姚紅偉 石磊
摘要:本文從形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記和分子標(biāo)記四個方面對泥蚶的遺傳多樣性研究進展進行了詳述。
關(guān)鍵詞:泥蚶;遺傳多樣性;遺傳標(biāo)記
泥蚶(Tegillarca granosa)俗稱血蚶,我國、韓國以及東南亞等國家地區(qū)都有分布,是一種肉質(zhì)鮮美且營養(yǎng)豐富的經(jīng)濟貝類,屬軟體動物門(Mollusca)、雙殼綱(Bivalvia)、翼形亞綱(Pterimorphia)、蚶目(Arcoida)、蚶科(Arcidae),雌雄異體,貝殼較厚,其貝殼的放射肋粗壯,肋上具明顯的結(jié)節(jié),如圖1所示。近年來隨著國內(nèi)外捕撈需求的提高和泥蚶養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大,為充分了解其遺傳背景,建立標(biāo)記輔助育種,有關(guān)泥蚶遺傳多樣性方面的研究也在不斷地進行著。
圖1泥蚶的殼體特征
1泥蚶遺傳多樣性研究概況
在遺傳學(xué)的建立和發(fā)展過程中,遺傳標(biāo)記(Genetic markers)是研究生物遺傳多樣性的合適指標(biāo)。遺傳標(biāo)記是指與目標(biāo)性狀緊密連鎖,同該性狀共同分離且易于識別的可遺傳的等位基因變異[1]。遺傳標(biāo)記主要經(jīng)歷了形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記和分子標(biāo)記四個階段。因此,泥蚶的遺傳多樣性研究也經(jīng)歷了這四個階段。
1.1形態(tài)學(xué)標(biāo)記
形態(tài)學(xué)標(biāo)記(morphological markers)是與目標(biāo)性狀緊密連鎖,表型上可識別的等位基因突變體[2]。自然界生物存在著許多非常明顯的形態(tài)標(biāo)記。張永普[3]等人對4個地理種群泥蚶的形態(tài)差異進行了研究,結(jié)果表明各形態(tài)性狀差異顯著,貝殼形狀是決定泥蚶不同地理種群的主要性狀,其次為咬合齒。蔣濤濤[4]等人對450個泥蚶成貝定量分析了殼形態(tài)性狀對活體重和軟體部重的影響。結(jié)果表明殼寬是影響活體重的主要因素,而殼高是影響軟體部重的主要因素。姚韓韓[5]等人利用形態(tài)學(xué)標(biāo)記研究了泥蚶奉化種群和韓國種群的殼形態(tài)差異,結(jié)果表明韓國種群的殼型比奉化種群更加鼓脹,軟體部含量更高。
1.2細胞學(xué)標(biāo)記
細胞學(xué)標(biāo)記(Cytological markers)是指對經(jīng)過處理的生物染色體數(shù)目和形態(tài)進行分析,能明確顯示遺傳多樣性的細胞學(xué)特征[6]。吳洪喜[7]等人利用胚胎細胞做成的染色體制片,對樂清灣泥蚶染色體進行了分析。結(jié)果表明樂清灣泥蚶核型為2N=38,32 m+6 sm,NF=76。鄭家聲[8]等人用鰓細胞空氣干燥法制片,對泥蚶、毛蚶、魁蚶的染色體組型進行了分析研究。它們的染色體數(shù)目2N和總臂數(shù)NF都相同,但是染色體組型不同。陸榮茂[9]等人以毛蚶、泥蚶、橄欖蚶擔(dān)輪幼蟲為材料進行染色體制備和核型分析,結(jié)果表明:3種蚶的二倍體染色體數(shù)目都為38,核型公式分別為20 m+12 sm+6 st、22 m+12 sm+4 st、18 m+18 sm+2 st、染色體臂數(shù)NF分別為70、72、74。聚類分析結(jié)果顯示橄欖蚶更接近于毛蚶。
1.3生化標(biāo)記
生化標(biāo)記(Biochemical markers)是指以生物體內(nèi)生化性狀為標(biāo)記,主要包括血型標(biāo)記、血清蛋白標(biāo)記和同工酶標(biāo)記等。目前,應(yīng)用較廣泛的生化標(biāo)記主要是同工酶標(biāo)記。喻子牛[10]等人采用水平淀粉凝膠電泳技術(shù)研究了榮成、青島、溫州三個泥蚶群體的等位基因酶遺傳變異。在12種等位基因酶中共檢測到了27個基因位點,結(jié)果表明榮成與青島群體遺傳同一性大于與溫州群體的,三個群體在多個位點上都存在明顯的雜合子缺失現(xiàn)象。賈守菊[11]等人采用聚丙烯酰胺凝膠電泳方法對過氧化物酶(POD)、酯酶(EST)及淀粉酶(AMY)進行研究,揭示了5個不同種群泥蚶同工酶的表達差異性。此外,王日昕[12]等人也對7個不同地理群體的泥蚶進行過同工酶分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)檢測的11種同工酶中,除ATPase外其他10種存在差異,特別是汕頭和湛江兩地理群體與其他5個地理群體之間的差異尤其顯著。
1.4分子標(biāo)記
分子遺傳標(biāo)記(molecular markers)是根據(jù)基因組DNA存在豐富的多態(tài)性而發(fā)展起來的可直接反映生物個體在DNA水平上的差異的一類新型的遺傳標(biāo)記[13]。目前,(一)在隨機擴增多態(tài)性DNA(即RAPD)分子標(biāo)記方面:李太武[14]等人對5個泥蚶群體的遺傳多樣性進行了研究,結(jié)果表明5個群體遺傳分化不明顯,其余4個群體的多態(tài)位點比例和遺傳平均雜合度比韓國群體有所降低。此外,李成華[15]和徐義平[16]等人也分別利用RAPD技術(shù)分析了不同地理泥蚶群體的遺傳多樣性。(二)在限制性片段長度多態(tài)性(即RFLP)分子標(biāo)記方面:戴偉[17]等人對3個泥蚶地理群體的核糖體DNA ITS區(qū)進行分析,從分子水平探討了三者的遺傳多樣性及親緣關(guān)系。此外,郭永軍[18]等人對毛蚶、魁蚶和泥蚶核糖體DNA轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)進行RFLP分析時未發(fā)現(xiàn)毛蚶和魁蚶間特異性RFLP標(biāo)記,但6種限制性內(nèi)切酶均能將泥蚶與毛蚶及魁蚶區(qū)別開來。(三)在微衛(wèi)星標(biāo)記方面:顧曉英[19]等人應(yīng)用6個微衛(wèi)星標(biāo)記在奉化泥蚶種群上進行擴增,以檢測其遺傳信息。田野[20]等人采用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對人工選育的泥蚶群體進行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明連續(xù)的人工選育過程,群體的遺傳多樣性仍然比較高,但選育過程對群體的遺傳多樣性和遺傳分化有一定程度的影響。此外,程雪艷[21]等人運用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記,對5個不同泥蚶地理群體分析發(fā)現(xiàn)其呈現(xiàn)出較低的遺傳分化。(四)在擴增片段長度多態(tài)性(即AFLP)分子標(biāo)記方面:姚韓韓[22]等人利用AFLP分子標(biāo)記技術(shù)對泥蚶4個快速生長家系的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳差異進行了分析,預(yù)測能夠繁育出生長優(yōu)勢子代的最佳親本組合,減少近交機率。劉博[23]等人采用AFLP標(biāo)記技術(shù)結(jié)合“擬測交”策略,對泥蚶父、母本和109個F1全同胞個體進行了遺傳連鎖的分析研究,構(gòu)建了泥蚶的遺傳連鎖圖譜。此外,董迎輝[24]等人利用AFLP標(biāo)記技術(shù)研究了快速生長品系的遺傳結(jié)構(gòu)并篩查出生長性狀相關(guān)的分子標(biāo)記。(五)在以特定序列為核心的分子標(biāo)記技術(shù)方面:鄭文娟[25]等人采用PCR技術(shù)對我國沿海地區(qū)7個泥蚶群體的線粒體COI基因部分序列進行了測定和遺傳分析。結(jié)果表明我國沿海泥蚶已分化形成福建以南和以北二大類群,二大類群之間的遺傳分化已達到亞種水平。劉春芳[26]等人以7個地理群體泥蚶材料,獲取592 bp線粒體COI基因片段序列進行遺傳多樣性及分化分析,結(jié)果顯示中國沿海泥蚶遺傳多樣性和群體內(nèi)遺傳分化系數(shù)由北向南呈升高趨勢。
2展望
遺傳多樣性與一個物種的進化潛在能力和抵御不利生存環(huán)境的能力緊密相連,如果一個種群或個體沒有遺傳多樣性,那么就失去了突變、選擇,失去了進化的可能,也就無法適應(yīng)周圍環(huán)境的變化,最終會被大自然淘汰。目前隨著人類的捕撈和養(yǎng)殖活動以及海域環(huán)境的急劇變化,泥蚶雖然在自然或人為因素下,基因流不斷進行著,但是長期的人工育苗和自繁自育,加劇了近交繁殖,使得泥蚶肥滿程度、生長速度的快慢以及繁殖力的大小等重要指標(biāo)出現(xiàn)下降。另外,盲目的引種和選種,不僅解決不了苗種問題,還有可能進步一降低野生群體的遺傳多樣性,卻得不到能穩(wěn)定遺傳的經(jīng)濟性狀優(yōu)良的后代,可以看出上述問題使得養(yǎng)殖群體以及個別野生群體不可避免地出現(xiàn)一定程度遺傳多樣性的衰退,泥蚶種質(zhì)資源受到威脅。為防止這種情況的進步一蔓延以及更好地實現(xiàn)對新發(fā)現(xiàn)種群的開發(fā)利用,就離不開對泥蚶遺傳多樣性的研究發(fā)展,因此泥蚶遺傳多樣性的研究步伐不會停滯。作為研究遺傳多樣性指標(biāo)的遺傳標(biāo)記已經(jīng)經(jīng)歷了從簡單到復(fù)雜、從宏觀到微觀、從定性到定量的發(fā)展過程,即便現(xiàn)在的分子標(biāo)記也沒有一種能完全滿足各類實驗要求的理想標(biāo)記。隨著物種多樣性的發(fā)展和發(fā)掘、科技的進步以及人類探索自然步伐的加快,生物遺傳多樣性的研究需求和必要性必將進一步加大,這就會極大地促使人類去探究更快、更精確、更便利的遺傳標(biāo)記用于遺傳多樣性的研究以造福人類。未來,這些新型遺傳標(biāo)記不僅是了解不同泥蚶種群遺傳背景的有力技術(shù)支持,而且會帶來更大的經(jīng)濟、科研等方面的價值,促使泥蚶增養(yǎng)殖和捕撈可持續(xù)健康發(fā)展。
參考文獻:
[1]
王永飛,馬三梅,劉翠平,等.遺傳標(biāo)記的發(fā)展和分子標(biāo)記的檢測技術(shù)[J].西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2001,29(6):130-136
[2] 李莉,周一兵,董瑾,等.遺傳標(biāo)記及其在沙蠶遺傳多樣性研究中的應(yīng)用[J].水產(chǎn)科學(xué),2008,27(6):312-314
[3] 張永普,林志華,應(yīng)雪萍.不同地理種群泥蚶的形態(tài)差異與判別分析[J].水產(chǎn)學(xué)報,2004,28(3):339-342
[4] 蔣濤濤,施育彥,姚韓韓,等.泥蚶殼形態(tài)性狀對活體重和軟體部重的影響[J].江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,41(5):200-202
[5] 姚韓韓,林志華,周小龍,等.泥蚶奉化種群與韓國種群形態(tài)特征和遺傳結(jié)構(gòu)的差異分析[J].江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,42(3):183-186
[6] 彭林澤,曾獻存,余智勇,等.動物遺傳標(biāo)記的研究進展及應(yīng)用[J].畜牧獸醫(yī)雜志,2007,26(2):32-34
[7] 吳洪喜,柴雪良,吳建波,等.樂清灣泥蚶Tegillarca granosa(Linnaeus)核型的初步研究[J].浙江海洋學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版),2001,20(3):189-191
[8] 鄭家聲,王梅林,郭丹紅,等. 3種蚶染色體組型的比較研究[J].海洋學(xué)報,1996,18(3):78-85.
[9] 陸榮茂,林志華,張永普,等.毛蚶、泥蚶、橄欖蚶的核型比較分析[J].上海水產(chǎn)大學(xué)學(xué)報,2008,17(5):625-629
[10] 喻子牛,孔曉瑜,楊銳,等.泥蚶等位基因酶遺傳變異研究[J].中國水產(chǎn)科學(xué),1997,4(5):15-21
[11] 賈守菊,張永普,陳艷樂,等.不同種群泥蚶的三種同工酶變異[J].河南科學(xué),2004,22(2):199-202
[12] 王日昕,李太武,呂振明,等.泥蚶[Tegillarca granosa)不同地理居群同工酶變異及遺傳分化的研究[J].海洋與湖沼,2005,36(3):227-234
[13] 單雪,王秀利,仇雪梅.分子標(biāo)記及其在海洋動物遺傳研究中的應(yīng)用[J].生物技術(shù)通訊,2005,16(4): 463-466
[14] 李太武,李成華,宋林生,等. 5個泥蚶群體遺傳多樣性的RAPD分析[J].生物多樣性,2003,11(2):118-124
[15] 李成華,李太武,宋林生,等.福建南北泥蚶種內(nèi)分化的RAPD分析[J].動物學(xué)研究,2003,24(5):362-366
[16] 徐義平,孫開練,楊桂梅,等.溫州樂清灣三個泥蚶群體遺傳多樣性的初步研究[J].上海水產(chǎn)大學(xué)學(xué)報,2006,15(2):234-238
[17] 戴偉,郭永軍,王曉梅,等. 3個地理居群泥蚶核糖體DNA ITS區(qū)的RFLP分析[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,38(10):4990-4991
[18] 郭永軍,戴偉,王曉梅,等.毛蚶、魁蚶和泥蚶核糖體DNA轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)的RFLP分析[J].華北農(nóng)學(xué)報,2010,25(4):88-91
[19] 顧曉英,曾慶國,尤仲杰,等.泥蚶(Tegillarca granosa)6個微衛(wèi)星引物的分離和鑒定[J].海洋與湖沼,2008,39(6):661-664
[20] 田野,邵艷卿,肖國強,等.泥蚶人工選育群體的微衛(wèi)星分析[J].海洋科學(xué),2015,39(4):1-7
[21] 程雪艷,滕爽爽,肖國強,等.基于微衛(wèi)星的泥蚶5個地理群體遺傳多樣性分析[J].海洋科學(xué),2015,39(11):116-125
[22] 姚韓韓,董迎輝,林志華,等.泥蚶4個快速生長家系的遺傳變異分析[J].水產(chǎn)學(xué)報,2011,35(3):340-347
[23] 劉博,滕爽爽,柴雪良,等.泥蚶(Tegillarca granosa)遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J].海洋與湖沼,2012,43(5):983-991
[24] 董迎輝,姚韓韓,林志華,等.泥蚶生長性狀相關(guān)AFLP分子標(biāo)記的篩選[J].水產(chǎn)學(xué)報,2012,36(6):825-831
[25] 鄭文娟,朱世華,沈錫權(quán),等.基于線粒體COI基因序列探討泥蚶的遺傳分化[J].動物學(xué)研究,2009,30(1):17-23
[26] 劉春芳,李翠,張振,等.中國沿海不同地區(qū)泥蚶(Tegillarca granosa)的遺傳多樣性分析[J].海洋與湖沼,2015,46(2):365-371
(收稿日期:2016-10-28)