王志宇,王國(guó)艷,薛俊龍,張偉業(yè),孫仰介,劉 源
(山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,山西 太原 030032)
大腸桿菌因血清型復(fù)雜而又具較強(qiáng)變異性,接種疫苗效果不佳,因而在生產(chǎn)中多采用抗生素防治。近年來,隨著抗菌藥物的廣泛、持續(xù)應(yīng)用,大腸桿菌耐藥水平隨之提高,尤其是多重耐藥菌株的出現(xiàn),給抗菌治療帶來了困難,給養(yǎng)殖業(yè)造成了一定的經(jīng)濟(jì)損失[1-2]。大腸桿菌的多重耐藥主要是由外膜通透性改變和主動(dòng)外排系統(tǒng)共同作用的結(jié)果。其中,主要是外排泵系統(tǒng)(AcrAB-TolC)[3-8]與多重耐藥有關(guān)。
本研究通過采集近年來山西各地不同的大腸桿菌菌株,在實(shí)驗(yàn)室分離純化培養(yǎng),篩選出30株多重耐藥的菌株作為研究對(duì)象,選取影響大腸桿菌多重耐藥的基因AcrA[9-11],并結(jié)合喹諾酮類耐藥基因qnrA[12-14]和 ESBLs(超廣譜 β- 內(nèi)酰胺酶)[15-16]相關(guān)耐藥基因TEM[17-18]進(jìn)行了初步分子生物學(xué)分析,旨在了解近年來山西省雞源大腸桿菌的耐藥機(jī)理,豐富山西省大腸桿菌病分子流行病學(xué)特征,也為今后生產(chǎn)實(shí)踐中更好地防控大腸桿菌疫病奠定一定基礎(chǔ)。
病料采集于2016—2017年山西省部分地區(qū)疑似大腸桿菌病的病死雞。細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司,PCR擴(kuò)增試劑購自Taraka寶生物(大連);引物合成于生工生物工程(上海)股份有限公司;革蘭陰性需氧菌鑒定板和腸桿菌藥敏板購自上海復(fù)星佰珞生物科技有限公司。
1.2.1 大腸桿菌的培養(yǎng)鑒定及藥敏 從病料采集菌株并分離純化,初步篩選革蘭氏陰性桿菌,使用微生物鑒定藥敏儀(上海復(fù)星佰珞)進(jìn)行菌種鑒定和18種藥敏判讀。
1.2.2 相應(yīng)基因的擴(kuò)增 提取大腸桿菌基因組DNA作為模板,分別使用以下引物進(jìn)行擴(kuò)增,并對(duì)擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行測(cè)序及同源性比較。AcrA:上游引物為 5′-GACGACAAACAGGCCCAACA-3′,下游引物為 5′-TTAAGACTTGGACTGTTCA-3′;qnrA[19]:上游引物為 5′-CCAGGATTTGAGTGACAGC-3′,下游引物為 5′-TCCCAAGGGTTCCAGCA-3′;TEM[20]:上游引物為 5′-GGGGATGAGTATTCAACATTTCC-3′,下游引物:5′-GGGCAGTTACCAATGCTTAATCA-3′。
藥敏結(jié)果表明,30株雞源性致病大腸桿菌對(duì)18種抗生素的17種產(chǎn)生不同程度耐藥,其中,對(duì)β-內(nèi)酰胺類藥物高度耐藥,耐藥率達(dá)70%,對(duì)FQs類藥物耐藥率為60%(表1)。
對(duì)多重耐藥進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果表明,30株大腸桿菌均表現(xiàn)多重耐藥。其中,7株菌耐4種藥,5株菌耐2種藥,耐6種藥和12種藥的菌各3株。每株菌平均耐藥6.5種,最少2種,最多14種(表2)。依據(jù)ELBLs判定方法,共計(jì)14株菌為ELBLs菌株。
表1 大腸桿菌對(duì)18種抗生素的藥敏試驗(yàn)結(jié)果
表2 大腸桿菌多重耐藥性結(jié)果
對(duì)多重耐藥類型進(jìn)行統(tǒng)計(jì),山西各地采集到的30株雞源大腸桿菌中,有23種多重耐藥類型,其中,AMK-TZP-SAM-CZO和CIP-LVX的耐藥型各4株,其他類型的多重耐藥譜出現(xiàn)情況幾乎無重復(fù)(表3)。
表3 大腸桿菌耐藥譜型
以大腸桿菌基因組為模板,對(duì)AcrA基因片段的擴(kuò)增結(jié)果如圖1所示。
從電泳結(jié)果可以看到,所有菌株通過PCR均得到了AcrA基因片段,選取多重耐藥菌株的PCR結(jié)果進(jìn)行膠回收并連接T載體、測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在NCBI進(jìn)行序列比對(duì),同源性達(dá)99%。對(duì)序列的編碼蛋白進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)蛋白編碼沒有改變。由此可知,菌體中的AcrAB功能完整。
由圖2可知,30株雞源大腸桿菌中檢測(cè)到符合目的基因(約592 bp)的共計(jì)11株,通過與藥敏結(jié)果進(jìn)行比對(duì),擴(kuò)增獲得qnrA基因的菌株均對(duì)FQs類藥物耐藥;而另有7株不具備qnrA基因的菌株也對(duì)FQs耐藥。在所有18株對(duì)FQs類耐藥的菌株中,僅有4株單純對(duì)FQs類耐藥,其余14株均不同程度對(duì)其他藥物也產(chǎn)生耐藥。
對(duì)TEM基因片段的擴(kuò)增結(jié)果表明,30株雞源大腸桿菌中檢測(cè)到符合目的基因(約861 bp)的共計(jì)4株(圖3)。根據(jù)PCR結(jié)果和藥敏結(jié)果綜合分析,具有TEM基因的菌株均表現(xiàn)為ESBLs型。而14株ESBLs菌株中僅有4株TEM檢出陽性,占28.5%。
本研究以30株雞源致病性大腸桿菌作為試驗(yàn)組,對(duì)其進(jìn)行藥敏試驗(yàn),結(jié)果表明,山西省雞源致病性大腸桿菌已對(duì)喹諾酮類、氨基糖苷類藥物產(chǎn)生高度耐藥性。其中,喹諾酮類藥物中,環(huán)丙沙星和左氟沙星耐藥率均為60%。選取與之耐藥有關(guān)的基因進(jìn)行分析,菌體染色體中具有遺傳耐藥性的已達(dá)61%,這是由喹諾酮類藥物在長(zhǎng)期的使用過程中導(dǎo)致菌體基因突變等原因造成的。
氨基糖甙類平均耐藥率已達(dá)到55%,該類藥物在生產(chǎn)實(shí)踐中已存在長(zhǎng)期普遍性耐藥。遺傳耐藥性已較為廣泛。
而頭孢類藥物耐藥情況表現(xiàn)為,對(duì)第1代頭孢(頭孢唑林)的耐藥性較高,耐藥率達(dá)到70%;而對(duì)2,3,4代頭孢的耐藥率平均為26.6%。在對(duì)相關(guān)基因進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),具有可遺傳性耐藥的僅占28.5%,其余大部分是由于用藥環(huán)境不當(dāng)(如抗生素的長(zhǎng)期使用、不規(guī)范使用等)激發(fā)菌體主動(dòng)外排機(jī)制活躍而引起,這種情況在用藥環(huán)境改善后會(huì)逐步消除。
從山西省雞源致病性大腸桿菌耐藥情況來看,喹諾酮類和氨基糖甙類由于耐藥水平較高且具有較高遺傳性,因而在實(shí)際生產(chǎn)中建議不作為首選用藥。頭孢藥物中除一代頭孢外,均對(duì)菌體具有一定的藥物敏感性,且其中具有遺傳性耐藥的比率很低,可作為首選用藥推薦使用。
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