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      基于PCR—DGGE的間作油茶林土壤細(xì)菌多樣性

      2017-02-15 19:00:23文亞雄??劉君昂??劉小平??周國(guó)
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年8期
      關(guān)鍵詞:土壤微生物多樣性

      文亞雄??+劉君昂??+劉小平??+周國(guó)英??

      摘要:土壤微生物多樣性是評(píng)價(jià)土壤質(zhì)量的重要指標(biāo),為探究林農(nóng)間作對(duì)油茶林土壤微生物多樣性的影響,采用PCR-DGGE方法研究了油茶林間作大豆、間作花生2種間作模式不同時(shí)期對(duì)油茶林土壤細(xì)菌多樣性的影響。結(jié)果表明:間作處理各時(shí)期的土壤微生物種群相似性、微生物多樣性指數(shù)均高于對(duì)照處理;間作處理微生物多樣性指數(shù)保持在3.2~3.4之間;間作處理各時(shí)期土壤微生物均勻度指數(shù)為0.960~0.982;各處理的微生物種群相似性、微生物多樣性指數(shù)與季節(jié)變化相關(guān)。

      關(guān)鍵詞:油茶林;林農(nóng)間作;土壤微生物;多樣性

      中圖分類號(hào): S154.38+1文獻(xiàn)標(biāo)志碼:

      文章編號(hào):1002-1302(2016)08-0057-03

      林農(nóng)間作是指將多年生木本植物通過(guò)空間或時(shí)間布局與農(nóng)作物合理安排在同一土地經(jīng)營(yíng)單位內(nèi),使其中各組分在生態(tài)和經(jīng)濟(jì)上具有相互作用[1]。研究表明,間作能顯著提高土壤微生物的生物量[2],改變土壤微生物群落結(jié)構(gòu),提高土壤微生物的群落結(jié)構(gòu)多樣性[3-4],對(duì)土壤有機(jī)質(zhì)的分解、腐殖質(zhì)的形成、養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化與循環(huán)等過(guò)程[5]也有促進(jìn)作用。間作豆科植物還能通過(guò)生物固氮提高土壤氮素水平、增加產(chǎn)量[6-7]。目前,關(guān)于林農(nóng)間作的研究大多關(guān)于間作系統(tǒng)中的物理因素,如間作對(duì)林下小環(huán)境中光、熱、水[8-9]、土壤養(yǎng)分[10]的影響,而關(guān)于間作體系中土壤微生物多樣性的研究較少,對(duì)油茶林土壤微生物多樣性的研究未見(jiàn)報(bào)道。

      油茶是世界四大木本油料植物之一,是我國(guó)特有的木本油料植物,廣泛分布于我國(guó)南方地區(qū)[11]。近年來(lái),隨著市場(chǎng)需求的發(fā)展及國(guó)家對(duì)油茶產(chǎn)業(yè)的支持,油茶逐漸成為我國(guó)南方地區(qū)的一種重要經(jīng)濟(jì)作物。

      通過(guò)對(duì)間作大豆、花生油茶林根區(qū)(距植物根系0~20 cm)土壤微生物多樣性進(jìn)行對(duì)比研究,探討間作大豆、花生對(duì)油茶根區(qū)土壤微生物多樣性的影響,以期為提高油茶林間套作生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益提供依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1試驗(yàn)設(shè)計(jì)

      試驗(yàn)于江西省宜春市袁州區(qū)西村鎮(zhèn)(27°44′9.83″N,114°11′24.32″E)油茶基地進(jìn)行,該地屬于中亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū),具有四季分明、熱量豐富、降水充沛、日照充足、霜期短、氣候資源豐富等特點(diǎn),有利于農(nóng)作物和林木生長(zhǎng)。試驗(yàn)地的年均日照時(shí)數(shù)約為1 737.1 h,年均氣溫為16.2~17.7 ℃,年均降水量約為1 624.9 mm,日均溫度≥10 ℃的活動(dòng)積溫為 5 050~5 644 ℃。試驗(yàn)地土壤為紅壤,地力均勻,便于排灌。

      試驗(yàn)處理包括間作花生、間作大豆、無(wú)處理對(duì)照。試驗(yàn)用油茶林為4年生油茶幼林,株行距為2 m×3 m,長(zhǎng)勢(shì)良好。

      處理1:于造林后1年開(kāi)始每年間種大豆,本研究中于2014年4月底間種,于同年7月收獲,收獲后將大豆苗覆于樣地。處理2:于造林后1年開(kāi)始每年間種花生,本研究中于2014年5月間種,于同年8月收獲,收獲后將花生苗覆于樣地。CK處理:選取1塊純林樣地作為無(wú)處理對(duì)照。

      1.2林間取樣

      本研究分別采集間作花生油茶林、間作大豆油茶林、對(duì)照純林間作植物收獲時(shí)及收獲后的土壤樣品,間作大豆、間作花生處理第1次采樣時(shí)間分別為7、8月,收獲后第2次采樣時(shí)間分別為8、10月。每個(gè)處理在樣地內(nèi)以對(duì)角線法選取5株油茶,采集油茶根區(qū)(距油茶根系0~20 cm)表層0~20 cm土壤樣品,采集后混合。

      將林間取得的土樣放入冰盒保存,帶回實(shí)驗(yàn)室后迅速過(guò)2 mm土篩,除去雜物。將過(guò)篩土樣于-20 ℃下保存,用于土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的研究。

      1.3.3土壤微生物多樣性的DGGE圖譜分析

      使用Bio-Rad DCode Universal Mutation Detection System電泳系統(tǒng)進(jìn)行DGGE分析。采用濃度為8%的聚丙烯酰胺凝膠,變性劑濃度梯度為45%~65%(100%變性濃度為100 mL聚丙烯酰胺凝膠中加入40 mL去離子甲酰胺與42 g尿素),每孔加樣為25 μL PCR產(chǎn)物、5 μL 6×loading buffer,于60 ℃恒溫條件下[JP3]在1×TAE緩沖液中100 V電泳10 h。電泳完成后銀染照相。

      1.4數(shù)據(jù)分析

      采用Quantity one軟件識(shí)別PCR-DGGE圖譜中的泳道及條帶,得出量化圖及相應(yīng)數(shù)據(jù),進(jìn)行數(shù)學(xué)未成對(duì)加權(quán)聚類分析(UPGMA),計(jì)算物種均勻度、Shannon-Wiener多樣性指數(shù)。Shannon-Wiener指數(shù)(H)、均勻度(E)的計(jì)算公式為:

      [HS+7mm][JZ]H=-∑[DD(]s[]i=1[DD)]PilnPi;E=H/lnS。

      式中:Pi為第i條條帶的優(yōu)勢(shì)度,S為樣本的總條帶數(shù)[12]。

      2結(jié)果與分析

      2.1PCR產(chǎn)物瓊脂糖電泳檢測(cè)

      所有樣品最終PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果(圖1)顯示,該P(yáng)CR方法能較好地?cái)U(kuò)增目標(biāo)片段,目標(biāo)片段長(zhǎng)度約為200 bp,無(wú)非特異性擴(kuò)增及引物二聚體,可用于后續(xù)DGGE分析。

      2.2DGGE圖譜分析

      對(duì)不同間作模式油茶林土壤微生物的16S rDNA V3可變區(qū)進(jìn)行DGGE圖譜分析,結(jié)果(圖2-a)表明,各DGGE泳道內(nèi)條帶被較好地分離,不同間作模式土壤微生物DNA條帶表現(xiàn)出不同的指紋圖譜及灰度,不同樣品的細(xì)菌群落表現(xiàn)出一定差別。由DGGE結(jié)果量化圖(圖2-b)可知,不同樣本的條帶分別與同批次樣本間有較多相同,表明相同樣地內(nèi)具有較多的共有微生物種群。該類微生物應(yīng)是土壤中的常見(jiàn)微生物種群,在土壤中的生長(zhǎng)繁殖較為穩(wěn)定,但該類微生物DNA條帶灰度不盡相同,表明間作處理對(duì)土壤微生物的數(shù)量也有一定影響。間作處理的條帶數(shù)量基本多于對(duì)照處理,表明間作處理增加了土壤中微生物的種群數(shù)量。 [FL)]

      [FL(2K2]2.3DGGE圖譜聚類分析

      以非加權(quán)算術(shù)平均法(UPGMA)對(duì)不同間作模式油茶林土壤細(xì)菌DNA的DGGE指紋圖譜進(jìn)行聚類分析。結(jié)果(圖3)表明,季節(jié)變化對(duì)土壤微生物多樣性的影響較大,不同季節(jié)各處理間的相似性均低于0.60,相似性水平較低。間作花生與間作大豆處理的相似性較高,第1、2次采樣的相似性均為0.48,第3次采樣的相似性為0.39,表明間作花生與間作大豆對(duì)土壤微生物多樣性的影響具有一定相似性。在3個(gè)不[JP3]同采樣時(shí)間之間,間作處理的相似性均聚于0.39,高于對(duì)照處理間的相似性,表明間作處理能提高土壤微生物種群的穩(wěn)定性。

      2.4土壤微生物多樣性指數(shù)分析

      根據(jù)由Quantity one軟件得出的不同條帶光密度峰值,運(yùn)用Shannon-Wiener指數(shù)公式,計(jì)算得出不同間作處理土壤微生物多樣性指數(shù)。由圖4、圖5可知,間作處理的土壤微生物多樣性指數(shù)基本高于對(duì)照處理,其中間作花生處理第1次采[CM(25]樣的多樣性指數(shù)最高,達(dá)3.463;各處理的多樣性指數(shù)與季[CM)]

      節(jié)變化相關(guān),由春季向冬季逐漸降低。間作處理第1次采樣的多樣性指數(shù)與對(duì)照處理相近,均處于3.3~3.5之間;間作處理第2、3次采樣的多樣性指數(shù)略有降低,但仍處于3.1以上,而對(duì)照處理下降較多,降至3.0以下,間作處理在后期對(duì)土壤微生物多樣性的影響較大。間作處理的微生物群落均勻度變化較大,表明間作植物處理對(duì)油茶林土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的影響較大。間作花生處理各時(shí)期的多樣性指數(shù)均高于間作大豆處理,表明間作花生對(duì)土壤微生物多樣性的影響較大。

      3結(jié)論與討論

      土壤微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)的主要組成部分,對(duì)土壤肥力、酶活性[13]、土壤結(jié)構(gòu)等有著重要影響。合理的間作可有效改善土壤微生態(tài)環(huán)境,提高土壤微生物的群落結(jié)構(gòu)多樣性,并對(duì)土壤理化性質(zhì)產(chǎn)生影響。陳永忠等、王瑞等研究表明,間作能提高油茶林土壤養(yǎng)分及微生物數(shù)量[14-15]。張向前等在研究玉米與花生、大豆間作時(shí)發(fā)現(xiàn),間作能顯著提高土壤中的微生物數(shù)量,且微生物數(shù)量與土壤中酶活性呈顯著正相關(guān)關(guān)系[16]。本研究結(jié)果表明,不同間作處理均能提高土壤微生物種群多樣性,對(duì)土壤微生物數(shù)量也有一定影響。

      王玉娟等研究表明,稻草覆蓋能有效調(diào)節(jié)土壤溫度,具有高溫季節(jié)降溫、低溫季節(jié)增溫的效果,并能改善土壤理化性質(zhì)[17-18]。徐華勤等研究發(fā)現(xiàn),稻草覆蓋與間作三葉草處理均可提高土壤微生物的活性與豐富度[19]。在本研究間作豆科植物處理中,豆科植物收獲后將植物殘?bào)w覆蓋于林間土地,不僅起到了夏季降溫、冬季保溫的作用,且隨著植物殘?bào)w的分解,較多的有機(jī)質(zhì)及營(yíng)養(yǎng)元素流入土壤中,為微生物的生長(zhǎng)繁殖提供了有利條件,使間作豆科植物處理的微生物種群相似性及微生物多樣性指數(shù)始終保持在較高水平。另外,間作植物本身伸展的枝葉也覆蓋了地面,可起到降溫作用。

      隨著微生物多樣性水平及種群數(shù)量的提高,油茶林土壤肥力也受到了影響。賈倩民等研究發(fā)現(xiàn),細(xì)菌及放線菌數(shù)量與土壤有機(jī)質(zhì)、全氮、全磷、速效氮、速效磷含量呈顯著或極顯著正相關(guān),真菌數(shù)量與土壤全鉀、速效磷、速效鉀含量呈極顯著正相關(guān)[20]。邵英男等認(rèn)為,N、P含量及土壤pH值與細(xì)菌和放線菌的數(shù)量呈顯著正相關(guān)[21]。本試驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,間作花生并于花生收獲后將花生秸稈覆蓋于林下土地的林農(nóng)復(fù)合經(jīng)營(yíng)模式,對(duì)調(diào)控油茶林土壤微生物多樣性具有較為積極的作用,同時(shí)對(duì)油茶林土壤肥力具有較好的影響,可在一定程度上促進(jìn)油茶幼林的生長(zhǎng)。

      參考文獻(xiàn):[HJ1.75mm]

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      [FQ)]

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