張子通 張愛亮 陳啟悅 / 上海市計(jì)量測(cè)試技術(shù)研究院
常見微生物快速檢測(cè)技術(shù)
張子通 張愛亮 陳啟悅 / 上海市計(jì)量測(cè)試技術(shù)研究院
微生物技術(shù)是人類21世紀(jì)三大科技革命之一,其對(duì)食品、醫(yī)學(xué)、材料等諸多領(lǐng)域都有著深遠(yuǎn)的影響。作為微生物技術(shù)的基礎(chǔ),微生物檢測(cè)技術(shù)的重要性不言而喻。微生物檢測(cè)的對(duì)象有細(xì)胞(細(xì)菌、單細(xì)胞生物、低等藻類等)及病毒,檢測(cè)指標(biāo)包括數(shù)量、類別,較高要求的會(huì)涉及細(xì)胞的活性狀態(tài)等方面。
涂布法是傳統(tǒng)的微生物檢測(cè)方法。現(xiàn)行國家標(biāo)準(zhǔn)GB 4789-2016《食品微生物檢測(cè)方法》的主體內(nèi)容就是一系列涂布方法:即在達(dá)到潔凈要求的實(shí)驗(yàn)室里對(duì)樣品進(jìn)行溶解稀釋,然后將不同比例稀釋的樣品液涂于相應(yīng)培養(yǎng)基表面,必要時(shí)取空白基參照,恒溫(一般是 35~37 ℃)培養(yǎng)一段時(shí)間(一般是 1~3 d)后進(jìn)行菌落計(jì)數(shù),其中計(jì)數(shù)可行有效的稀釋樣品用于計(jì)算原始樣品的濃度;依所測(cè)指標(biāo),試劑、器材、實(shí)驗(yàn)條件亦會(huì)相應(yīng)調(diào)整。GB 4789-2016系列標(biāo)準(zhǔn)于2017年正式生效,代替了GB 4789-2010。雖然冠以“食品”之名,GB 4789-2016總則及其包含的各單獨(dú)方法對(duì)不同行業(yè)的微生物檢測(cè)都具有較高的指導(dǎo)性和代表性。譬如對(duì)于更嚴(yán)苛的藥品檢測(cè),操作流程類似,但實(shí)驗(yàn)室要求更高,同樣的指標(biāo)培養(yǎng)時(shí)間一般會(huì)更長(zhǎng)(5~7 d)。
隨著經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,市場(chǎng)對(duì)微生物檢測(cè)的時(shí)效性和精密分析能力提出了較高要求,如:對(duì)食藥、生化流水線產(chǎn)品品質(zhì)的即時(shí)監(jiān)控;執(zhí)法部門、海關(guān)對(duì)樣品執(zhí)法、通關(guān)檢測(cè);高端生化行業(yè)對(duì)特定菌種的大批量、高精度檢測(cè)。在這些訴求面前,經(jīng)典的涂布法在對(duì)實(shí)驗(yàn)室要求高(包括硬件、環(huán)境、種類試劑耗材的采購制備)、對(duì)人員專業(yè)性和人數(shù)要求高、樣品培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng)、無法檢測(cè)病毒等方面,其局限性日益顯現(xiàn),故微生物快速檢測(cè)方法和儀器(以下簡(jiǎn)稱速測(cè)方法、速測(cè)儀器)應(yīng)運(yùn)而生。從21世紀(jì)初開始到現(xiàn)在,不同原理的速測(cè)方法都已經(jīng)取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步,目前常見的儀器在可靠性、動(dòng)作機(jī)構(gòu)等方面已經(jīng)比較成熟,應(yīng)用的范圍也各自確立了。
新版GB 4789-2016整合了部分快速檢測(cè)方法。比如《PCR熒光法檢測(cè)諾如病毒》(GB 4789.42-2016,替代了原來只適用于貝類的SN/T 1635-2005《貝類的諾沃克病毒檢測(cè)方法》),填補(bǔ)了涂布法無法檢測(cè)病毒空白。在許多特定微生物檢測(cè)項(xiàng)目中,新標(biāo)準(zhǔn)也使用了PCR方法在涂布后用來確認(rèn)物種??梢哉f,我國對(duì)微生物的檢測(cè)在國家層面上也已經(jīng)順應(yīng)時(shí)勢(shì)進(jìn)行了自我完善,PCR方法作為菌種判定和病毒檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)方法的地位基本確立。
隨著速測(cè)方法在各個(gè)方面的應(yīng)用越來越廣泛,相關(guān)儀器的計(jì)量工作也勢(shì)在必行。目前國家尚無對(duì)此類儀器的統(tǒng)一的計(jì)量校準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn),非常重要的一個(gè)原因是因?yàn)閮x器的種類豐富、原理各異、應(yīng)用條件也不同。故本文對(duì)常見的速測(cè)方法的原理特點(diǎn)、主要應(yīng)用領(lǐng)域進(jìn)行概括歸納,既可以為未來的計(jì)量工作整合信息,同時(shí)在開展微生物速測(cè)工作時(shí),對(duì)方法的選用,也可以提供一些建議和參照。
快速測(cè)試卡(套裝)是對(duì)涂布方法通過技術(shù)手段盡可能簡(jiǎn)化步驟來達(dá)到提速的一種微生物速測(cè)方法。這種方法技術(shù)成熟,成本低廉,攜帶方便,非常適合常見指標(biāo)的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。該方法將實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)基用含有營養(yǎng)物質(zhì)的預(yù)制“取樣-保存-培養(yǎng)”一體化的壓片、紙卡或小型容器替代,取樣涂布同時(shí)進(jìn)行,取樣后的預(yù)制載體或直接用于培養(yǎng),多無需稀釋,減輕了現(xiàn)場(chǎng)采樣和實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的工作量,并且試圖通過改良培養(yǎng)物質(zhì)以求縮短某些指標(biāo)的培養(yǎng)時(shí)間,但一般依舊難以短于12 h。
同時(shí),亦有根據(jù)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)或其他特定需求專用的試紙型器材。這類器材通過色差,可定性表現(xiàn)或粗略定量地表現(xiàn)某些指標(biāo)。其原理與涂布法稍有不同,多是通過特征菌與特定物質(zhì)反應(yīng)顯色而非涂布計(jì)數(shù),但大多依舊無法繞開培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng)這一瓶頸。其中比較典型的有餐具大腸桿菌專用試紙,其根據(jù)GB 14934-2016《消毒餐(飲)具》所述,在定性分析餐具大腸桿菌存否這一指標(biāo)上和GB 4789.3-2016《大腸桿菌測(cè)試方法》等效。
PCR方法是一種比較快速的精密微生物檢測(cè)方法,其原理是利用DNA在95 ℃時(shí)變性成單鏈,低溫60 ℃左右時(shí),引物與單鏈按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則結(jié)合,再升溫至72 ℃左右,DNA聚合酶在此最佳活性溫度沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補(bǔ)鏈。由于原理上其直接復(fù)制目標(biāo)堿基配對(duì),故可非常準(zhǔn)確地測(cè)量某一特定微生物種的數(shù)量。然而其存在假陽性概率較高的問題,原因是已死微生物的DNA鏈也會(huì)被檢出,所以排除干擾是實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中的重要一環(huán)。此法可用于檢測(cè)病毒,國標(biāo)中收錄的有GB 4789-2016.42《食品微生物檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)熒光法檢測(cè)諾如病毒》,還有在禽流感流行時(shí)期催生的GB/T19438.1-2004《禽流感病毒通用熒光RT-PCR檢測(cè)方法》等。目前GB 4789-2016里所涉及的PCR方法主要為PCR熒光法,即對(duì)培養(yǎng)得到的堿基透過熒光物質(zhì)染色然后定量分析的做法。
除了與其他微生物檢測(cè)方法類似的注意點(diǎn)以外,由于此方法所涉及的生物反應(yīng)對(duì)溫度極度敏感,所以溫控準(zhǔn)確是保障檢測(cè)可靠性的必須條件,故多作為實(shí)驗(yàn)室的固定設(shè)備。目前存在用戶通過對(duì)溫控系統(tǒng)的校準(zhǔn)來輔助判斷儀器可靠性的做法。
ATP熒光法的基本原理是通過螢火蟲熒光素酶(簡(jiǎn)稱蟲光素酶)催化螢火蟲熒光素(簡(jiǎn)稱蟲熒光素)與生命體中常在能量物質(zhì)腺苷三磷酸在有氧狀態(tài)下發(fā)生氧化還原反應(yīng)發(fā)光。當(dāng)蟲光素酶和蟲熒光素在體系中處于過量情況下,發(fā)光強(qiáng)弱取決于ATP 數(shù)量。只要排除非檢測(cè)項(xiàng)目因素的ATP,則可以通過發(fā)光強(qiáng)度直接求得目標(biāo)量的數(shù)值。因此ATP法在應(yīng)對(duì)復(fù)雜的情況或是用于檢測(cè)特定項(xiàng)目時(shí),需要追加前處理,一般較涂布法的培養(yǎng)基或是培養(yǎng)過程調(diào)整來說容易。如伍季等將此技術(shù)用于啤酒菌落總數(shù)的檢測(cè):啤酒中含有其他有機(jī)活性物質(zhì),他們通過追加了減壓過濾富集裝置,降低了啤酒中酶抑制劑和發(fā)光干擾的影響,達(dá)到的檢測(cè)線可達(dá)到10-15ATP,即相當(dāng)于103cfu的菌落。
ATP法檢測(cè)速度一般為15~30 min,對(duì)現(xiàn)場(chǎng)要求比較低,無需培養(yǎng),步驟少,誤操作、無效數(shù)據(jù)易被發(fā)覺,設(shè)備也已經(jīng)小型化,較之速測(cè)套裝依舊需要等待培養(yǎng)時(shí)間以及只能檢測(cè)基礎(chǔ)指標(biāo),可謂優(yōu)勢(shì)明顯,而且操作上,“取樣-儀器-讀數(shù)”的用戶體驗(yàn)也更符合當(dāng)代人操作習(xí)慣,故ATP技術(shù)是目前各技術(shù)中比較有潛力發(fā)展成“傻瓜”型民用或執(zhí)法用便攜產(chǎn)品的速測(cè)儀器。
流式細(xì)胞計(jì)數(shù)法是基于細(xì)胞直接計(jì)數(shù)的一種微生物快速檢測(cè)方法,其基本原理是樣品流經(jīng)小孔時(shí),檢測(cè)由于細(xì)胞存在而改變的環(huán)境參數(shù),比如電傳導(dǎo)差、光散射、熒光標(biāo)記,進(jìn)而可以獲得細(xì)胞大小、數(shù)量等信息。結(jié)合其他條件,可以進(jìn)行諸如病菌種類、細(xì)胞死活狀態(tài)等精密分析,已經(jīng)成為專業(yè)生物實(shí)驗(yàn)室的重要裝備。流式細(xì)胞計(jì)數(shù)裝置一般由五大部分組成:液流系統(tǒng)、光學(xué)系統(tǒng)、信號(hào)收集與轉(zhuǎn)換系統(tǒng)、分析系統(tǒng)。經(jīng)過數(shù)年的發(fā)展,該系統(tǒng)已經(jīng)進(jìn)入到了微生物檢測(cè)的各個(gè)領(lǐng)域,以熒光標(biāo)記為主要信號(hào)采集方式。該檢測(cè)方法速度較快,約為15 min,若進(jìn)行連續(xù)批量操作,單個(gè)的平均時(shí)間更短。
除了用于精密分析,在批量分析的應(yīng)用中,流式細(xì)胞技術(shù)憑借其大批量以及在線處理能力所連帶的總成本下降,也具有一定優(yōu)勢(shì)。并且利用其原理上便能判斷細(xì)胞死活的特性,是常見速測(cè)方法里假陽性概率最低的方法。另外,流式細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)變能力很強(qiáng),在已經(jīng)有主體設(shè)備的情況下,如果需要拓展、改變檢測(cè)項(xiàng)目,流式細(xì)胞儀器往往只需要調(diào)整檢測(cè)程序,配合改變相應(yīng)的耗材即可,這使得該儀器實(shí)際利用率很高,盡管初期投入較大,不少企業(yè)依舊樂意使用。
微生物的活動(dòng)會(huì)產(chǎn)生大分子電化學(xué)惰性物質(zhì)與小分子電化學(xué)活性物質(zhì),可利用其對(duì)周遭電化學(xué)性質(zhì)的變化檢測(cè)微生物的數(shù)目。目前比較成熟的是阻抗法,即測(cè)量體系阻抗變化來推算微生物指標(biāo)。
這種方法原理經(jīng)典成熟,儀器自身廉價(jià),敏感度、可靠性、重復(fù)性都較好。該方法不需要對(duì)樣品進(jìn)行復(fù)雜的前處理,因而在線檢測(cè)容易實(shí)現(xiàn)。其主要缺點(diǎn)在于其本質(zhì)只是檢測(cè)阻抗,而影響阻抗的因素非常多,其中不乏很多非生物性的因素,所以其檢測(cè)往往需要在某個(gè)固定環(huán)境下,阻抗變化才會(huì)和微生物的多少有關(guān)。張愛萍等對(duì)牛奶的菌落總數(shù)使用阻抗法進(jìn)行檢測(cè)的試驗(yàn)中,其檢測(cè)對(duì)象就是某特定批次的牛奶產(chǎn)品,其實(shí)驗(yàn)結(jié)果充分說明了阻抗法在固定工況下檢測(cè)的優(yōu)勢(shì)。由于多用于檢測(cè)環(huán)境相對(duì)固定的諸如生產(chǎn)線監(jiān)測(cè),其計(jì)量也必須是現(xiàn)場(chǎng)或是在線的校準(zhǔn)。脫離工況狀態(tài)的校準(zhǔn)只能判斷儀器功能的完整性,對(duì)于使用方并無意義。
就本文所介紹的五種常見的微生物速測(cè)方法,這些方法各有所長(zhǎng),特點(diǎn)歸納到表1。
表1 常見微生物快速檢測(cè)方法歸納
總體來說,目前生物速測(cè)方法經(jīng)過十幾年的發(fā)展,各種技術(shù)都日趨成熟,在各自應(yīng)用上的準(zhǔn)確度、可靠性上也都經(jīng)過了實(shí)踐檢驗(yàn),選擇上以任務(wù)特點(diǎn)導(dǎo)向?yàn)橹?,每個(gè)方法互為補(bǔ)充,不存在替代關(guān)系,更多是如同GB 4789-2016一般整合搭配使用,從而做到取長(zhǎng)補(bǔ)短以提高總體的檢測(cè)質(zhì)量及能力。但對(duì)每種儀器的使用方法來說,未來如何尋求一個(gè)統(tǒng)一可行的標(biāo)準(zhǔn)來公證地校準(zhǔn)不同速測(cè)儀器將會(huì)是計(jì)量工作的一個(gè)主要問題。
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