王淑菁 付 瑞 李曉波 王 吉 岳秉飛
(中國(guó)食品藥品檢定研究院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源研究所,北京 100050)
雞胚致死孤兒病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用
王淑菁 付 瑞 李曉波 王 吉 岳秉飛
(中國(guó)食品藥品檢定研究院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源研究所,北京 100050)
目的:建立雞胚致死孤兒病毒CELO的熒光定量PCR檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)該病毒在雞胚及禽源性生物制品中的快速檢測(cè)。方法 根據(jù)CELO L5 纖突1序列設(shè)計(jì)引物和探針,建立熒光定量PCR檢測(cè)方法,并對(duì)其線性、特異性、精密性、靈敏度進(jìn)行考察。運(yùn)用建立的方法對(duì)40份SPF雞胚尿囊液和16株流感疫苗主種子批毒種進(jìn)行CELO檢測(cè)。結(jié)果:建立的熒光定量PCR其最佳線性范圍為1x109~1x104拷貝/μl,R2值達(dá)0.99以上,特異性良好,與其他種屬的腺病毒及流感病毒間均無(wú)交叉反應(yīng),靈敏度為102拷貝/μl;熒光定量PCR方法檢測(cè)40份SPF雞胚尿囊液和16株流感毒種結(jié)果為陰性。結(jié)論:本研究所建立的雞胚致死孤兒病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法,特異性好,敏感性高,為雞胚及禽源性生物制品中的快速檢測(cè)提供了技術(shù)支撐。
雞胚致死孤兒病毒;熒光定量PCR;雞胚
雞胚致死孤兒病毒(CELO)屬于禽腺病毒I型,為無(wú)包膜雙股DNA病毒,主要引起雞的包涵體肝炎、再生障礙性貧血、呼吸道感染、出血性腸炎和產(chǎn)蛋量減少,常與禽類呼吸道病原微生物混合感染,導(dǎo)致死亡率增加[1,2,3]。2008年制定的SPF雞微生物學(xué)監(jiān)測(cè)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)中要求SPF雞和雞胚需要排除禽腺病毒I型的感染[4]。此外,2015年版《中國(guó)藥典》中也規(guī)定流感病毒主種子毒種也需要進(jìn)行外源性禽腺病毒I型的檢測(cè),排除外源性病毒的污染[5]。
目前國(guó)標(biāo)中規(guī)定的禽腺病毒I型的檢測(cè)方法是瓊脂擴(kuò)散法,該方法耗時(shí)較長(zhǎng),敏感性差[4]。本研究旨在建立一種檢測(cè)禽腺病毒I型代表株CELO病毒的熒光定量PCR方法,能夠快速、靈敏的檢測(cè)CELO病毒。
CELO毒種(ATCC VR-432)購(gòu)于ATCC;禽腺病毒III型(EDS株)購(gòu)于中國(guó)獸藥監(jiān)察所;小鼠腺病毒(MAdV)均購(gòu)買于ATCC;猴腺病毒-1和猴腺病毒-20均為本科室保存。H1N1、H3N2、B型流感病毒為疫苗廠家送檢毒種。
Takara MiniBEST Viral RNA/DNA 提取試劑盒試劑盒購(gòu)自TaKaRa公司;TaqMan Universal PCR Master Mix購(gòu)自Applied Biosystems公司。SPF雞胚購(gòu)買于北京梅里亞維通實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司。
擴(kuò)增CELO29763-30208區(qū)域,得到446bp目的片段,測(cè)序后將目的片段轉(zhuǎn)入pMD19-T質(zhì)粒中,作為CELO質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品。
針對(duì)CELO六鄰體蛋白446bp保守序列設(shè)計(jì)引物和探針,引物和探針序列如下:CELO-F:CGCTTACTGCCGTTTAGCT,CELO-R:GGCATAGCTTGTCACTTGAATGGT,
探針:FAM-CCGCTGACCACGCCAC-NFQ,探針標(biāo)記FAM熒光基團(tuán)。引物與探針均由英俊上海公司合成部合成。PCR反應(yīng)體系為:TaqMan Universal PCR Master Mix 10μl,探針引物混合物(10μM)1μl,無(wú)RNA酶水7μl,模板2μl。反應(yīng)條件:50℃2min;95℃ 10min;95℃ 15s,60℃ 1min,40個(gè)循環(huán)。
建立的熒光定量PCR方法對(duì)各濃度的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品均進(jìn)行考察,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,并確定該方法的最佳線性范圍。
提取CELO、禽腺病毒III型EDS、鼠腺病毒,猴腺病毒-1,猴腺病毒-20、H1N1流感病毒、H3N2流感病毒、B型流感病毒的核酸DNA,進(jìn)行熒光定量PCR,考察該引物和探針的特異性。
倍比稀釋構(gòu)建的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,從109至100拷貝/μl,每個(gè)稀釋度重復(fù)三次,考察該方法的靈敏度,以陽(yáng)性檢出率為100%的最低稀釋倍數(shù)為該方法的靈敏度。
使用熒光定量PCR方法對(duì)40份SPF雞胚尿囊液和16株流感病毒主種子批毒種進(jìn)行檢測(cè)。其中16株流感病毒毒種包括3株H1N1亞型、6株H3N2亞型、7株B亞型.
2.1.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線及最佳線性范圍:當(dāng)CELO標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒分別在109~104拷貝/μl時(shí),標(biāo)準(zhǔn)曲線的線性關(guān)系良好,R2值可達(dá)0.998,擴(kuò)增效率為96.184%。
2.1.2 特異性:檢測(cè)結(jié)果顯示,當(dāng)檢測(cè)CELO病毒時(shí),出現(xiàn)FAM熒光擴(kuò)增曲線。禽腺病毒III型、鼠腺病毒、猴腺病毒-1、猴腺病毒-20、H1N1流感病毒、H3N2流感病毒、B型流感病毒提取DNA樣品均無(wú)明顯擴(kuò)增曲線。表明所建立的熒光定量PCR法特異性良好,與其他腺病毒及流感病毒株無(wú)交叉反應(yīng)。見圖1
圖1 熒光定量PCR方法的特異性
2.1.3 靈敏度:以陽(yáng)性檢出率為100%的最低稀釋倍數(shù)為該方法的靈敏度,檢測(cè)結(jié)果顯示,該方法檢測(cè)CELO標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的靈敏度為102拷貝/μl。見圖2。
圖2 熒光定量PCR方法的靈敏度
使用熒光定量PCR方法檢測(cè)40份雞胚尿囊液和16株流感疫苗主種子批毒種中是否存在CELO污染,結(jié)果顯示陽(yáng)性對(duì)照CELO毒種出現(xiàn)S型擴(kuò)增曲線,40份雞胚尿囊液和16株流感疫苗主種子批毒種擴(kuò)增曲線均無(wú)抬起,判定為CELO陰性。見圖3。
圖3 40份雞胚尿囊液和16株流感疫苗主種子批毒種CELO熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果
目前新建立的CELO熒光定量PCR方法對(duì)于檢測(cè)雞胚和禽源性生物制品中是否存在外源性CELO病毒污染具有重要意義。新建立的CELO熒光定量PCR檢測(cè)方法與傳統(tǒng)的血清學(xué)檢測(cè)方法相比,建立的熒光定量PCR靈敏度高,最低檢測(cè)可達(dá)102拷貝/μl,特異性好,與其他種屬的腺病毒及流感病毒間均無(wú)交叉反應(yīng),檢測(cè)時(shí)間更短,僅需要1天時(shí)間即可完成全部實(shí)驗(yàn)。對(duì)于污染了極其微量的外源性CELO病毒時(shí)也可以及時(shí)檢出,更好的保證雞胚和禽源性生物制品的安全性。
[1]周斌,劉華雷,曹瑞兵.污染疫苗的禽腺病毒分離和鑒定[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2004,27(3):78-80.
[2]付瑞,王淑菁,岳秉飛,等.雞胚致死孤兒病毒PCR檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[J].實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué),2012,29(4):9-11.
[3]殷震,劉景華.動(dòng)物病毒學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,1997.
王淑菁,女,助理研究員,研究方向:實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病毒學(xué)。