紀(jì) 洋,于海洋,CONRAD Ralf ,徐 華*
(1 南京信息工程大學(xué)應(yīng)用氣象學(xué)院,南京 210044;2 土壤與農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(中國(guó)科學(xué)院南京土壤研究所),南京 210008;3 Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Marburg 35043)
稻田是大氣 CH4排放的重要來(lái)源,其 CH4排放量達(dá)25.6 Tg/a[1]。我國(guó)水稻種植面積占世界總種植面積的20%,其水稻產(chǎn)量占世界總量的32%~35%[2]。稻田CH4排放包括 CH4產(chǎn)生、再氧化和傳輸3個(gè)過(guò)程[3],其中前兩個(gè)過(guò)程與土壤中產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌的數(shù)量及活性密切相關(guān)。產(chǎn)甲烷菌功能基因mcrA控制甲烷化的最后一步反應(yīng),將輔酶M連接的甲基催化還原為CH4[4],甲烷氧化菌功能基因pmoA編碼利用甲烷的第一個(gè)關(guān)鍵酶,將甲烷氧化為甲醇[5]。因而稻田土壤中含有上述基因的功能微生物種群豐度結(jié)構(gòu)及其演變規(guī)律受到廣泛關(guān)注。
以前期淹水、中期烤田和后期干濕交替為特征的間隙灌溉是我國(guó)稻田主要的水分管理措施[1]。大量研究表明,相對(duì)于持續(xù)淹水,稻田烤田可顯著抑制水稻生長(zhǎng)期 CH4排放。水稻生長(zhǎng)季持續(xù)淹水造成稻田極端厭氧,有利于 CH4的產(chǎn)生排放;相反,間隙灌溉模式下烤田增加土壤通透性,土壤中原有的還原狀態(tài)被破壞,土壤Eh迅速增加,土壤CH4的生成受到限制[6];烤田期間土壤氧化CH4能力的提高是導(dǎo)致CH4排放減少的另一個(gè)原因[7-8]。然而有關(guān)間隙灌溉抑制稻田 CH4排放的微生物機(jī)理尚不清楚??蒯尫适羌冗m應(yīng)作物全生長(zhǎng)季不同生育階段氮素營(yíng)養(yǎng)的需求,而又不使土壤中剩余無(wú)機(jī)氮濃度過(guò)高的一種可控釋放氮肥。目前有關(guān)控釋肥對(duì)稻田 CH4排放影響的研究結(jié)果不一致。李方敏等[9]大田試驗(yàn)研究表明,稻季控釋肥處理CH4排放量是尿素處理的2~3倍;林匡飛等[10]兩季稻試驗(yàn)表明控釋肥施用均顯著降低50% 左右的早、晚稻CH4排放量;筆者前期研究發(fā)現(xiàn)稻季尿素處理和控釋肥處理 CH4排放量之間無(wú)顯著差異[11]。然而有關(guān)控釋肥施用對(duì)稻田土壤微生物種群的影響,尤其是對(duì)與 CH4排放相關(guān)的功能微生物種群的了解很少。羅蘭芳等[12]研究表明,短期施用控釋氮肥的稻田土壤中細(xì)菌、真菌和放線菌數(shù)量明顯高于不施氮處理;土壤氨化細(xì)菌、反硝化細(xì)菌的數(shù)量比尿素處理低;但控釋氮肥處理的周年土壤細(xì)菌、放線菌數(shù)量明顯高于尿素處理,真菌數(shù)量略低于尿素處理,說(shuō)明控釋肥能明顯增加土壤微生物的數(shù)量。劉蕊等[13]發(fā)現(xiàn)控釋尿素提高了小麥近根區(qū)土壤微生物的功能多樣性和活性,促進(jìn)了小麥近根區(qū)養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化和循環(huán)。張怡等[14]研究發(fā)現(xiàn)控釋肥增加了覆膜栽培稻田土壤細(xì)菌數(shù)量,提高了土壤微生物生物量氮。以上研究均采用傳統(tǒng)的平板培養(yǎng)法,對(duì)土壤微生物的認(rèn)識(shí)十分有限。近年來(lái),隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,基于16S rDNA基因及其他功能基因的非培養(yǎng)技術(shù),包括聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),克隆文庫(kù)技術(shù)(Clone)和核酸定量技術(shù)(real-time PCR)的出現(xiàn)為揭示自然環(huán)境中微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性的分子生態(tài)學(xué)研究開(kāi)辟了一個(gè)全新的研究平臺(tái)[15]。
本研究通過(guò)采集稻季田間原位試驗(yàn)新鮮土樣,采用核酸定量技術(shù)(qPCR)和末端限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性技術(shù)(T-RFLP),研究間隙灌溉和控釋肥施用對(duì)與CH4排放相關(guān)的土壤微生物群落豐度和結(jié)構(gòu)的影響,探討不同水肥管理?xiàng)l件下稻田CH4排放的微生物機(jī)理,從而為農(nóng)田系統(tǒng)溫室氣體減排提供理論和實(shí)踐依據(jù)。
供試土壤是采自于2011年江蘇省句容市行香鎮(zhèn)(31°58′N, 119°18′E)水稻生長(zhǎng)季田間原位新鮮土。試驗(yàn)地屬北亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū),年平均氣溫15.1℃,年平均降雨量為1 100~1 200 mm。試驗(yàn)土壤為發(fā)育于下蜀黃土的爽水性水稻土,其基本理化性質(zhì)為:pH 6.91,有機(jī)碳含量為18.9 g/kg,全N含量為1.2 g/kg,砂粒(2~0.02 mm)14%,粉粒(0.02~0.002 mm)69%,黏粒(<0.002 mm)17%,土壤WHC為 55%。
試驗(yàn)共設(shè)3個(gè)處理:①對(duì)照處理(CK):不施氮肥;②尿素處理(U):稻季尿素施用量為N 240 kg/hm2,麥季尿素施用量為N 200 kg/hm2;③控釋肥處理(C):與尿素處理相同施氮量。本試驗(yàn)所施用的控釋肥為山東金正大生態(tài)工程股份有限公司生產(chǎn)的可降解樹(shù)脂包膜尿素肥料,含氮量為42%。小區(qū)面積均為3 m ×5 m,每個(gè)處理3次重復(fù),隨機(jī)區(qū)組排列。
田間管理措施與當(dāng)?shù)剞r(nóng)民的大田管理相同。稻季尿素按基肥∶分蘗肥∶穗肥為 50%∶25%∶25% 施用(施用時(shí)間分別為2011年7月2日、7月22日和8月20日);控釋肥作為基肥一次性施入。所有處理均施用450 kg/hm2的過(guò)磷酸鈣和225 kg/hm2的氯化鉀,作為基肥一次性施入。水稻品種為華粳3號(hào),
于7月2日移栽(水稻移栽密度為24穴/m),11月6日收割。水分管理參照當(dāng)?shù)氐咎锍R?guī)管理方式,采用傳統(tǒng)的前期淹水(7月1日—8月1日)、中期烤田(8月2日—8月13日)、后期干濕交替(8月14日—10月7日)和末期排水落干(10月8日—11月6日)的管理模式。
稻季土壤樣品分別在淹水期(7月23日)、烤田初期(8月3日)、烤田末期(8月11日)和水稻成熟前排水落干期(11月4日)采集。各小區(qū)按“S”形多點(diǎn)采樣法取表層(0~15 cm)土壤混合。取200 g新鮮土壤用液氮冷凍后-80 ℃ 保存,供分子生物學(xué)研究。
稱取 0.5 g 土壤用 Fast DNA SPIN KIT 試劑盒(MP Biomedicals, Eschwege, Germany)提取總DNA,操作按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。所提 DNA 質(zhì)量與長(zhǎng)度通過(guò) 1%凝膠電泳檢測(cè)。所得 DNA 均稀釋 10 倍后再進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)。
細(xì)菌16S rRNA基因、古菌16S rRNA基因、產(chǎn)甲烷菌功能基因mcrA和甲烷氧化菌功能基因pmoA的定量PCR分析均采用SYBR Green染色法。各基因定量PCR所用的引物和參考文獻(xiàn)如表1所示。
表1 各目標(biāo)基因定量PCR所用引物及參考文獻(xiàn)Table 1 Primers and references used in qPCR
根據(jù)不同處理下古菌 T-RFLP 圖譜的差異研究間隙灌溉和控釋肥施用對(duì)稻田土壤古菌群落結(jié)構(gòu)的影響。采用正向引物為 109f,反向引物為 915r[16],其中反向引物 5′ 端用 6-羧基二乙酸熒光素(FAM)標(biāo)記的古菌通用引物擴(kuò)增古菌 16S rRNA 片段[17]。擴(kuò)增后的產(chǎn)物用TaqI進(jìn)行消化酶切,酶切產(chǎn)物用ABI 3130 DNA sequencer(Applied Biosystems, Darmstadt, Germany)進(jìn)行自動(dòng)測(cè)序分析。T-RFLP圖譜中每一個(gè)限制性片段(T-RF)作為一個(gè) OTU(operational taxonomic unit),T-RFs片段大小 ±1 bp是同一個(gè)OTU。
采用 SPSS 13.0 for Windows(SPSS Inc., USA)軟件對(duì)不同處理的功能基因數(shù)目進(jìn)行顯著性差異分析(One-way ANOVA)。采用R3.0.0軟件對(duì)不同處理古菌 T-RFs片段結(jié)構(gòu)進(jìn)行典型相關(guān)性分析(canonical correspondence analysis,CCA)。
圖 1表示稻季不同水分管理時(shí)期土壤細(xì)菌、古菌、產(chǎn)甲烷菌(mcrA)和甲烷氧化菌(pmoA)群落豐度變化。土壤中檢測(cè)到的細(xì)菌數(shù)量多于古菌,介于2.1×109~6.0×109copies/g干土之間。隨著水稻生長(zhǎng),各處理細(xì)菌數(shù)量逐漸降低。與不施氮肥的對(duì)照處理相比,在水稻生長(zhǎng)前期的淹水期、烤田期和烤田末期,施用尿素和控釋肥均促進(jìn)細(xì)菌數(shù)量增加,其中尿素處理細(xì)菌數(shù)量高于控釋肥處理;而在水稻收獲前的落干期,施用尿素降低細(xì)菌數(shù)量,施用控釋肥對(duì)細(xì)菌數(shù)量沒(méi)有明顯影響。檢測(cè)到的古菌數(shù)量在 1.3×108~3.8×108copies/g干土之間,隨著水稻生長(zhǎng),各處理古菌數(shù)量逐漸增加。與不施氮肥的對(duì)照處理相比,施用尿素和控釋肥均降低稻季古菌數(shù)量;與尿素相比,施用控釋肥增加土壤中古菌數(shù)量。
產(chǎn)甲烷菌(mcrA)數(shù)量分別介于 5.0×106~2.1×107copies/g干土之間??咎锍跗诤涂咎锬┢诘漠a(chǎn)甲烷菌數(shù)量均小于淹水期和收獲前的落干期。在淹水期,水稻正處于幼苗期,施用尿素和控釋肥均促進(jìn)產(chǎn)甲烷菌數(shù)量增加,隨著水稻生長(zhǎng),氮肥施用逐漸抑制產(chǎn)甲烷菌生長(zhǎng)。在水稻收獲前的落干期期,尿素和控釋肥均顯著抑制產(chǎn)甲烷菌生長(zhǎng),其中控釋肥處理產(chǎn)甲烷菌數(shù)量高于尿素處理。甲烷氧化菌(pmoA)數(shù)量介于 1.2× 107~4.2×107copies/g干土之間,且隨著水稻的生長(zhǎng)而增加。在水稻生長(zhǎng)前期的淹水期、烤田初期和末期,尿素施用抑制甲烷氧化菌生長(zhǎng),隨著水稻的生長(zhǎng),在水稻收獲前的落干期,尿素施用促進(jìn)甲烷氧化菌生長(zhǎng);在整個(gè)稻季,控釋肥施用抑制甲烷氧化菌生長(zhǎng),但其抑制作用小于尿素處理。
圖1 稻季土壤微生物的群落豐度Fig. 1 Abundances of soil microorganisms during the rice growing season
根據(jù)毛細(xì)管凝膠電泳分離后所得到的有效T-RF數(shù)目來(lái)確定樣品中古菌種群數(shù),每個(gè)T-RF所對(duì)應(yīng)峰的面積反映了該種群的豐度,而每個(gè)不同長(zhǎng)度 T-RF的峰面積在所有T-RF的峰面積總和中的比例可以反映這個(gè)片斷在酶切產(chǎn)物中的相對(duì)豐度,從而間接反映出這個(gè)片斷所代表的物種在微生物群落中的相對(duì)豐度。圖2表示水稻不同生長(zhǎng)時(shí)期古菌群落組成的T-RF相對(duì)豐度變化。
由圖2可知,整個(gè)水稻生長(zhǎng)季,土壤古菌群落結(jié)構(gòu)相似性較高,優(yōu)勢(shì)T-RFs長(zhǎng)度為184 bp和391 bp,相對(duì)豐度分別是23%~55% 和11%~26%。184 bp片段在處于水稻生長(zhǎng)前期的淹水期和烤田初期相對(duì)豐度較高(45%~55%),但隨著烤田的進(jìn)行逐漸下降,在烤田末期和水稻收獲前的落干期僅占23%~30%;而391bp片段逐漸增加,其相對(duì)豐度由12%~18% 增至23%~26%,說(shuō)明在水稻生長(zhǎng)季,隨著間隙灌溉的進(jìn)行,古菌群落結(jié)構(gòu)處于動(dòng)態(tài)變化中。圖3所示為利用典型相關(guān)性分析(CCA)研究間隙灌溉和氮肥施用對(duì)土壤古菌群落結(jié)構(gòu)的影響。CCA分析表明間隙灌溉顯著影響土壤古菌群落結(jié)構(gòu)(P<0.001),其中淹水期和烤田前期、烤田末期、收獲前落干期的土壤古菌群落聚集于3個(gè)不同區(qū)域。而控釋肥和尿素施用對(duì)土壤古菌群落結(jié)構(gòu)沒(méi)有明顯影響,不施氮處理、尿素處理和控釋肥處理土壤古菌群落聚集區(qū)域沒(méi)有明顯規(guī)律。
圖2 稻季土壤古菌的群落組成Fig. 2 Archaeal community composition in the soils during the rice growing season
圖3 稻季土壤古菌群落結(jié)構(gòu)的典型性對(duì)應(yīng)分析(CCA)Fig. 3 Canonical correspondence analysis (CCA) of archaeal community composition in the soils during the rice growing season
土壤微生物在稻田 CH4的產(chǎn)生和排放中發(fā)揮著重要作用。稻田 CH4排放包括 CH4產(chǎn)生、再氧化和傳輸3個(gè)過(guò)程[3],其中前兩個(gè)過(guò)程都與產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌數(shù)量及活性密切相關(guān)[5]。陳中云等[23]研究發(fā)現(xiàn)水稻田土壤的甲烷排放量受到甲烷氧化菌、產(chǎn)甲烷菌種群數(shù)量及其活性及土壤理化性狀的影響。結(jié)合筆者2011年在本原位試驗(yàn)地所測(cè)得的稻季CH4排放數(shù)據(jù)(表2)[11],我們發(fā)現(xiàn)稻田CH4排放量與土壤微生物豐度之間存在顯著相關(guān)性(表 3)。稻季不同生長(zhǎng)季CH4排放量與相應(yīng)階段的古菌和產(chǎn)甲烷菌數(shù)量之間均存在極顯著的正相關(guān)關(guān)系(P<0.01),這與以往研究結(jié)果一致[23-25]。因此,控制農(nóng)田產(chǎn)甲烷菌可以有效減少CH4排放量。
表2 稻季CH4排放量Table 2 CH4 emission during the rice growing season
甲烷氧化菌生長(zhǎng)在“通氣-厭氣”界面,可氧化CH4,消耗大量CH4[26-27]。本研究中稻季CH4排放量與甲烷氧化菌數(shù)量呈顯著正相關(guān)關(guān)系(表 3)。以往研究表明,土壤高濃度 CH4會(huì)促進(jìn)甲烷氧化菌的生長(zhǎng)和活性[28-29]。Zhang等[6]在本試驗(yàn)地的研究表明,CH4產(chǎn)生潛勢(shì)對(duì)稻田 CH4排放量的影響較大,而 CH4氧化潛勢(shì)對(duì)其影響較小。本研究中,由于產(chǎn)甲烷菌數(shù)量的增加促進(jìn) CH4產(chǎn)生,而高濃度的CH4含量同時(shí)又促進(jìn)甲烷氧化菌的生長(zhǎng),產(chǎn)甲烷菌數(shù)量增加對(duì) CH4產(chǎn)生的促進(jìn)作用強(qiáng)于甲烷氧化菌數(shù)量增加對(duì) CH4氧化的促進(jìn)作用,因此產(chǎn)甲烷菌與甲烷氧化菌的數(shù)量同時(shí)與CH4排放呈正相關(guān)關(guān)系。
表3 稻季CH4排放量與土壤微生物豐度的相關(guān)性Table 3 Correlation analysis of CH4 emissions and the abundance of soil microbial communities
隨著人們節(jié)水意識(shí)的提高,各種水稻節(jié)水灌溉技術(shù),如“間隙灌溉”、“控制灌溉”“薄淺濕曬”等灌溉模式得到了大面積的推廣應(yīng)用。前期淹水、中期烤田(通??咎?~10 d)、后期干濕交替(約每周灌溉1 次、期間出現(xiàn)土面落干狀態(tài))至水稻收獲的間隙灌溉模式是一項(xiàng)廣泛推廣的農(nóng)業(yè)措施。大量研究表明,相對(duì)于持續(xù)淹水,稻田烤田可顯著抑制水稻生長(zhǎng)期CH4排放[6-8],然而有關(guān)間隙灌溉模式對(duì)稻田土壤產(chǎn)甲烷微生物群落結(jié)構(gòu)和功能影響的研究較少。本研究中土壤細(xì)菌、古菌、產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌的群落豐度均隨著間隙灌溉的進(jìn)行和水稻的生長(zhǎng)而處于動(dòng)態(tài)變化中。Asakawa和Hayano[30]采用MPN法發(fā)現(xiàn)產(chǎn)甲烷菌的數(shù)量在整個(gè)稻麥生長(zhǎng)季保持恒定;李大明等[25]研究發(fā)現(xiàn)在水稻生長(zhǎng)旺盛期(分蘗期)產(chǎn)甲烷菌的數(shù)量顯著高于其他時(shí)期;而 Ma 等[31]通過(guò)研究不同水分管理方式對(duì)稻田產(chǎn)甲烷菌數(shù)量和結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),根際土壤中古菌的數(shù)量在水稻生長(zhǎng)后期有明顯的增加,與持續(xù)淹水相比,干濕交替水分管理方式顯著降低稻田產(chǎn)甲烷菌數(shù)量,增加稻田甲烷氧化菌數(shù)量。本研究中稻季的水分管理參照當(dāng)?shù)氐咎锍R?guī)管理方式,采用前期淹水、中期烤田、后期干濕交替和末期排水落干的管理模式,為了有效控制水稻分蘗,烤田在水稻生長(zhǎng)的旺期分蘗期進(jìn)行。在淹水期,水稻正處于幼苗期,厭氧環(huán)境有利于產(chǎn)甲烷菌的生長(zhǎng);在烤田期,雖然水稻生長(zhǎng)旺盛,但烤田增加了土壤通氣性,破壞了產(chǎn)甲烷菌的生存條件,產(chǎn)甲烷菌數(shù)量下降,達(dá)到最低值;隨著后期干濕交替的進(jìn)行,產(chǎn)甲烷菌所需厭氧環(huán)境逐漸恢復(fù),根系分泌物的大量產(chǎn)生又為產(chǎn)甲烷菌的增加提供了充足的反應(yīng)底物,產(chǎn)甲烷菌數(shù)量逐漸增加,在水稻收獲前的落干期達(dá)到最大值。甲烷氧化菌數(shù)量隨著水稻生長(zhǎng)而逐漸增加,在收獲前的落干期達(dá)到最大值,烤田對(duì)甲烷氧化菌的數(shù)量沒(méi)有顯著影響,這可能是由于烤田期土壤銨態(tài)氮大部分轉(zhuǎn)化為硝態(tài)氮,盡管烤田有利于甲烷氧化菌的生長(zhǎng),但硝態(tài)氮對(duì)甲烷氧化菌有一定的脅迫作用[32]。
水稻土中的產(chǎn)甲烷古菌群落主要由甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae),甲烷八疊球菌科(Methanosarcinaceae),甲烷鬃菌科(Methanosaetaceae),甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae)和 RC-I,以及相當(dāng)一部分在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)上沒(méi)有確定分類的種群[4]。本研究通過(guò)T-RFLP研究稻季土壤古菌群落組成和季節(jié)變化,結(jié)果表明,水稻生長(zhǎng)季古菌群落優(yōu)勢(shì)片段是 184bp和391bp。Ma等[31]研究發(fā)現(xiàn),水稻生長(zhǎng)季內(nèi),水稻土產(chǎn)甲烷古菌群落結(jié)構(gòu)非常穩(wěn)定,且不受間歇性排水的影響。Watanabe等[33]發(fā)現(xiàn)無(wú)論是在淹水狀況下的水稻種植期,還是干旱的小麥種植期,產(chǎn)甲烷古菌群落結(jié)構(gòu)非常穩(wěn)定。而本研究CCA分析表明間隙灌溉顯著影響整個(gè)水稻生長(zhǎng)季古菌群落結(jié)構(gòu),其中處于水稻生長(zhǎng)前期的淹水期和烤田前期群落結(jié)構(gòu)相似,但隨著烤田的進(jìn)行和水稻的生長(zhǎng),古菌184bp的T-RF相對(duì)豐度逐漸下降,391bp的T-RF相對(duì)豐度逐漸上升。根據(jù)已有研究中古菌 16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[4],184bp的T-RF通常代表乙酸發(fā)酵型產(chǎn)甲烷菌(Methanosarcinaceae),391bp的 T-RF通常代表氫營(yíng)養(yǎng)型產(chǎn)甲烷菌(RC-I),表明水稻生長(zhǎng)季內(nèi),乙酸型產(chǎn)甲烷菌相對(duì)豐度最高,隨著間隙灌溉的進(jìn)行和水稻的生長(zhǎng),乙酸發(fā)酵型產(chǎn)甲烷菌相對(duì)豐度逐漸增加,而氫營(yíng)養(yǎng)型產(chǎn)甲烷菌相對(duì)豐度逐漸下降。Penning等[34]培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,隨著土壤有機(jī)質(zhì)逐漸分解產(chǎn)生豐富的乙酸,則 CH4產(chǎn)生主要由乙酸發(fā)酵而來(lái),隨著土壤中乙酸被大量消耗,乙酸發(fā)酵產(chǎn)甲烷途徑逐漸減弱,而H2/CO2還原產(chǎn)甲烷途徑逐漸增強(qiáng)。Zhang等[8]在本試驗(yàn)地研究間隙灌溉下稻田CH4產(chǎn)生途徑的季節(jié)變化,結(jié)果表明,隨著間隙灌溉的進(jìn)行,乙酸發(fā)酵產(chǎn)甲烷途徑由 70% 以上下降到 50% 左右。因此我們可以得到結(jié)論,水稻生長(zhǎng)季內(nèi),乙酸發(fā)酵型產(chǎn)甲烷菌和氫營(yíng)養(yǎng)型產(chǎn)甲烷菌相對(duì)豐度的變化決定了 CH4產(chǎn)生途徑的變化。
控釋肥作為一種新型肥料,不僅可以提高肥料利用率,有效防止環(huán)境污染,而且具有提高土壤酶活性、增加土壤微生物數(shù)量、降低環(huán)境污染等優(yōu)點(diǎn)[35]。孟慶英等[36]研究結(jié)果表明,施用肥料的各個(gè)處理土壤微生物數(shù)量均高于不施肥處理,其中控釋肥施用有利于增加土壤細(xì)菌、土壤氮素含量及玉米產(chǎn)量;羅蘭芳等[13]研究發(fā)現(xiàn),短期施用控釋氮肥稻田土壤的細(xì)菌數(shù)量明顯高于不施氮處理,周年土壤細(xì)菌明顯高于尿素處理,土壤中大多數(shù)微生物數(shù)量與土壤氮素養(yǎng)分含量呈正相關(guān)。氮肥養(yǎng)分釋放特性不同,其對(duì)土壤中微生物數(shù)量及土壤中氮素產(chǎn)生影響不同[37]。本研究表明,與不施氮處理相比,施用尿素降低稻季收獲期細(xì)菌數(shù)量,而施用控釋肥增加其數(shù)量,這可能是由于尿素施用量過(guò)多會(huì)導(dǎo)致高濃度氮的脅迫作用和改變土壤pH,從而影響細(xì)菌的數(shù)量和活性,而控釋肥可調(diào)節(jié)養(yǎng)分釋放模式,滿足作物全生育期對(duì)氮的生理需求,更利于提高土壤氮素含量為微生物創(chuàng)造良好的生存環(huán)境,刺激微生物的生長(zhǎng)和活性。
氮肥施用對(duì)土壤產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌的影響較為復(fù)雜。Schimel[38]研究表明氮促進(jìn)植株生長(zhǎng),為CH4產(chǎn)生提供前體基質(zhì),從而促進(jìn)產(chǎn)甲烷菌的生長(zhǎng)和活性;而許靜等[39]研究表明高氮肥施用在一定程度上會(huì)抑制產(chǎn)甲烷菌的生長(zhǎng),降低其數(shù)量。本研究中,施用氮肥降低稻季古菌和產(chǎn)甲烷菌豐度,控釋肥的抑制作用小于尿素,這可能是由于尿素施用后通過(guò)硝化作用產(chǎn)生硝態(tài)氮,提升了土壤氧化還原電位,間接抑制產(chǎn)甲烷古菌的生長(zhǎng)。銨態(tài)氮肥對(duì)土壤甲烷氧化菌的影響隨NH4+和CH4濃度的不同而變化[40],本研究中,稻季生長(zhǎng)前期,氮肥施用降低甲烷氧化菌數(shù)量,但稻季收獲期,氮肥施用增加其數(shù)量,這是由于在稻田高內(nèi)源 CH4濃度的條件下,施用銨態(tài)氮肥對(duì)稻田 CH4氧化菌開(kāi)始表現(xiàn)為抑制作用,隨著時(shí)間的延長(zhǎng)和銨態(tài)氮的逐漸消失,高濃度 CH4和銨態(tài)氮的存在促進(jìn)了甲烷氧化菌的生長(zhǎng)[41]。以上分析表明稻季施氮處理降低CH4排放量(表2)主要是由于氮肥對(duì)產(chǎn)甲烷菌生長(zhǎng)的抑制作用及其對(duì)水稻生長(zhǎng)前期甲烷氧化菌生長(zhǎng)的促進(jìn)作用。水稻生長(zhǎng)前期,與尿素相比,施用控釋肥對(duì)產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌數(shù)量沒(méi)有明顯影響,表3顯示尿素處理和控釋肥處理 CH4排放量之間無(wú)顯著差異,這進(jìn)一步說(shuō)明稻田 CH4排放量與產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌數(shù)量的顯著相關(guān)性。
研究表明,農(nóng)業(yè)管理措施如施肥等會(huì)對(duì)土壤微生物產(chǎn)生重要的脅迫作用。長(zhǎng)期以來(lái),囿于培養(yǎng)方法,人們對(duì)土壤微生物多樣性特別是古菌和細(xì)菌多樣性所知甚少。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者們結(jié)合DGGE和RFLP等分子標(biāo)記技術(shù)研究了長(zhǎng)期定位施肥對(duì)土壤產(chǎn)甲烷古菌和氨氧化古菌群落結(jié)構(gòu)的影響[42],但尚無(wú)關(guān)于控釋肥施用對(duì)稻季古菌群落結(jié)構(gòu)影響的報(bào)道。Watanabe等[33]研究發(fā)現(xiàn)土壤中的產(chǎn)甲烷古菌主要受土壤類型的影響,而受土壤施肥制度與作物種植方式的影響相對(duì)較小,原因可能與產(chǎn)甲烷古菌主要介導(dǎo)了淹水土壤中丙酸鹽的厭氧氧化有關(guān)。本研究通過(guò)采用T-RFLP手段研究氮肥施用對(duì)水稻生長(zhǎng)季土壤古菌群落結(jié)構(gòu)的影響,得到與上述研究相似的結(jié)果,雖然在水稻生長(zhǎng)季,古菌群落結(jié)構(gòu)處于動(dòng)態(tài)變化中,但控釋肥和尿素施用對(duì)土壤古菌群落結(jié)構(gòu)沒(méi)有明顯影響。辜運(yùn)富等[43]研究表明石灰性紫色土上種植水稻和小麥會(huì)對(duì)土壤中的古菌群落結(jié)構(gòu)造成明顯影響,不同施肥制度對(duì)土壤古菌群落結(jié)構(gòu)相似性具有明顯影響。目前有關(guān)施用無(wú)機(jī)肥對(duì)土壤微生物多樣性的影響報(bào)道存在矛盾之處,可能與無(wú)機(jī)肥的種類、施用量和施用時(shí)間長(zhǎng)短、土壤類型和利用方式等因素有關(guān)。以往研究表明,控釋肥養(yǎng)分采用緩慢釋放的形式,改變了普通速溶肥料養(yǎng)分供應(yīng)集中的特點(diǎn),提高養(yǎng)分利用率的同時(shí)可減少施肥量,能減輕施肥對(duì)環(huán)境的污染[44]。本研究中控釋肥施用量與尿素施用量相同,在保證作物產(chǎn)量的前提下減少控釋肥施用量會(huì)對(duì)土壤微生物群落,尤其是功能微生物,產(chǎn)生不同的影響嗎?因此,有關(guān)控釋肥施用對(duì)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能的影響仍需進(jìn)一步研究。
本研究通過(guò)采集水稻生長(zhǎng)季田間原位試驗(yàn)新鮮土樣,采用核酸定量技術(shù)和末端限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性技術(shù),研究間隙灌溉和控釋肥施用對(duì)稻田土壤產(chǎn)甲烷微生物群落豐度和結(jié)構(gòu)的影響,以探討間隙灌溉和控釋肥施用影響稻田 CH4排放的微生物機(jī)理。結(jié)果表明,稻季CH4排放量與古菌、產(chǎn)甲烷菌(mcrA基因)和甲烷氧化菌(pmoA基因)數(shù)量均呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,而與細(xì)菌數(shù)量無(wú)顯著相關(guān)性。在間隙灌溉水分管理方式下,稻田土壤產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌數(shù)量呈現(xiàn)明顯的季節(jié)變化,其中烤田抑制產(chǎn)甲烷菌生長(zhǎng),而對(duì)甲烷氧化菌數(shù)量沒(méi)有顯著影響。與尿素相比,施用控釋肥增加了稻田土壤細(xì)菌、古菌和產(chǎn)甲烷菌數(shù)量,降低了甲烷氧化菌數(shù)量。土壤古菌群落的優(yōu)勢(shì) T-RFs長(zhǎng)度為184bp和391bp,其中184bp片段的相對(duì)豐度隨著間隙灌溉的進(jìn)行逐漸降低為主,而391bp片段逐漸增加。CCA分析表明間隙灌溉顯著影響土壤古菌
群落結(jié)構(gòu),而控釋肥施用對(duì)土壤古菌群落結(jié)構(gòu)沒(méi)有明顯影響。
[1] Yan X Y, Yagi K, Akiyama H, et al. Statistical analysis of the major variables controlling methane emission from rice fields[J]. Global Change Biology, 2005, 11: 1131-1141
[2] International Rice Research Institute (IRRI). RiceStat database[DB]. Los Ba?os, Philippines, 2004, http://www.irri.org/science/ricestat/index.asp
[3] 蔡祖聰, 徐華, 馬靜. 稻田生態(tài)系統(tǒng)CH4和N2O排放[M].合肥: 中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)出版社, 2009, 70: 155-160
[4] Conrad R, Klose M, Lu Y, et al. Methanogenic pathway and archaeal communities in three different anoxic soils amended with rice straw and maize straw[J]. Frontiers in Microbiology, 2012, 3: 4-doi: 10.3389/fmicb.2012.00004.[5] Theisen A R, Ali M H, Radajewski S, et al. Regulation of methane oxidation in the facultative methanotrophMethylocella silvestrisBL2[J]. Molecular Microbiology,2005, 58(3): 682-692
[6] Zhang G B, Liu G, Zhang Y, et al. Methanogenic pathway and fraction of CH4oxidized in paddy fields: Seasonal variation and effect of water management in winter fallow season[J]. PLoS ONE, 2013, 8(9): e73982. doi:10.1371/journal.pone.0073982.
[7] Jia Z J, Sugano A, Asari N, et al. Molecular characterrization of methane-oxidizing bacteria associated with rice straw decomposition in a rice field[J]. Soil Science and Plant Nutriention, 2007, 53(6): 729-739
[8] Zhang G B, Ji Y, Ma J, et al. Intermittent irrigation changes production, oxidation, and emission of CH4in paddy fields determined with stable carbon isotope technique[J]. Soil Biology and Biochemistry, 2012, 52: 108-116
[9] 李方敏, 樊小林, 劉芳, 等. 控釋肥料對(duì)稻田氧化亞氮排放的影響[J]. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào), 2004, 15(11): 2170-2174[10] 林匡飛, 項(xiàng)雅玲, 姜達(dá)炳, 等. 湖北地區(qū)稻田甲烷排放量及控制措施的研究[J]. 農(nóng)業(yè)環(huán)境保護(hù), 2000, 19(5):267-270
[11] Ji Y, Liu G, Ma J, et al. Effects of urea and controlled release urea fertilizers on methane emission from paddy fields: A multi-year field study. Pedosphere, 2014, 24(5):662-673
[12] 羅蘭芳, 鄭圣先, 廖育林, 等. 控釋氮肥對(duì)稻田土壤微生物的影響及其與土壤氮素肥力的關(guān)系[J]. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 2007, 33(5): 608-613
[13] 劉蕊. 控釋尿素對(duì)土壤氨揮發(fā)、氮素養(yǎng)分和微生物多樣性及小麥產(chǎn)量的影響[D]. 泰安: 山東農(nóng)業(yè)大學(xué), 2010
[14] 張怡, 呂世華, 馬靜, 等. 控釋肥料對(duì)覆膜栽培稻田N2O排放的影響[J]. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào), 2014, 25(3): 769-775
[15] Heid C A, Srevrns J. Real time quantitative PCR[J].Genome Research, 1996, 6: 986-994
[16] Grosskopf R, Janssen P H, Liesack W. Diversity and structure of the methanogenic community in anoxic rice paddy soil microcosms as examined by cultivation and direct 16S rRNA gene sequence retrieval[J]. Applied and Environmental Microbiology, 1998, 64: 960-969
[17] Chin K J, Lukow T, Conrad R. Effect of temperature on structure and function of the methanogenic archaeal community in an anoxic rice field soil[J]. Applied and Environmental Microbiology, 1999, 65: 2341-2349
[18] Burggraf S, Huber H, Stetter K O. Reclassification of the crenarchaeal orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data[J]. International Journal of Systematic Bacteriology, 1997, 47(3): 657-660
[19] Lane D J. 16S/23S rRNA sequencing // Stackebrandt E,Goodfellow M. Nucleic acid techniques in bacterial systematics[M]. New York: Wiley, 1991: 115-147
[20] Angel R, Matthies D, Conrad R. Activation of methanogenesis in arid biological soil crusts despite the presence of oxygen[J]. PLoS ONE, 2011, 6: e20453-doi:10.1371/journal. pone.0020453.
[21] Angel R, Claus P, Conrad R. Methanogenic archaea are globally ubiquitous in aerated soils and become active under wet anoxic conditions[J]. ISME Journal, 2012, 6:847-862
[22] Costello A M, Lidstrom M E. Molecular characterization of functional and phylogenetic genes from natural populations of methanotrophs in lake sediments[J]. Applied and Environmental Microbiology, 1999, 65(11): 5066-5074
[23] 陳中云, 閔航, 陳美慈, 等. 不同水稻土甲烷氧化菌和產(chǎn)甲烷菌數(shù)量與甲烷排放量之間相關(guān)性的研究[J]. 生態(tài)學(xué)報(bào), 2001, 21(9): 1499-1504
[24] Conrad R. Soil microbial communities and global climate change-methanotrophic and methanogenic communities as paradigms // VanElsas J D, Jansson J, Trevors J T. Modern soil microbiology[M]. 2 ed. Boca Raton (FL): CRC Press,2007: 263-282
[25] 李大明, 成艷紅, 劉滿強(qiáng), 等. 雙季稻田甲烷排放與土壤產(chǎn)甲烷菌群落結(jié)構(gòu)和數(shù)量關(guān)系研究[J]. 農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào), 2013, 32(4): 866-873
[26] Bodelier P L E, Frenzel E F. Contribution of methanotrophic and nitrifying bacteria to CH4and NH4+oxidation in the rhizosphere of rice plants as determined by new methods of discrimination[J]. Applied and Environmental Microbiology, 1999, 65(5): 1826-1833
[27] Holmes A J, Costello A. Evidence that particulate methane monooxygenase and ammonia monooxygenase may be evolutionarily related[J]. FEMS Microbiology Letters,1995, 132(3): 203-208
[28] Arif M A S, Houwen F, Verstraete W. Agricultural factors affecting methane oxidation in arable soil[J]. Biology and Fertility of Soils, 1996, 21: 95-102
[29] Bender M, Conrad R. Effect of CH4concentrations and soil conditions on the induction of CH4oxidation activity[J].Soil Biology and Biochemistry, 1995, 27(12): 1517-1527
[30] Asakawa S, Hayano K. Populations of methanogenic bacteria in paddy field soil under double cropping conditions (rice-wheat)[J]. Biology and Fertility of Soils,1995, 20: 113-117
[31] Ma K, Conrad R, Lu Y H. Responses of methanogenmcrAgenes and their transcripts to an alternate dry/wet cycle of paddy field soil[J]. Applied and Environmental Microbiology, 2012; 78(2): 445-450
[32] Boer W D, Duyt S, Laanbrock H J. Autotrophic nitrifycation in a fertilized acid health soil[J]. Soil Biology and Biochemistry, 1988, 20: 845-850
[33] Watanabe T, Kimura M, Asakawa S. Community structure of methanogenic archaea in paddy field soil under double cropping (rice-wheat)[J]. Soil Biology and Biochemistry,2006, 38: 1264-1274
[34] Penning H, Claus P, Casper P, et al. Carbon isotope fractionation during acetoclastic methanogenesis by Methanosaeta conciliiin culture and a lake sediment[J]. Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72: 5648-5652
[35] Trenkel M E. Controlled-release and stabilized fertilizers in agriculture[M]. Pairs: Published by international Fertilizer Industry Association, 1997
[36] 孟慶英 , 朱寶國(guó), 王囡囡, 等. 控釋尿素與常規(guī)尿素不同配施對(duì)根際土壤微生物數(shù)目、土壤氮素及玉米產(chǎn)量的影響[J]. 土壤通報(bào), 2012, 43(5): 1173-1176
[37] Yuan Q, Liu P F, Lu Y H. Differential responses ofnirK-andnirS-carrying bacteria to denitrifying conditions in the anoxic rice field[J]. Environmental Microbiology Reports,2012, 4(1): 113-122
[38] Schimel J. Global change: Rice, microbes and methane[J].Nature, 2000, 403: 375-377
[39] 許靜, 嚴(yán)陳, 林毅, 等. FACE對(duì)水稻土產(chǎn)甲烷古菌豐度的影響[J]. 土壤學(xué)報(bào), 2012, 49(6): 1248-1251
[40] Oneill J G, Wilkinson J F. Oxidation of ammonia by methane oxidizing bacteria and the effects of ammonia on methane oxidation[J]. Journal of General Microbiology,1977, 100: 407-412
[41] Cai Z C, Xing G X, Yan X Y, et al. Methane and nitrous oxide emissions from rice paddy fields as affected by nitrogen fertilizers and water management[J]. Plant and Soil, 1997, 196(1): 7-14
[42] Peng S Z, Yang S H, Xu J Z, et al. Nitrogen and phosphorus leaching losses from paddy fields with different water and nitrogen managements[J]. Paddy and Water Environment, 2011, 9: 333-342
[43] 辜運(yùn)富, 張小平, 涂仕華, 等. 長(zhǎng)期定位施肥對(duì)石灰性紫色水稻土古菌群落結(jié)構(gòu)的影響[J]. 生物多樣性, 2011,19(3): 369-376
[44] 樊小林, 劉芳, 廖照源, 等. 我國(guó)控釋肥料研究的現(xiàn)狀和展望[J]. 植物營(yíng)養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào), 2009, 15(2): 463-473