周小露 ,周才富 ,劉麗明,羅學(xué)尹,李興春,周才碧*
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院,湖南長(zhǎng)沙 410000;2.中共安龍縣委機(jī)要局,貴州安龍 552400;3.黔南民族師范學(xué)院生物科學(xué)與農(nóng)學(xué)院,貴州都勻 558000)
貴州是種茶大省,其茶葉種植面積已高達(dá)700萬(wàn)畝;其中黔南州的種植面積為150萬(wàn)畝,占貴州省茶園總面積的21%,是重要茶區(qū)之一。黔南州明確提出有機(jī)茶的發(fā)展目標(biāo),在有機(jī)茶園的建設(shè)過(guò)程中,必須提高無(wú)害化有機(jī)肥的投入,構(gòu)建茶園動(dòng)態(tài)植保體系。然而大量使用化學(xué)肥料會(huì)帶來(lái)土壤酸化、重金屬超標(biāo)、農(nóng)藥殘留等問(wèn)題。相關(guān)研究表明,貴州茶區(qū)如:都勻茶區(qū)[1,2]pH 值 3.00~4.00;湄潭和鳳岡在 4.00~4.50;正安在 4.00~5.00,土壤大面積有酸化情況。不僅如此,茶樹缺少大量元素,植株矮小,產(chǎn)量降低等問(wèn)題也困擾著茶農(nóng)。生物有機(jī)肥制作使用的是天然原料,比如秸稈、微生物、腐殖質(zhì)等,在有效菌種發(fā)酵過(guò)程中產(chǎn)生的多種可溶性生理活性物質(zhì),如有機(jī)酸、維生素等能被植物迅速吸收,既達(dá)到改善土壤結(jié)構(gòu)的目標(biāo),又可降低土壤的酸化程度[3-7],加快土壤中氮、磷等元素循環(huán)[8-11],減少Cd等[12]重金屬的累積,有助于緩解土壤酸化趨勢(shì)[13-14],促進(jìn)茶樹提早萌發(fā)[16]。
目前,可用于茶樹的生物有機(jī)肥較少,但使用化肥已經(jīng)對(duì)茶園造成嚴(yán)重危害,研制出可供茶樹使用的生物有機(jī)肥迫在眉睫,這就對(duì)生物技術(shù)專業(yè)的人員提出了新的市場(chǎng)研究方向。本實(shí)驗(yàn)以黔南州茶園優(yōu)質(zhì)土壤為材料,分離、純化得到優(yōu)勢(shì)菌株,并通過(guò)形態(tài)鑒定和分子鑒定,旨在于明確優(yōu)勢(shì)菌株的背景,為其在茶園專用有機(jī)肥的開發(fā)提供參考。
(1)土樣:采集于省黔南州都勻市三江堰茶園。
(2)蔗糖:化學(xué)純,天津市密歐化學(xué)試劑有限公司。
(3)瓊脂粉:北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)責(zé)任有限公司。
(4)硝酸鈉:分析純,北京化工廠。
(5)七水合硫酸鎂:分析純,天津市風(fēng)船化學(xué)試劑科技有限公司。
(6)氯化鉀:分析純,天津市福晨化學(xué)試劑廠。
(7)七水合硫酸亞鐵:分析純,天津市致遠(yuǎn)化學(xué)試劑有限公司。
(8)磷酸二氫鉀:分析純,壽光市艾益農(nóng)生物科技有限公司。
(9)其他材料:塑封袋,記號(hào)筆,鏟子,藥匙,蒸餾水,報(bào)紙,橡皮筋,保鮮膜,標(biāo)簽紙,馬鈴薯,利馬豆粉,75%酒精。
(1)電子顯微鏡:XSP-8C,德卡精密量?jī)x有限公司;
(2)電子天平:LTI000B,常熟市天量?jī)x器有限責(zé)任公司;
(3)恒溫培養(yǎng)箱:BHIC-250,上海博迅實(shí)業(yè)有限公司;
(4)超凈工作臺(tái):SW-CYJ1FDA,蘇凈集團(tuán)蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;
(5)高壓蒸汽滅菌鍋:GI5M4DS,致微儀器有限公司;
(6)冰箱:BCD-2651WBSV,上海帝覽實(shí)業(yè)有限公司;
(7)其他儀器:培養(yǎng)皿,取樣袋,酒精燈,濾紙,玻璃棒,燒杯,鑷子,接種環(huán),試管,三角瓶,量筒。
2.3.1 培養(yǎng)基配備
參考周才碧[17]的方法,按試驗(yàn)要求進(jìn)行適當(dāng)修改,具體方法如下:
(1)PDA培養(yǎng)基:洋芋400 g,葡萄糖40 g,瓊脂40 g,蒸餾水2000 mL。
(2)察氏培養(yǎng)基:蔗糖30 g,硝酸鈉2 g,七水合硫酸鎂0.5 g,氯化鉀0.5 g,七水合硫酸亞鐵0.01 g,磷酸二氫鉀1.0 g,瓊脂粉15 g,蒸餾水1000 mL。
2.3.2 菌株分離
(1)采集土壤:在貴州省都勻市三江堰茶園中,挑選優(yōu)質(zhì)土壤,用鏟子挖出,裝入密封袋中,用標(biāo)簽紙貼好并編號(hào),帶入實(shí)驗(yàn)室以便制作菌種懸液。
(2)材料消毒:防止帶回土壤被周圍環(huán)境中的菌種污染,實(shí)驗(yàn)操作要求在無(wú)菌條件下進(jìn)行。提前2h把制備的培養(yǎng)基、實(shí)驗(yàn)所用的工具和蒸餾水(制備稀釋濃度梯度的無(wú)菌水)放入高壓滅菌鍋中滅菌,以便使用。
(3)稀釋菌懸液:取20g土壤放入三角瓶中,裝入80mL的無(wú)菌水,搖晃 20min,制備菌種原懸液;再依次稀釋得到 10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6濃度梯度的菌種懸液。
(4)涂布接種:在酒精燈周圍,用接種環(huán)蘸取兩到三滴菌種懸浮液,使用涂布法在已經(jīng)配好的培養(yǎng)基中接種,并且將接種濃度用標(biāo)簽紙?jiān)谂囵B(yǎng)皿上做好記錄。實(shí)驗(yàn)完成后,整理并關(guān)閉超凈工作臺(tái),把已接種好的培養(yǎng)基放入25℃的培養(yǎng)箱中,培養(yǎng)6-7d。直到有菌落形成時(shí),就可以對(duì)菌株進(jìn)行純化處理。
2.3.3 菌株純化
(1)準(zhǔn)備工作:培養(yǎng)至第6d,已經(jīng)在培養(yǎng)基上可以明顯觀察到菌落。挑選培養(yǎng)基上生長(zhǎng)旺盛的菌落,使用涂布平板劃線法進(jìn)行進(jìn)一步的純化處理。
(2)平板劃線法純化菌種:在超凈工作臺(tái)上進(jìn)行劃線操作:首先在培養(yǎng)皿的底部用記號(hào)筆畫出五個(gè)區(qū)域,并標(biāo)號(hào)。涂布劃線時(shí)注意在酒精燈周圍操作,先把接種環(huán)在酒精燈上灼燒2、3秒,等待接種環(huán)的溫度降低,可以把接種環(huán)放入培養(yǎng)基中等待降溫,防止較高的溫度殺死菌種。接著用接種環(huán)沾取菌,從標(biāo)記的第I個(gè)區(qū)域開始劃線,畫出3、4條線后,用一定的角度連接著第Ⅰ個(gè)區(qū)域,繼續(xù)朝第Ⅱ個(gè)區(qū)域劃出3-4條線,接著再朝第三個(gè)區(qū)域畫線,以此類推。
2.3.4 菌株鑒定
在本試驗(yàn)中對(duì)于菌株的檢測(cè)主要采用傳統(tǒng)的生物形態(tài)學(xué)鑒定法和ITS序列鑒定法。
(1)形態(tài)學(xué)鑒定的方法:
利用電子顯微鏡對(duì)菌種進(jìn)行觀察并記錄菌種的相關(guān)特征,初步判斷該菌種的種類。被純化的菌種檢測(cè)出有25個(gè)孢子囊、分生孢子及厚垣孢子,根據(jù)記錄的優(yōu)勢(shì)菌種形態(tài)特征,先對(duì)比、分析出一類屬種。
生長(zhǎng)速率的測(cè)定:在無(wú)菌環(huán)境下,把優(yōu)勢(shì)菌株打成直徑為5 mm的菌餅,轉(zhuǎn)移至條件為25℃的培養(yǎng)箱中,培養(yǎng)7 d后,量取優(yōu)勢(shì)菌的直徑并再次記錄優(yōu)勢(shì)菌的特征。
(2)分子鑒定的方法:
①DNA的提取
利用優(yōu)勢(shì)種的菌絲,分步進(jìn)行操作:a.研磨菌絲,加進(jìn)500 μL裂解液,放置10 min;b.加入濃度是3M的KAC 150 μ L,經(jīng)離心(12000 rpm)15 min,取其上清;c.重復(fù)b,取上清液加入異丙醇,在12000 rpm條件下離心至15 min;d.取上清,加300 μL 70%的乙醇沉淀DNA,12000 rpm離心10 min,洗滌 4次;e.等水分散失,加 0.1×TE 30 μL,最終獲取液體狀態(tài)下的DNA。
②PCR擴(kuò)增
引物是通用引物ITS4(5'-TCCT CCGC TTAT TGAT ATGC-3',擴(kuò)增體系的總體積是 25μL(DNA模板 1μL、10× buffer的緩沖液體 2.5μL、dNTPs 2μL、正引物1μL的體積、反向引物 1μL。Ex Taq DNA 聚合酶 0.125μL和ddH2O 17.4 μL),把體系中的不加菌株DNA提取物作為陰性對(duì)照,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增完成取出產(chǎn)物保存在4度冰箱,備用。
③電泳
a.制膠:稱 0.2 g瓊脂糖,加 20 mL的 0.5×TBE緩沖液(pH8.0),用微波爐加熱1.5 min,拿出瓊脂糖溶液,靜置一段時(shí)間,加1 μL Goldview指示劑,搖勻;插好梳子,穩(wěn)定模具,把凝膠倒入制膠模具。
b.電泳:將制膠板置于電泳槽中。取5 μL擴(kuò)增產(chǎn)物加入2.5 μL溴酚藍(lán),混勻后點(diǎn)樣。開啟設(shè)備,設(shè)定電壓(120 V)和時(shí)間(30 min)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)束后在凝膠成像系統(tǒng)中查看拍照并將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送到華大基因生物技術(shù)有限公司測(cè)序。
④序列分析
把測(cè)序所得序列放到National Center for Biotechnology Information(NCBI)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)Blast檢測(cè),然后下載相應(yīng)菌株序列。把所有菌株序列導(dǎo)入MEGA6.0軟件用多序列比對(duì)分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,肯定菌株種別。
PCR產(chǎn)物測(cè)序后提交到GenBank中,經(jīng)BLAST比對(duì)。
以優(yōu)質(zhì)土壤為材料,利用稀釋涂布分離得到5種菌;進(jìn)一步利用平板劃線純化該菌株,最終得到優(yōu)勢(shì)菌株S3(詳見圖1),該菌株在25℃,PDA培養(yǎng)基中生長(zhǎng)旺盛,生長(zhǎng)周期較長(zhǎng)。
3.2.1 形態(tài)鑒定
利用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定的方法,對(duì)3.1分離、純化得到的菌株S3進(jìn)行觀察:利用電子顯微鏡觀察,優(yōu)勢(shì)菌種S3邊緣薄,中心有不規(guī)則狀的條紋,向上突起的菌絲在球形頂囊上分生出粗糙的孢子梗,孢子梗中長(zhǎng)出許多分生孢子,具有足細(xì)胞。呈橄欖色,放射圓柱狀1-2節(jié)球狀,菌落大小4-8.5nm。根據(jù)菌株S3的菌落和孢子形態(tài)等特征,初步推斷該菌屬為青霉屬菌株(詳見圖 2)。
3.5.2 分子鑒定
提取菌株變幻青霉DNA,進(jìn)行凝膠電泳及PCR擴(kuò)增得到1條946 bp的清晰條帶(圖3),將此PCR產(chǎn)物測(cè)序后提交到GenBank中,經(jīng)BLAST比對(duì)后發(fā)現(xiàn),病原真菌的rDNA-ITS序列與Penicillium Variabile(HM469398)的序列相似度高達(dá)100%。依據(jù)比對(duì)結(jié)果構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖4),表明該菌應(yīng)歸為Penicillium Variabile。
結(jié)合形態(tài)學(xué)與分子生物學(xué)鑒定,確定從茶園土壤中分離純化出的菌為變幻青霉。
圖1 利用平板劃線純化出的優(yōu)勢(shì)菌S3
圖2 S3形態(tài)特征
圖3 S3 ITS擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
圖4 S3的系統(tǒng)發(fā)育樹
不同海拔、土壤、品種、樹齡、季節(jié)及管理方式,茶園土壤的優(yōu)勢(shì)菌株各異,且隨著土層的加深,真菌的種類和數(shù)量均逐漸減少;在茶園16目29屬39種微生物中,霉菌的種類最多[18-19]。本實(shí)驗(yàn)取黔南州茶園優(yōu)質(zhì)土壤為材料,并對(duì)其進(jìn)行稀釋分離,將其樣品懸液涂布于培養(yǎng)皿培養(yǎng)得出多種菌種,又對(duì)菌種進(jìn)行分離,再挑取菌種純化得到優(yōu)勢(shì)菌株S3。
為了明白優(yōu)勢(shì)菌株的背景,對(duì)于優(yōu)勢(shì)菌株S3的鑒定首要采取傳統(tǒng)的生物形態(tài)學(xué)鑒定法,利用電子顯微鏡觀察,初步推測(cè)該優(yōu)勢(shì)菌株S3為青霉屬菌株。青霉屬、曲霉屬和藍(lán)狀菌屬微生物均是土壤重要的腐生真菌,在不同地區(qū)和不同土壤類型都有廣泛分布,特別是熱帶或亞熱帶的磚紅壤、赤紅壤、紅壤、黃壤和燥紅土等酸性土壤[20]。為了研究?jī)?yōu)勢(shì)菌株的背景、便于進(jìn)一步開發(fā)該菌株,需進(jìn)一步明確目標(biāo)菌的種屬關(guān)系。經(jīng)過(guò)ITS序列分析,優(yōu)勢(shì)菌株S3與Penicillium Variabile(HM469398)的序列相似度高達(dá)100%。依據(jù)比對(duì)結(jié)果構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)合形態(tài)鑒定表明該菌應(yīng)歸為變幻青霉Penicillium Variabile;該菌株在蘆葦根際土壤、山西歷山自然保護(hù)區(qū)土壤等[21-22]中均有發(fā)現(xiàn),而在茶園土壤中為首次報(bào)道。
本研究從優(yōu)質(zhì)土壤中稀釋培養(yǎng)出菌種,并通過(guò)分離、純化得到優(yōu)勢(shì)菌株S3;結(jié)合形態(tài)鑒定和分子鑒定可確定本次研究所得到的優(yōu)勢(shì)菌株S3為變幻青霉。
目前,化學(xué)肥料的使用已經(jīng)有不同的危害,微生物是土壤的重要組成部分,在土壤中有至關(guān)重要的作用;利用有益微生物參與有機(jī)肥的配制,可調(diào)節(jié)速效與緩效養(yǎng)分、提高肥料利用率,減輕氮肥造成的硝酸鹽積累以及磷鉀肥造成的重金屬污染。但用變幻青霉作為生物有機(jī)肥的報(bào)道很少,對(duì)其是否有益于茶園土壤改善還有待于進(jìn)一步研究。