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      5?Aza?CdR對MDA?MB?231細(xì)胞PPAR?γ基因甲基化的影響

      2018-07-21 02:39:20董家書韋美德周格琛鄧開鳳戴盛明
      分子診斷與治療雜志 2018年4期
      關(guān)鍵詞:癌基因培養(yǎng)液甲基化

      董家書 韋美德 周格琛 鄧開鳳 戴盛明

      三陰性乳腺癌(triple?negative breast cancer,TNBC)約占所有乳腺癌的10%~20%[1],因其侵襲力強(qiáng),且缺乏有效的治療靶點(diǎn),而成為預(yù)后極差的惡性腫瘤。抑癌基因的甲基化改變是三陰性乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的重要事件。文獻(xiàn)報(bào)道,PPAR?γ基因可通過調(diào)節(jié)Wnt信號傳導(dǎo)通路的表達(dá)抑制乳腺癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移[2]。PPAR?γ是一種由配體激活的核轉(zhuǎn)錄因子,參與炎癥信號通路如NF?KB、Ap?1、JAK?sTAT,抑制促炎介質(zhì)的生成[3]。有研究認(rèn)為細(xì)胞內(nèi)PPAR?γ的表達(dá)是調(diào)節(jié)性T細(xì)胞抗炎作用所必須的[4]。5?氮雜?2?脫氧胞嘧啶(5?aza?2'?deox?ycytidine,5?Aza?CdR)是DNA甲基轉(zhuǎn)移酶特異性抑制劑,通過與DNA甲基轉(zhuǎn)移酶共價(jià)鍵結(jié)合,抑制DNA甲基轉(zhuǎn)移酶I的甲基轉(zhuǎn)移活性,除去抑癌基因啟動子的甲基化,解除甲基化對抑癌基因的抑制,從而使抑癌基因再表達(dá),發(fā)揮抑癌作用[5]。本研究擬選用不同濃度的 5?Aza?CdR 作用于乳腺癌MDA?MB?231細(xì)胞系,觀察該藥物對乳腺癌細(xì)胞PPAR?γ基因甲基化情況以及轉(zhuǎn)錄水平,以及對該細(xì)胞凋亡的影響,為探索乳腺癌化療藥物奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 試劑材料

      MDA?MB?231細(xì)胞購自中科院上海細(xì)胞庫;RPMI 1640培養(yǎng)基、無菌PBS、胎牛血清和胰蛋白酶均購自美國GIBCO公司;5?Aza?CdR購自日本sigma公司,經(jīng)無菌PBS溶解后分裝,-80℃保存;DNA抽提純化試劑盒QIAamp DNA Mini Kit(貨號51304),重亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit(貨號 59824),均購自德國凱杰生物技術(shù)(上海)有限公司;總RNA提取試劑盒Mini BEST Universal RNA Extraction Kit(貨號9767),逆轉(zhuǎn)錄試劑盒Mir?X miRNA First?Strand Syn?thesis Kit(貨號 68313),PCR 試劑盒 PrimeScript?RT Master Mix(貨號 RR036),均購自日本 Takara公司;PCR引物由大連寶生物公司合成。

      1.2 細(xì)胞培養(yǎng)

      MDA?MB?231細(xì)胞用含10%胎牛血清的RPMI 1640完全培養(yǎng)液(含1%青霉素、鏈霉素),于5%CO2、37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)。取對數(shù)生長期的MDA?MB?23l細(xì)胞種入35 mm培養(yǎng)皿中,培養(yǎng)過夜使細(xì)胞充分貼壁后,加入含5、10、15、20 μmol/L的5?Aza?CdR完全培養(yǎng)液處理細(xì)胞,對照組用不含5?Aza?CdR的普通完全培養(yǎng)液,并加入與藥物相同體積的PBS緩沖液,培養(yǎng)48 h后收獲細(xì)胞。

      1.3 甲基特異性PCR(methylmion specific PCR,MSP)檢測PPAR?γ基因甲基化情況

      QIAamp DNA Mini Kit提取 5?Aza?CdR 處理細(xì)胞48 h后基因組DNA,EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit進(jìn)行重亞硫酸氫鹽修飾并回收DNA,利用甲基化以及非甲基化引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PPAR?γ基因甲基化引物和非甲基化引物見表1。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性3 min;95℃變性30 s,55℃退火 30 s,72℃延伸 45 s,30 個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min,進(jìn)行熔解曲線分析以確認(rèn)產(chǎn)物的特異性,4℃維持至結(jié)束。

      表1 引物序列Table 1 Details of primers

      1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real?time fluorescent quan?tive PCR,qPCR)檢測PPAR?γmRNA表達(dá)水平

      Trizol法提取藥物處理48 h后細(xì)胞的總RNA,TAKARA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒獲得cDNA。PPAR?γ基因以及β?actin引物見表1。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30個(gè)循環(huán);72℃終延伸5 min,進(jìn)行熔解曲線分析以確認(rèn)產(chǎn)物的特異性,4℃維持至結(jié)束。

      1.5 流式細(xì)胞儀檢測5?Aza?CdR對MDA?MB?231細(xì)胞凋亡的影響

      取生長對數(shù)期MDA?MB?231細(xì)胞,胰酶消化后細(xì)胞計(jì)數(shù);含10%血清的RPMI1640培養(yǎng)液調(diào)整細(xì)胞懸液濃度至1×106個(gè)/mL接種于6孔板內(nèi),每孔2 mL,每組細(xì)胞3個(gè)復(fù)孔,置于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng);24 h后更換培養(yǎng)液,實(shí)驗(yàn)組加入含不同濃度 5?Aza?CdR(5、10、15、20 μmol/L)的RPMI1640培養(yǎng)液;對照組加同等體積的培養(yǎng)液,孵育48 h后胰酶消化收集細(xì)胞;凋亡試驗(yàn)取1×106個(gè)細(xì)胞,冷 PBS(2~8℃)洗 2 次,用 500 μL 1×An?nexin V結(jié)合液重懸細(xì)胞,濃度為1×106cells/mL,向細(xì)胞懸液中加5 μL Annexin V?FITC染色液,輕輕混勻后于2~8℃避光條件下孵育15 min;加入10 μL PI染色液后輕輕混勻,2~8℃避光條件下孵育5 min,立即用流式細(xì)胞儀檢測,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

      2 結(jié)果

      2.1 MSP檢測PPAR?γ基因啟動子區(qū)域甲基化情況

      5?Aza?CdR 藥物處理細(xì)胞后,PPAR?γ基因甲基化程度明顯降低,與對照組相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖1。

      2.2 MDA?MB?231細(xì)胞PPAR?γmRNA表達(dá)情況

      藥物作用48 h,RT?qPCR結(jié)果顯示,與對照組相比PPAR?γmRNA 表達(dá)增加(P<0.01);隨著實(shí)驗(yàn)組藥物濃度的增加,PPAR?γmRNA表達(dá)略有增加,組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見圖2。

      2.3 5?Aza?CdR 對 MDA?MB?231 細(xì)胞凋亡的影響

      與空白對照組細(xì)胞相比,5、10、15、20 μmol/L 5?Aza?CdR處理組的細(xì)胞凋亡率分別為(14.1±2.3)%、(25.4±3.3)%、(32.7±2.8)%、(43.1±1.9)%,與對照組的(6.9±0.8)%相比,凋亡率增加(P<0.05),藥物處理組間均有明顯差異(P<0.05),見圖3。

      圖1 5?Aza?CdR 對MDA?MB?231細(xì)胞PPAR?γ基因去甲基化的影響Figure 1 Effects of 5?Aza?CdR on PPAR?γdemethylation in MDA?MB?231 cells

      圖2 5?Aza?CdR 對 MDA?MB?231細(xì)胞 PPAR?γmRNA表達(dá)的影響Figure 2 Effects of 5?Aza?CdR on PPAR?γmRNA expression in MDA?MB?231 cells

      3 討論

      乳腺癌是危害女性健康最常見的婦科腫瘤,而其中TNBC是惡性程度極高,預(yù)后極差的腫瘤,且對內(nèi)分泌治療不敏感[6],至今仍然沒有具有針對性的治療方案。PPAR?γ是核受體基因超家族中的一員,在脂肪組織、結(jié)腸、脾臟及巨噬細(xì)胞中大量表達(dá),并且通過配體依賴途徑影響相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄的方式[7],影響乳腺癌的發(fā)生發(fā)展[8?9]。Abduljab?bar等[10]研究發(fā)現(xiàn)高表達(dá)的PPAR?γ與沒有接受激素治療的雌激素受體(estrogen receptor,ER)陽性腫瘤患者的生存期延長有關(guān)[10]。張洪斌等[11]對 40例乳腺浸潤性導(dǎo)管癌組織的檢測中亦發(fā)現(xiàn),PPAR?γ表達(dá)高者,5年生存率平均為91%,弱陽性或陰性表達(dá)者,5年生存率平均為42%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。本課題組前期的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)乳腺癌組織PPAR?γ表達(dá)低于癌旁組織,且PPAR?γ在MDA?MB?231(ER?)細(xì)胞中的表達(dá)明顯低于MCF?7(ER+)乳腺癌細(xì)胞[12]。綜合以上結(jié)果,提示PPAR?γ低表達(dá)很有可能是ER陰性且5年生存率低的TNBC的重要因素。

      圖3 不同濃度5?Aza?CdR作用MDA?MB?231細(xì)胞48 h后凋亡率的變化Figure 3 Changes of the apoptosis rate of MDA?MB?231 cells after treatment with different concentrations of 5?Aza?CdR for 48 h

      DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)修飾的重要方式之一,抑癌基因甲基化導(dǎo)致基因轉(zhuǎn)錄抑制,引起細(xì)胞代謝紊亂,是腫瘤發(fā)生的重要機(jī)制之一[13]。本課題組的另一部分研究結(jié)果表明乳腺癌患者PPAR?γ基因啟動子甲基化程度顯著高于健康對照。而基因異常甲基化導(dǎo)致的基因沉默是可以逆轉(zhuǎn)的過程,應(yīng)用甲基化酶抑制劑可以使基因發(fā)生去甲基化,恢復(fù)基因的表達(dá)[14]。許多研究已成功將 5?Aza?CdR應(yīng)用于體外培養(yǎng)的乳腺癌、宮頸癌等細(xì)胞株中,逆轉(zhuǎn)E鈣粘蛋白(E?cadherin)、RAS相關(guān)結(jié)構(gòu)域蛋白 2A基因(RAS associated domain family 2A,RASSF2A)和人Runt相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子3(Runt related transcription factor 3,RUNX3)等多種抑癌基因啟動子的甲基化狀態(tài),恢復(fù)其表達(dá),抑制腫瘤的生長[15?17]。研究已證實(shí),PPAR?γ低表達(dá)與該基因的啟動子甲基化增加有關(guān)[18]。因此,本研究選用去甲基化藥物 5?Aza?CdR 作用 MDA?MB?231 細(xì)胞。經(jīng)檢測,PPAR?γ甲基化水平明顯降低,提示 5?Aza?CdR能夠有效解除PPAR?γ基因甲基化。同時(shí),RT?qPCR檢測結(jié)果也顯示,與對照組相比,藥物處理組PPAR?γ表達(dá)水平顯著增加,但不同藥物濃度間無顯著差異,提示PPAR?γ在低濃度(10 μmol/L)5?Aza?CdR處理時(shí)即可顯著表達(dá)升高;然MDA?MB?231細(xì)胞凋亡增加卻有劑量依賴性,提示PPAR?γ可能參與了誘導(dǎo)癌細(xì)胞凋亡的部分作用。在袁昱寧的研究中,作者利用5?Aza?CdR作用MDA?MB?231細(xì)胞后檢測促進(jìn)凋亡的E?cadherin、Wnt抑制因子(Wnt inhibitory factor 1,WIF1)基因表達(dá)上調(diào),且呈時(shí)間依賴性逐漸升高,而抑制凋亡的β?連環(huán)蛋白(β?catenin)的表達(dá)隨作用時(shí)間延長逐漸下降[15];Long 等[19]的研究亦發(fā)現(xiàn) 5?Aza?CdR處理MDA?MB?231細(xì)胞后,特異AT序列結(jié)合蛋白 2(special AT?rich binding protein 2,SATB2)表達(dá)降低,miR?31表達(dá)升高,抑制了細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。綜合以上結(jié)果,提示5?Aza?CdR可有效提高抑癌基因的表達(dá),從而抑制MDA?MB?231腫瘤細(xì)胞的生長。

      綜上,本研究提示,5?Aza?CdR 可有效降低PPAR?γ甲基化的水平,使其在mRNA轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)增加,促進(jìn)MDA?MB?231細(xì)胞凋亡,為表觀遺傳學(xué)藥物5?Aza?CdR用于TNBC治療提供更多實(shí)驗(yàn)和理論依據(jù)。

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