠電泳等方法檢測(cè)了吉安西雜母牛98頭個(gè)體DGAT1基因的遺傳變異,分析了其遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,并對(duì)98頭個(gè)體在該基因K232A突變位點(diǎn)的多態(tài)性與其4個(gè)乳成分指標(biāo)進(jìn)行了相關(guān)分析。
本研究所用98份成年吉安西雜母牛(Xiza cattle,XZ)母牛的血樣,采自江西牛牛乳業(yè)有限公司西雜母牛群,測(cè)定的主要性狀包括:脂肪(Fat)、非脂(Non-fat)、蛋白質(zhì)(Protein)和乳糖(Milk sugar)的百分含量;測(cè)定時(shí)間為2012年1月~2014年12月。
根據(jù)GenBank上公布的奶牛DGAT1基因的DNA序列(登錄號(hào):AJ318490),圍繞K232A突變位點(diǎn),利用引物設(shè)計(jì)軟件Primer5.0設(shè)計(jì)引物(Fp:5'-CACCATCCTCTTCCTCAAGC-3';Rp:5'-CCTCACCATCTCCAGGAGTC-3');引物由上海生工生物工程公司合成。
PCR反應(yīng)體系為25μL,包括:10×Buffer(Mg2+free)2.5μL、Mg+2+1.5μL、dNTPs 0.5 μL、FP 0.5μL、RP 0.5μL、DNA 模板(50ng/μL)2μL,加雙蒸水至25μL。
PCR反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性5min;95℃變性45s,61℃退火45s,72℃延伸45s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,4℃保存。
隨機(jī)從提取的所有DNA樣品中選出1/3的樣品,各取5μL,放入同一離心管中,混勻,調(diào)整終濃度為50~60ng/μL,快速建立吉安西雜母?;旌螪NA池。
以DNA池樣品為模板進(jìn)行擴(kuò)增,抽取5μL PCR產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠中電泳檢測(cè),將目的條帶清晰、明亮的產(chǎn)物,利用PCR擴(kuò)增產(chǎn)物回收純化試劑盒進(jìn)行回收及純化(北京天根生物公司),回收產(chǎn)物直接在ABI 3730自動(dòng)測(cè)序儀上進(jìn)行雙向測(cè)序(上海生物工程有限公司)。將測(cè)序結(jié)果提交http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST 網(wǎng)站比較,以檢測(cè)SNPs位點(diǎn)。
PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè):抽取10μL PCR產(chǎn)物經(jīng)限制性酶EaeI消化處理,選用2%(w/v)的瓊脂糖凝膠,電泳50~60min,采用EB染色,分析、拍照。
采用PopGene軟件進(jìn)行群體遺傳分析,對(duì)觀測(cè)到的基因型進(jìn)行計(jì)數(shù),分別統(tǒng)計(jì)基因頻率和基因型頻率、純合度(Ho)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)和多態(tài)信息含量(PIC)。以及對(duì)多態(tài)位點(diǎn)的基因型頻率分布進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。
采用SPSS軟件(Version 16.0)的 GLM(General Linear Models)程序?qū)?DGAT1基因型與乳成分性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,所用動(dòng)物模型為:Yijk=μ+Ai+ Gj+ Eijk,其中,Y-ijk:個(gè)體乳成分記錄;μ:總體均數(shù);Ai:年齡效應(yīng);Gj:基因型效應(yīng);Eijk:隨即誤差。
經(jīng)DNA池PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序發(fā)現(xiàn),吉安西雜母牛DGAT1擴(kuò)增區(qū)存在一個(gè)K232A的突變位點(diǎn),這個(gè)位點(diǎn)也正是限制性內(nèi)切酶EaeI的酶切位點(diǎn)。所以,利用DGAT1基因擴(kuò)增片段中存在限制性內(nèi)切酶EaeI的特異性酶切位點(diǎn)特性,使用EaeI酶切結(jié)合凝膠電泳的RFLP法對(duì)吉安西雜母牛進(jìn)行分型,酶切后KK型片段大小為441bp,AA型片段大小為(239bp+202bp),KA型片段大小為(401bp+239bp+202bp),判型結(jié)果如圖1所示。在所研究群體中,該位點(diǎn)存在多態(tài)性,發(fā)現(xiàn)3種基因型AA、KA和KK。
圖1 吉安西雜母牛DGAT1基因突變區(qū)2%瓊脂糖凝膠電泳
從表1可知,在3種基因型AA、KA和KK中,AA基因型為優(yōu)勢(shì)基因型。等位基因A和K在西雜母牛群體中的分布頻率分別為0.56和0.44;等位基因A的分布頻率高于K基因。PIC在西雜母牛群體中為0.371(0.25<PIC<0.5),屬于中度多態(tài)。平衡檢驗(yàn)的結(jié)果顯示,吉安西雜母牛群體處于哈德-溫伯平衡狀態(tài)(P>0.05)。
對(duì)DGAT1基因突變位點(diǎn)的基因頻率和基因型頻率統(tǒng)計(jì)分析,該突變位點(diǎn)在吉安西雜母牛群體中基因型頻率和基因頻率及Ho、He、Ne和PIC結(jié)果見表1。
表1 吉安西雜母牛DGAT1基因K232A遺傳多態(tài)性指標(biāo)
在表2中列出了吉安西雜母牛DGAT1基因突變位點(diǎn)不同基因型個(gè)體的乳脂率、乳非脂率、乳蛋白率和乳糖率的統(tǒng)計(jì)值,經(jīng)顯著性檢驗(yàn)和多重比較,結(jié)果表明:KA雜合型個(gè)體的在乳脂率、非脂率、乳蛋白率和乳糖率指標(biāo)上都大于KK型AA型的趨勢(shì),但差異不顯著(P>0.05)。
表2 吉安西雜母牛DGAT1基因K232A多態(tài)性與生乳檢測(cè)指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析
本研究以牛DGAT1基因作為影響奶牛乳成分的候選基因,對(duì)吉安西雜母牛群DGAT1基因外顯子8區(qū)域K232A突變的遺傳多態(tài)性進(jìn)行了檢測(cè)。結(jié)果顯示,A等位基因是群體中的優(yōu)勢(shì)等位基因,AA基因型是優(yōu)勢(shì)基因型。野生純合子KK基因型少于突變純合子AA基因型,這種現(xiàn)象顯示在人工選擇,遷移,遺傳漂變過程中,動(dòng)物種群中K等位基因的頻率呈現(xiàn)減少的趨勢(shì)。
由于該缺失突變存在于牛DGAT1基因外顯子8區(qū)域,該突變可能對(duì)DGAT1基因自身的翻譯效率產(chǎn)生影響,我們推測(cè)該缺失突變對(duì)奶牛的脂肪合成性狀起了間接的作用。為了證實(shí)外顯子8區(qū)域K232A突變對(duì)牛泌乳性狀的影響機(jī)理,仍需要對(duì)牛DGAT1基因在轉(zhuǎn)錄翻譯水平做進(jìn)一步的研究。
在本研究中,我們對(duì)3種基因型與乳成分進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示:KA雜合型個(gè)體的脂肪、非脂、蛋白質(zhì)和乳糖的百分含量大于AA和KK型。推測(cè)等位基因K和A可能產(chǎn)生互作影響西雜母牛的乳成分。因此,奶牛遺傳育種工作者在西雜母牛選育過程中,應(yīng)當(dāng)盡可能的選擇KA基因型個(gè)體,進(jìn)行擴(kuò)群飼養(yǎng),不斷提高KA基因型個(gè)體在群體中的頻率,最終育成西雜牛新品系。
泌乳性狀是受多基因座位控制的,影響泌乳性狀主基因的確定對(duì)我國(guó)地方黃牛品種向乳用方向培育有重要意義。候選基因法是尋找畜禽QTL一種非常有效的方法,它可以直接研究具有特定功能基因的多態(tài)性與經(jīng)濟(jì)性狀之間的關(guān)系。已有研究證明,DGAT1基因在動(dòng)物的脂代謝和泌乳過程中起著重要的作用,該基因的突變對(duì)奶牛的乳成分有重要影響。因此,可以被其作為候選基因與數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)作連鎖分析,用于數(shù)量性狀的輔助標(biāo)記選擇。在吉安西雜母牛群體中,已反映出KA基因型個(gè)體比AA、KK基因型個(gè)體在乳成分性狀上有一定的優(yōu)勢(shì),但還必須擴(kuò)大樣品做進(jìn)一步驗(yàn)證。
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