劉勝男,張 燕,劉泰瑜,許 可,張建國(guó)
(上海理工大學(xué) 食品科學(xué)與工程研究所,上海 200093)
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TTC比色法篩選高存活率的畢赤酵母突變株
劉勝男,張燕,劉泰瑜,許可,張建國(guó)
(上海理工大學(xué) 食品科學(xué)與工程研究所,上海 200093)
采用TTC比色法篩選高存活率畢赤酵母NTG突變株,探討了pH值、菌體濃度(OD600)、反應(yīng)時(shí)間、細(xì)胞存活率等對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響,并與平板計(jì)數(shù)法進(jìn)行比較。結(jié)果表明,在pH值為4.0~7.0或菌體濃度(OD600)低于50.00時(shí),pH值、OD600均與1,3,5-三苯基甲臜(TPF)生成量(OD485)呈線性正相關(guān)關(guān)系;反應(yīng)時(shí)間超過(guò)9 h后可以保持穩(wěn)定的TPF生成量;死細(xì)胞對(duì)TTC顯色反應(yīng)無(wú)干擾,在細(xì)胞存活率低于50%時(shí),仍然可以采用TTC比色法測(cè)定細(xì)胞活性。表明,TTC比色法在一定范圍內(nèi)可以篩選高存活率畢赤酵母突變株,且操作簡(jiǎn)單省時(shí),為篩選高存活率的微生物菌株提供了可靠技術(shù)。
TTC比色法;畢赤酵母;存活率;優(yōu)化;亞硝基胍;篩選
畢赤酵母是一種重要的工業(yè)微生物,以畢赤酵母為對(duì)象研究工業(yè)微生物中的共性問(wèn)題具有重要的示范意義。畢赤酵母是具有良好應(yīng)用前景的細(xì)胞工廠,尤其是在高效表達(dá)外源蛋白質(zhì)方面受到研究者的重視[1],目前已報(bào)道有600多種外源蛋白質(zhì)在畢赤酵母中成功表達(dá),畢赤酵母表達(dá)的外源蛋白在食品工業(yè)的應(yīng)用潛力巨大[2]。畢赤酵母的優(yōu)點(diǎn)是:基因操作和培養(yǎng)技術(shù)簡(jiǎn)單、成熟,可以分泌表達(dá)不同來(lái)源的基因[3],有與人相近的蛋白質(zhì)糖基化系統(tǒng)[4],高密度發(fā)酵(130g·L-1)。
目前,畢赤酵母高密度發(fā)酵的主要方式是控制溶氧和流加碳源的濃度:(1)控制溶氧濃度在20%以上可以保證畢赤酵母具有一定的代謝甲醇的能力[5],但受甲醇濃度、攪拌、通氣等因素的影響,控制穩(wěn)定的溶氧濃度較困難[6],若溶氧濃度過(guò)高會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞死亡[7];另外,以傳感器測(cè)定甲醇濃度[8]、建立生長(zhǎng)模型[9]、調(diào)整進(jìn)氣口的氧分壓[6]等方式控制溶氧濃度會(huì)使發(fā)酵液變?yōu)榉桥nD流體而干擾溶氧的測(cè)定[7],導(dǎo)致發(fā)酵過(guò)程失敗。(2)控制流加碳源(甲醇)濃度。在MutS型畢赤酵母的誘導(dǎo)過(guò)程中甲醇濃度一般控制在0.2%~0.8%[10],Mut+型畢赤酵母的誘導(dǎo)過(guò)程中甲醇濃度一般控制在3%[11]。
由于畢赤酵母以甲醇為碳源的比生長(zhǎng)速率較低(0.002~0.14h-1),從而限制了外源蛋白的表達(dá)[12],細(xì)胞死亡率達(dá)到35%[13], 提高微生物細(xì)胞存活率因此成為近年來(lái)的研究重點(diǎn)[14]。不同學(xué)者報(bào)道的畢赤酵母高密度發(fā)酵過(guò)程中細(xì)胞存活率有所不同。Xiao等[15]在培養(yǎng)畢赤酵母時(shí)發(fā)現(xiàn)畢赤酵母的細(xì)胞存活率在74%~91%之間;Hohenblum等[13]以批式流加方式培養(yǎng)畢赤酵母時(shí),畢赤酵母的細(xì)胞存活率低于70%;Routledge等[16]搖瓶培養(yǎng)畢赤酵母時(shí),細(xì)胞存活率達(dá)到100%,這可能與分批培養(yǎng)畢赤酵母的培養(yǎng)時(shí)間較短有關(guān)。
目前,提高細(xì)胞存活率的方法有很多,如利用轉(zhuǎn)錄因子提高細(xì)胞適應(yīng)耐受環(huán)境的壓力、利用TATA結(jié)合蛋白和σ70提高釀酒酵母耐受酒精的能力[17]、利用產(chǎn)物泄露的方式降低產(chǎn)物對(duì)細(xì)胞的毒性、動(dòng)態(tài)控制蛋白質(zhì)的表達(dá)和平衡細(xì)胞中的代謝過(guò)程,但這些方法都需要復(fù)雜的技術(shù)[17]。而亞硝基胍(NTG)誘變方法較為成熟,操作簡(jiǎn)單[18],是提高細(xì)胞存活率的有效途徑。采用人工細(xì)胞計(jì)數(shù)篩選高存活率突變株工作量大、誤差大,因此,需要尋找一種簡(jiǎn)單的篩選方法?;?,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)可利用細(xì)胞呼吸鏈中的脫氫酶還原為紅色的1,3,5-三苯基甲臜(TPF)[19],可用TTC比色法篩選[20]。為此,作者采用TTC比色法篩選高存活率的畢赤酵母NTG突變株,探討了pH值、菌體濃度、反應(yīng)時(shí)間、細(xì)胞存活率等對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響,并與平板計(jì)數(shù)法進(jìn)行了比較。
1.1菌種與培養(yǎng)基
畢赤酵母GS115,購(gòu)于生命科學(xué)公司(Waltham,MA,USA)。
YPD培養(yǎng)基:酵母粉 10g·L-1,蛋白胨 20g·L-1,葡萄糖 20g·L-1,瓊脂粉15g·L-1(平板培養(yǎng)時(shí)添加)。
BMGY培養(yǎng)基: 酵母粉 10g·L-1,蛋白胨 20g·L-1,磷酸鹽緩沖液(pH值7.0)100mmol·L-1,甘油 20g·L-1,硫酸銨 20g·L-1,生物素4×10-4g·L-1。
1.2畢赤酵母的培養(yǎng)
將25% 甘油保存的畢赤酵母轉(zhuǎn)接到Y(jié)PD平板培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)3d;然后轉(zhuǎn)接到含有25mLYPD培養(yǎng)基的250mL三角瓶中,30 ℃、200r·min-1培養(yǎng)18~20h;再以4%接種量轉(zhuǎn)接到含有25mLBMGY培養(yǎng)基的250mL三角瓶中,30 ℃、200r·min-1培養(yǎng)2d后每24h加入1.0%甲醇誘導(dǎo)3d。
1.3畢赤酵母的NTG誘變
參照文獻(xiàn)[21]進(jìn)行NTG誘變:10mL畢赤酵母經(jīng)BMGY培養(yǎng)2d后的菌體濃度(OD600)約為30.00;用100mmol·L-1檸檬酸緩沖液(pH值5.5)洗滌2次后,重懸于10mL100mmol·L-1檸檬酸緩沖液中;加入NTG使終濃度為500μg·mL-1,誘變30min,得到致死率約為88%的畢赤酵母細(xì)胞。
1.4TTC顯色反應(yīng)條件探討
1.4.1pH值對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響
取1.0 mL菌液,10 000 r·min-1離心1 min,去上清,加入1.0 mL含0.4%TTC的pH值分別為4.0、5.0、6.0、7.0、8.0的100 mmol·L-1Tris緩沖液,振蕩混勻,置于搖床上12 h;10 000 r·min-1離心1 min,去上清,加入1.0 mL的85%二甲基亞砜,振蕩混勻;10 000 r·min-1離心1 min,取上清液測(cè)OD485。
1.4.2菌體濃度對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響
分別取0.1 mL、0.2 mL、0.3 mL、0.4 mL、0.5 mL、0.6 mL、0.7 mL、0.8 mL、0.9 mL、1.0 mL菌液(菌體濃度在5.71~57.12之間),10 000 r·min-1離心1 min,去上清,加入1.0 mL含0.4%TTC的pH值為8.0的100 mmol·L-1Tris緩沖液,振蕩混勻,置于搖床上12 h;10 000 r·min-1離心1 min,去上清,加入1.0 mL的85%二甲基亞砜,振蕩混勻;10 000 r·min-1離心1 min,取上清液測(cè)OD485。
1.4.3反應(yīng)時(shí)間對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響
取1.0 mL菌液于2.0 mL離心管中,10 000 r·min-1離心1 min,去上清,加入1.0 mL含0.4%TTC的pH值為8.0的100 mmol·L-1Tris緩沖液,振蕩混勻,置于搖床上12 h,期間每隔1 h對(duì)菌液進(jìn)行10 000 r·min-1離心,去上清,加入1.0 mL的85%二甲基亞砜后振蕩混勻;10 000 r·min-1離心1 min,取上清液測(cè)OD485。
1.4.4細(xì)胞存活率對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響
將畢赤酵母活細(xì)胞和高溫滅活的酵母死細(xì)胞混合,得到不同存活率的菌液,畢赤酵母細(xì)胞的終體積為2.0 mL。按上述方法進(jìn)行TTC顯色反應(yīng),測(cè)OD485。
1.5TTC比色法篩選高存活率畢赤酵母NTG突變株
首先測(cè)定NTG誘變后畢赤酵母菌株的TTC顯色反應(yīng)的吸光度(OD485),再利用OD485值和活細(xì)胞數(shù)目之間的關(guān)系計(jì)算活細(xì)胞數(shù)目,最后計(jì)算畢赤酵母細(xì)胞的存活率。
2.1pH值對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響(圖1)
圖1 pH值對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響Fig.1 Effect of pH value on TTC colorimetric reaction
由圖1可以看出,畢赤酵母生長(zhǎng)的pH值范圍為4.0~8.0,在此范圍內(nèi),TPF的生成量(OD485)隨著pH值的升高而升高;其中,在pH值為4.0~7.0范圍內(nèi)pH值與OD485呈線性正相關(guān)關(guān)系(OD485=0.1007×pH值-0.3019,R2=0.9922)。表明,低pH值條件下畢赤酵母細(xì)胞的呼吸活性較低,升高pH值有利于提高畢赤酵母細(xì)胞的呼吸活性。由圖1還可以看出,在畢赤酵母可以生長(zhǎng)的pH值范圍內(nèi)都可以用TTC顯色反應(yīng)來(lái)測(cè)定細(xì)胞活性。
2.2菌體濃度對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響(圖2)
由圖2可以看出,pH值8.0條件下,OD485隨著畢赤酵母菌體濃度(OD600)的升高(從5.71升高到57.12)而升高,且OD485與OD600呈線性正相關(guān)關(guān)系(OD485=0.0089×OD600+0.0615,R2=0.9264)。表明,菌體濃度(OD600)在5.71~57.12范圍內(nèi)都可以用TTC顯色反應(yīng)測(cè)定畢赤酵母細(xì)胞活性。由于畢赤酵母在搖瓶中培養(yǎng)的菌體濃度(OD600)最高為50.00[22],所以采用TTC比色法可以不稀釋菌體濃度直接測(cè)定畢赤酵母細(xì)胞活性,簡(jiǎn)化了操作步驟。
圖2 菌體濃度對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響Fig.2 Effect of OD600 value on TTC colorimetric reaction
2.3反應(yīng)時(shí)間對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響(圖3)
圖3 反應(yīng)時(shí)間對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響Fig.3 Effect of reaction time on TTC colorimetric reaction
由圖3可以看出,隨著反應(yīng)時(shí)間的延長(zhǎng),OD485不斷升高;當(dāng)反應(yīng)時(shí)間超過(guò)9 h后,OD485保持不變。表明,反應(yīng)時(shí)間超過(guò)9 h可以保持穩(wěn)定的TPF生成量,也可以避免后續(xù)操作中反應(yīng)時(shí)間對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響。
2.4細(xì)胞存活率對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響(圖4)
圖4 細(xì)胞存活率對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響Fig.4 Effect of cell viability on TTC colorimetric reaction
由圖4可以看出,在細(xì)胞存活率小于50%的情況下,隨著細(xì)胞存活率的升高,OD485逐漸升高,且OD485與細(xì)胞存活率呈線性正相關(guān)關(guān)系(OD485=0.0127×細(xì)胞存活率-0.0483,R2=0.9589)。表明采用TTC比色法可以在細(xì)胞存活率低于50%的條件下測(cè)定畢赤酵母細(xì)胞活性,說(shuō)明死細(xì)胞對(duì)TTC比色法的干擾不明顯。
2.5TTC比色法篩選高存活率畢赤酵母NTG突變株
隨機(jī)選取20株NTG誘變的畢赤酵母菌株,用TTC比色法測(cè)定OD485/OD600值(表征細(xì)胞存活率),結(jié)果如圖5所示。
由圖5可知,OD485/OD600值的最低值為37.82,最高值為69.13。
將OD485/OD600值最高的14#突變株培養(yǎng)后分別畢赤酵母的OD485/OD600值采用TTC比色法和平板計(jì)數(shù)法測(cè)定細(xì)胞存活率,并與畢赤酵母GS115進(jìn)行比較,結(jié)果見(jiàn)圖6。
圖5TTC比色法測(cè)定NTG誘變后的
Fig.5OD485/OD600value ofPichiapastorismutated by NTGviaTTC colorimetric method
圖6 TTC比色法(a)與平板計(jì)數(shù)法(b)測(cè)定的畢赤酵母細(xì)胞存活率Fig.6 Cell viability of Pichia pastoris via TTC colorimetric method(a) and plate counting method(b)
由圖6可以看出,采用TTC比色法測(cè)得GS115菌株和14#NTG誘變菌株的OD485/OD600值分別為53.00、58.23;采用平板計(jì)數(shù)法測(cè)得GS115菌株和14#NTG誘變菌株的存活率分別為48.10%、61.68%。表明TTC比色法能準(zhǔn)確描述畢赤酵母細(xì)胞的存活率。
2.6討論
誘變和篩選具有耐受環(huán)境或者特殊形狀的工業(yè)微生物是目前的研究熱點(diǎn)。誘變法分為化學(xué)法、物理法、空間技術(shù)、基因工程等。通過(guò)各種誘變手段改變菌體的遺傳性狀后,從數(shù)量龐大的突變菌種庫(kù)中篩選目標(biāo)菌種是最關(guān)鍵的步驟,決定能否得到目的突變株,也決定了誘變效率。由于微生物種類(lèi)和誘變篩選的目的形狀的多樣性,篩選方法也有所不同,主要有抗性篩選、熒光標(biāo)記篩選、PCR技術(shù)篩選。對(duì)篩選菌株活性的測(cè)定大多采用稀釋涂平板法,該方法非常費(fèi)時(shí)費(fèi)力。本研究以TTC比色法代替稀釋涂平板法,簡(jiǎn)單省時(shí);利用酶標(biāo)儀可以同時(shí)測(cè)定近百個(gè)樣品,提高了測(cè)定效率,但TTC比色法仍需要對(duì)每一個(gè)菌株進(jìn)行測(cè)定,這也是需要進(jìn)一步改進(jìn)的地方。
采用TTC比色法篩選高存活率畢赤酵母NTG突變株,探討了pH值、菌體濃度(OD600)、反應(yīng)時(shí)間、細(xì)胞存活率等對(duì)TTC顯色反應(yīng)的影響,并與平板計(jì)數(shù)法進(jìn)行了比較。結(jié)果表明,在pH值為4.0~7.0、菌體濃度(OD600)低于50.00時(shí),pH值、OD600均與1,3,5-三苯基甲臜(TPF)生成量(OD485)呈線性正相關(guān)關(guān)系;反應(yīng)時(shí)間超過(guò)9 h后可以保持穩(wěn)定的TPF生成量;死細(xì)胞對(duì)TTC顯色反應(yīng)無(wú)干擾,在細(xì)胞存活率低于50%時(shí),仍然可以采用TTC比色法測(cè)定細(xì)胞活性。表明,TTC比色法在一定范圍內(nèi)可以篩選高存活率畢赤酵母突變株,且操作簡(jiǎn)單省時(shí),為篩選高存活率的微生物菌株提供了可靠技術(shù)。
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Screening of High Cell ViabilityPichiapastorisMutant by TTC Colorimetric Method
LIU Sheng-nan,ZHANG Yan,LIU Tai-yu,XU Ke,ZHANG Jian-guo
(InstituteofFoodScienceandEngineering,UniversityofShanghaiforScienceandTechnology,Shanghai200093,China)
HighcellviabilityPichia pastorismutantwasscreenedbyTTCcolorimetricmethod.TheeffectsofpHvalue,celldensity(OD600),reactiontime,cellviabilityonTTCcolorimetricreactionwereinvestigated,andcomparedwiththeplatecountingmethod.ResultsindicatedthatOD485of1,3,5-triphenylformazan(TPF)wasproportionalrelatedtothepHvalue(4.0~7.0)orOD600(below50.00).AndtheproductionofTPFremainedstableafterreactionfor9h.Deadcellsdidnotinterferewithcolorimetricreaction.SoTTCcolorimetricmethodcouldbeusedtodetectcellactivityevenwhenthecellviabilitywasbellow50%.TTCcolorimetricmethodcouldbeappliedinscreeningofhighcellviabilityPichia pastorismutantwithinacertainrange,anditwassimpleandtime-saving.Insummary,TTCcolorimetricmethodprovidedareliableapproachforscreeningofhighcellviabilitystrain.
TTCcolorimetricmethod;Pichia pastoris;viability;optimization;NTG;screening
國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(21306112),上海市自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(13ZR1429100),上海高校青年教師培養(yǎng)資助計(jì)劃項(xiàng)目(slg14037),教育部留學(xué)回國(guó)人員科研啟動(dòng)基金資助項(xiàng)目,上海理工大學(xué)研究生創(chuàng)新基金資助項(xiàng)目,微創(chuàng)勵(lì)志創(chuàng)新基金資助項(xiàng)目(YS30808007)
10.3969/j.issn.1672-5425.2016.10.004
Q 815
A
1672-5425(2016)10-0018-05
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