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      桿狀病毒ctl基因的進化分析

      2017-07-15 20:43:27朱姍穎康啟鑫武亞楠陳奕蓄
      江蘇農業(yè)科學 2017年9期
      關鍵詞:進化桿狀病毒分類

      朱姍穎++康啟鑫++武亞楠++陳奕蓄++王文兵++何華綱

      摘要:苜蓿尺蠖核型多角體病毒(AcMNPV)芋螺毒素類似多肽(CTL)具有酚氧化酶抑制劑活性,在農業(yè)害蟲的生物防治領域具有潛在的應用價值。為了揭示桿狀病毒ctl基因的進化特點,對桿狀病毒CTLs進行多序列比對分析和分類研究。結果表明,桿狀病毒CTLs可分為Ⅰ型、Ⅱ型,2種類型的CTLs都具有相同的二硫鍵骨架,但涉及昆蟲酚氧化酶抑制劑活性的酪氨酸殘基在2種類型CTLs中的數(shù)目、位置明顯不同;另外,Ⅰ型CTLs、Ⅱ型CTLs的理化性質也存在明顯差異,疏水性氨基酸平均含量分別為29.7%、21.3%,凈電荷平均值分別為-3.56、+0.507,等電點平均值分別為3.86、7.32。由此推測,Ⅰ型CTLs、Ⅱ型CTLs在功能上可能存在著重要分化。

      關鍵詞:桿狀病毒;ctl基因;分類;進化

      中圖分類號:Q753 文獻標志碼: A

      文章編號:1002-1302(2017)09-0022-05

      芋螺毒素(conotoxin)是由海洋軟體動物芋螺分泌的一類用于自衛(wèi)和捕食的活性多肽,一般由10~30個氨基酸殘基組成,富含半胱氨酸(C)。芋螺毒素能特異性地作用于鉀、鈉、鈣等離子通道、細胞膜上的各種神經遞質、激素的受體,從而干擾細胞或神經中的信號傳遞,在治療慢性疼痛、急性疼痛、神經保護等方面具有廣泛的應用前景。根據保守的信號肽序列,芋螺毒素可分為A、M、O、I、P、S、T等超家族;進一步依據其半胱氨酸骨架及藥理活性,又可分為α、μ、ω、δ、Ψ、σ、λ、κ、γ等家族[1]。

      1992年,Eldridge等從苜蓿尺蠖核型多角體病毒(Autographa californica nucleopolyhedrovirus,簡稱AcMNPV)中鑒定了1個基因,該基因編碼的蛋白質序列與ω-芋螺毒素具有一定的相似性且具有相同的二硫鍵骨架(C1—C2—C3C4—C5—C6),因此將其命名為類芋螺毒素基因(conotoxin-like,簡稱ctl)[2]。但Eldridge等通過體內、體外試驗都未能證明桿狀病毒ctl基因的任何功能[2-3]。曹青等發(fā)現(xiàn),AcMNPV CTL不僅對金黃色葡萄球菌、微球菌等具有顯著的抗菌活性,還可對酚氧化酶起到抑制作用,能阻止昆蟲血液的黑化[4-5]。本研究從GenBank數(shù)據庫中收集已知的桿狀病毒ctl基因,對其編碼的CTLs進行較全面系統(tǒng)的進化分析,在此基礎上對桿狀病毒ctl基因進行分類,以期為該基因的功能研究提供理論依據。

      1材料與方法

      1.1基因序列和蛋白質序列的獲取

      以AcMNPV ctl基因(GenBank登錄號:L22858)作為種子序列,在GenBank數(shù)據庫中進行BLAST,獲取桿狀病毒ctl基因序列,使用DNAStar軟件進一步推導出對應的蛋白質序列。芋螺毒素ω-MⅦA、虎紋蜘蛛毒素HWTX-X、家蠅酚氧化酶抑制劑MdPOI等抑制劑半胱氨酸結(inhibitor cystine knot,簡稱ICK)家族(也稱knottin家族)成員的氨基酸序列從KNOTTIN數(shù)據庫(http://knottin.cbs.cnrs.fr)中獲得。

      1.2多序列比對分析

      使用SignalP 3.0軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0)預測桿狀病毒CTL蛋白質的信號肽,進而根據信號肽的位置,推導CTL成熟肽。使用ClustalW軟件(http://www.genome.jp/tools/clustalw)對桿狀病毒CTL成熟肽進行多序列比對分析,并采用同樣的方法對ICK家族進行多序列比對分析。

      1.3系統(tǒng)進化樹的構建

      應用MEGA 4.0軟件通過鄰接(N-J)法構建系統(tǒng)進化樹。

      1.4蛋白質理化性質分析

      用DNAStar軟件統(tǒng)計桿狀病毒CTL成熟肽、ICK家族成員的疏水性氨基酸含量,并計算凈電荷、等電點(pI)。

      2結果與分析

      2.1桿狀病毒ctl基因的分布

      以AcMNPV ctl基因為種子,在GenBank數(shù)據庫中進行BLAST分析。結果顯示,在全基因組已測序的50多個桿狀病毒中,有22個桿狀病毒含有ctl基因,約占40%。在這些桿狀病毒中,ctl基因的數(shù)目一般為1~2個。例如,AcMNPV、豆天蛾核型多角體病毒(Clanis bilineata NPV,簡稱ClbiNPV)等16種NPVs和棉鈴蟲顆粒體病毒(Helicoverpa armigera granulosisvirus,簡稱HearGV)、八字地老虎顆粒體病毒(Xestia c-nigrum GV,簡稱XecnGV)等2種GVs都只有1個ctl基因(表1);蓖麻蠶核型多角體病毒(Samia cynthia NPV,簡稱SacyNPV)、柞蠶核型多角體病毒(Antheraea pernyi NPV,簡稱AnpeNPV)等6種NPVs均有2個ctl基因(表2),而家蠶核型多角體病毒(Bombyx mori NPV,簡稱BmNPV)等桿狀病毒中則沒有該基因。在桿狀病毒中,ctl基因序列一致性在74%~100%之間,推導的蛋白質CTLs的氨基酸序列一致性為 40%~78%。對不同桿狀病毒CTLs進行信號肽的預測分析,發(fā)現(xiàn)所有CTLs的N端都有1段信號肽序列,其氨基酸組成的保守性較低,而成熟肽的氨基酸序列保守性較高。

      2.2桿狀病毒CTLs的分類

      對預測的桿狀病毒CTLs成熟肽序列進行多序列比對分析,可將桿狀病毒CTLs分為2種類型,分別命名為Ⅰ型CTLs、Ⅱ型CTLs(圖1)。Ⅰ型CTLs的前體肽都含有53個氨基酸殘基(aa),預測的成熟肽均為30個氨基酸,成熟肽的氨基酸組成相當保守,為ACA(/S)E(/D)TGAVCV(/I)HN(/S/D)DECCSGACSPV(/I)FNYCLPQ(/E/D),包括AcMNPV等4種NPVs編碼的CTLs,及SacyNPV、AnpeNPV等含有2個ctl基因的NPVs所編碼的CTL-1(表1、表2)。

      Ⅱ型CTLs的前體肽含有48~68個氨基酸,長度變異主要位于信號肽部分,而成熟肽大部分為29個氨基酸,個別為35、32個氨基酸,成熟肽的氨基酸組成較為保守,為CTE(/D)T(/D)GR(/K)NCK(/Q)Y(/T)S(/N)Y(/A/D/N)ECCSG(/N)ACSAA(/V/L)FG(/K)F(/Y)CLH(/K/P)R,包括ClbiNPV等11種NPVs、HearGV等2種GVs編碼的CTLs及含有2個ctl基因的NPVs所編碼的CTL-2(表1、表2)。

      采用CTLs成熟肽的氨基酸序列對桿狀病毒進行系統(tǒng)發(fā)育分析,發(fā)現(xiàn)所有編碼Ⅰ型CTLs的桿狀病毒聚于1支,而所有編碼Ⅱ型CTLs的桿狀病毒聚于另1支(圖2)。

      2.3Ⅰ型、Ⅱ型CTLs成熟肽的保守位點

      多序列比對分析表明,在Ⅰ型CTLs、Ⅱ型CTLs的成熟肽中均含有6個高度保守的半胱氨酸殘基(C),二硫鍵骨架為C1—C2—C3C4—C5—C6。酪氨酸(Y)是涉及昆蟲酚氧化酶抑制劑活性的關鍵位點,因此本研究對2類CTLs中的酪氨酸的分布進行統(tǒng)計分析。結果顯示,Ⅰ型CTLs都有1個保守的酪氨酸殘基,位于C5~C6之間;在Ⅱ型CTLs中,除了茶小卷葉蛾核型多角體病毒(Adoxophyes honmai NPV,簡稱 AdhoNPV)、棉褐帶卷蛾核型多角體病毒(Adoxophyes orana NPV,簡稱AdorNPV)的CTL缺乏酪氨酸殘基,ChchNPV CTL、OrleNPV CTL-2只有1個酪氨酸殘基之外,其余CTLs在C2~C3之間都有2個保守的酪氨酸殘基。除了這2個保守的酪氨酸殘基,黎豆夜蛾核型多角體病毒(Anticarsia gemmatalis NPV,簡稱AgNPV)、HearGV、XecnGV的CTLs還有1個酪氨酸殘基,其位置與Ⅰ型CTLs中的一致。此外,在HearGV CTL、黃杉毒蛾核型多角體病毒(Orgyia pseudotsugata MNPV,簡稱 OpMNPV)CTL-2的C1之前還有1個額外的酪氨酸殘基(圖1)。

      2.4Ⅰ型、Ⅱ型CTLs成熟肽的理化性質

      本研究對Ⅰ型、Ⅱ型CTLs的凈電荷、等電點、疏水性氨基酸含量等理化性質進行了比較分析,表3結果顯示,Ⅰ型CTL在pH值7.0時凈電荷范圍為-4.10~-3.10(平均值為-3.56),等電點(pI)范圍為3.69~3.96(平均值為 3.86),疏水性氨基酸占26.7%~30.0%(平均值為 29.7%);而Ⅱ型CTLs在pH值7.0時凈電荷為-0.11~+1.89(平均值為+0.507),pI值為6.88~8.01(平均值為7.32),疏水性氨基酸占17.2%~28.6%(平均值為 21.3%)。本結果表明,桿狀病毒Ⅰ型、Ⅱ型CTLs的理化性質存在明顯差異,這暗示2類CTLs在功能上可能存在分化。

      注:括號內數(shù)據為平均值。AcCTL為苜蓿尺蠖核型多角體病毒CTL;ClbiCTL為豆天蛾核型多角體病毒CTL;SacyCTL-1、SacyCTL-2為蓖麻蠶核型多角體病毒CTL-1、CTL-2;AhIAAI為千穗谷(Amaranthus hypochondriacus)α-淀粉酶抑制劑;GsGUR為匙羹藤(Gymnema sylvestre)甜味抑制蛋白gurmarin;MjTI1為紫茉莉(Mirabilis jalapa)胰蛋白酶抑制劑;AsAST-A為海洋生物Asteropus simplex抗菌肽;MVⅡA為芋螺毒素ω-MVⅡA;AlALO1為長臂天牛(Acrocinus longimanus)抗菌肽;MdPOI為家蠅(Musca domestica)酚氧化酶抑制劑;PaAMP1為美洲商陸(Phytolacca americana)抗菌肽;HWTX-X為虎紋蜘蛛(Ornithoctonus huwena)毒素Huwentoxin-X。

      2.5桿狀病毒CTLs與ICK家族的比較分析

      桿狀病毒CTLs屬于抑制劑半胱氨酸結(inhibitor cystine knot,簡稱ICK)家族,多序列分析表明,桿狀病毒CTLs與芋螺毒素ω-MⅦA、虎紋蜘蛛毒素HWTX-X、紫茉莉胰蛋白酶抑制劑MjTI1、匙羹藤甜味抑制蛋白GsGUR、美洲商陸抗菌肽PaAMP1、家蠅酚氧化酶抑制劑MdPOI等具有相同的二硫鍵骨架,但氨基酸序列一致性較低,僅為16.7%~33.3%(圖3)。

      在理化性質方面,AhIAAI、GsGUR、MjTI1、AsAST-A等都帶負電荷,等電點分別為6.06、4.97、4.81、3.04, 疏水性氨

      基酸含量分別為9.4%、25.7%、24.3%、44.4%;而ω-MⅦA、AlALO1、MdPOI、PaAMP1、HWTX-X等都帶正電荷,等電點為8.00~8.53,疏水性氨基酸含量分別為6.7%、11.8%、23.7%、21.1%、14.3%(表3)。由此可見,不同的ICK家族成員在理化性質上存在較大差異,不過桿狀病毒Ⅰ型CTLs的凈電荷(平均值為-3.56)、等電點(平均值為3.86)與 MjTI1、AsAST-A、GsGUR等比較接近。

      3討論與結論

      抑制劑半胱氨酸結家族,又稱knottin家族,該家族是由富含半胱氨酸殘基的小分子蛋白質組成,廣泛存在于各種動物、植物和微生物中[6]。研究發(fā)現(xiàn),海洋生物芋螺中的芋螺毒素屬于ICK家族。在ICK家族中,HWTX-X、Pa-AMP、MdPOI等大量成員都與芋螺毒素ω-MⅦA具有相同的二硫鍵骨架,即C1-C2-C3C4-C5-C6。這些類MⅦA(MⅦA-like)蛋白往往具有復雜的生物學功能,例如,HWTX-X是虎紋蜘蛛產生的一種神經毒素,在捕食過程中發(fā)揮作用[7]。PaAMP1是從美洲商陸種子中分離的抗菌肽,對多種真菌和革蘭氏陽性菌具有明顯的抑制活性[8]。MdPOI是從家蠅蛹中發(fā)現(xiàn)的酚氧化酶抑制劑(phenoloxidase inhibitor,簡稱POI),對家蠅幼蟲的酚氧化酶具有顯著的抑制作用[9-10]。從二硫鍵骨架看,桿狀病毒CTLs也屬于ICK家族中類MⅦA蛋白。桿狀病毒CTLs很少帶有正電荷,而帶正電荷氨基酸對芋螺毒素的鎮(zhèn)痛功能是必需的,因此,盡管最初桿狀病毒CTLs因與芋螺毒素具一定的同源性而被命名,但是桿狀病毒CTLs并不像芋螺毒素那樣具有鎮(zhèn)痛活性(筆者的相關研究數(shù)據未發(fā)表)。另外,曹青等已證實,AcMNPV CTL對金黃色葡萄球菌、微球菌、短小芽孢桿菌等多種臨床致病菌的生長有顯著抑制功能,目前尚不明確抑菌活性對于桿狀病毒的生物學意義[4]。還有研究發(fā)現(xiàn),AcMNPV CTL具有酚氧化酶抑制活性,能阻止昆蟲血液的黑化[5]。

      昆蟲酚氧化酶不僅在昆蟲發(fā)育過程中具有重要的生理功能,如參與表皮的鞣化、硬化、傷口愈合等,還在昆蟲免疫防御反應中起著重要作用,它可使病原微生物表面產生黑色素沉淀,通過黑色素包囊反應來隔離和抵抗病原物,并在黑色素形成過程中產生醌及其衍生物,導致活性氧的積累,從而對病原物起到殺傷作用[11]。已有研究表明,昆蟲酚氧化酶與黑化幼蟲表現(xiàn)出的較強的桿狀病毒抗性有關[12]。Trudeau等用 AcMNPV 感染美洲棉鈴蟲時發(fā)現(xiàn),氣管上皮細胞的感染位點上出現(xiàn)了酚氧化酶介導的黑化及包囊反應[13]。由此可見,昆蟲酚氧化酶在宿主防御桿狀病毒的過程中發(fā)揮著重要作用。昆蟲體內存在內源性酚氧化酶抑制劑,能在納摩爾(nmol)水平上高效地競爭性抑制酚氧化酶活性[9]。Cao等的研究表明,AcMNPV CTL是病毒來源的酚氧化酶抑制劑,它可能在一定程度上能抑制昆蟲宿主對桿狀病毒的防御反應[5]。

      Daquinag等對家蠅MdPOI的氨基酸序列及蛋白質結構進行解析發(fā)現(xiàn),MdPOI成熟肽由38個氨基酸殘基組成,富含半胱氨酸、賴氨酸,其中6個半胱氨酸形成3對二硫鍵(C1—C2—C3C4—C5—C6),且在C5~C6之間的酪氨酸殘基(Y)經羥化修飾為多巴殘基,該位點與酚氧化酶抑制劑的競爭性抑制活性有重要關系[10]。本研究將桿狀病毒CTLs分為2類,即Ⅰ型CTLs、Ⅱ型CTLs,其中Ⅰ型CTLs在C5~C6之間也都有1個保守的酪氨酸殘基,目前尚不清楚該位點是否存在羥化修飾,而大部分Ⅱ型CTLs在C2~C3之間有2個保守的酪氨酸殘基。另外,與Ⅰ型CTLs類似,3個Ⅱ型CTLs(AgNPV CTL、HearGV CTL和XecnrGV CTL)在C5~C6之間還有1個酪氨酸殘基。目前尚不清楚Ⅱ型CTLs是否也具有酚氧化酶抑制活性。此外,在蛋白質疏水性、電荷特性等方面,Ⅱ型CTLs與Ⅰ型CTLs存在明顯差異,由此推測,Ⅱ型CTLs的功能可能不同于Ⅰ型CTLs,這有待進一步研究。

      參考文獻:

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