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      Penta E基因座母系突變1例分析

      2017-05-03 01:55:10陳延冰何軼群齊一鳴彭海山
      關(guān)鍵詞:親權(quán)母系孟德爾

      陳延冰 何軼群 齊一鳴 彭海山

      廣東省婦幼保健院(廣州,511442)

      短串聯(lián)重復(fù)序列 (STR)是人類遺傳學(xué)中重要的遺傳標(biāo)記,也是目前法醫(yī)物證鑒定中應(yīng)用最多的一類遺傳標(biāo)記。常染色體STR基因座的平均突變率為0.002[1],所以在用常染色體STR進(jìn)行親權(quán)鑒定時(shí)尤其在排除時(shí)需謹(jǐn)慎。目前關(guān)于常染色體STR突變?cè)趪?guó)內(nèi)外報(bào)道較多為父系突變,母系突變較少見。本實(shí)驗(yàn)室鑒定617例親子鑒定案例時(shí),檢出1例Penta E基因座不符合母系遺傳關(guān)系。本文對(duì)此例進(jìn)行總結(jié)分析。

      1 材料與方法

      1.1 樣本來源

      親子鑒定617例樣本均來自于廣東省婦幼保健院法醫(yī)物證司法鑒定所日常檢測(cè)案例,檢材包括血液樣品、血紗、毛發(fā)、口腔拭子、胎兒羊水、絨毛等。本文突變案例梁某及其妻子夏某因家庭因素?cái)y其女兒來到本所要求進(jìn)行親子鑒定,取樣過程同上述常規(guī)進(jìn)行。

      1.2 實(shí)驗(yàn)室方法及分析

      DNA的提取按照PowerplexTM21system試劑盒(美國(guó)promega公司)方法[2]進(jìn)行、PCR復(fù)合擴(kuò)增,反應(yīng)體系為10μl,在3500XL遺傳分析儀上對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分離和檢測(cè),并收集結(jié)果。利用 GeneMapper ID-X v1.3分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

      1.3 基因座親權(quán)指數(shù)(PI)值計(jì)算方法[4]

      方法1,當(dāng)在母親確定,父親懷疑的前提下:

      方法2,當(dāng)在父親確定,母親懷疑的前提下:

      方法3,當(dāng)雙親皆疑的前提下:

      其中男性突變率(μf)可取0.002,女性突變率(μm)可取0.001~0.0005。本次女性突變率取0.0005[1],p11=0.124,p17=0.096,等位基因頻率數(shù)據(jù)來自本實(shí)驗(yàn)室。

      2 結(jié)果

      2.1 基因分型

      本案被檢測(cè)3人樣本的STR基因座分型結(jié)果見表1、圖1。

      2.2 Penta E基因座累計(jì)親權(quán)指數(shù)(CPI)值

      經(jīng)PowerplexTM21system試劑盒檢驗(yàn),除Penta E基因座外,其余的19個(gè)常染色體STR基因座均符合孟德爾遺傳定律。經(jīng)計(jì)算,CPI19=6.84959×1010(計(jì)算所需的突變率及等位基因頻率來自本實(shí)驗(yàn)室),可認(rèn)定梁某3人的親子關(guān)系,故可考慮子代Penta E基因座發(fā)生突變的可能[3]。

      圖1 Penta基因座分析結(jié)果圖

      表1 被鑒定父母及子女基因分型結(jié)果

      3 討論

      目前,STR基因座發(fā)生突變的機(jī)制普遍認(rèn)為是在DNA復(fù)制過程中,由于DNA聚合酶發(fā)生滑脫,從而核心序列的重復(fù)次數(shù)發(fā)生改變(多見于減少或增加一個(gè)重復(fù)核心序列)而導(dǎo)致突變的出現(xiàn)。運(yùn)用于法醫(yī)物證學(xué)檢驗(yàn)的STR基因座均有較好多態(tài)性及較高突變率特性,且突變率明顯高于人類基因的平均突變率(1.4×10-10)[5]。故在實(shí)際應(yīng)用中若不注意STR基因座的突變現(xiàn)象,可能會(huì)出現(xiàn)錯(cuò)判誤判情況,影響鑒定的結(jié)論。

      在實(shí)際檢案中發(fā)生突變的多數(shù)為父系突變,而母系突變?nèi)暂^少見。從本案的Penta E基因座分型來看父親為11,母親為14/16,孩子為11/17,孩子的11等位基因來自父親,而因母親與孩子的基因分型均為雜合子,即可排除等位基因丟失的現(xiàn)象存在,故17等位基因是由母親16突變而成的,即等位基因17可以合理解釋為母親的等位基因16傳遞給子代時(shí)減少了一個(gè)重復(fù)單位突變所致。

      對(duì)于親子鑒定的結(jié)論判斷一般均采用多基因座聯(lián)合分析,當(dāng)有≥4個(gè)STR基因座不符合遺傳規(guī)律時(shí),可排除親子關(guān)系[6];如果僅有1個(gè)、2個(gè)或3個(gè)基因座不符合孟德爾遺傳定律時(shí),不能輕易做出排除結(jié)論,應(yīng)考慮可能存在突變現(xiàn)象。同時(shí)應(yīng)增加常染色體STR基因座的檢測(cè)數(shù)量,即三聯(lián)體案件出現(xiàn)1個(gè)、2個(gè)或3個(gè)基因座不符合孟德爾遺傳定律時(shí),應(yīng)對(duì)應(yīng)增加至19個(gè)、28個(gè)或35個(gè)基因座的檢測(cè);單親案件出現(xiàn)1個(gè)或2個(gè)基因座不符合孟德爾遺傳定律時(shí),應(yīng)對(duì)應(yīng)增加至29個(gè)或41個(gè)基因座的檢測(cè)[7],且對(duì)檢測(cè)基因座的PI值進(jìn)行計(jì)算分析,CPI達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)(CPI≥10000)即可認(rèn)定其親子關(guān)系。

      對(duì)于突變基因座PI的計(jì)算,不同的前提條件計(jì)算方法不同。本案方法1的CPI20較方法2及方法3的高,表明案情與案件結(jié)論有很大關(guān)聯(lián)。不同的案情可能有不同的結(jié)論,故從本案得到的提示是:當(dāng)出現(xiàn)1至3個(gè)基因座不符合孟德爾遺傳定律時(shí),特別是存在母系突變現(xiàn)象時(shí),在了解清楚案情的基礎(chǔ)上,選擇對(duì)應(yīng)的計(jì)算方法,結(jié)合檢測(cè)分析的結(jié)果,給出正確的結(jié)論,避免錯(cuò)判誤判的發(fā)生,提高檢案的準(zhǔn)確率。

      [1] 李成濤,李莉,侯一平,等.司法鑒定技術(shù)規(guī)范[M].中華人民共和國(guó)司法部司法鑒定管理局,2016.

      [2] Walsh PS,Metzger DA,Higuchi R.Chelex 100as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic materialJ[J].Biotechniques,1991,10(4):506-513.

      [3] 孫宏鈺,伍新堯,曾艷紅,等.PowerplexTM16system體系在親子鑒定中的應(yīng)用評(píng)估[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志,2002,17(4);207.

      [4] CharlesH.Brenner.ForensicMathematics[EB/OL].[2012-11-22].http://dna-view.com/3band.htm.

      [5] Levinson G,Gutman GA,Slippedstrandmispriming:amajior mechanism for DNA sequence evolution[J].MolBiol,1987,4:203.

      [6] 孟海英,侯一平,陳國(guó)弟,等.短串聯(lián)重復(fù)序列在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2000,16(1):55-58.

      [7] 伍新堯,童大躍,朱運(yùn)良,等.用STR分型技術(shù)作親權(quán)鑒定時(shí)判斷標(biāo)準(zhǔn)的研究[J].中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版),2010,31(1):1-6.

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