王利彬 董爽爽 王燦國 程敦公 李豪圣 劉愛峰 宋健民 劉建軍 劉成 張玉梅 穆平 趙振東 曹新有
摘要:本研究從黑麥中克隆了一個熱激蛋白Hsp90基因,暫命名為ScHsp90-1,并對其序列進行分析。結果顯示,該基因cDNA序列全長2 103 bp,共計編碼700個氨基酸,蛋白質(zhì)分子量約80.47 kD。序列同源性分析表明,ScHsp90-1與小麥、玉米、水稻等物種的熱激蛋白同源性較高;進化樹分析表明ScHsp90-1與小麥的TaHsp90親緣關系最近。利用實時熒光定量PCR技術對其表達特性分析表明,ScHsp90-1對高溫、低溫、高鹽、干旱等非生物脅迫均有響應,其可能是黑麥的一個脅迫相關基因。
關鍵詞:黑麥;熱激蛋白Hsp90;克??;表達分析
中圖分類號:S512.5:Q781文獻標識號:A文章編號:1001-4942(2018)03-0001-05
Abstract In this study, a Hsp90 gene was isolated from rye, named ScHsp90-1.The full cDNA sequence of ScHsp90-1 is 2 103 bp, which encodes 700 amino acids with a predicted molecular mass of 80.47 kD. The sequence analysis showed that ScHsp90-1 had higher homology with that of wheat, maize and rice. The phylogenetic analysis indicated that ScHsp90-1 was especially similar to TaHsp90 from wheat. The real-time quantitative PCR analysis showed that ScHsp90-1 had response to high-temperature, cold, high-salt and drought treatments in rye. These results indicated that ScHsp90-1 gene might be a stress-related gene of rye.
Keywords Rye; Heat-shock protein Hsp90; Cloning; Expression analysis
在受到高溫或其他理化因素脅迫后,生物體內(nèi)的熱激蛋白(heat-shock protein, Hsp)會極速合成并積累,從而參與生物體內(nèi)蛋白的折疊,防止體內(nèi)蛋白聚合[1]。熱激蛋白作為一類分子伴侶蛋白,根據(jù)其分子量大小可分為小分子量Hsps、Hsp60、Hsp70、Hsp90和Hsp110等不同家族。目前對Hsp90的研究相對較多,Hsp90家族在生物體內(nèi)蛋白折疊、降解及各種條件下的生長發(fā)育等方面均起到了十分重要的作用;其底物蛋白也廣泛參與了生物細胞信號的傳導[2]。當生物遭受逆境脅迫時,Hsp90家族基因會迅速做出響應,發(fā)揮其保護作用,阻止相關蛋白變形或功能出現(xiàn)紊亂,進而維持生物的正常生長。
大量研究表明,Hsp90家族基因廣泛參與植物對各類逆境脅迫的應答。擬南芥中7個Hsp90家族基因已經(jīng)被成功克隆,其中AtHsp90.2、AtHsp90.3、AtHsp90.4的蛋白序列相似度達96%以上,功能也有一定的交叉重復[3]。有研究表明,在擬南芥植株中過表達AtHsp90.3,轉基因植株對高鈣離子濃度耐受能力增強,對高溫及重金屬離子的耐受性卻變?nèi)鮗4];過表達AtHsp90.2、AtHsp90.5 和AtHsp90.7,轉基因擬南芥植株對鈣離子濃度的耐受性有所增強,但是對高鹽和干旱的耐受能力卻有所降低[5]。同時,在小麥和水稻上的研究證明,Hsp90在脅迫環(huán)境響應及抗病性中也具有非常重要的作用[6,7]。
黑麥作為小麥的近緣物種之一,有許多可利用的條銹病、腥黑穗病、白粉病等抗性基因,與產(chǎn)量相關的大穗、多小穗性狀,較高的蛋白質(zhì)含量等;并且耐低溫、耐干旱、耐土壤酸性[8]。目前對黑麥DNA重復序列及遺傳連鎖圖譜構建的研究相對較多,而對其優(yōu)異基因的挖掘卻較少。為此,我們利用構建的NTT系統(tǒng)及后差減剔除技術[9],獲得了黑麥熱激蛋白Hsp90家族基因的EST序列,本試驗在前期研究的基礎上克隆到一個基因全長(GenBank accession no. JQ685506.1),暫定名為ScHsp90-1。對ScHsp90-1蛋白序列進行生物信息學分析,進一步明確該基因的序列特征;并通過實時熒光定量PCR技術,對ScHsp90-1基因的表達特性進行研究,明晰ScHsp90-1基因在高溫、低溫、高鹽、干旱等逆境條件下的表達特性,為進一步明晰ScHsp90-1基因可能參與的調(diào)控網(wǎng)絡奠定基礎及為下一步應用于分子育種提供優(yōu)良的候選基因。
1 材料與方法
1.1 植物材料與脅迫處理
將黑麥(AR132)幼苗25℃條件下培養(yǎng)10 d后分別進行不同脅迫處理:(1)干旱:將整株黑麥幼苗置于干燥濾紙上進行干旱處理;(2)低溫:將培養(yǎng)的黑麥幼苗置于4℃培養(yǎng)箱中進行低溫處理;(3)高溫:將培養(yǎng)的黑麥幼苗置于42℃培養(yǎng)箱中進行高溫處理;(4)高鹽:將黑麥幼苗根系完全置于100 mmol/L NaCl溶液中進行高鹽處理;25℃條件下恒溫培養(yǎng)。所有處理分別處理0、1、2、5、12、24 h后取樣,快速置于液氮中,-80℃超低溫保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2 ScHsp90-1基因全長的獲得及特性分析
用RNA提取試劑盒(天根公司,北京)提取黑麥整株RNA,利用AMV反轉錄酶進行反轉錄。根據(jù)我們前期NTT系統(tǒng)及后差減剔除技術獲得的黑麥Hsp90家族基因的EST序列及網(wǎng)上拼接,設計全長引物進行擴增(F: 5′-GCCATGGCGACGGAGACC-3′; R: 5′-GCTTAGTCGACCTCCTCCATCTTGCT-3′)。反應體系50 μL:10×buffer 5 μL,2.5 mmol/L dNTP mix 2 μL,10 μmol/L上下游引物各1 μL,cDNA模板2 μL,高保真Taq酶0.5 μL,ddH2O 38.5 μL。反應條件:95℃變性3 min;95℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸60 s,40個循環(huán)。對擴增產(chǎn)物純化后,連接到pEasy載體上(全式金公司,北京),轉化大腸桿菌感受態(tài)細胞,挑取單克隆進行測序,獲得全長序列利用CLUSTAL X和MEGA 4.1軟件進行分析。
1.3 ScHsp90-1基因表達特性分析
將經(jīng)過干旱、高溫、低溫、高鹽處理的黑麥整株cDNA稀釋50倍為Real-time PCR 反應模板, 設計實時熒光定量PCR引物ScHsp90-1-F(5′-GACCGAGACCTTCGCCTTCC-3′);ScHsp90-1-R(5′-TGGTCATGCCAATGCCGCTGTC-3′)。以Actin基因( F: 5′-TACTCCCTCACAACAACC-3′; R: 5′-GCTCCTGCTCATAATCAA-3′) 為內(nèi)參。根據(jù)RealMasterMix(SYBR Green)試劑盒(天根公司,北京)操作說明書,建立反應體系,每個樣品設3個重復。反應體系:2×Mix 12.5 μL、正向引物 (10 μmol/L)0.5 μL、反向引物 (10 μmol/L) 0.5 μL、模板cDNA 5.0 μL、ddH2O 6.5 μL,共計25 μL 體系。反應程序: 95℃變性2 min;95℃變性20 s, 56℃退火30 s,68℃延伸30 s,40個循環(huán)。在ABI PRISM7000 實時定量PCR 儀上進行。采用2-△△CT算法[10]對結果進行分析。
2 結果與分析
2.1 ScHsp90-1基因序列的獲得及分析
以黑麥整株cDNA為模板,利用設計的全長引物,PCR擴增后電泳可見明顯的擴增條帶(圖1),回收連接載體、轉化、挑單克隆進行測序,結果表明,該基因全長2 103 bp,共計編碼700個氨基酸,命名為ScHsp90-1。經(jīng)網(wǎng)上序列分析(http://www.bio-soft.net/sms/prot_mw.html),其蛋白質(zhì)相對分子量為80.47 kD。與其它植物的熱激蛋白氨基酸序列分析比對 (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)表明,ScHsp90-1與小麥、水稻、玉米等物種的熱激蛋白具有較高的同源性;進一步進化樹分析(圖2)表明,ScHsp90-1與小麥的TaHsp90親緣關系比較近,與水稻親緣關系僅次于小麥。可見,Hsp90類蛋白在長期的進化過程中具有較好的保守特性。
2.2 ScHsp90-1基因時空表達特性分析
根據(jù)實時熒光定量PCR結果(圖3),在高溫42℃處理1 h后, ScHsp90-1的基因表達量達到最高值,之后表達量又降低,在10 h時又增加,隨后減少;4℃低溫處理條件下,ScHsp90-1基因在24 h時誘導表達量最大;在干旱脅迫處理下,ScHsp90-1的表達量均低于未脅迫水平;經(jīng)高鹽處理后,ScHsp90-1表達量增加,處理1 h時達到最大值,后迅速下降且低于未處理水平。上述結果表明,ScHsp90-1基因可能對高溫、低溫、高鹽等脅迫均具有一定的響應表達,而在高溫脅迫條件下誘導表達最為強烈。
3 討論與結論
Hsp90家族基因作為分子伴侶,是一類廣泛存在于生物體中高度保守的脅迫蛋白,在生物體受到高溫等脅迫時快速響應,其作用十分廣泛且重要[11-14]。作為分子伴侶,其可以保護細胞分子蛋白免受傷害,同時折疊已損壞的蛋白;還在植物的發(fā)育與進化、細胞信號傳遞、植物抗病性和遺傳隔離中具有十分重要的作用[15,16]。
隨著植物中大量Hsp90家族基因不斷被挖掘與克隆,對其氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn),植物中的Hsp90與動物或酵母中的Hsp90 約有63%~71%的同源性;而在植物物種間,Hsp90的同源性高達90%左右[17]。本研究進化樹分析表明,ScHsp90-1與TaHsp90親緣關系最近,與其他植物的熱激蛋白序列也有較高的同源性。由此可見Hsp90家族在植物長期進化過程中的作用應該比較重要,進而在不同植物中保持序列的高度保守。
Hsp90同時受多種生物或非生物逆境脅迫的誘導表達。有研究表明,水稻在遭受低溫、高鹽、干旱及ABA誘導后,體內(nèi)的Hsp90基因表達量顯著增加[7];擬南芥中,Hsp90基因在重金屬、高鹽或高溫逆境脅迫條件下,其表達量也有明顯增加[18]。本試驗表明,ScHsp90-1基因受低溫、高溫、干旱和高鹽逆境脅迫的誘導表達,但在不同的逆境脅迫條件下,其表達模式不盡相同。其在高溫脅迫條件下誘導表達最為強烈,而在干旱脅迫下表達量最低。然而,這種高度保守的Hsp90家族基因在不同植物中多個或單個核苷酸的變化是否具有一定的規(guī)律,以及其對各種脅迫的響應及作用機制,都可能是我們下一步研究的重要內(nèi)容。
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