周欽茂 謝燕純 陳彥梅 張揚(yáng) 柯德森 陳瓊?cè)A
(廣州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣州 510000)
瓊膠是從紅藻中提取的親水性海藻多糖,由瓊膠糖和硫瓊膠組成[1]。由于瓊膠具有優(yōu)良的凝膠、增稠和穩(wěn)定性能,常被用于制作增稠劑、凝固劑、保鮮劑等,廣泛應(yīng)用于食品、日用化工、輕工、醫(yī)藥等領(lǐng)域中[2];但是,由于瓊膠黏度高,水溶性差,難以被吸收,在應(yīng)用方面也受到很大限制[3]。然而,由瓊膠水解得到的瓊膠寡糖(主要由瓊二糖的重復(fù)單位連接而成,分為瓊寡糖和新瓊寡糖兩個(gè)系列)卻具有水溶性高,易被吸收的特點(diǎn),具備良好的抑菌、增殖腸道益生菌、抗腫瘤、抗炎、抗氧化、抗病毒、增強(qiáng)免疫、吸濕保濕、美白和對(duì)植物病害防治等藥理作用和生物活性,是一種新型海洋功能性低聚糖,已經(jīng)成為國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn),具有極大的開發(fā)潛力[4-6]。目前利用瓊膠來(lái)獲得低分子量的瓊膠寡糖多采用生物酶法(瓊膠酶)和化學(xué)法(酸水解),其中化學(xué)法處理無(wú)法精確控制水解度,而且后期的分離純化過程非常繁瑣,還會(huì)導(dǎo)致生成的瓊膠寡糖喪失生物活性,具有很大的局限性;而生物酶法作用環(huán)境十分溫和,降解過程易控制,產(chǎn)物專一且易于分離純化,工藝環(huán)保高效[7-9]。因此,運(yùn)用瓊膠酶降解瓊膠制備瓊膠寡糖已成為瓊膠工業(yè)高值化研究的重要方向。
瓊膠酶是能夠降解瓊膠的水解酶,分為α-瓊膠酶和β-瓊膠酶。α-瓊膠酶裂解瓊脂糖的 α-1,3糖苷鍵,生成以3,6-內(nèi)醚-α-L半乳糖為還原性末端的的瓊寡糖系列;β-瓊膠酶裂解瓊脂糖的 β-1,4 糖苷鍵,生成以β- D-半乳糖為還原性末端的新瓊寡糖系列[10]。迄今為止,瓊膠酶主要通過海洋微生物獲得,因此,獲得具有開發(fā)前景的菌株是開發(fā)微生物瓊膠酶的前提,目前人們已經(jīng)從海水系統(tǒng)中分離到了多種產(chǎn)瓊膠酶菌株,包括假單胞菌屬[11](Pseudomonas)、假別單胞菌屬[12](Pseudoalteromonsa)、鏈霉菌屬[13](Streptomyces)、別單胞菌屬[14](Alteromonas)、不動(dòng)桿菌屬[15](Acinetobacter)、弧菌屬[16](Vibrio)和船蛆桿菌屬[17](Teredinibacter)等。但是普遍存在的問題是這些菌株所產(chǎn)瓊膠酶活性低,多數(shù)報(bào)道的菌株產(chǎn)瓊膠酶活力在 10 U 以下,降解瓊膠能力普遍不高,遠(yuǎn)未能達(dá)到工業(yè)化生產(chǎn)瓊膠寡糖的需求[18]。目前只有Sigma公司從大西洋假單胞菌中分離的β瓊膠酶應(yīng)用于生產(chǎn),且價(jià)格十分昂貴,應(yīng)用范圍大多僅限于科研工作中,這嚴(yán)重阻礙了瓊膠酶及瓊膠寡糖的開發(fā)應(yīng)用[19]。
廣東省擁有豐富的海藻資源,近年來(lái)海藻養(yǎng)殖方面也取得了很大進(jìn)展,但在開發(fā)利用方面還比較薄弱,存在很大的資源利用空間。因此,本研究選擇富含瓊膠的海洋龍須菜做為瓊膠酶產(chǎn)生菌的分離對(duì)象,通過多種不同的篩選培養(yǎng)基,從龍須菜中分離產(chǎn)瓊膠酶菌株,并對(duì)得到的菌株進(jìn)行形態(tài)學(xué)、生理生化、16S rRNA 基因序列分析及發(fā)酵產(chǎn)酶研究,旨在獲得瓊膠酶高產(chǎn)菌株,為瓊膠酶及瓊膠寡糖的開發(fā)利用奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 樣品 龍須菜樣品于2016年8月采自廣東省南澳島海域。
1.1.2 主要試劑和儀器 K2HPO4,KCl,MgSO4·7H2O,牛肉膏,酵母浸膏,海鹽,D半乳糖,碘化鉀,3-5二硝基水楊酸,酒石酸鉀鈉(上海生工生物工程有限公司),α-pNPG 和 β-pNPG(Macklin 公司)。
7230G紫外-可見分光光度計(jì)(上海諾科),SX-500高壓蒸汽滅菌鍋(Tomy公司),PB-10 pH計(jì)(Sartorius公司),BS423S天平(Sartorius公司),BCD-563WY-C對(duì)開門冰箱(Haier 公司),SW-CJ-2FD潔凈工作臺(tái)(Airtech公司),ETC 811 PCR儀(北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司),弧菌科細(xì)菌生化鑒定盒(廣東環(huán)凱微生物科技有限公司)。
1.1.3 培養(yǎng)基 x半海水培養(yǎng)基[20](g/L):蛋白胨6,瓊脂粉15,K2HPO41,KCL 0.5,MgSO4.7H2O 0.5,人工海水配制,pH 7.2左右;2216E培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨5,酵母膏1,瓊脂粉15,磷酸高鐵0.01,人工海水配制,pH 7.6-7.8;改良培養(yǎng)基[21](g/L):MgSO4.7H2O 0.1,F(xiàn)eSO40.1,(NH4)2SO42,K2HPO47,KH2PO43,瓊脂粉15,人工海水配制,pH 7.2;富集培養(yǎng)基(g/L):瓊脂粉2,蛋白胨10,酵母膏10,NaCL 20,pH 6.5;斜面培養(yǎng)基:同x半海水培養(yǎng)基;種子培養(yǎng)基:蛋白胨6,瓊脂粉10,K2HPO41,KCL 0.5,MgSO4.7H2O 0.5,人工海水配制,pH 7.2左右;發(fā)酵培養(yǎng)基:同種子培養(yǎng)基。
1.2.1 產(chǎn)瓊膠酶菌株分離和篩選 在廣東省南澳島采集龍須菜樣品,分別通過均質(zhì)法和振蕩法處理樣品后,取懸液接入富集培養(yǎng)基進(jìn)行富集培養(yǎng),將富集培養(yǎng)的菌液進(jìn)行 10-1-10-4逐級(jí)稀釋,取 10-3、10-4兩個(gè)稀釋度的菌液涂布平板,27℃恒溫培養(yǎng)18-24 h。用接種環(huán)挑取不同菌落進(jìn)行平板分區(qū)劃線,重復(fù)操作直至得到純化菌株。滴加盧戈氏碘液,觀察是否產(chǎn)透明圈,以此判斷純化菌株是否產(chǎn)瓊膠酶。選取透明圈較大的菌株,挑取相應(yīng)的菌苔3環(huán),接入裝有60 mL 種子培養(yǎng)基的100 mL錐形瓶中,28℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)18 h后以3%的接種量接入裝有100 mL發(fā)酵培養(yǎng)基的500 mL錐形瓶中,28℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)24 h后以5 000 r/min 的轉(zhuǎn)速離心15 min,取上清液即粗酶液進(jìn)行酶活力的測(cè)定。
1.2.2 瓊膠酶活力的測(cè)定 (1)標(biāo)準(zhǔn)曲線的制定:準(zhǔn)確稱取100 mg 半乳糖,用少量蒸餾水溶解后轉(zhuǎn)移到100 mL 容量瓶定容,得到濃度為l mg/mL的半乳糖溶液。取9 支25 mL 具塞試管,按照表1內(nèi)容加入試劑,混合均勻后沸水浴5 min,冷卻至室溫,將其定容到25 mL,隨后對(duì)混合液540 nm 處的吸光值進(jìn)行測(cè)定,然后根據(jù)吸光值制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。(2)DNS法測(cè)酶活:參照朱慧文、孫延娜等的方法[22],采用DNS法測(cè)酶活:配制底物,加熱煮沸,待瓊脂全部溶解后取出置于50℃水浴鍋中緩慢降溫。將發(fā)酵液在5 000 r/min下離心20 min 后分別取粗酶液1 mL加入4支25 mL具塞試管中,1支作為空白對(duì)照組,另外3支為實(shí)驗(yàn)重復(fù)組。在空白組中加入1.5 mL DNS溶液鈍化瓊膠酶,將全部試管置于50℃水浴鍋中水浴保溫10 min。各吸取底物溶液(0.3%瓊脂配制)1 mL,加入4根試管中,充分混勻后于50℃水浴鍋中反應(yīng)30 min。DNS各1.5 mL,分別加入至實(shí)驗(yàn)組的3根試管中以終止反應(yīng),50℃水浴保溫10 min。取出試管,沸水浴 5 min后立即冷卻至室溫,,用蒸餾水定容至25 mL,充分混勻后,于540 nm 處測(cè)吸光值。以煮沸滅活酶液為對(duì)照,用半乳糖制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線確定酶降解底物產(chǎn)生的還原糖的量。瓊膠酶的活力定義為:在上述反應(yīng)條件下,1 mL酶液1 min產(chǎn)生l μg還原糖作為一個(gè)酶活力單位(U/mL)。
表1 半乳糖標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
瓊膠酶活力(U/mL)= 半乳糖含量(mg)×1 000×粗酶液(mL)×稀釋倍數(shù) / 反應(yīng)體系中酶液加入量(mL)×?xí)r間(min)
1.2.3 菌株的形態(tài)學(xué)觀察及生理生化鑒定 將菌株在平板培養(yǎng)基上劃線接種,采用肉眼觀察菌落形態(tài),參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[23]進(jìn)行染色,觀察菌體的單染色、革蘭氏染色、鞭毛染色、芽孢染色和莢膜染色等結(jié)果,利用弧菌科細(xì)菌生理生化鑒定盒(廣東環(huán)凱微生物科技有限公司)鑒定菌株的生理生化特性。
1.2.4 16S rRNA基因序列的基因序列擴(kuò)增、比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析 采用煮沸處理法[24]對(duì)菌株進(jìn)行破壁處理,使用通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和 1492R(5′-GGCTA CCTTGTTACGACTT-3′)進(jìn)行菌落PCR。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?95℃ 2 min,94℃ 30s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,35個(gè) 循環(huán);72℃ 10 min。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),送至上海生工生物工程有限公司測(cè)序。使用Geneious軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接,利用NCBI網(wǎng)站的BLAST程序在GenBank上對(duì)拼接結(jié)果進(jìn)行相似性比對(duì),分析比對(duì)結(jié)果,從比對(duì)結(jié)果中挑出相似性較高的菌株序列,使用 MEGA7.0的Neighbor-Joining(NJ)方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。
1.2.5 細(xì)菌生長(zhǎng)曲線和產(chǎn)酶曲線的測(cè)定 以6%的接種量將種子液接種到發(fā)酵培養(yǎng)基,180 r/min,28℃搖床發(fā)酵培養(yǎng),定期取適量發(fā)酵液測(cè)定600 nm下稀釋10倍的菌液的吸光度和發(fā)酵液的酶活力,繪制該菌的生長(zhǎng)曲線和產(chǎn)酶曲線。
1.2.6 瓊膠酶類型的鑒定 參照Temuujin等[25]、馬芮萍和朱艷冰等[26]的方法,取400 μL 4 mg/mL的α-pNPG(對(duì)硝基苯基 -α-D-吡喃半乳糖苷)和 β-pNPG(對(duì)硝基苯基-β-D-吡喃半乳糖苷)分別和1 mL 50 mmol/L的NaH2PO4-Na2HPO4緩沖液(pH 7.0)混合均勻,40℃水浴預(yù)熱5 min,迅速加入1 mL粗酶液,混勻后40℃水浴加熱反應(yīng)1 h,加入1 mL 1 mol/L的Na2CO3終止反應(yīng),420 nm波長(zhǎng)下測(cè)定吸光度。
2.1.1 初篩結(jié)果 從采集到的龍須菜樣品中共分離到18株產(chǎn)瓊膠酶的海洋細(xì)菌。通過滴加盧戈氏碘液觀察透明圈大小,測(cè)量比較透明圈內(nèi)外徑大小進(jìn)行初篩,得到8株產(chǎn)瓊膠酶能力較強(qiáng)的菌株。圖1是其中編號(hào)為D-5的菌株的盧戈氏碘液染色圖片,其菌落周圍形成較大的透明水解圈,說明該菌株具有較強(qiáng)的瓊膠降解能力。
圖1 菌株D-5在瓊脂平板上的碘液染色結(jié)果
2.1.2 復(fù)篩結(jié)果 將初篩得到的8個(gè)菌株搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)48 h,分別測(cè)定其發(fā)酵液的瓊膠酶活力,測(cè)定結(jié)果見表2。由復(fù)篩結(jié)果可知,編號(hào)D-5的菌株酶活最高,故確定D-5為研究對(duì)象,將其命名為ZQM2017。
表2 復(fù)篩酶活對(duì)比
如圖2所示,將PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,在大約1 500 bp處得到一條單一、明亮的條帶。將PCR產(chǎn)物送至上海生工生物工程有限公司測(cè)序,拼接得到 1 453個(gè)堿基序列,將序列提交到GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),獲得登錄號(hào)為MG772935。將測(cè)序所得基因序列在NCBI上通過BLAST與 GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)的序列進(jìn)行比對(duì),菌株ZQM2017的16S rRNA 基因序 列 與Vibrio alginolyticus、Vibrio natriegens、Vibrio azureus、Vibrio azureus和Vibrio parahaemolyticus等細(xì)菌的序列相似性達(dá)到99%,將這些相似性較高的序列,通過MEGA7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果如圖3。
菌株ZQM2017的16S rRNA序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中52株弧菌(Vibrio)的16S rRNA序列相似度達(dá)到99%,可以鑒定ZQM2017為一株弧菌,但由于ZQM2017與這些菌株的相似性過高導(dǎo)致構(gòu)建出的系統(tǒng)發(fā)育樹的bootstrap太小,仍需結(jié)合形態(tài)學(xué)和生理生化指標(biāo)將ZQM2017鑒定到種。
圖2 菌株ZQM2017 16S rRNA PCR產(chǎn)物電泳圖譜
菌株平板分區(qū)劃線結(jié)果和單染色鏡檢結(jié)果如圖4所示:該菌形成的菌落小,直徑0.43-1.56 mm不等,圓形,乳白色,邊緣整齊,質(zhì)地濕潤(rùn)黏稠,表面光滑,可被挑起,不透明。點(diǎn)接培養(yǎng)24 h后滴加盧戈氏碘液染色,測(cè)量得到透明圈內(nèi)徑(菌落直徑)約為3.6 mm,外徑(透明圈直徑)12.23-15.89 mm。
圖3 菌株ZQM2017系統(tǒng)進(jìn)化樹
圖4 菌株ZQM2017形態(tài)學(xué)特征
挑取少量菌苔染色制片,單染色結(jié)果顯示該菌為短桿狀;革蘭氏染色結(jié)果顯示菌體呈紅色,判斷為革蘭氏陰性(G-)細(xì)菌;鞭毛染色結(jié)果顯示該菌為周生鞭毛;莢膜染色結(jié)果顯示該菌無(wú)莢膜;芽孢染色結(jié)果顯示該菌無(wú)芽孢。使用弧菌科細(xì)菌生化鑒定盒,經(jīng)培養(yǎng)觀察,得到ZQM2017和弧菌科常見菌種的部分生理生化指標(biāo)對(duì)照表(表3)。菌株ZQM2017的部分生理生化指標(biāo)和溶藻弧菌基本相符,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征和16S rRNA序列比對(duì)結(jié)果,可將該菌鑒定為一株溶藻弧菌,命名為Vibrio alginolyticusZQM2017。
半乳糖濃度在0-1.6 mg范圍內(nèi),含量和反應(yīng)液在540 nm處的吸光值具有良好的線性關(guān)系,線性方程為y=0.521 8x-0.025(圖5)。
由圖6可以看出,菌株Vibrio alginolyticusZQM-2017延滯期較短,在3 h時(shí)已經(jīng)結(jié)束延滯期;3-9 h屬于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,在該時(shí)期內(nèi)生物量快速增加,相應(yīng)的酶活逐步上升;在9-35 h期間,該菌生物量開始下降且相對(duì)穩(wěn)定,進(jìn)入相對(duì)穩(wěn)定期,相應(yīng)酶活仍保持持續(xù)上升;在35 h以后,該菌生物量總體呈下降趨勢(shì),可以判斷為衰亡期;在46 h時(shí),生物量最低,相應(yīng)的酶活卻達(dá)到最大值為109.87 U/mL,在46 h以后酶活開始下降。
表3 Vibrio sp. ZQM2017與相近弧菌屬的生理生化特征
圖5 半乳糖標(biāo)準(zhǔn)曲線圖
出現(xiàn)酶活峰值可能是因?yàn)樵?6 h時(shí),生物量最低,細(xì)菌裂解量達(dá)到最大,胞內(nèi)酶釋放,增加了粗酶液的酶活,使得總體酶活達(dá)到最大。在46 h以后,菌體裂解量增大,胞內(nèi)有機(jī)酸釋放,代謝產(chǎn)物不斷累積,導(dǎo)致酶活受到抑制,酶活性大小呈下降趨勢(shì)。由此可判斷,該菌株最佳發(fā)酵時(shí)間為46 h。
圖6 菌株ZQM2017生長(zhǎng)曲線和產(chǎn)酶曲線
利用Vibrio alginolyticusZQM2017菌株發(fā)酵所得的粗酶液分別與α-pNPG和β-pNPG反應(yīng)1 h,測(cè)定OD420,結(jié)果顯示,粗酶液和α-pNPG反應(yīng)后測(cè)得OD420為0.145,粗酶液和β-pNPG反應(yīng)后測(cè)得OD420為0.136。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,菌株Vibrio alginolyticusZQM2017所產(chǎn)瓊膠酶為混合型,同時(shí)含α-瓊膠酶和β-瓊膠酶,且前者含量略高于后者,可以水解瓊膠得到瓊寡糖和新瓊寡糖。
利用瓊膠酶水解瓊膠得到新型海洋功能性低聚糖——瓊膠寡糖是開拓海藻深加工及瓊膠寡糖開發(fā)利用的重要途徑,目前已成為國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn)。分離篩選產(chǎn)瓊膠酶的微生物是獲取瓊膠酶的主要方法,但目前分離得到的微生物所產(chǎn)瓊膠酶活力普遍不高,遠(yuǎn)未能滿足工業(yè)化生產(chǎn)瓊膠寡糖的要求。如2014年,馬芮萍等[27]分離的Stenotrophomonassp.NTa.,優(yōu)化后的發(fā)酵酶活僅為1.98 U/mL;2014年,劉麗莉等[28]分離的新型產(chǎn)瓊膠酶海洋菌株Vibrio agarivoransZGR-26所產(chǎn)酶活為32.1 U/mL;2016年,曾誠(chéng)[29]分離的Thalassospirasp.fst-13007,發(fā)酵酶活最大僅達(dá)到2.76 U/mL;2016年,張林林等[30]分離的編號(hào)為A-001的海洋貝類腸道瓊膠降解菌株,酶活達(dá)到13.01 U/mL;2017年,張建美等[31]對(duì)分離到的產(chǎn)瓊膠酶弧菌Ag-1進(jìn)行發(fā)酵優(yōu)化,得到最高酶活為45.51 U/mL。迄今只有Sigma-Aldrich有限公司從大西洋假單胞菌(Pseudomonasatlantica)中分離的β瓊膠酶應(yīng)用于生產(chǎn),且價(jià)格十分昂貴,純度大于 5 000 U/mg 的產(chǎn)品,1 kU包裝的價(jià)格為 1 854.45元人民幣,目前應(yīng)用范圍僅限于科研工作中,這嚴(yán)重阻礙瓊膠酶及瓊膠寡糖、瓊膠低聚糖的開發(fā)應(yīng)用。
本研究篩選得到的海洋細(xì)菌Vibrio alginolyticusZQM2017在相同培養(yǎng)條件下的產(chǎn)酶能力處于較高水平,具有極大的開發(fā)潛力。若要進(jìn)一步提高菌株Vibrio alginolyticusZQM2017的產(chǎn)酶能力,可對(duì)該菌株進(jìn)行多方面如碳源、氮源、接種量、接種時(shí)間和酶解溫度等條件的綜合優(yōu)化,這將是后續(xù)實(shí)驗(yàn)開展的方向。相信經(jīng)過進(jìn)一步優(yōu)化,菌株Vibrio alginolyticusZQM2017的產(chǎn)酶能力會(huì)大大提高,為瓊膠寡糖的開發(fā)利用奠定扎實(shí)的基礎(chǔ)。
本研究從廣東省南澳島海域采集到的龍須菜(Gracilaria lemaneiformis)上分離得到18株瓊膠酶產(chǎn)生菌,從中篩選得到1株酶活最高的瓊膠酶產(chǎn)生菌ZQM2017。通過形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性和分子鑒定等手段,確定ZQM2017是一株溶藻弧菌。利用底物顯色法鑒定得到,該菌所產(chǎn)瓊膠酶為混合酶,同時(shí)含有α-瓊膠酶和β-瓊膠酶,且前者含量略高于后者。通過初步優(yōu)化測(cè)酶活方法,測(cè)定該菌的產(chǎn)酶曲線、生長(zhǎng)曲線和pH曲線,初步了解該菌的生長(zhǎng)特點(diǎn),得到最佳發(fā)酵時(shí)間為46 h,初始酶活最高可達(dá)109.87 U/mL。