王 艷 成金樂(lè)
(1 廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥資源科學(xué)與工程研究中心、嶺南中藥資源教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(廣州中醫(yī)藥大學(xué))、國(guó)家中成藥工程技術(shù)研究中心南藥研發(fā)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510006;2 國(guó)家中醫(yī)藥管理局中藥破壁飲片技術(shù)與應(yīng)用重點(diǎn)研究室,中山市中智藥業(yè)集團(tuán)有限公司,廣東 中山 528437)
中藥破壁飲片[1]是中山市中智藥業(yè)集團(tuán)有限公司研發(fā)的一種創(chuàng)新型中藥飲片,系指將符合法定標(biāo)準(zhǔn)要求并具有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的植物類中藥飲片,經(jīng)現(xiàn)代粉碎技術(shù)加工至D90<45 μm(300目以上) 的粉體,不添加成型劑制成30~100目的具有原飲片全成分的均勻干燥顆粒狀飲片。中藥破壁飲片在保證物質(zhì)基礎(chǔ)沒(méi)有改變的前提下,將物質(zhì)成分利用率提高至90%以上,是傳統(tǒng)飲片煎煮提取的3倍以上,從而大幅度減少使用劑量。這對(duì)于資源緊缺的中藥,尤其是貴重藥材的可持續(xù)利用具有重大的意義。為了保證臨床及日常使用的安全有效,中藥破壁飲片的真?zhèn)舞b別及其重要前提。然而破壁飲片經(jīng)過(guò)破壁粉碎處理后,其粉體粒度非常小,失去了傳統(tǒng)中藥飲片應(yīng)有的性狀特征和絕大部分的顯微特征。利用傳統(tǒng)飲片法定標(biāo)準(zhǔn)中的性狀鑒別和粉末鑒別法來(lái)鑒定中藥破壁飲片真實(shí)性的可行性比較低。因此,建立一種行之有效、可信可靠的方法來(lái)鑒定中藥破壁飲片的真實(shí)性是非常有必要的。
DNA條形碼是近年來(lái)發(fā)展迅速的可用于動(dòng)植物物種快速鑒定的技術(shù)[2],是利用基因組中一段公認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)的、相對(duì)較短的DNA片段來(lái)進(jìn)行物種鑒定的分子診斷技術(shù),是近年來(lái)生物分類和鑒定的研究熱點(diǎn)。DNA條形碼直接利用物種的遺傳信息在分子水平上進(jìn)行鑒別,為物種鑒定提供了最本質(zhì)的依據(jù)。DNA條形碼作為新的分子鑒定技術(shù),在物種鑒定方面有著其他技術(shù)無(wú)法比擬的優(yōu)點(diǎn):①技術(shù)指標(biāo)相對(duì)統(tǒng)一:只需選用一個(gè)或少數(shù)幾個(gè)合適的基因片段即可對(duì)整個(gè)屬、科甚至幾十個(gè)科的絕大部分物種進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒定;②快速高效;③重復(fù)性和穩(wěn)定性好;④試驗(yàn)過(guò)程標(biāo)準(zhǔn)化、簡(jiǎn)單化;⑤鑒定信息的可管理性:試驗(yàn)所得的物種序列信息可通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)和信息平臺(tái)等在全球范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)統(tǒng)一管理和資源共享,有利于構(gòu)建系統(tǒng)、完整的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)。
與傳統(tǒng)鑒定方法相比,DNA條形碼技術(shù)可快速有效地達(dá)到物種鑒定的目的,并且不受個(gè)體形態(tài)、大小、發(fā)育生長(zhǎng)階段和完整性的影響。DNA條形碼是近年來(lái)發(fā)展迅速的可用于動(dòng)植物物種快速鑒定的技術(shù),因此也被廣泛用于藥用植物的物種鑒定工作中。陳士林等[2]應(yīng)用ITS2、psbA-trnH和COI序列完成了《中華人民共和國(guó)藥典》2010版208味中藥材原動(dòng)植物及1000余種混淆品種的DNA條形碼鑒定。同時(shí)該課題組對(duì)6000余份藥用植物樣本進(jìn)行DNA條形碼序列篩選,提出以ITS2(Internal Transcribed Spacer 2)作為藥用植物標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼[3],以psbA-trnH作為輔助的藥用植物鑒定技術(shù)的思路[4]。馬新業(yè)等[5]研究發(fā)現(xiàn)psbA-trnH在藥用蕨類中具有較高的PCR擴(kuò)增率和物種鑒定率,并建議psbA-trnH作為蕨類中藥的DNA條形碼序列。朱英杰等[6]對(duì)重樓屬11個(gè)物種17份樣品的psbA-trnH、rpoB、rpoC1、rbcL、matK和核ITS2序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)ITS2序列在重樓屬中的鑒定成功率達(dá)到100%。
中藥破壁飲片是一類創(chuàng)新型中藥飲片,經(jīng)過(guò)破壁處理后已完全失去外觀形狀,無(wú)法進(jìn)行傳統(tǒng)的性狀鑒別。同時(shí),由于破壁粉末粒徑極小,顯微特征也大多缺失。因此,傳統(tǒng)鑒定方法已不能適用于破壁飲片的鑒別,而DNA條形碼正好提供了一個(gè)強(qiáng)大的鑒別手段?!吨腥A人民共和國(guó)藥典》 (2010年版第三增補(bǔ)版)收錄了DNA條形碼技術(shù),作為中藥材質(zhì)量控制的新方法[7]。近幾年來(lái),相關(guān)課題組成員已針對(duì)中藥破壁飲片的DNA條形碼鑒別展開(kāi)了一系列的科研實(shí)驗(yàn),并且已經(jīng)利用psbA-trnH片段鑒定羅漢果和山藥破壁草本[8]。向麗等[9]選用ITS2序列作為DNA條形碼對(duì)全草類、根及根莖類、葉類、花類、果實(shí)類和種子類的31種代表性中藥(28個(gè)物種)的原藥材、超微飲片及破壁飲片共93份樣品進(jìn)行研究,驗(yàn)證DNA條形碼技術(shù)對(duì)中藥超微飲片和中藥破壁飲片基原物種追溯的可靠性。DNA條形碼技術(shù)近年來(lái)在中藥的鑒定應(yīng)用方面的推廣,為破壁飲片等粉末或顆粒狀中藥制品的物種鑒定提供了很好的技術(shù)參考。DNA條形碼在破壁飲片的物種鑒定的成功應(yīng)用,也對(duì)后者的質(zhì)量控制發(fā)揮了重要的作用。而對(duì)于DNA提取的方法,通過(guò)實(shí)驗(yàn)研究也有很多種,如氯化銫法、SDS法和一管法等[10],并把它運(yùn)用在動(dòng)、植物和微生物的DNA研究中。由于這些DNA提取方法有的成本高和使用會(huì)造成環(huán)境污染,且提取效果不夠理想。隨著這一技術(shù)逐步改進(jìn),如Saghai-Maroof等[11]研發(fā)出十六烷基三甲基溴化銨 (CTAB)法用于提取植物DNA等,使得DNA的提取相對(duì)較為快捷,提取的DNA質(zhì)量較高。本實(shí)驗(yàn)應(yīng)用改良的CTAB法提取32個(gè)中藥破壁飲片品種的DNA,以ITS2為鑒定序列,其方法簡(jiǎn)單可行,能高效達(dá)到提取樣品中的DNA并測(cè)序成功及物種鑒定。
利用CTAB在高離子強(qiáng)度的緩沖溶液中與蛋白質(zhì)和大多數(shù)酸性多聚糖以外的多聚糖形成復(fù)合物,但不沉淀核酸的特性,用離心獲得含DNA的上清液;用氯仿和異戊醇混合液使蛋白質(zhì)變性、分層,同時(shí)除去脂類的方法,從而達(dá)到提取和純化DNA的目的。
2.1 實(shí)驗(yàn)材料 白芍(批號(hào):20141205)、大棗(批號(hào):20141208)、槐花(批號(hào):20140722)、荷葉(批號(hào):20140901)、雞骨草(批號(hào):20141216)、木棉花(批號(hào):20141231)、人參 (批號(hào):20141221)、熟三七(批號(hào):20141202)、山銀花(批號(hào):20141214)、太子參(批號(hào):20141207)、鹽補(bǔ)骨脂(批號(hào):20141203)、薏苡仁(批號(hào):20140729)、枳實(shí)(批號(hào):20140326)、木瓜(批號(hào):20141205)、百合(批號(hào):20140805)、葛花(批號(hào):20140715)、蓮子、(批號(hào):20140729)、白術(shù)(批號(hào):201709P001)、白芷(批號(hào):20170502)、川芎(批號(hào):20171201)、桔梗(批號(hào):20170701)、女貞子 (批號(hào):20170602)、肉蓯蓉 (批號(hào):20170801)、玄參(批號(hào):20170701)、白茅根(批號(hào):170801)、炒麥芽(批號(hào))、佛手(批號(hào):170901)、柯子(批號(hào):C-170157)、南沙參(批號(hào):B705101-01)、桑葚(批號(hào):171001)、冬凌草(批號(hào):A170601)、五指毛桃(批號(hào):170102)
2.2 試劑 主要有NaCl、EDTA、Tris、HCl、CTAB、β-巰基乙醇、氯仿、異戊醇、異丙醇、乙醇、PVP-40等。
2.3 實(shí)驗(yàn)儀器 生物樣品均質(zhì)儀(愛(ài)施德,Bioprep-24)、低 溫冰 箱 (Eppendorf,5430R); 多 功能PCR儀(Biometra,F(xiàn)lex Cycler 2);水平電泳儀 (Bio-Rad);凝膠成像儀(Biometra,BDA digital)。
3.1 CTAB溶液的配制 CTAB緩沖液配制如表1。
表1 3%CTAB(1000 mL)緩沖液配制成分表
3.2 DNA提取 取已研磨好的樣品50 mg,向各樣品管中加入800 μL核分離液 (100 mmol/L Tris-HCl,20 mmol/L EDTA,0.7 mol/L NaCl,20 g PVP-40,2 mLβ-巰基乙醇)劇烈振蕩,旋轉(zhuǎn)混勻5 min,12000 r/min離心3 min,棄去上清液,重復(fù)上述步驟1~2次;向各樣品管中加入800 μL 3%CTAB緩沖液,充分振蕩混勻,65℃金屬浴中孵育3 h,期間每隔10 min左右顛倒混勻數(shù)下。加入600 μL氯仿-異戊醇 (24∶1,V∶V),充分振蕩混勻,12000 r/min離心10 min,小心吸取上清于新的1.5 mL離心管中。加入等體積-20℃預(yù)冷的異丙醇,分次轉(zhuǎn)移至吸附柱中12 000 r/min離心1 min,棄去下液。加入700 μL-4℃預(yù)冷的75%乙醇,12000 r/min離心1 min,棄盡下液,繼續(xù)加入500 μL-4℃預(yù)冷的75%乙醇,上下顛倒混勻數(shù)次,12000 r/min離心1 min,棄盡下液,將空管離心1 min,取出加入50 μL 65℃預(yù)熱的dd H2O,12000 r/min離心1 min,置于-20℃保存,備用。
表2 ITS2比對(duì)結(jié)果
3.3 PCR擴(kuò)增及測(cè)序 PCR反應(yīng)體系:2×Power Taq PCR Master Mix(百泰克,PR1701)12.5 μL,正反向引物:ITS2-2F,ATGCGATACTTGGTGTGAAT;ITS2-3R,GACGCTTCTCCAGACTACAAT各1.0 μL,DNA模板2.0 μL,ddH2O補(bǔ)足體積至25.0 μL;陰性對(duì)照 (Negative control,NC) 采用ddH2O作為模板。溫度程序(ITS2):94℃,4 min;94℃,30 s;52℃,30 s;72℃,45 s,35個(gè)循環(huán);72℃,5 min。反應(yīng)完成后用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)各PCR產(chǎn)物,在目的區(qū)域出現(xiàn)清晰條帶的樣品則送檢做Sanger測(cè)序[12]。
3.4 數(shù)據(jù)處理 將測(cè)序所得的原始峰圖導(dǎo)入Codon-CodeAligner(Version 5.1.5.0) 進(jìn)行序列處理,去除5.8SrRNA和28SrRNA區(qū)以獲得ITS2序列。將各樣品的ITS2序列作為Quary分別在NCBI、中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng)(http://www.tcmbarcode.cn/china/index.php?optionid=174)上做比對(duì),取同源性最高的比對(duì)結(jié)果。
利用ITS2片段可以成功鑒定出本研究中的32個(gè)中藥破壁飲片品種,各樣品的ITS2序列比對(duì)結(jié)果與公共數(shù)據(jù)庫(kù)中已有序列的同源性達(dá)到95%以上。結(jié)果見(jiàn)表2。
中藥破壁飲片通過(guò)氣流破壁技術(shù)導(dǎo)致其形態(tài)及外觀特征發(fā)生改變,難以對(duì)物種進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒定。本文運(yùn)用DNA條形碼技術(shù)對(duì)32個(gè)中藥破壁飲片品種進(jìn)行物種鑒定。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明改良的CTAB法對(duì)于一些炮制過(guò)的樣品也能成功地提取出DNA,同時(shí)也說(shuō)明破壁技術(shù)未對(duì)藥材的遺傳物質(zhì)產(chǎn)生破壞。在實(shí)驗(yàn)研究初期,也嘗試使用試劑盒法提取DNA,結(jié)果都不理想,而采用改良的CTAB法能達(dá)到提取及鑒定的效果。用3%CTAB進(jìn)行提取,比常規(guī)的CTAB法提取出來(lái)的DNA更純,由于植物組織,如葉片中含有較高的多酚、蛋白質(zhì)、脂類、多酯的角質(zhì)等不利于DNA提取過(guò)程中干擾物質(zhì)的去除,利用常規(guī)的CTAB方法等難以獲得高質(zhì)量DNA。主要原因是提取所得的DNA樣品中含有較高含量的蛋白質(zhì),甚至具有多酚氧化的褐色物等,從而影響利用DNA進(jìn)行進(jìn)一步的特性分析(如酶切,PCR反應(yīng)等)。運(yùn)用DNA條形碼技術(shù)對(duì)中藥破壁飲片進(jìn)行鑒定可以不受藥材外部形態(tài)不完整或已被加工成粉末、飲片的影響,能直接在分子水平上對(duì)中藥材進(jìn)行快速準(zhǔn)確鑒定,為中藥破壁飲片的真?zhèn)舞b別提供有效手段。