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      “開放科學(xué) 數(shù)據(jù)共享 軟件共享”, 你準(zhǔn)備好了嗎?

      2016-02-28 18:47:35
      心理科學(xué)進(jìn)展 2016年6期
      關(guān)鍵詞:科學(xué)研究開放性指南

      朱 瀅

      (北京大學(xué)心理系, 北京 100871)

      當(dāng)前, “開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”(Open science, data sharing, software sharing)的趨勢(shì)十分明顯, 它是科學(xué)的未來(lái)(Gewin, 2016)。那么,“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”是如何體現(xiàn)的呢?

      它的最明確的信號(hào)是刊登在2015年《科學(xué)》雜志上的“促進(jìn)期刊透明性和開放性的指南” (以下簡(jiǎn)稱指南) (Nosek, et al. 2015)一文, 接受該指南的雜志或研究團(tuán)體, 就意味著它們支持科學(xué)的透明性、開放性和重現(xiàn)性(reproducibility, 一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)可以由原作者或其他人重復(fù)進(jìn)行)。具體說(shuō)來(lái),就是可以僅僅刊登實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì), 廣泛征求意見(jiàn)后再進(jìn)行實(shí)驗(yàn); 實(shí)驗(yàn)結(jié)束后將原始數(shù)據(jù)公布, 以便人們使用或檢查; 刊登無(wú)顯著差別的發(fā)現(xiàn)以及重復(fù)的研究, 等等。這些做法可以改善科研的重現(xiàn)性,擴(kuò)大科學(xué)觀察的范圍。據(jù)報(bào)道, 名為《Research Ideas and Outcomes》(RIO)的雜志已于2015年11月正式登場(chǎng)。它可以僅僅刊登研究設(shè)想, 或方法,或工作流程(Workflows), 或數(shù)據(jù), 或報(bào)告, 或軟件。一句話, 它可以僅僅刊登研究周期中的任何一項(xiàng)產(chǎn)品(參見(jiàn)2015年9月《Science》News)。這樣的雜志正好體現(xiàn)了當(dāng)今的科學(xué)精神——科學(xué)的開放性。它與過(guò)去的刊物僅僅刊登科研的最后成果——論文不同, 更關(guān)心做科學(xué)的做法(Take more care about the modus operandi of doing science than only the publication of results)。這樣, 科研的每一環(huán)節(jié)都可以得到監(jiān)控, 從而大大提高了科學(xué)自身的糾錯(cuò)能力, 并改善了科研的重現(xiàn)性。另外, 有一類雜志的總稱叫 PLOS, 它包括生物學(xué)及醫(yī)學(xué)各分支的8份期刊。PLOS從2014年3月起要求作者在投稿時(shí)包含一項(xiàng)數(shù)據(jù)可用性的聲明, 讓讀者可以得到該數(shù)據(jù)。PLOS相信, 數(shù)據(jù)可用性允許數(shù)據(jù)重復(fù), 再分析, 新分析, 解釋, 或包含在元分析中, 從而促進(jìn)研究的重現(xiàn)性, 所有這些都會(huì)提供一個(gè)更好的“貨真價(jià)實(shí)”的科學(xué)研究。

      目前, 538個(gè)出版社和雜志(包括 Elserier和Springer出版社)以及 57個(gè)研究團(tuán)體(包括美國(guó)科學(xué)促進(jìn)會(huì))已采用指南。另外, 實(shí)行數(shù)據(jù)公開政策的基金會(huì)也愈來(lái)愈多, 他們要求申請(qǐng)者在科研中公開數(shù)據(jù)。這些基金會(huì)包括美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(the US National Science Foundation)以及一些慈善基金會(huì)(the Bill & Melinda Gates Foundation in Seattle, Washington, and the Wellcome Trust in London)。還有一些基金會(huì)目前對(duì)公開數(shù)據(jù)不作硬性要求, 但鼓勵(lì)人們這樣做。因此, 有人認(rèn)為, 如果不走“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”這條道路,今后做科學(xué)研究將會(huì)變得十分艱難(Gewin, 2016)。

      但是, 許多年輕人包括研究生與博士后還沒(méi)有決定是否接受數(shù)據(jù)共享。一方面是因?yàn)樗?她們的老板才有選擇的權(quán)利, 因?yàn)槔习鍨樗?她們提供科研經(jīng)費(fèi); 另一方面, 人們擔(dān)心數(shù)據(jù)共享可能的副作用。例如, 數(shù)據(jù)共享后有可能會(huì)讓別人在科研上搶先一步做出成果; 公布數(shù)據(jù)后要回答來(lái)信詢問(wèn), 會(huì)花很多時(shí)間, 等等。提倡數(shù)據(jù)共享的人提醒說(shuō), 參與開放科學(xué)的人們有可能得到三種引用:引用數(shù)據(jù), 引用軟件和引用最后的文章。這些引用最終會(huì)導(dǎo)致好的名聲, 即知名度——這是申請(qǐng)基金和找工作的一個(gè)極為重要的條件。至于一些可能的副作用也不必?fù)?dān)心, 例如, 根據(jù)數(shù)據(jù)、軟件公布的時(shí)間是可以防止剽竊行為的; 在公布數(shù)據(jù)的同時(shí)附上怎樣使用數(shù)據(jù)的說(shuō)明, 可以節(jié)約作者的許多時(shí)間。還有, 當(dāng)前共享數(shù)據(jù)不存在什么技術(shù)障礙。例如, 線上的存儲(chǔ)庫(kù)如Fig Share或Zenodo使數(shù)據(jù)存儲(chǔ)愈來(lái)愈容易。

      “開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神,源于當(dāng)下科學(xué)研究的需要, 即改善科學(xué)的重現(xiàn)性。2015年在《科學(xué)》雜志上撰寫“促進(jìn)期刊透明性和開放性的指南”的作者(Nosek, B. et al.2015), 就是在2015年在《科學(xué)》雜志上刊登實(shí)驗(yàn)報(bào)告, 報(bào)道100項(xiàng)心理學(xué)實(shí)驗(yàn)成功重現(xiàn)的不足1/2的作者(Open Science Collaboration, 2015), 這絕不是偶然的!因?yàn)樾睦砜茖W(xué)研究重現(xiàn)性差的問(wèn)題在科學(xué)界具有普遍意義。科研發(fā)現(xiàn)必須能夠重復(fù),它才能成為累積起來(lái)的科學(xué)知識(shí), 成為科學(xué)長(zhǎng)城中的一塊磚或是一顆沙粒; 科研發(fā)現(xiàn)如果不能重復(fù), 它就會(huì)被拋棄掉。因此, 科學(xué)的進(jìn)步既依賴創(chuàng)新也依賴重現(xiàn)(Open Science Collaboration, Science,2015)。而改善科學(xué)重現(xiàn)性的唯一方法就是提倡“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神, 這涉及科研人員, 學(xué)術(shù)期刊與出版社, 資助科研的基金會(huì)及各種學(xué)術(shù)團(tuán)體, 以及公眾對(duì)科學(xué)的關(guān)注與參與, 可以說(shuō), 這就是當(dāng)代的科學(xué)精神。

      心理學(xué)科學(xué)研究的重現(xiàn)性不佳, 更為迫切地要求公開數(shù)據(jù)(朱瀅, 伍錫洪, 2016)。為此,《Psychological Science》雜志采取措施鼓勵(lì)人們進(jìn)行重復(fù)性研究。具體的做法是, 如果作者愿意,該雜志給某些文章貼上“公開數(shù)據(jù)”的標(biāo)簽, 清楚地告訴讀者, 這些數(shù)據(jù)在哪里可以找到。據(jù)報(bào)道,從2013年到2015年貼有“公開數(shù)據(jù)”標(biāo)簽的文章由10%增加到38%, 這也就是“數(shù)據(jù)共享”比例的增長(zhǎng)。

      國(guó)內(nèi)心理學(xué)學(xué)者已經(jīng)開始對(duì)“開放科學(xué)”進(jìn)行了有益的探索。如復(fù)旦大學(xué)心理系教授張學(xué)新與同行發(fā)起了學(xué)術(shù)期刊的“公評(píng)”審稿制度, 他們正在創(chuàng)辦由多個(gè)高校共建的雙語(yǔ)期刊《中國(guó)心理學(xué)家》(Chinese Psychologist)。這份期刊所發(fā)表的科研報(bào)告將在網(wǎng)上做公開評(píng)審, 作者也可以與評(píng)論者在網(wǎng)上展開相互討論(黃永明, 南方周末,2015?11?05)。中國(guó)科學(xué)院心理研究所研究員、副所長(zhǎng)劉勛正在加緊建設(shè)一個(gè)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器平臺(tái), 并設(shè)計(jì)移動(dòng)客戶端與該平臺(tái)交換數(shù)據(jù), 包括大規(guī)模行為數(shù)據(jù)和腦成像數(shù)據(jù)。借此達(dá)到數(shù)據(jù)共享的目的, 推動(dòng)心理學(xué)實(shí)驗(yàn)任務(wù)的標(biāo)準(zhǔn)化(私人通信2016)。

      “開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”依賴互聯(lián)網(wǎng)讓科學(xué)成為更多人的科學(xué)(有人稱為“公民科學(xué)” (citizen science)), 使科學(xué)更健康地發(fā)展。有人用一句話總結(jié)“開放科學(xué)”:“科學(xué)有問(wèn)題, 但網(wǎng)絡(luò)可以修復(fù)” (Science has its problems, but the Web could be fix)。

      致謝:本文得到陸巖女士大力幫助, 在此表示感謝!

      朱瀅, 伍錫洪. (2016).《科學(xué)》和《自然》雜志 2015 年的兩篇心理學(xué)文章.心理科學(xué), 39(2), 474?477.

      Gewin, V. (2016). An open mind on open data. Nature,529,117?119

      Nosek, B, et al. (2015). Supplementary materials for promoting an open research culture.Science, 348, 1422?1425. DOI:10. 1126/science.aab2734

      Open Science Collaboration. (2015). Estimating the reproducibility of psychological science.Science, 349,aac4716 DOI: 10. 1126/science.aac4716

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