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      鴨坦布蘇病毒的分離和PCR鑒定

      2017-04-15 10:26:51曹宗喜賀冬梅葉保國(guó)張艷楊少雄
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年5期
      關(guān)鍵詞:分離

      曹宗喜+賀冬梅++葉保國(guó)+張艷++楊少雄++陳朝喜+林哲敏

      摘要:鴨坦布蘇病是危害養(yǎng)鴨業(yè)最嚴(yán)重的傳染病之一。從某鴨場(chǎng)的疑似鴨坦布蘇病病死鴨中分離到1株病毒,并對(duì)該毒株進(jìn)行PCR鑒定和序列分析。結(jié)果顯示,分離株的序列與GenBank上登錄的DTMUV序列的同源性在99%以上,表明分離的病毒為鴨坦布蘇病毒。

      關(guān)鍵詞:鴨坦布蘇病毒;分離;PCR鑒定

      中圖分類號(hào): S858.325.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A

      文章編號(hào):1002-1302(2017)05-0152-01

      鴨坦布蘇病毒?。╠uck tembusu virus disease)是由鴨坦布蘇病毒(duck tembusu virus,DTMUV)感染所致的蛋鴨、種鴨以產(chǎn)蛋率和采食量突然下降為主要特征的傳染病[1-2]。該病自2010年在福建省、浙江省、江蘇省、安徽省、山東省、河北省等地區(qū)的鴨群中相繼暴發(fā),約導(dǎo)致1.2億羽蛋鴨和1 500萬(wàn)羽肉鴨發(fā)病,經(jīng)濟(jì)損失達(dá)數(shù)十億元,對(duì)我國(guó)鴨養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大損失[3-5]。雞、鴨以及養(yǎng)殖場(chǎng)周圍的麻雀、蚊子均有被感染的報(bào)道[6-8],這為該病的防控提出了新挑戰(zhàn)。本研究以鴨坦布蘇病疑似樣品為研究對(duì)象進(jìn)行病原分離鑒定,為鴨坦布蘇病毒的進(jìn)化關(guān)系及其致病性的進(jìn)一步研究提供了參考。

      1材料

      RNAiso Plus、Ex Taq DNA聚合酶、dNTP Mixture(2.5 mmol/L)、DL 2 000 DNA marker均購(gòu)自TaKaRa公司。

      2方法

      2.1病料采集與處理

      從國(guó)內(nèi)主要鴨養(yǎng)殖區(qū)收集鴨坦布蘇病疑似樣品。無(wú)菌采集病鴨的肝臟、脾臟等病變組織,取病料約1.0 g并置于滅菌研磨器中,加入5倍體積含抗生素的PBS緩沖液研磨制成混懸液,反復(fù)凍融3次,以8 000 r/min離心10 min,取上清液經(jīng)0.22 μm濾膜除菌,置于-20 ℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

      2.2病毒分離

      [JP2]將處理好的病料接種于9~11 d的鴨胚,每個(gè)胚接種 0.2 mL,每天觀察鴨胚。如果無(wú)死亡鴨胚則7 d收獲,盲傳5代仍無(wú)病變且用PCR方法檢測(cè)為陰性者,作為病毒分離陰性。[JP]

      2.3引物設(shè)計(jì)與合成

      參照胡旭東等的引物[9]進(jìn)行設(shè)計(jì),F(xiàn):5′-GCCACGGAATTAGCGGTTGT-3′;R:5′-TAATCCTCCATCTCAGCGGTGTAG-3′。引物由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成,采用滅菌超純水稀釋至10 μmol/L,于-20 ℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

      2.4PCR鑒定

      RNA抽提和反轉(zhuǎn)錄按照試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作。擴(kuò)增體系及程序分別以反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系(20 μL)為:10×Ex Taq buffer 2 μL、上游及下游引物各1 μL、dNTP Mixture 2 μL、Ex Taq酶0.1 μL、cDNA 2 μL,加水補(bǔ)足至20 μL。擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸7 min。取PCR產(chǎn)物5 μL,采用1%瓊脂糖凝膠電泳觀察并分析PCR產(chǎn)物。按凝膠回收試劑盒說(shuō)明書純化回收PCR產(chǎn)物,由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司進(jìn)行測(cè)序,采用Lasergene 7.10軟件對(duì)所測(cè)序列進(jìn)行Blast比對(duì)分析。

      3結(jié)果與分析

      3.1病毒分離

      病毒分離時(shí),試驗(yàn)組鴨胚于3~7 d內(nèi)部分死亡,可見(jiàn)胚體出血水腫、發(fā)育不良。

      3.2PCR擴(kuò)增

      取PCR產(chǎn)物,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,分離株出現(xiàn)400 bp的條帶,與預(yù)期目的條帶相符。

      3.3基因序列測(cè)定與分析

      采用Lasergene 7.10軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行同源性分析,所[CM(25]擴(kuò)增序列與GenBank上登錄的DTMUV序列的同源性在

      99%以上,表明分離的病毒為鴨坦布蘇病毒。

      4討論

      鴨坦布蘇病是危害養(yǎng)鴨業(yè)最嚴(yán)重的傳染病之一[3,5]。對(duì)某鴨場(chǎng)發(fā)病鴨根據(jù)流行病學(xué)、臨床特征、剖檢特點(diǎn)初步診斷為鴨坦布蘇病,經(jīng)過(guò)病毒分離,獲得病毒分離株。通過(guò)PCR擴(kuò)增出與預(yù)期大小相符的400 bp目的片段,對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行測(cè)序及Blast分析,確定分離病原為鴨坦布蘇病毒。本試驗(yàn)為鴨坦布蘇病毒進(jìn)化關(guān)系及其致病性的進(jìn)一步研究奠定了基礎(chǔ)。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Su J,Li S,Hu X,et al. Duck egg-drop syndrome caused by BYD virus,a new Tembusu-related flavivirus[J]. PLoS One,2011,6(3):e18106.

      [2]Yan P X,Zhao Y S,Zhang X,et al. An infectious disease of ducks caused by a newly emerged Tembusu virus strain in mainland China[J]. Virology,2011,417(1):1-8.

      [3]Cao Z Z,Zhang C,Liu Y E,et al. Tembusu virus in ducks,China[J]. Emerging Infectious Diseases,2011,17(10):1873-1875.

      [4]Li L L,An H J,Sun M H,et al. Identification and genomic analysis of two duck-origin Tembusu virus strains in Southern China[J]. Virus Genes,2012,45(1):105-112.

      [5]Zhu W J,Chen J D,Wei C Y,et al. Complete genome sequence of duck tembusu virus,isolated from muscovy ducks in Southern China[J]. Journal of Virology,2012,86(23):13119.

      [6]Liu M,Chen S,Chen Y,et al. Adapted tembusu-like virus in chickens and geese in China[J]. Journal of Clinical Microbiology,2012,50(8):2807-2809.

      [7]Tang Y,Diao Y,Chen H,et al. Isolation and genetic characterization of a tembusu virus strain isolated from mosquitoes in Shandong,China[JP2][J]. Transboundary and Emerging Diseases,2015,62(2):209-216.[JP]

      [8]Tang Y,Diao Y,Yu C,et al. Characterization of a tembusu virus isolated from naturally infected house sparrows (passer domesticus) in Northern China[J]. Transboundary and Emerging Diseases,2013,60(2):152-158.

      [9]胡旭東,路浩,劉培培,等. 我國(guó)發(fā)現(xiàn)的一種引起鴨產(chǎn)蛋下降綜合征的新型黃病毒[J]. 中國(guó)獸醫(yī)雜志,2011,47(7):43-47.

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