2019年5月8日,《PLoS Genetics》在線發(fā)表了來自華中農(nóng)業(yè)大學葉志彪教授和張余洋教授課題組合作題為“Genome-wide association analysis identifies a natural variation in basic helix-loop-helix transcription factor regulating ascorbate biosynthesis via D-mannose/L-galactose pathway in tomato”的研究論文,報道了番茄果實代謝變異的遺傳基礎,重點解析了番茄進化過程中抗壞血酸(VC)變異的調(diào)控機制。
研究通過對不同生長環(huán)境下的302份番茄材料的全基因組關聯(lián)分析,鑒定了92個代謝性狀的388個suggestive SNPs(包括126個顯著SNPs)。利用連鎖作圖對可溶性固形物的遺傳位點進行了驗證。研究結(jié)果表明,番茄果實抗壞血酸顯著關聯(lián)位點TFA編碼轉(zhuǎn)錄因子SlbHLH59,該蛋白定位于細胞核。酵母單雜交和瞬時表達分析結(jié)果顯示SlbHLH59直接結(jié)合于抗壞血酸生物合成途徑之一的D-甘露糖/L-半乳糖合成途徑中的PMM、GMP2和GMP3基因啟動子,促進抗壞血酸積累。
研究結(jié)果為番茄果實中代謝物的自然變異提供了新的遺傳視角,將促進代謝物性狀在番茄改良中的高效利用。此外,研究中所發(fā)現(xiàn)的變異基因和多態(tài)性為進一步的基因組比較研究和提高番茄和其他園藝作物果實營養(yǎng)品質(zhì)奠定了基礎。