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      繡球和圓錐繡球品種遺傳多樣性ISSR研究

      2017-07-15 20:40:42彭繼慶徐志高曹福祥董旭杰
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年9期
      關(guān)鍵詞:繡球遺傳多樣性

      彭繼慶++徐志高++曹福祥++董旭杰++張鵬鴻

      摘要:以繡球、圓錐繡球2個種38個品種為材料,利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)及PopGen32軟件對其遺傳多樣性進(jìn)行分析,結(jié)果表明,100條引物中篩選出10條引物用于PCR擴(kuò)增,共擴(kuò)增出條帶132個,其中多態(tài)性條帶122個,占 92.42%,繡球、圓錐繡球2個種的多態(tài)條帶比例分別為79.55%、67.42%;38個繡球花品種觀測等位基因數(shù)為 1.924 2,有效等位基因數(shù)為1.676 8,Neis基因多樣性指數(shù)為0.378 2,Shannons信息指數(shù)為0.549 7,具有較高的遺傳多樣性和較強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)能力;繡球、圓錐繡球2個種的基因多樣性為0.375 8,種內(nèi)基因多樣性為0.282 6,種內(nèi)遺傳變異占75.20%;38個繡球花品種間的遺傳一致度變化范圍為0.454 5~0.977 3,存在很大差異,繡球、圓錐繡球的遺傳一致度為0.749 1,遺傳距離為0.288 9,兩者之間親緣關(guān)系較近;UPGMA聚類分析將38個品種分成2類4個亞類,聚類結(jié)果與葉片、花的特征基本分類結(jié)果一致,可完全區(qū)分繡球與圓錐繡球2個種。

      關(guān)鍵詞:繡球;圓錐繡球;ISSR;遺傳多樣性

      中圖分類號: S685.990.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A

      文章編號:1002-1302(2017)09-0018-04

      繡球花別稱八仙花,是繡球花科繡球?qū)伲℉ydrangea)植物的總稱,為常綠或落葉亞灌木、灌木或小喬木,主要分布于亞洲東部至東南部、北美洲東南部至中美洲和南美洲西部,全球有60余種,我國約有37個種、7個變種,是繡球花分布較多的國家之一。目前,市場上的繡球花品種繁多,花大艷麗,性狀各異,形態(tài)優(yōu)美,極具觀賞價值,已成為世界上極具發(fā)展?jié)摿Φ幕ɑ芷贩N之一,在花卉產(chǎn)業(yè)中具有重要意義。我國具有豐富的繡球花資源,對繡球花的研究主要集中在抗逆性、扦插繁殖、組培快繁、栽培管理、病蟲害防治、次生代謝物質(zhì)提取與檢測等方面[1-19],而在新品種培育方面的研究較少,屈連偉等雖有報道,也僅局限于繡球花品種的雜交方面[20-21],有關(guān)繡球花品種遺傳多樣性的研究報道相對較少。

      ISSR分子標(biāo)記技術(shù)是在SSR分子標(biāo)記基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種新型分子標(biāo)記方法,具有成本低、穩(wěn)定性高、操作簡單、重復(fù)性高等特點[22],近年來在園林花卉植物遺傳多樣性研究、親緣關(guān)系與子代鑒定、指紋圖譜構(gòu)建等應(yīng)用廣泛。董海燕等利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù),將41個紅花檵木品種聚為5類,聚類結(jié)果與葉色分類結(jié)果[23]一致;胡仲義等對重慶南山植物園中的26株川茶花古樹進(jìn)行分類研究,將26個品種分為5個類群,并獲得山牡丹可能是由牡丹茶芽變的結(jié)論[24];嚴(yán)華利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)建立了部分國蘭的指紋圖譜[25];王湘瑩等成功分析了23個金銀花品種間的遺傳變異[26];楊梅等將9個武當(dāng)木蘭典型種群分為3大類群,聚類結(jié)果與地理分布和花部特征劃分基本一致[27]。此外,利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對崇明水仙、金葉女貞、芍藥等品種或雜交后代進(jìn)行了鑒定[28-30]。中南林業(yè)科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院通過多年努力,從國內(nèi)外共收集繡球花新優(yōu)品種38個,其中21個繡球花品種屬于繡球種,17個繡球花品種屬于圓錐繡球種,研究收集到的38個繡球花品種的遺傳多樣性,有助于了解繡球花品種間或種間的親緣關(guān)系和遺傳背景,可為繡球花新品種培育親本的選擇提供依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1植物材料

      繡球花材料來源于中南林業(yè)科技大學(xué)植物園繡球花品種資源庫,包含繡球、圓錐繡球2個種,共計38個品種(表1),其中25個繡球花品種引自美國,12個品種源自荷蘭,1個為中國原生種。

      1.2DNA提取與檢測

      每個繡球品種采集3~5株新鮮葉片,直接帶回實驗室,采用天根生物科技(北京)有限責(zé)任公司的植物基因組DNA提取試劑盒提取繡球基因組總DNA;采用濃度為1%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測,溴化乙錠(EB)核酸染料濃度為 0.5 mg/mL,緩沖液為1×TAE,電泳電壓為5 V/cm,電泳時間30 min;電泳成像采用凝膠成像系統(tǒng),DNA純度及濃度用核酸蛋白分析儀測定;將DNA條帶明亮清晰、無拖帶現(xiàn)象、無RNA和蛋白質(zhì)污染的樣品于-70 ℃冰箱保存,備用。

      1.3ISSR-PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系與程序

      以繡球基因組總DNA樣品為模板,利用引物UBC855通過單因素試驗和正交試驗對Mg2+,TaqDNA聚合酶、引物、dNTPs、模板DNA濃度等影響因素進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增體系優(yōu)化[31],確定繡球品種的ISSR-PCR擴(kuò)增體系為(20 μL):10[CM(24*2]×PCR Buffer 2.0 μL,DNA 30 ng,Mg2+ 2.0[KG*3]mmol/L,ISSR 引物0.6 μmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,用ddH2O補(bǔ)足到20 μL。擴(kuò)增程序為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 變性30 s,52 ℃ 退火45 s,72 ℃延伸90 s,共36個循環(huán);72 ℃ 總延伸420 s,4 ℃保存[32]。

      1.4引物篩選及擴(kuò)增

      利用最優(yōu)ISSR-PCR反應(yīng)體系,以任意一個繡球品種總DNA樣品為模板,從100條隨機(jī)引物中篩選出擴(kuò)增條帶多、條帶清晰、能擴(kuò)增出高質(zhì)量條帶的引物用于38個繡球花品種遺傳多樣性檢測,并經(jīng)1%瓊脂糖電泳分離、凝膠成像系統(tǒng)成像。

      1.5數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

      根據(jù)DNA指紋圖譜和條帶位置,確定樣品圖譜中擴(kuò)增條帶的位置和大小,清晰、可辨認(rèn)的條帶記為“1”,模糊不清或沒有條帶的記為“0”,建立數(shù)據(jù)庫;利用PopGen32統(tǒng)計分析軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行計算、分析,利用Mega 6進(jìn)行聚類分析。

      2結(jié)果與分析

      2.1繡球花品種ISSR-PCR擴(kuò)增多態(tài)性

      多態(tài)位點比率是衡量一個群體內(nèi)遺傳變異水平高低的重要指標(biāo),比值越高,該群體變異水平越大,環(huán)境適應(yīng)性越強(qiáng),反之則越弱,在進(jìn)化過程中越易被淘汰。由表2可見,從100條引物篩選出10條引物對38個繡球花品種進(jìn)行PCR擴(kuò)增,共擴(kuò)增出132個位點,其中多態(tài)性位點122個,每個引物平均擴(kuò)增13.2個位點、多態(tài)位點12.2個,多態(tài)位點比率為92.42%,說明繡球花品種間具有較大的遺傳變異,環(huán)境適應(yīng)能力較強(qiáng),這可能與繡球花新品種的培育方式有關(guān)。由表3可見,繡球種群體包含21個繡球花品種,多態(tài)性位點為105個,多態(tài)位點[CM(25]比率為79.55%,圓錐繡球群體包含17個繡球花品種,多態(tài)性位點為89個,多態(tài)位點比率為67.42%,說明這2個繡球種群具有較高的遺傳多樣性,圓錐繡球品種多態(tài)性略低于繡球品種。

      2.2繡球花品種的遺傳多樣性

      由表3可見,38個繡球花品種的觀測等位基因數(shù)為 1.924 2,有效等位基因數(shù)為1.676 8,Neis基因多樣性指數(shù)為0.378 2,Shannons信息指數(shù)為0.549 7,這表明該群體具有較高的遺傳多樣性;繡球種群的觀測等位基因數(shù)為1.795 5,有效等位基因數(shù)為1.560 7,Neis基因多樣性指數(shù)為0.315 5,Shannons信息指數(shù)為0.460 2;圓錐繡球種群的觀測等位基因數(shù)為1.674 2,有效等位基因數(shù)為1.435 1,Neis基因多樣性指數(shù)為0.249 8,Shannons信息指數(shù)為0.368 8。統(tǒng)計結(jié)果表明,2種繡球群體總的基因多樣性為0.375 8,種內(nèi)基因多樣性為0.282 6,種內(nèi)遺傳變異占75.20%,種間遺傳變異占 24.80%,這說明2個繡球群體之間存在遺傳變異,并主要存在于種內(nèi),繡球與圓錐繡球之間的雜交親和性相對較低,二者通過雜交培育新品種難度較大;2個種群之間的基因流為 1.517 4(大于1),這表明二者之間存在明顯的基因流。

      2.3繡球花品種的遺傳一致度

      采用PopGen 32軟件對38個繡球花品種進(jìn)行遺傳距離和遺傳一致度分析,結(jié)果表明,38個繡球花品種間的遺傳一致度變化范圍為0.454 5~0.977 3,其中繡球花品種夢幻藍(lán)(pop10)與繡球花品種史歐尼(pop11)之間的遺傳一致度相對最高,為0.977 3,二者親緣關(guān)系相對較近,繡球花品種史歐尼(pop11)與繡球花品種小檸檬(pop27)的遺傳一致度相對最低,為0.454 5,二者之間親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn),彼此間存在較大的差異;2個種群之間的遺傳一致度為0.749 1,遺傳距離為0.288 9,這說明2個種群之間的親緣關(guān)系相對較近。

      2.4繡球花品種的親緣關(guān)系

      由圖1可見,38個繡球花品種聚分為兩大類,第1類包含所有的繡球品種,第2類包含所有的圓錐繡球品種;每類又分2個亞類,第1亞類包括19個繡球品種,第2亞類包括2個繡球品種,第3亞類包括1個圓錐繡球品種,第4亞類包括16個圓錐繡球品種;繡球為傘房狀聚傘花序近球狀或頭狀,小枝粗,無毛,葉倒卵形或?qū)挋E圓形,先端驟尖,基部鈍圓或?qū)捫ㄐ?,具粗齒,兩面無毛;圓錐繡球為圓錐狀聚傘花序,密被柔毛,幼枝疏被柔毛,葉紙質(zhì),卵形或橢圓形,先端漸尖或驟尖,具短尖頭,基部圓或?qū)捫ㄐ?。聚類結(jié)果與形態(tài)分類基本一致,可將繡球、圓錐繡球2個種完全區(qū)分。

      3討論與結(jié)論

      ISSR分子標(biāo)記技術(shù)具有檢測靈敏、多態(tài)性好、穩(wěn)定、重復(fù)性高等優(yōu)點。利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對國內(nèi)外收集的38個繡球花品種進(jìn)行的品種鑒定結(jié)果、聚類關(guān)系表明,ISSR分子標(biāo)記技術(shù)能很好地區(qū)分繡球花品種種群,38個繡球花品種聚為兩大類,第1類為繡球,第2類為圓錐繡球,與按照花型、葉型特征的分類結(jié)果基本一致;繡球品種史歐尼、夢幻藍(lán)親緣關(guān)系相對最近,在繡球花種間分類中具有較高的靈敏性;38個繡球品種分為4個亞群,第1亞群包含19個繡球品種,第2亞群包含2個繡球品種,第3亞群包含16個圓錐繡球品種,第4亞群包含1個圓錐繡球品種。繡球和圓錐繡球在葉片、花形態(tài)方面差異明顯,繡球葉片倒卵形,先端聚尖,基部鈍圓,具粗齒,葉柄粗,葉片較厚,圓錐繡球葉片紙質(zhì),橢圓形,先端漸尖或聚尖,基部圓或?qū)捫ㄐ?,密生小鋸齒,上面無毛或疏被糙伏毛,葉片較薄;繡球花序近球形或花序頂端平,而圓錐繡球花序為圓錐形聚傘花序。試驗結(jié)果表明,繡球品種之間的聚類結(jié)果與花序形態(tài)特征存在明顯差異,呈近球形聚傘花序品種與花序頂端平頭狀花序品種相間分布的特點,如變?nèi)~繡球(pop7)、南丁格爾繡球(pop14)、塔貝(pop17)3個繡球品種,花序為頂端平狀花序,但聚類結(jié)果并未單獨(dú)聚在一起,而是與近球形花序品種聚在一起,可能與這3個品種屬于山繡球(繡球變種)有關(guān),具體原因還須進(jìn)一步研究。

      38個繡球花品種遺傳多樣性分析表明,繡球花多態(tài)位點比率為92.42%,與大菊品種的92.5%[33]基本一致,遺傳多樣性高于紅花檵木品種的72.9%[23],但略低于李艷香的研究結(jié)論[34],這可能與試驗材料不同有關(guān);繡球品種的多態(tài)位點比率為79.55%,圓錐繡球品種的多態(tài)位點比率為67.42%,介于紅花檵木品種之間,遠(yuǎn)低于大菊品種;38個繡球花品種的遺傳距離介于0~0.769 1,平均值為0.373 5,遺傳一致度介于0.463 4~1.000 0之間,平均值為0.696 2,遺傳距離和遺傳一致度跨度較大,這可能有2個方面的原因:一是繡球花資源分布廣泛,種類較多,分布區(qū)域跨不同氣候帶,適應(yīng)性廣,本身具有很好的遺傳基礎(chǔ);二是繡球花新品種培育多采用雜交方式,有利于品種或種之間的基因交流;繡球、圓錐繡球2個種的基因多樣性為0.375 8,種內(nèi)變異占75.20%,存在一定的種間變異,但種內(nèi)變異起主導(dǎo)作用,開展種內(nèi)雜交更有利于獲得雜交后代。

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