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      維生素D受體基因敲除小鼠品系的建立與鑒定

      2019-01-07 12:26:18趙家榮劉歡張濤王令路宏朝杜偉立
      關(guān)鍵詞:品系測(cè)序引物

      趙家榮,劉歡,張濤,王令,路宏朝,杜偉立

      (陜西理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,陜西漢中 723000)

      維生素D受體(vitamin D receptor,VDR)是一種核轉(zhuǎn)錄因子,屬于類固醇激素/甲狀腺激素受體超家族成員[1],廣泛存在于人體多種組織和細(xì)胞[2-3]。1,25-二羥基維生素D3(1,25(OH)2D3)激素信號(hào)分子與VDR結(jié)合形成激素-受體復(fù)合物并作用于靶基因上的特定DNA序列,調(diào)節(jié)下游基因表達(dá),同時(shí)影響相關(guān)代謝通路[4-6]。VDR的生理功能是調(diào)節(jié)人體內(nèi)鈣和礦物質(zhì)平衡,參與皮膚、免疫系統(tǒng)、結(jié)腸、乳腺和前列腺等多種器官的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程[7-10]。當(dāng)VDR缺乏后,可能會(huì)導(dǎo)致心血管疾病、炎癥、糖尿病和毛囊發(fā)育障礙等疾病的發(fā)生[11-12]。由于生物體的復(fù)雜多樣性,在不同物種、不同組織和機(jī)體發(fā)育的不同階段,VDR的生理功能目前仍存在較大爭(zhēng)議,特別是在糖脂代謝過(guò)程、骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育、生殖機(jī)能等方面,VDR的功能并未完全揭示。因此,構(gòu)建穩(wěn)定遺傳的VDR敲除鼠品系,將為后續(xù)其功能的解析提供良好的動(dòng)物模型。

      基于實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的F0代VDR敲除鼠模型[13],本實(shí)驗(yàn)將首先測(cè)定小鼠的繁殖性能,選擇具有生殖能力的敲除鼠與野生鼠進(jìn)行交配,建立能夠?qū)DR敲除基因穩(wěn)定遺傳的雜合群體,進(jìn)而對(duì)繁育小鼠的基因型和VDR表達(dá)水平進(jìn)行鑒定分析,為揭示VDR的生物學(xué)功能提供實(shí)驗(yàn)材料。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

      4月齡SPF級(jí)C57BL/6 J小鼠12只,雌、雄各6只,體重20~25 g,購(gòu)于成都達(dá)碩實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司【SCXK(川)2015-030】,實(shí)驗(yàn)室采用胚胎顯微注射和CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建成VDR-/-基因敲除鼠,飼養(yǎng)于陜西理工大學(xué)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中心【SYXK(陜)2016-0012】。所有小鼠均飼養(yǎng)于12/12 h光照/黑暗條件下,自由采食和飲水,所有操作均符合實(shí)驗(yàn)動(dòng)物倫理學(xué)要求(倫理審查備案號(hào):SLGQD2017-10-IACUC2017-0004)。

      T7E1核酸內(nèi)切酶,總RNA提取試劑盒,SYBR Premix Ex Taq(大連寶生物工程有限公司,中國(guó));Trizol(西安熱默爾生物公司,中國(guó));一抗(兔抗VDR單抗抗體),辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔二抗,內(nèi)參抗體(辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記鼠β-actin抗體)(Cell Signaling Technology,美國(guó));裂解液RIPA和ECL曝光液(武漢博士德生物工程有限公司,中國(guó));DNA純化試劑盒、PVDF膜(Fluxion Biosciences,美國(guó));基因序列測(cè)序,Real-time qPCR引物合成由北京奧科生物技術(shù)有限公司完成。

      1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器

      實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Step OnePlusTM,Applied Biosystems,美國(guó)),數(shù)顯恒溫水浴鍋(HH-2,常州潤(rùn)華電器有限公司,中國(guó)),PCR擴(kuò)增儀(PTC-200,MJResearch,美國(guó)),常溫離心機(jī)(Centrifuge5424,Eppendorf,德國(guó)),低溫離心機(jī)(Centrifuge5415R,Eppendorf,德國(guó)),立式壓力蒸汽滅菌器(YXQ-Ls-75G,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司,中國(guó)),電泳儀(DYY-6C,北京市六一儀器廠,中國(guó)),渦旋儀(VDP7EX-6,海門(mén)市其林貝爾儀器制造有限公司,中國(guó)),紫外可見(jiàn)光光度計(jì)(UV-4802,尤尼柯(上海)儀器有限公司,中國(guó)),凝膠成像系統(tǒng)(Gel Doc,BIO-RAD,美國(guó)),蛋白曝光儀(GeneGnome,Syngene,美國(guó))。

      1.2 實(shí)驗(yàn)方法

      1.2.1 引物設(shè)計(jì)

      根據(jù)Genbank公布的小鼠VDR基因序列(CT010294.1),設(shè)計(jì)檢測(cè)鼠VDR基因打靶位點(diǎn)引物及其定量引物(見(jiàn)表1)。

      表1 引物名稱及序列Table 1 Primer names and sequences

      注:qVDR-F和qVDR-R為定量引物;VDRTPF和VDRTPR為擴(kuò)增打靶位點(diǎn)引物。

      Note. qVDR-F and qVDR-R are quantitative primers; VDRTPF and VDRTPR are amplified target site primers.

      1.2.2 VDR敲除鼠品系構(gòu)建

      施工單位在對(duì)該公路使用強(qiáng)夯技術(shù)之前,必須派專業(yè)人員對(duì)所要進(jìn)行施工的路段進(jìn)行詳細(xì)勘測(cè),勘測(cè)其地質(zhì)條件、施工地周圍環(huán)境以及如何有效進(jìn)行該技術(shù)的應(yīng)用,都必須通過(guò)前期的勘測(cè)做出詳細(xì)規(guī)劃。從而提高工程的建設(shè)質(zhì)量和效率。在強(qiáng)夯技術(shù)的應(yīng)用時(shí),重錘自由落體的強(qiáng)烈震動(dòng)會(huì)對(duì)周圍的建筑物造成直接的影響,為了避免此現(xiàn)象的發(fā)生,施工單位就需要對(duì)施工周圍的環(huán)境進(jìn)行詳細(xì)的監(jiān)測(cè),可以通過(guò)挖掘減震溝等辦法來(lái)減少重錘下落帶來(lái)強(qiáng)烈震動(dòng)對(duì)周圍建筑物的影響。由于在施工過(guò)程中,會(huì)造成路基水分的流失,在情況比較嚴(yán)重的時(shí)候,直接影響工程的建設(shè)進(jìn)程。所以工程建設(shè)公司要加強(qiáng)臨時(shí)排水設(shè)施的建設(shè),從而確保工程建設(shè)的順利進(jìn)行。

      先將F0代雌、雄性VDR基因敲除純合子(VDR-/-)小鼠互交,分析繁殖能力,后將VDR-/-小鼠與野生型(VDR+/+)小鼠互交,獲得F1代;F1代雌、雄性VDR基因敲除雜合子(VDR+/-)小鼠互交或VDR+/-小鼠與VDR+/+小鼠互交獲得F2代;F2代雌、雄性VDR+/-小鼠互交獲得F3代。

      1.2.3 VDR敲除鼠鑒定

      (1)VDR敲除鼠表型分析

      每周定期觀察小鼠體型以及被毛和皮膚形態(tài)的變化,詳細(xì)記錄。

      (2)VDR敲除鼠基因型鑒定

      剪取鼠尾組織樣,蛋白酶K法提取小鼠基因組DNA,PCR擴(kuò)增CRISPR/Cas9打靶基因片段,PCR擴(kuò)增體系為50 μL:5 μLTaq酶緩沖液,6 μL Mg2+,5 μL dNTP,上下游引物各2 μL,模板1 μL,Taq酶0.5 μL,水28.5 μL;PCR反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,共34個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min,12℃保存,擴(kuò)增結(jié)束后,用DNA純化試劑盒純化PCR產(chǎn)物,從而獲得VDR敲除打靶基因片段。T7E1核酸內(nèi)切酶檢測(cè)VDR基因是否敲除,同時(shí)將VDR敲除打靶基因片段測(cè)序,進(jìn)一步確認(rèn)VDR基因敲除類型。

      1.2.4 VDR敲除鼠不同組織中VDR表達(dá)水平分析

      利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)檢測(cè)敲除鼠多種組織中VDR基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平。TRIZOL法提取VDR敲除鼠肺、腎、皮膚、小腸、睪丸和胸腺等組織RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)為cDNA,以cDNA為模板,在轉(zhuǎn)錄水平檢測(cè)VDR敲除鼠各個(gè)組織中VDR基因的表達(dá)情況。25 μL qPCR反應(yīng)體系:SYBR Premix Ex Taq TM(2x)12.5 μL,上下游引物各1 μL,cDNA模板2 μL,ddH2O 8.5 μL;qPCR反應(yīng)程序:95℃,10 min;95℃,15 s;60℃,1 min;溶解曲線收集信號(hào)程序:95℃,15 s;60℃,1 min;95℃,15 s;共40個(gè)循環(huán);采用2-ΔΔCt法分析qPCR結(jié)果。

      取VDR敲除鼠肺、腎、皮膚、小腸和睪丸等組織各50 mg于研缽,加入液氮研磨后加入150 μL RIPA裂解液。轉(zhuǎn)移細(xì)胞裂解混合物至離心管,然后加入SDS-聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)上樣緩沖液,混勻后置于沸水浴10 min,然后于4℃,10 000 r/min,冷凍離心10 min。取上清液進(jìn)行12% SDS-PAGE電泳,然后轉(zhuǎn)至硝酸纖維膜,洗脫后用封閉液封閉,加入一抗、洗脫、加二抗,ECL曝光。

      1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

      2 結(jié)果

      2.1 F0代VDR敲除鼠繁殖性能測(cè)定

      實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建F0代VDR敲除鼠12只,均為雙等位基因敲除,其中8只VDR-/-小鼠等位基因敲除片段大小與位置一致,4只VDR-/-小鼠等位基因敲除片段存在差異。采用12只雌、雄性VDR-/-小鼠隨機(jī)互交和VDR-/-小鼠與VDR+/+小鼠互交兩種交配方式進(jìn)行VDR敲除鼠的繁育,結(jié)果只有VDR-/-10#(♂)和VDR-/-32#(♀)可以產(chǎn)生子代,且VDR-/-10#(♂)與VDR-/-32#(♀)交配也可以產(chǎn)生VDR-/-子代。VDR-/-10#(♂)和VDR-/-32#(♀)交配產(chǎn)生的VDR-/-小鼠及VDR-/-32#與VDR+/+小鼠繁育的子代沒(méi)有繁育能力,因此本實(shí)驗(yàn)的研究對(duì)象都是VDR-/-10#與VDR+/+小鼠產(chǎn)生的后代,突變型VDR的保存與遺傳都是以VDR+/-雜合體形式進(jìn)行,本研究中VDR敲除鼠品系的建立均是通過(guò)VDR+/-與VDR+/+和VDR+/-與VDR+/-兩種交配方式進(jìn)行。

      2.2 VDR基因敲除鼠鑒定

      2.2.1 敲除鼠表型分析

      本研究借助于前期獲得F0代敲除鼠,建立了可穩(wěn)定遺傳的VDR敲除鼠品系,實(shí)驗(yàn)室保存的敲除鼠分別有VDR+/-和VDR-/-兩種。通過(guò)觀察,VDR+/-小鼠和VDR+/+小鼠在表型、骨骼發(fā)育及活動(dòng)能力上無(wú)顯著差異,隨著月齡增大也沒(méi)有發(fā)生明顯變化,而VDR-/-小鼠和VDR+/+小鼠具有顯著差異,3月齡時(shí)眼眶周圍開(kāi)始脫毛,并隨著月齡增加,四肢及背部脫毛現(xiàn)象逐漸明顯,直到12月齡時(shí)幾乎完全脫毛,且骨骼發(fā)育緩慢,體型小,皮膚皺縮,活動(dòng)能力降低(圖1)。

      2.2.2 敲除鼠基因型鑒定

      以F2代小鼠基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增靶點(diǎn)片段,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果顯示:均能擴(kuò)增大小約470 bp的條帶,與預(yù)期的VDR靶基因片段大小一致(圖2);純化的PCR產(chǎn)物在T7E1核酸內(nèi)切酶作用下檢測(cè)F2代VDR敲除鼠,如圖3所示,本實(shí)驗(yàn)從F2代小鼠中隨機(jī)挑選3只小鼠進(jìn)行檢測(cè)分析,結(jié)果顯示3號(hào)泳道樣本為野生型小鼠,2號(hào)和4號(hào)泳道的樣本為VDR+/-小鼠。T7E1檢測(cè)后再經(jīng)測(cè)序確認(rèn),發(fā)現(xiàn)2號(hào)和4號(hào)樣本的敲除類型一致,有5 bp的小片段刪除,導(dǎo)致VDR發(fā)生無(wú)義突變,這一測(cè)序結(jié)果與F0代VDR-/-10#小鼠的一個(gè)等位基因的突變一致,說(shuō)明本實(shí)驗(yàn)已經(jīng)通過(guò)F0代VDR-/-10#小鼠繁育了VDR+/-小鼠,為后續(xù)VDR敲除鼠品系奠定了基礎(chǔ)。(見(jiàn)圖4)。

      圖1 小鼠表型特征Figure 1 Phenotypic characteristics of mice

      圖4 VDR敲除鼠靶點(diǎn)測(cè)序圖Figure 4 Target sequencing chart of VDR knockout mice

      注:M. DNA標(biāo)準(zhǔn)Marker DL2000;1-6.不同個(gè)體VDR靶點(diǎn)基因擴(kuò)增產(chǎn)物。圖2 VDR靶點(diǎn)基因擴(kuò)增Note. M. DNA Standard Marker DL2000; 1-6. Amplified products of VDR target gene in different individuals.Figure 2 Amplification of VDR target gene

      注:M. DNA標(biāo)準(zhǔn)Marker DL2000;1.T7E1未切VDR靶點(diǎn)基因;2-4.T7E1酶切不同個(gè)體VDR靶點(diǎn)基因。圖3 T7E1核酸內(nèi)切酶鑒定VDR敲除鼠Note. M. DNA Standard Marker DL2000; 1. T7E1 uncut VDR target gene; 2-4. T7E1 digests VDR target gene in different individuals.Figure 3 T7E1 endonuclease to identify VDR knockout mice

      2.2.3 VDR基因敲除小鼠的繁育及鑒定情況

      前期通過(guò)F0代12只VDR-/-敲除鼠繁育性能的檢測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)只有VDR-/-10#小鼠具有較好的、穩(wěn)定的繁殖能力,因此本研究所有小鼠都是VDR-/-10#小鼠繁育的后代,每一代的繁殖性能和基因型鑒定情況見(jiàn)表2,這些數(shù)據(jù)表明不同繁育方式所產(chǎn)子代小鼠的基因型分布基本符合孟德?tīng)栠z傳定律,在VDR敲除鼠品系構(gòu)建過(guò)程中,本研究建立了詳細(xì)、系統(tǒng)的遺傳系譜圖,其中部分遺傳系譜圖見(jiàn)圖5。

      表2 VDR基因敲除小鼠不同繁育方式繁育結(jié)果Table 2 Breeding results of different breeding methods in VDR knockout mice

      圖5 VDR敲除鼠遺傳系譜圖Figure 5 Genetic lineage of VDR knockout mice

      2.3 敲除鼠不同組織中VDR基因表達(dá)水平分析

      采用qPCR檢測(cè)F0代和F1代VDR-/-小鼠的肺、腎、皮膚、小腸、睪丸和胸腺等組織中VDR的轉(zhuǎn)錄水平。結(jié)果顯示,與VDR+/+小鼠相比,F(xiàn)0代VDR-/-小鼠小腸和胸腺組織中VDR轉(zhuǎn)錄水平升高,且差異有極顯著性(P< 0.01),肺組織中呈顯著升高(P< 0.05),睪丸組織中也呈現(xiàn)升高趨勢(shì),但差異無(wú)顯著性,腎和皮膚組織中VDR轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)量呈降低趨勢(shì),且差異不顯著,如圖6(a)所示。F1代VDR-/-小鼠各組織中VDR轉(zhuǎn)錄水平均呈升高趨勢(shì),其中肺、皮膚、小腸和睪丸組織中差異極顯著(P< 0.01),胸腺組織中差異有顯著性(P< 0.05),但腎組織中差異不顯著,如圖6(b)所示。

      Western blot檢測(cè)F0代VDR-/-小鼠和VDR+/+小鼠皮膚、小腸、腎、睪丸、肺等組織蛋白表達(dá)水平,如圖7所示,VDR+/+小鼠中各組織均有VDR表達(dá),而VDR-/-小鼠中都未檢測(cè)到VDR蛋白水平表達(dá),說(shuō)明VDR敲除成功。

      注:(a) F0代VDR-/-小鼠與VDR+/+小鼠不同組織VDR基因表達(dá)水平;(b) F1代VDR-/-小鼠與VDR+/+小鼠不同組織VDR基因表達(dá)水平;*P< 0.05,**P< 0.01。圖6 F0代、F1代VDR-/-小鼠與VDR+/+小鼠不同組織中VDR轉(zhuǎn)錄水平分析Note. (a) VDR gene expression levels in different tissues of F0 generation VDR-/- mice and VDR+/+ mice. (b) VDR gene expression levels in different tissues of F1 generation VDR-/- mice and VDR+/+ mice; *P< 0.05, **P< 0.01.Figure 6 Analysis of VDR transcriptome levels in different tissues of F0 and F1 generations VDR-/- mice and VDR+/+mice

      圖7 Western blot檢測(cè)F0代VDR-/-小鼠與VDR+/+小鼠不同組織中VDR蛋白表達(dá)Figure 7 Western blot detected VDR protein expression in different tissues of F0 generation VDR-/- mice and VDR+/+mice

      3 討論

      基因敲除是研究基因功能不可缺少的邏輯環(huán)節(jié)[14],也是最直接的手段之一[15],為疾病發(fā)生發(fā)展、藥物篩選以及活體和整體水平的研究提供了有力手段[16]。最近幾年來(lái),該領(lǐng)域技術(shù)發(fā)展迅速,基因敲除模型被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域。但是,敲除鼠品系建立又受敲除基因功能的限制,基因敲除小鼠的某些功能喪失,可能造成生長(zhǎng)發(fā)育或生殖功能障礙[17],因此不易獲得純合型后代。本研究發(fā)現(xiàn)VDR-/-小鼠互交后,大多數(shù)小鼠無(wú)子代產(chǎn)生,僅有兩只能夠產(chǎn)生子代。由此推斷,VDR基因缺失后可能影響雌雄小鼠的生殖能力,但目前機(jī)制尚不清楚,有待后期驗(yàn)證。另外,采用VDR+/-互交方式,子代小鼠出現(xiàn)三種基因型:純合型(VDR-/-)、雜合型(VDR+/-)和野生型(VDR+/+),其比例接近1∶2∶1,VDR-/-可以用于后續(xù)功能研究,VDR+/-則可用來(lái)保種。

      對(duì)于VDR-/-小鼠,本研究通過(guò)qPCR技術(shù)檢測(cè)各組織中VDR基因的轉(zhuǎn)錄水平,發(fā)現(xiàn)F0和F1代VDR-/-小鼠VDR轉(zhuǎn)錄水平均有明顯升高。同時(shí),通過(guò)Western blot檢測(cè)不同組織中VDR蛋白表達(dá)情況,在各組織中未檢測(cè)到VDR表達(dá),這一結(jié)果與本研究的預(yù)期結(jié)果一致。本研究的VDR敲除鼠品系是基于實(shí)驗(yàn)室前期通過(guò)CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建的F0代VDR敲除鼠建立的,VDR敲除的機(jī)理是在VDR基因外顯子上5 bp的小片段刪除,導(dǎo)致VDR基因無(wú)義突變,無(wú)法產(chǎn)生完整有功能的VDR,因此Western blot檢測(cè)不到蛋白表達(dá),說(shuō)明VDR敲除是成功的。由于VDR敲除僅僅是5 bp小片段刪除,其轉(zhuǎn)錄機(jī)制沒(méi)有受到影響,僅僅是mRNA翻譯的提前終止,無(wú)法產(chǎn)生有功能的完整VDR,由于VDR是一個(gè)廣泛存在的轉(zhuǎn)錄因子,機(jī)體不同組織生理功能的發(fā)揮都需要VDR,因此生物體就會(huì)通過(guò)自身調(diào)控機(jī)制進(jìn)一步加強(qiáng)VDR基因轉(zhuǎn)錄水平,所以敲除鼠的VDR基因轉(zhuǎn)錄水平就會(huì)升高,這一結(jié)果符合生物體基因表達(dá)調(diào)控的基本原理。另外,由于不同組織對(duì)VDR的需求程度不同,不同組織之間會(huì)有差異,但具體調(diào)節(jié)機(jī)制還有待進(jìn)一步的研究。基于前期的表型分析、測(cè)序分析、qPCR和Western blot檢測(cè)結(jié)果,本研究篩選出以F0代VDR-/-10#為父本進(jìn)行VDR敲除鼠品系建立,VDR基因上5 bp的片段刪除導(dǎo)致了VDR發(fā)生無(wú)義突變,導(dǎo)致其功能的喪失,通過(guò)VDR-/-與VDR+/+,VDR+/-與VDR+/-及VDR+/-與VDR+/+不同交配模式最終建立VDR敲除鼠品系,為后續(xù)VDR功能研究提供了良好的實(shí)驗(yàn)?zāi)P汀?/p>

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