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      結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義

      2017-06-19 19:27:15陳伊韋常宏寧淑芳韋文娥劉海洲利基林張力圖
      山東醫(yī)藥 2017年16期
      關鍵詞:突變率密碼子基因突變

      陳伊,韋常宏,寧淑芳,韋文娥,劉海洲,利基林,張力圖

      (廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院,南寧 530021)

      結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義

      陳伊,韋常宏,寧淑芳,韋文娥,劉海洲,利基林,張力圖

      (廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院,南寧 530021)

      目的 探討結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變情況及其臨床意義。方法 選擇行手術治療的結直腸癌患者262例,采用ARMS-PCR法檢測其結直腸癌組織KRAS基因外顯子2第12、13位密碼子及BRAF V600E基因突變情況,分析其與患者臨床病理參數(shù)、肝轉移及預后的關系。結果 262例結腸癌患者中女性患者98例。262例份結腸癌組織中,KRAS基因突變49例(18.7%),其中第12位密碼子突變37例(包括1例KRAS復合突變),第13位密碼子突變12例;184例份結腸癌組織中,BRAF V600E基因突變6例。結直腸癌組織KRAS基因突變與患者性別(女性)、原發(fā)腫瘤直徑、遠處轉移情況均有關,BRAF基因突變與民族、家族史、原發(fā)腫瘤分化程度均有關(P均<0.05)。同時性肝轉移患者KRAS基因突變率高于異時性肝轉移患者,KRAS基因G13D突變率低于異時性肝轉移患者(P均<0.05)。KRAS基因突變的結直腸癌患者生存時間短于未突變者(P<0.05)。KRAS基因突變是結直腸癌患者預后的獨立危險因素(P<0.01)。BRAF基因突變與未突變者生存時間比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。結論 結直腸癌組織KRAS基因突變率高,BRAF基因突變率低;KRAS基因突變多發(fā)生于女性,與結直腸癌的發(fā)生、發(fā)展有關。

      結直腸癌;KRAS基因;BRAF基因;基因突變;預后

      KRAS基因是EGFR信號通路上的一個重要作用靶點,抗EGFR單克隆抗體(西妥昔單抗、帕尼單抗)治療結直腸癌的療效與KRAS基因突變狀態(tài)密切相關,只有KRAS野生型患者才可從抗 EGFR單克隆抗體單藥治療或聯(lián)合化療中獲益[1]。BRAF V600E基因是KRAS基因下游的作用位點,其突變狀態(tài)可能會影響抗EGFR單克隆抗體的治療效果。2009年1月~2012年12月,本研究觀察了結直腸癌組織KRAS與BRAF基因的突變情況,現(xiàn)分析結果并探討其臨床意義。

      1 資料與方法

      1.1 臨床資料 選擇同期于廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院行手術治療的結直腸癌患者262例,男164例、女98例,年齡24~87歲、中位年齡55歲;民族:漢族182例、壯族70例、其他10例;家族史:結直腸腺癌家族史4例、大腸腺瘤家族史2例、潰瘍性結腸炎家族史2例、家族性腺瘤性息肉病1例;組織學類型:腺癌229例、黏液腺癌+印戒細胞癌33例;腫瘤部位:左半結腸81例、右半結腸70例、直腸111例;原發(fā)腫瘤分化程度:低分化93例、中分化161例、高分化8例;原發(fā)腫瘤直徑:≤5 cm 146例、>5 cm 116例;T分期:T1、T2期20例、T3、T4期242例;N分期:N0期95例、N1期98例、N2期69例;遠處轉移情況:無轉移70例、肝轉移135例、其他部位轉移57例;肝轉移情況:同時性肝轉移105例、異時性肝轉移30例;臨床分期:Ⅰ、Ⅱ期35例、Ⅲ、Ⅳ期227例。均經(jīng)病理組織學檢查確診為結直腸癌,術前均未接受抗EGFR靶向治療。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會審核,患者及其家屬均簽署知情同意書。

      1.2 癌組織KRAS、BRAF基因突變檢測 采用ARMS-PCR法。收集262例患者術中切除的新鮮腫瘤組織,立即放入液氮中冷凍, -80 ℃冰箱保存。將組織進行甲醛固定、石蠟包埋,4 μm厚切片,脫蠟、水化,共10張切片。取1張切片進行HE染色,顯微鏡下選擇腫瘤細胞富集區(qū)域,確保其腫瘤細胞比例≥80%。取其余9張切片,參照DNeasy Blood &Tissue Kit和QIAamp DNA FFPE Tissue Kit試劑盒(德國Qiagen公司)說明書提取樣本DNA,采用ARMS-PCR法檢測KRAS基因外顯子2第12、13位密碼子突變情況。其中184例份結直腸癌組織僅行BRAF V600E突變檢測。參照人類KRAS基因7種突變檢測試劑盒和人類BRAF基因V600E突變檢測試劑盒說明書,KRAS基因外顯子2上游引物:5′-AGGCCTGCTGAAAATGACTG-3′,下游引物:5′-GGTGCAGGACCATTCTTTGA-3′,目的片段:173 bp;BRAF基因第15號外顯子上游引物:5′-GCTFGCTCTGATAGGAAAATGAG-3′,下游引物:5′-GTAACTCAGCAGCATCTCAGG-3′,目的片段:237 bp。反應循環(huán)參數(shù):95 ℃、5 min;95 ℃、25 s,64 ℃、20 s,72 ℃、20 s,循環(huán)15次;93 ℃、25 s,60 ℃、35 s,72 ℃、20 s,循環(huán)31次。每次試驗均按要求設定陰性、陽性對照孔及空白對照孔。使用Roche480Ⅱ實時熒光定量PCR儀進行檢測,PCR產(chǎn)物經(jīng)3%瓊脂糖凝膠電泳確定后,根據(jù)突變檢測試劑盒說明書提供的判讀原則,將樣品ΔCt值(突變Ct值-外控Ct值)與信號閾值比較,樣品檢測結果分為陽性和陰性。

      1.3 相關性分析 分析KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關系;隨訪至2015年12月,以死亡為終點事件,繪制生存曲線,分析KRAS、BRAF基因突變與患者生存時間及預后的關系。

      1.4 統(tǒng)計學方法 采用SPSS19.0統(tǒng)計軟件。KRAS、BRAF基因突變率與臨床病理參數(shù)的關系采用χ2檢驗或Fisher確切概率法。采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線,Log-Rank檢驗法分析KRAS、BRAF基因突變對患者生存時間的影響,COX比例風險回歸模型進行預后影響因素分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

      2 結果

      2.1 KRAS、BRAF基因突變情況 262例份結腸癌組織中,KRAS基因突變49例(18.7%);第12位密碼子突變37例(14.1%),包括1例KRAS復合突變(G12V和G12R同時突變),第13位密碼子突變12例(4.6%),未檢出第12、13位密碼子同時突變;其余均未發(fā)生突變。184例份結腸癌組織中,BRAF V600E基因突變6例(3.3%)。見表1。同時性與異時性肝轉移患者KRAS基因突變率分別為27.6%(29/105)、6.7%(2/30),二者比較P<0.05; KRAS基因G13D突變率分別為4.8%(5/105)、30%(9/30),二者比較P<0.05;同時性與異時性肝轉移患者KRAS基因其他類型突變率比較P均>0.05。

      2.2 結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關系 見表2。

      2.3 結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者預后的關系 患者術后隨訪2.37~77.31個月,失訪8例,隨訪率為96.9%。 共30例患者死亡, 中位

      表1 結直腸癌組織中KRAS、BRAF基因突變情況

      注:檢出1例KRAS復合突變,為G12V和G12R同時突變。

      表2 結直腸癌組織KRAS、BRAF基因突變與患者臨床病理參數(shù)的關系

      生存時間為22.43個月。生存曲線分析結果顯示,KRAS基因突變的結直腸癌患者生存時間為(27.43±3.2)個月,未突變者為(46.22±4.25)個月,二者比較P<0.05;BRAF基因突變的結直腸癌患者生存時間為(31.23±3.61)個月,未突變者為(35.93±2.19)個月,二者比較P>0.05。COX比例風險回歸模型多因素分析結果顯示,KRAS基因突變是結直腸癌患者預后不良的獨立危險因素(β=2.044,RR=7.725,95%CI:2.722~21.927,P<0.01)。

      3 討論

      結直腸癌的發(fā)生、轉移是一個受多基因、多因素影響的過程,EGFR與肝轉移密切相關[2]。KRAS、BRAF基因是該信號通路下游的重要位點,其中BRAF基因又是KRAS基因下游的重要位點,與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關。KRAS基因野生型患者能從抗EGFR靶向治療中獲益,但仍有部分患者對抗EGFR藥物治療無反應;BRAF基因與抗EGFR治療效果的關系目前無統(tǒng)一定論,尚不能單獨作為預測因子。本研究結直腸癌組織KRAS基因突變率為18.7%,BRAF基因突變率為3.3%,與目前國內(nèi)外研究報道接近[3~5]。一項來自多地區(qū)、納入6 346例患者的研究表明, G12R突變?yōu)槲覈币娡蛔冾愋蚚6]。本研究檢出1例G12R突變,該患者同時伴有G12V突變;并未檢出KRAS基因第12、13位密碼子同時突變,表明各密碼子突變是相互獨立的。V600E為BRAF基因的常見突變位點,本研究顯示該位點突變率較低,僅為3.3%。

      高靜等[4]研究認為,KRAS突變更易發(fā)生在女性且分化程度較好的右半結腸癌患者中,并與年齡有關。也有研究認為,KRAS基因突變與結直腸癌患者的年齡、性別、分化程度、腫瘤位置等臨床病理參數(shù)均無關[7,8]。本研究結果顯示,結直腸癌組織KRAS基因突變與患者的性別、原發(fā)腫瘤直徑、遠處轉移情況均有關。Chen等[9]大樣本Meta分析結果顯示,女性、老年患者以及右半結腸癌患者BRAF基因突變率較高;但也有研究顯示BRAF突變與臨床病理參數(shù)之間無顯著性關系[10]。本研究中結直腸癌組織BRAF基因突變與患者的民族、家族史、原發(fā)腫瘤分化程度均有關。

      KRAS、BRAF基因突變對結直腸癌患者肝轉移及預后的影響報道不一[10,11]。Bazan等[12]認為,KRAS基因第13位密碼子突變與高度侵襲性結直腸癌相關,預示其可能是腫瘤擴散和導致患者死亡的獨立危險因素。Yaeger等[13]研究表明,BRAF基因突變與轉移性結腸癌預后差有關,伴有該基因突變的患者更容易發(fā)生肝、腹膜轉移,且轉移瘤術后生存期更短。Modest等[14]研究結果表明,KRAS基因第13位密碼子突變與結直腸癌發(fā)生同時性肝轉移及局部轉移相關。梁立等[15]指出,結直腸癌同時性肝轉移與RAS-RAF-ERK、P13K-PTEN-AKT通路同時激活有關,異時性肝轉移與P13K-PTEN-AKT單獨激活、RAS-RAF-ERK不激活有關。本研究結果顯示,同時性肝轉移患者KRAS基因突變率高于異時性肝轉移患者,KRAS基因G13D突變率低于異時性肝轉移患者。G13D突變有一定的療效評估作用,G13D突變的結直腸癌患者能從一線西妥昔單抗治療中獲益,而且其獲益程度與KRAS野生型相仿,提示KRAS基因G13D突變的特殊性。由于已經(jīng)得出BRAF基因突變與患者遠處轉移情況無關的結果,故本研究未對同時性與異時性肝轉移患者的BRAF基因突變率進行對比分析。文獻報道,KRAS第13位密碼子突變的患者較未突變者生存期更短[5, 16]。但本研究結果顯示,KRAS基因突變的結直腸癌患者生存時間明顯短于未突變者,KRAS基因突變是結直腸癌患者預后的獨立危險因素,提示KRAS基因突變患者預后較差;但本研究并未發(fā)現(xiàn)KRAS基因G13D突變、BRAF基因突變與預后的關系,可能與樣本量小、隨訪時間短有關。

      綜上所述,結直腸癌組織KRAS基因突變率高,BRAF突變率低;KRAS基因突變多發(fā)生于女性,與結直腸癌的發(fā)生、發(fā)展有關。未來將進一步明確KRAS基因在結直腸癌肝轉移中的作用,及其突變相關生物標志物的表達變化,以期為結直腸癌的快速診斷、病情判斷及預后評估提供理論依據(jù)。

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      廣西科學研究與技術開發(fā)計劃基金資助項目(桂科攻1298003-2-8);南寧市青秀區(qū)科學研究與技術開發(fā)計劃基金資助項目(2015S03)。

      張力圖(E-mail: zhanglitu@gmail.com)

      10.3969/j.issn.1002-266X.2017.16.026

      R735.3

      B

      1002-266X(2017)16-0077-04

      2016-10-13)

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