申雪芳,花 晴 綜述,許平波 審校
復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院麻醉科,復旦大學上海醫(yī)學院腫瘤學系,上海 200032
細胞的生長增殖依賴于細胞周期的正常運行,從間期的DNA合成前期(G1期)、DNA合成期(S期)與DNA合成后期(G2期),到細胞分裂期(M期);每個環(huán)節(jié)對于細胞正常生長和功能的維持都很重要,任何環(huán)節(jié)出現(xiàn)錯誤,都會導致細胞生長和功能的異常,進而導致腫瘤的發(fā)生[1]。SET8亦稱PR-set7、SETD8或KMT5A,是哺乳動物中唯一的組蛋白單甲基轉移酶。SET8定位于細胞核的染色體上,調節(jié)細胞周期的運行,SET8和組蛋白單甲基化在G2期最為豐富,而G1期和S期會降到最低[2-4];它作用于組蛋白以及非組蛋白的甲基化,維持細胞周期運行、調節(jié)細胞增殖和侵襲以及細胞代謝等,對于維持細胞的功能至關重要。研究發(fā)現(xiàn)很多腫瘤中SET8都高表達,如乳腺癌[5-6]、小細胞肺癌[7]、前列腺癌[8]、甲狀腺癌[9]、肝癌[10]、腎癌[11]和卵巢癌[12]等。腫瘤作為一種由基因和環(huán)境共同作用而導致的慢性代謝性疾病,與轉錄后修飾調節(jié)的失調密切相關,本文選取表觀遺傳學中的一個位點-SET8,闡述其在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的作用及其機制。
在GeneCards數據庫中檢索發(fā)現(xiàn),SET8(KMT5A)是包含SET區(qū)[Su(var),Enhancer of zeste,Trithorax]的甲基轉移酶之一,其編碼基因定位于12q24.31,包含25 586個堿基對。研究發(fā)現(xiàn)SET8可分為保守的SET區(qū)、Cdk1/Cyclin B區(qū)、D Box區(qū)、PIP Box區(qū)以及非保守區(qū)域,相互調節(jié)、相互作用的因子分別結合在SET8的功能區(qū)域,與之相互作用,調節(jié)細胞周期[1]。PIP Box位于SET區(qū)上游,通常與復制因子PCNA相結合,作為共刺激因子,促進SET8與CRL4Cdt2的結合,進而促進SET8泛素化以及蛋白酶依賴的降解,這也就是我們觀察到的在S期,SET8水平降低的原因[1,13]。Cdk1/Cyclin B區(qū)、D Box區(qū)位于PIP Box區(qū)的上游,由APC/C(促進分裂后期復合物-細胞周期體)泛素化E3復合物識別并降解蛋白,而其上游的S29位點可被Cdk1/Cyclin B復合物識別,在G1~G2早期磷酸化S29位點,磷酸化的修飾并不改變SET8的活性,而是將其從分裂的染色體上移除;并且能夠抑制SET8的泛素化和降解[14]。
研究發(fā)現(xiàn)SET8可作用于組蛋白,調節(jié)細胞周期與增殖凋亡,進而促進腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。如在乳腺癌中,TWIST招募SET8于其靶基因E-cadherin和N-cadherin的啟動子,正向調節(jié)TWIST和N-cadherin,抑制E-cadherin的表達,進而促進上皮-間質轉化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),促進腫瘤的侵襲和轉移[5-6]。在前列腺癌中,二氫睪酮刺激后,SET8聚集于性激素受體的靶基因前列腺特異性抗原(prostate-specific antigen,PSA)基因的啟動子區(qū)域,使該區(qū)域的H4K20me1增加,增加PSA的基因轉錄,促進癌細胞的增殖[15]。在此之前研究也發(fā)現(xiàn),LEF1/TCF4招募SET8于Wnt信號的靶基因AXIN2、c-MYC、NKD1和LEF1的啟動子,促進基因的表達,同樣在結腸癌中SET8也調節(jié)Wnt信號的激活[8]。miR-382直接作用于SET8的3’-UTR,負向調節(jié)SET8,在神經膠質瘤中,miR-382下調,使得SET8表達增加,增加了神經膠質瘤的轉移侵襲能力[16]。與之相似的是miR-7也能夠作用于SET8的3’-UTR,負性調節(jié)SET8,能夠抑制EMT并降低乳腺癌的轉移和侵襲能力[17],miR-502通過對SET8 mRNA的3’-UTR不同的結合力,負向調節(jié)SET8轉錄水平,進而影響腫瘤的增殖和轉移能力[7,10-12]。
SET8不僅可以促進基因的表達,增加腫瘤的增殖與轉移,同時還可以參與基因的抑制作用。如在SET8發(fā)現(xiàn)之時,研究者就注意到,在男性和女性的X染色體上H4K16Ac和H4K20me呈相反的關系,H4K20me抑制鄰近的賴氨酸乙?;M而發(fā)揮基因沉默的作用[18];我們知道H4K20me1在G2/M期會達到高峰,Vaquero等[19]發(fā)現(xiàn)在這一時刻SirT2也會定位在染色體中,并使H4K16Ac去乙?;?,Serrano等[20]后續(xù)補充了該通路:SET8招募SirT2與染色體,SirT2使SET8的K90位點去磷酸化,增加SET8的穩(wěn)定性和活性,促進SET8的定位,同時SirT2也可以使臨近核小體的H4K16Ac去磷酸化,進一步增加了SET8的甲基化。也有研究發(fā)現(xiàn)SET8可以招募L3MBTL1到其作用的基因的啟動子區(qū),增強L3MBTL1對下游基因的抑制作用,但其生物學作用仍有待進一步研究[21]。
隨著研究的不斷深入,我們發(fā)現(xiàn)SET8還可作用于非組蛋白,如SET8不僅可以修飾細胞核內組蛋白的甲基化,也可以與抑癌基因P53相互作用,SET8單甲基化P53蛋白第382位點的賴氨酸(p53K382me1),抑制P53的生物學作用,降低其促進凋亡和抑制細胞周期的作用等[22]。后續(xù)的研究發(fā)現(xiàn),SET8與P53的相互作用由Numb介導,SET8甲基化Numb的磷酸酪氨酸結合位點,阻斷Numb與P53的結合,導致P53泛素化降解,進而發(fā)揮抑制凋亡等生物學作用[23]。有研究[17]報道,該調節(jié)作用可能是由miR-7介導,miR-7通過抑制SET8甲基化,促進P53的轉錄活性。SET8也可以甲基化增殖細胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)第248位點的賴氨酸,抑制PCNA的泛素化降解,增加PCNA的穩(wěn)定性,促進腫瘤的增殖[24]。
自20世紀初發(fā)現(xiàn)有氧糖酵解之后,腫瘤的代謝方式便被認為是腫瘤的一大特點;雖然有氧糖酵解合成ATP的效率低于氧化磷酸化,但是它能更快地合成ATP,并且糖酵解的中間產物可以為細胞的生物合成提供底物,有利于腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[25]。代謝和表觀遺傳修飾之間具有緊密的聯(lián)系,二者互相調節(jié);在肝癌中SET8除了能夠促進腫瘤的增殖和侵襲,還能夠影響腫瘤細胞的代謝變化,SET8通過KLF4/SIRT4信號轉導通路,促進糖酵解,抑制線粒體呼吸,影響腫瘤細胞的代謝功能[26]。SET8能夠增加ATP的合成,降低氧消耗,增加糖酵解,其機制為SET8與HIF-1共定位于細胞核,調節(jié)HIF-1及其下游基因(如HK2、PKM2、LDHA)的轉錄活性,SET8還可降低HIF-1的羥化和乙酰化,進而增加其穩(wěn)定性;當通過降低氧供增加HIF-1的表達后,SET8可作為HIF-1的下游基因,其表達也會隨之上升[5],但具體機制仍有待進一步探究。
此外也有研究認為,在甲狀腺乳頭狀瘤中SET8除了增加腫瘤侵襲、促進轉移、促進腫瘤進展外,還調節(jié)脂質的代謝,促進固醇調節(jié)元件結合轉錄因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的表達,以及其下游與脂質代謝相關的基因,如硬脂酰輔酶A去飽和酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)、脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,F(xiàn)AS)和乙酰輔酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylase,ACC);而Liao等[9]研究認為,腫瘤高表達SET8與其預后不良相關,與之相似的是在胃癌患者中,SET8的高表達與患者的5年生存率降低相關,這可能成為判斷腫瘤預后的獨立預測因子[27]。
研究發(fā)現(xiàn)SET8在維持基因穩(wěn)定性、基因復制和細胞周期的正常循環(huán)中發(fā)揮重要作用,SET8缺失會導致細胞復制應激和染色體損傷,導致單鏈DNA含量增加[28]。外界因素導致的DNA損傷后,SET8的表達和p53K382me1都會降低;但是有研究也發(fā)現(xiàn)DNA損傷后,SET8依賴的DNA修復基因GADD45的表達量反而會上升,而其具體的機制和生物學作用仍需進一步的研究[22]。缺乏SIRT2基因后,斷裂的雙鏈DNA在S期增加,這與H4K20me1、H4K20me2減少以及基因穩(wěn)定性降低有關,同時缺乏SIRT2基因也會導致腫瘤的發(fā)病率增加[20]。Takawa等[24]也發(fā)現(xiàn)SET8能夠增強PCNA和核酸內切酶FEN1之間的作用,PCNA甲基化的降低可導致岡崎片段異常、DNA復制減慢以及DNA損傷等一系列問題。
SET8除了在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展以及代謝中發(fā)揮重要的作用,在其他系統(tǒng)如免疫系統(tǒng)和血管內皮細胞等也有著重要的作用。SET8能夠重新編碼宿主的免疫反應,從而增加結核分枝桿菌的存活,SET8與單核細胞的氧化應激和凋亡相關,通過miR-30e-3p-FoxO3a作用于Nqo1和Txnrd1的啟動子,促進NAD(P)H醌氧化還原酶1(NQO1)和硫氧還蛋白還原酶(thioredoxin reductase 1,TRXR1)的表達,而NQO1還能與PGC1相互作用,促進M2型單核細胞的極化,發(fā)揮抗炎的作用;SET8還可與腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)相關凋亡誘導配基(tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand,TRAIL)相互作用,發(fā)揮抗炎抗凋亡的作用[29]。同時SET8還可以通過53BP1影響子宮內膜腺體中DNA的修復,進而調節(jié)腺體的發(fā)生、發(fā)展,影響小鼠的生育能力[30]。
SET8作為核小體H4K20的單甲基轉移酶,在維持DNA復制、基因穩(wěn)定性、細胞周期循環(huán)和基因的表達等方面發(fā)揮重要的作用。SET8通過作用于相應基因的啟動子區(qū)或者直接作用于轉錄后修飾(非組蛋白修飾),調節(jié)染色體的折疊和基因的表達,維持細胞的功能。SET8表達的異常對于腫瘤的發(fā)生、發(fā)展具有重要的意義,研究發(fā)現(xiàn)在很多腫瘤中SET8都高表達,而其高表達能夠促進腫瘤的能量代謝,促進腫瘤的進展、侵襲和轉移。同時SET8的高表達與腫瘤的不良預后和生存率降低相關,其相關的機制仍有待于進一步研究。SET8與腫瘤的相關性使得其可能為判斷腫瘤預后提供線索,并為臨床開發(fā)治療腫瘤的靶向藥提供相應的靶點。