沈馨,王艷,代凱文,尚雪嬌,董蘊(yùn),郭壯,*
(1.湖北文理學(xué)院化學(xué)工程與食品科學(xué)學(xué)院鄂西北傳統(tǒng)發(fā)酵食品研究所,湖北襄陽441053;2.當(dāng)陽市婦幼保健院 檢驗(yàn)科,湖北宜昌444100;3.當(dāng)陽市食品藥品監(jiān)督管理局,湖北宜昌444100)
辣椒醬是以破碎的鮮辣椒或干辣椒為原料,經(jīng)發(fā)酵或非發(fā)酵加工制作而成的一種調(diào)味品,因具有促進(jìn)食欲和健脾開胃的功效而深受消費(fèi)者喜愛[1]。傳統(tǒng)的辣椒醬主要依靠辣椒自帶或環(huán)境中的乳酸菌自然發(fā)酵而成,制作工藝相對簡單,發(fā)酵周期也較長[2]。眾所周知,傳統(tǒng)發(fā)酵食品制作環(huán)境相對開放,基質(zhì)中微生物的多樣性亦相對較高,不僅蘊(yùn)含對產(chǎn)品品質(zhì)形成具有積極意義或具有潛在益生特性的菌株,亦可能含有一些致病菌或條件致病菌[3]。然而令人遺憾的是,目前關(guān)于辣椒醬細(xì)菌微生物多樣性研究的報(bào)道尚少。
近年來以Miseq為代表的第二代高通量測序技術(shù),采用宏基因組學(xué)的研究策略,不僅全面揭示了傳統(tǒng)發(fā)酵食品中微生物的群落結(jié)構(gòu),同時(shí)亦實(shí)現(xiàn)了微生物多樣性與產(chǎn)品品質(zhì)的關(guān)聯(lián)分析[4],目前在葡萄酒[5]、臘腸[6]、泡菜[7]和窖泥[8]等微生物多樣性研究中有了廣泛的應(yīng)用,這為解析辣椒醬中細(xì)菌微生物的多樣性提供了新的技術(shù)手段。作為產(chǎn)品品質(zhì)的重要組成部分,滋味品質(zhì)直接決定了消費(fèi)者對辣椒醬產(chǎn)品的喜好程度。相對于感官鑒評方法,電子舌技術(shù)實(shí)現(xiàn)了醬類制品中酸、苦、澀、鮮和咸5個(gè)基本味及苦、澀和鮮味3個(gè)基本味回味的數(shù)字化評價(jià),具有對試驗(yàn)人員專業(yè)技能要求低且受外界影響小的優(yōu)點(diǎn)[9]。
在采用Miseq高通量測序技術(shù)對辣椒醬中細(xì)菌微生物多樣性進(jìn)行揭示的基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步使用電子舌這一仿生設(shè)備對產(chǎn)品的滋味品質(zhì)進(jìn)行了評價(jià),同時(shí)探討了核心細(xì)菌類群對辣椒醬品質(zhì)的影響,以期為后續(xù)辣椒醬中優(yōu)勢菌株的分離及產(chǎn)品的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)提供理論指導(dǎo)。
樣品采集:從湖北省當(dāng)陽市草埠湖鎮(zhèn)和玉泉辦事處的6個(gè)農(nóng)戶家中,各采集1個(gè)自制辣椒醬樣品,每個(gè)樣品分別采集200 g左右,置于含有冰袋的采樣箱中進(jìn)行DNA提取。
5×TransStartTM FastPfu Buffer、dNTPs Mix、FastPfu Fly DNA Polymerase:北京全式金生物技術(shù)有限公司;E.Z.N.A.?Soil DNA Kit試劑盒:美國OMEGA公司;陰離子溶液、陽離子溶液、味覺標(biāo)準(zhǔn)溶液、內(nèi)部溶液和參比溶液:日本Insent公司。
5810R臺式高速冷凍離心機(jī):德國Eppendorf公司;ND-2000C微量紫外分光光度計(jì):美國Nano Drop公司;DYY-12電泳儀:北京六一儀器廠;UVPCDS8000凝膠成像分析系統(tǒng):美國BIO-R AD公司;vetiri梯度基因擴(kuò)增儀:美國AB公司;Miseq高通量測序平臺:美國Illumina公司;R 920機(jī)架式服務(wù)器:美國DELL公司;SA 402B電子舌(配備 AAE、CT0、CA0、AE1和 C00測試傳感器):日本Insent公司。
1.3.1 DNA提取
取10 g辣椒醬加入40 mL蒸餾水,300 r/min離心10 min后取上清,繼而10 000 r/min離心10 min后取沉淀,采用E.Z.N.A.?Soil DNA Kit試劑盒進(jìn)行微生物宏基因組DNA提取。
1.3.2 細(xì)菌16S rR NA序列V4-V5區(qū)擴(kuò)增及擴(kuò)增體系
DNA模板10 ng,5 μmol/L正向和反向引物各0.8 μL,5U/μLDNA 聚合酶0.4μL,2.5mmol/LdNTPsmix 2μL,5×PCR緩沖液4μL,體系用 ddH2O 補(bǔ)充至 20 μL。其中:正向引物為338F(5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3'), 反 向 引 物 為 806R(5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3'),在正向引物前端加入7個(gè)核苷酸標(biāo)簽(barcode),以便進(jìn)行生物信息學(xué)分析時(shí)將序列劃分到各個(gè)樣品。擴(kuò)增條件:95℃變性3 min;95℃變性 30 s,55℃退火 30 s,72℃延伸 45 s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。
1.3.3 高通量測序及序列質(zhì)控
PCR產(chǎn)物置于干冰中冷鏈寄往上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司,使用Miseq高通量測序平臺進(jìn)行測序。數(shù)據(jù)下機(jī)后,首先將雙端序列拼接成一條序列,繼而根據(jù)barcode信息將拼接好的序列劃分到各樣品并進(jìn)行序列方向校正,然后去除序列中的barcode和引物,最后將6個(gè)樣品的序列歸并為1個(gè)fna文件進(jìn)行后續(xù)生物信息學(xué)分析。值得一提的是,若在拼接過程中成對序列的重疊區(qū)小于10 bp或最大錯(cuò)配比率大于0.2、有barcode堿基錯(cuò)配或引物堿基錯(cuò)配數(shù)大于2 bp及切除barcode和引物后序列長度小于50 bp,則相對應(yīng)的序列均予以剔除。
1.3.4 生物信息學(xué)分析
將質(zhì)控后的序列文件導(dǎo)入QIIME(v1.7.0)[10]進(jìn)行分析,首先調(diào)用PyNAST[11]軟件將所有序列對齊;其次采用UCLUST算法[12]進(jìn)行序列劃分并建立分類操作單元(Operational taxonomic units,OTU),若某一 OTU 在所有樣品中均存在則將其定義為核心OTU;然后使用ChimeraSlayer[13]進(jìn)行嵌合體去除;繼而挑選OTU中的代表性序列同時(shí)使用R DP(ribosomal database project,R elease 11.5)[14]和 Greengenes(R elease 13.8)[15]數(shù)據(jù)庫明確OTU分類學(xué)地位,若某一門或?qū)僭谒袠悠分芯嬖?,則將其定義為核心門或?qū)伲唤又褂肍astTree軟件[16]繪制代表性序列系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,并在此基礎(chǔ)上計(jì)算α多樣性指數(shù)—香農(nóng)指數(shù)(Shannon index)、超1指數(shù)(Chao1 index)和發(fā)現(xiàn)物種數(shù),進(jìn)而繪制稀疏曲線圖和香農(nóng)指數(shù)曲線。
1.3.5 核酸登錄號
本研究中所有Miseq高通量測序數(shù)據(jù)均已提交至MG-RAST數(shù)據(jù)庫,ID號為mgp336604。
1.3.6 辣椒醬樣品的滋味品質(zhì)分析
取20.0 g辣椒醬用180 mL蒸餾水4℃浸泡過夜后,3 000 r/min離心10 min后取上清備用。傳感器活化、清洗后,首先在參比溶液中測得電勢值Vr;其次在樣品中測得電勢 Vs,C00、AE1、CA0、CT0 和 AAE 5 個(gè)傳感器對應(yīng)的Vs-Vr值即為樣品酸、苦、澀、咸和鮮味等5個(gè)基本味的相對強(qiáng)度值;再次洗滌后,C00、AE1和AAE 3個(gè)傳感器分別在參比溶液中測得電勢Vr’,Vr’-Vr值為辣椒醬后味A(澀的回味)、后味B(苦的回味)和豐度(鮮的回味)的相對強(qiáng)度值。
1.3.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
使用皮爾森相關(guān)性分析法(Pearson correlation analysis)計(jì)算核心細(xì)菌類群和各滋味指標(biāo)相對強(qiáng)度之間的相關(guān)系數(shù),并選取相關(guān)系數(shù)絕對值大于0.5的指標(biāo),使用Cytoscape軟件(v3.5.1)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)圖繪制。采用Mega5.0軟件繪制核心OTU系統(tǒng)發(fā)育樹;其他圖均由Origin 8.6軟件繪制。進(jìn)行滋味品質(zhì)分析時(shí),每個(gè)辣椒醬樣品重復(fù)測定4次,選后3次納入數(shù)據(jù)分析。
納入本研究的6個(gè)辣椒醬樣品16s rRNA V4-V5區(qū)序列測序情況及各分類地位數(shù)量如表1所示。
由表1可知,本研究共有225 830條高質(zhì)量16srRNA序列通過質(zhì)控,平均每個(gè)樣品產(chǎn)出37 638條序列。本研究分別采用100%和97.0%相似性進(jìn)行兩步UCLUST劃分,共得到74 179條代表性序列和4 709個(gè)OTU,在采用ChimeraSlayer進(jìn)行嵌合體檢查時(shí),去除了11個(gè)OTU,因而每個(gè)樣品平均有1 398個(gè)OTU。由表1亦可知,在6個(gè)辣椒醬樣品中LJ3的Chao 1指數(shù)最高同時(shí)Shannon指數(shù)最大,由此可見,LJ3樣品中細(xì)菌微生物的豐富度最大多樣性亦最高。本研究進(jìn)一步繪制了隨著測序深度的加深,發(fā)現(xiàn)物種數(shù)指數(shù)和Shannon指數(shù)的變化曲線,進(jìn)而對本研究的測序深度是否滿足后續(xù)生物信息學(xué)分析要求進(jìn)行了評估,其結(jié)果如圖1所示。
表1 樣品16s rRNA測序情況及各分類地位數(shù)量Table 1 16s rRNA read counts and number of identifiable units at different taxonomical levels
圖1 稀疏曲線和香農(nóng)指數(shù)曲線圖Fig.1 Rarefaction analysis and shannon diversity estimates of the high throughput sequencing
由圖1(A)可知,即使達(dá)到本研究單個(gè)樣品的最大測序深度43 546條,稀疏曲線亦未進(jìn)入平臺期,這說明隨著測序深度的增大,辣椒醬中依舊會(huì)有新的細(xì)菌種系型被發(fā)現(xiàn)。然而由圖1(B)可知,在測序深度達(dá)到2 000條左右時(shí),所有的香農(nóng)指數(shù)曲線已經(jīng)進(jìn)入了平臺期,這說明隨著測序量的增加雖然新的種系型會(huì)被發(fā)現(xiàn),但細(xì)菌微生物的多樣性不會(huì)再隨之發(fā)生變化了,因而本研究的測序深度是可以滿足后續(xù)分析要求的。
在對序列豐富度和多樣性分析的基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步對質(zhì)控合格后的序列進(jìn)行了鑒定,所有的序列鑒定為19個(gè)門、46個(gè)綱、65個(gè)目、160個(gè)科和387個(gè)屬,其中僅有0.056%和7.70%的序列不能鑒定到門和屬水平。因本研究僅采集了6個(gè)辣椒醬樣品,存在樣本量不足的缺陷,為了彌補(bǔ)這一不足同時(shí)減少樣品間差異性對分析結(jié)果造成的影響,本研究僅對平均相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌門、屬和OTU進(jìn)行了分析。辣椒醬樣品中相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌門構(gòu)成如圖2所示。
圖2 辣椒醬樣品中相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌門Fig.2 Comparative analysis on the content of core bacterial phyla with relative abundance more than 1.0%in chilli sauce samples
由圖2可知,在門水平上,辣椒醬樣品中的細(xì)菌類群主要隸屬于硬壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)和放線菌門(Actinobacteria),其平均相對含量分別為66.73%、22.79%和9.75%。辣椒醬樣品中相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌屬構(gòu)成如圖3所示。
由圖3可知,辣椒醬中平均相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌屬包括隸屬于硬壁菌門(Firmicutes)的芽孢桿菌(Bacillus)、葡萄球菌(Staphylococcus)、梭菌(Clostridium)、魏斯氏菌(Weissella)和乳酸桿菌(Lactobacillus),其平均相對含量分別為37.62%、20.66%、2.5%、1.37%和1.09%;隸屬于變形菌門(Proteobacteria)的克雷白氏桿菌(Klebsiella)、腸桿菌屬(Enterobacter)和布丘氏菌屬(Buttiauxella),其平均相對含量分別為6.87%、1.18%和1.08%;以及隸屬于放線菌門(Actinobacteria)的棒狀桿菌(Corynebacterium),其平均相對含量為5.96%。
圖3 辣椒醬樣品中相對含量大于1.0%的核心細(xì)菌屬Fig.3 Comparative analysis on the content of core bacterial genera with relative abundance more than1.0%in chilli sauce samples
辣椒醬樣品中含有隸屬于乳桿菌目(Lactobacillales)的魏斯氏菌(Weissella)和乳酸桿菌(Lactobacillus),其平均含量分別為1.37%和1.09%。兩者均為乳酸菌,通過產(chǎn)生有機(jī)酸,同時(shí)生成醇、醛和酮等多種風(fēng)味物質(zhì),對發(fā)酵食品的滋味和風(fēng)味品質(zhì)具有積極的影響[17]。此外,本研究發(fā)現(xiàn)辣椒醬中存在37.62%的芽孢桿菌(Bacillus),究其原因可能與辣椒醬中食鹽含量較高有關(guān)而芽孢桿菌具有較好的耐受性。值得一提的是,芽孢桿菌亦為細(xì)菌型豆豉中的優(yōu)勢菌,對豆豉風(fēng)味品質(zhì)的形成具有積極的意義[18]。
從農(nóng)戶家中采集的辣椒醬樣品含有大量的克雷白氏桿菌(Klebsiella)、腸桿菌(Enterobacter)、葡萄球菌(Staphylococcus)和梭菌(Clostridium),其累計(jì)平均含量達(dá)到了細(xì)菌序列總數(shù)的30.08%。隸屬于上述4個(gè)屬的部分細(xì)菌種為條件致病菌,例如作為克雷白氏桿菌(Klebsiella)中常見的種肺炎克雷伯氏菌(K.peneumoniae)是重要的醫(yī)源性感染菌之一[19],隸屬于腸桿菌屬(Enterobacter)的阪崎腸桿菌(E.Sakazakii)能引起新生兒腦膜炎和敗血癥[20],葡萄球菌(Staphylococcus)中的金黃色葡萄球菌(S.aureus)是人類化膿感染中最常見的病原菌[21],梭菌屬(Clostridium)中的致病性菌種可引起梭菌病這一人畜共患病[22]。由此可見,農(nóng)家自制的辣椒醬樣品中存在大量的條件致病菌,具有一定的食品安全隱患,其與產(chǎn)品制作環(huán)境開放且發(fā)酵周期長有關(guān),因而在后續(xù)研究中從辣椒醬中分離、純化、鑒定并篩選出具有優(yōu)良發(fā)酵特性的優(yōu)勢菌株用于產(chǎn)品的生產(chǎn),無論是對實(shí)現(xiàn)辣椒醬的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn),還是減少食品安全隱患均具有積極的意義。本研究亦發(fā)現(xiàn)辣椒醬中存在1%左右的布丘氏菌屬細(xì)菌,有報(bào)道指出隸屬于該菌屬的細(xì)菌為草魚肉冷藏過程中的優(yōu)勢腐敗菌[23]。值得一提的是,本研究發(fā)現(xiàn)辣椒醬樣品中存在5.96%的隸屬于棒狀桿菌(Corynebacterium)的細(xì)菌,該屬中的谷氨酸棒狀桿菌(C.glutamicum)可在微生物發(fā)酵工程生產(chǎn)谷氨酸來制取味精[24],而同樣是隸屬該屬的白喉?xiàng)U菌(C.diphtheriae)卻是引起小兒白喉的病原菌[25]。令人遺憾的是,由于Miseq測序長度較短,無法完成16s rRNA全長測序,因而僅能將序列鑒定到屬水平,在后續(xù)研究中采用單分子實(shí)時(shí)(single molecule real-time,SMRT)測序技術(shù)[26]或使用選擇性培養(yǎng)基對棒狀桿菌屬的細(xì)菌進(jìn)行分離鑒定,進(jìn)而進(jìn)一步在種水平上對細(xì)菌的種系型進(jìn)行確定是極為必要的。
本研究進(jìn)一步統(tǒng)計(jì)了4 698個(gè)OTU在6個(gè)辣椒醬樣品中出現(xiàn)的次數(shù),其結(jié)果如圖4所示。
由圖4可知,雖然核心OTU有271個(gè),僅占OTU總數(shù)的5.77%,但其包含了196 955條序列,占所有質(zhì)控后合格序列數(shù)的87.21%。此外,在6個(gè)樣品中出現(xiàn)5、4、3、2 次的 OTU 各有 176、183、279、522 個(gè),分別占OTU總數(shù)的6.23%、1.96%、1.38%和1.34%,4類OTU共包含24 634條序列,占所有質(zhì)控后合格序列數(shù)的10.91%。雖然在6個(gè)樣品中僅出現(xiàn)1次的OTU多達(dá)4 241個(gè),占到OTU總數(shù)的69.54%,但其僅包含4 241條序列,平均每個(gè)OTU包含1.3條序列。由此可見,在OTU水平上,6個(gè)辣椒醬樣品亦共有大量的細(xì)菌類群,其累計(jì)平均相對含量達(dá)到87%以上。本研究進(jìn)一步對271個(gè)核心OTU進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)有14個(gè)OTU的平均相對含量大于1.0%,相對含量大于1.0%核心OTU在各辣椒醬樣品中相對含量的熱圖如圖5所示。
圖4 OTU在6個(gè)樣品中出現(xiàn)次數(shù)統(tǒng)計(jì)Fig.4 Distribution of OTU as a function of their prevalence in 6 samples
圖5 平均相對含量大于1.0%核心OTU在各辣椒醬樣品中相對含量的熱圖Fig.5 Heat map of the contents of core OTUs among chilli sauce samples
由圖5可知,本研究甄別出的14個(gè)核心OTU中3個(gè)隸屬于葡萄球菌(Staphylococcus),5個(gè)隸屬于芽孢桿菌(Bacillus)、2個(gè)隸屬于克雷白氏桿菌(Klebsiella),各有1個(gè)隸屬于梭菌(Clostridium)、棒狀桿菌(Corynebacterium)、布丘氏菌屬(Buttiauxella)和腸桿菌科(Enterobacteriaceae)。此外,14個(gè)核心OTU累計(jì)平均相對含量達(dá)到55.29%,尤其是OTU1218(隸屬于芽孢桿菌)、OTU597(隸屬于葡萄球菌)、OTU1350(隸屬于芽孢桿菌)和OTU2747(隸屬于葡萄球菌),其平均含量含量為11.41%、9.49%、7.03%和6.25%。值得一提的是,各核心OTU在樣品中的分布也存在較大的差異,例如OTU1350(隸屬于芽孢桿菌)在LJ4和LJ5中的相對含量分別為18.16%和20.21%,但在其他樣品中的相對含量均小于2.0%,OTU64(隸屬于芽孢桿菌)在LJ1中的相對含量達(dá)到15.40%,但在其他5個(gè)樣品中的相對含量均小于3.0%。由此可見,雖然存在于所有樣品中,但核心OTU在各樣品中的平均含量差異是較大的。平均相對含量大于1.0%核心OTU相關(guān)性的熱圖如圖6所示。
圖6 平均相對含量大于1.0%核心OTU相關(guān)性的熱圖Fig.6 Heat map of correlation among the core OTUs with relative abundance more than 1.0%
由圖6可知,OTU2747(隸屬于葡萄球菌屬)與OTU1568(隸屬于葡萄球菌屬)呈顯著正相關(guān)(R=0.905,P<0.05);OTU597(隸屬于葡萄球菌屬)與 OTU921(隸屬于腸桿菌科)呈顯著正相關(guān)(R=0.892,P<0.05);OTU1199(隸屬于克雷白氏桿菌屬)與OTU790(隸屬于克雷白氏桿菌屬)呈極顯著正相關(guān)(R=0.979,P<0.001),與OTU1652(隸屬于梭菌屬)呈顯著正相關(guān)(R=0.818,P<0.001);OTU64(隸屬于芽孢桿菌屬)與 OTU1652(隸屬于梭菌屬)呈極顯著正相關(guān)(R=0.989,P<0.001);OTU2087(隸屬于芽孢桿菌屬)與 OTU1350(隸屬于芽孢桿菌屬)呈非常顯著正相關(guān)(R=0.931,P<0.01);OTU3254(隸屬于芽孢桿菌屬)與 OTU1218(隸屬于芽孢桿菌屬)呈極顯著正相關(guān)(R=0.977,P<0.001)。由此可見,葡萄球菌可以促使芽孢桿菌和一些腸桿菌科細(xì)菌的增長。
在對6個(gè)辣椒醬樣品核心細(xì)菌類群進(jìn)行解析的基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步對樣品滋味品質(zhì)的差異性進(jìn)行了評價(jià),同時(shí)通過構(gòu)建核心細(xì)菌類群與滋味品質(zhì)相關(guān)性的網(wǎng)絡(luò)圖,探討了核心細(xì)菌類群對鲊廣椒滋味品質(zhì)的影響。辣椒醬各滋味指標(biāo)相對強(qiáng)度值的箱形圖如圖7所示。
圖7 辣椒醬各滋味指標(biāo)相對強(qiáng)度值的箱形圖Fig.7 The box plot of relative intensity of each taste index in chilli sauce samples
由圖7可知,納入本研究的辣椒醬樣品在酸味、咸味、澀味和鮮味上的差異較大,其極差值分別為18.85、13.41、7.56和6.22,而在后味A(澀的后味)和后味B(苦的回味)指標(biāo)上的差異性較小,極差值僅為0.16和2.02。辣椒醬樣品在酸味上差異比較大的原因可能與樣品中含有2.46%的乳酸菌有關(guān),而鮮味差異比較大的原因可能與樣品中含有棒狀桿菌有關(guān),該屬的部分細(xì)菌可以產(chǎn)生谷氨酸等鮮味呈味物質(zhì)。本研究進(jìn)一步對辣椒醬核心細(xì)菌類群和滋味物質(zhì)的相關(guān)性進(jìn)行了計(jì)算,其結(jié)果如圖8所示。
圖8 辣椒醬核心細(xì)菌類群和滋味指標(biāo)相關(guān)性的網(wǎng)絡(luò)圖Fig.8 Correlation network diagram of core bacterial microflora and taste indexes among chilli sauce samples
由圖8可知,相對于乳酸桿菌(Lactobacillus)、梭菌(Clostridium)、葡萄球菌(Staphylococcus)和腸桿菌屬(Enterobacter)的核心細(xì)菌類群,芽孢桿菌(Bacillus)、魏斯氏菌(Weissella)、克雷白氏桿菌(Klebsiella)、布丘氏菌屬(Buttiauxella)和棒狀桿菌(Corynebacterium)對辣椒醬的滋味品質(zhì)影響可能相對更大。由圖8亦可知,棒狀桿菌(Corynebacterium)、克雷白氏桿菌(Klebsiella)和布丘氏菌屬(Buttiauxella)的相對含量與辣椒醬的鮮味呈現(xiàn)正相關(guān)。本研究亦發(fā)現(xiàn)芽孢桿菌(Bacillus)與酸味呈現(xiàn)正相關(guān),這可能與部分芽孢桿菌具有產(chǎn)酸特性有關(guān)[27],而乳酸桿菌(Lactobacillus)與酸味的相關(guān)性較弱。
辣椒醬中的核心細(xì)菌類群主要由隸屬于硬壁菌門(Firmicutes)的芽孢桿菌(Bacillus)和葡萄球菌(Staphylococcus)構(gòu)成,酸味是辣椒醬樣品間差異最大的滋味指標(biāo),微生物構(gòu)成對辣椒醬滋味品質(zhì)的形成具有較大的影響。
[1]郭琳,孟夢,郭淼,等.接種乳酸菌改善辣椒醬風(fēng)味的研究[J].中國調(diào)味品,2016,41(5):1-7
[2]白露露,胡文忠,姜愛麗,等.辣椒加工工藝及其設(shè)備的應(yīng)用現(xiàn)狀[J].食品工業(yè)科技,2014,35(15):369-372
[3]Gracias K S,Mckillip J L.A review of conventional detection and enumeration methods for pathogenic bacteria in food[J].Canadian journal of microbiology,2004,50(11):883-890
[4]Cocolin L,Alessandria V,Dolci P,et al.Culture independent methods to assess the diversity and dynamics of microbiota during food fermentation[J].International journal of food microbiology,2013,167(1):29-43
[5]Boynton P J,GREIG D.Fungal diversity and ecosystem function data from wine fermentation vats and microcosms[J].Data in brief,2016,8(12):225-229
[6]Justyna P,Annalisa R,Vincenza P,et al.Bacterial diversity in typical Italian salami at different ripening stages as revealed by highthroughput of 16s rDNA amplicons[J].Food microbiology,2015,46(4):342-356
[7]Yang H,Wu H,Gao L,et al.Effects of Lactobacillus curvatus and Leuconostoc mesenteroides on Suan Cai Fermentation in Northeast China[J].Journal of microbiology and biotechnology,2016,26(12):2148-2158
[8]Hu X,Du H,Ren C,et al.Illuminating anaerobic microbial community and cooccurrence patterns across a quality gradient in Chinese liquor fermentation pit muds[J].Applied and environmental microbiology,2016,82(8):2506-2515
[9]Winquist F,Wide P,Lundstr?m I.An electronic tongue based on voltammetry[J].Analytica chimica acta,1997,357(1):21-31
[10]Caporaso J G,Kuczynski J,Stombaugh J,et al.QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data[J].Nature methods,2010,7(5):335-336
[11]Caporaso J G,Bittinger K,Bushman F D,et al.PyNAST:a flexible tool for aligning sequences to a template alignment[J].Bioinformatics,2010,26(2):266-267
[12]Edgar R C.Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST[J].Bioinformatics,2010,26(19):2460-2461
[13]Haas B J,Gevers D,EARL A M,et al.Chimeric 16S rRNA sequence formation and detection in Sanger and 454-pyrosequenced PCR amplicons[J].Genome research,2011,21(3):494-504
[14]Cole J R,Chai B,Farris R J,et al.The ribosomal database project(RDP-II):introducing myRDP space and quality controlled public data[J].Nucleic acids research,2007,35(1):169-172
[15]Desantis T Z,Hugenholtz P,Larsen N,et al.Greengenes,a chimerachecked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB[J].Appliedandenvironmentalmicrobiology,2006,72(7):5069-5072
[16]Price M N,Dehal P S,Arkin A P.Fasttree:computing large minimum evolution trees with profiles instead of a distance matrix[J].Molecular biology and evolution,2009,26(7):1641-1650
[17]劉畢琴,蘆夏霏,柳陳堅(jiān),等.乳酸菌貢獻(xiàn)細(xì)菌型豆豉風(fēng)味的研究進(jìn)展[J].核農(nóng)學(xué)報(bào),2016,30(1):136-144
[18]蘇悟,鄭小芬,徐睿烜,等.1種細(xì)菌型豆豉自然發(fā)酵過程中生物胺的變化[J].食品與發(fā)酵工業(yè),2014,40(7):40-45
[19]Tong S Y C,Davis J S,Eichenberger E,et al.Staphylococcus aureus infections:epidemiology,pathophysiology,clinical manifestations,and management[J].Clinical microbiology reviews,2015,28(3):603-661
[20]Hu X,Dou W,Fu L,et al.A disposable immunosensor for Enterobacter sakazakii based on an electrochemically reduced graphene oxide-modified electrode[J].Analytical biochemistry,2013,434(2):218-220
[21]陳文秀,姜旋,馬曉燕,等.實(shí)時(shí)熒光環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測乳粉中的肺炎克雷伯氏菌[J].食品科學(xué),2014,35(20):192-197
[22]Hosie B D.Clostridial disease in domestic and wild animals[J].Veterinary record,2017,180(14):360-360
[23]王發(fā)祥,王滿生,劉永樂,等.低溫貯藏下草魚肉優(yōu)勢腐敗菌鑒定及其消長規(guī)律[J].食品與發(fā)酵工業(yè),2012,38(2):66-68
[24]張成林,龍輝,溫冰,等.雙底物指數(shù)流加和雙階段溶氧控制對谷氨酸棒狀桿菌生產(chǎn)L-異亮氨酸的影響[J].食品與發(fā)酵工業(yè),2014,40(4):1-6
[25]Efstratiou A,George R C.Laboratory guidelines for the diagnosis of infections caused by Corynebacterium diphtheriae and C ulcerans[J].Communicable disease and public health,1999,2(4):250-257
[26]Mccarthy A.Third generation DNA sequencing:pacific biosciences'single molecule real time technology[J].Chemistry&biology,2010,17(7):675-676
[27]于華,黃丹,陳卓,等.四川麩醋醋醅中產(chǎn)酸芽孢桿菌的分離及發(fā)酵特性研究[J].中國食品添加劑,2017,24(1):83-90