余乃通 ,李賓賓,2,黎維麗,2,楊 毅 ,劉志昕
(1. 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所/海南省微生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部熱帶作物生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南 ???571101;2. 海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院, 海南 ???570228;3. 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境與植物保護(hù)研究所, 海南 海口 571101)
柑桔黃龍?。–itrus Huanglongbing, HLB)是柑桔類作物一種毀滅性病害,嚴(yán)重威脅著世界各地柑桔類作物主產(chǎn)區(qū)的生產(chǎn)[1-2]。目前該病害已相繼在亞洲、非洲、大洋洲和美洲的50多個(gè)國(guó)家和地區(qū)報(bào)道,引起柑桔產(chǎn)業(yè)的巨大經(jīng)濟(jì)損失[1,3]。在我國(guó)19個(gè)柑桔主產(chǎn)區(qū)中,已有11個(gè)遭受到HLB危害[4-5]。柑桔黃龍病的病原是一種專性寄生于植物韌皮部的革蘭氏陰性菌,屬韌皮部桿菌屬(CandidatusLiberibacter),目前有3個(gè)種,即亞洲種(CandidatusLiberibacter asiaticus)、非洲種(CandidatusLiberibacter africanus)和美洲種(CandidatusLiberibacter americanus)[6],主要由亞洲柑桔木虱(Diaphorina citri)和非洲柑桔木虱(Trioza erytreae)傳播[7]。
近年來(lái),隨著海南綠橙等柑桔類產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,柑桔黃龍病也隨之而來(lái)和快速傳播[8]。前期,我們從感染HLB的海南綠橙中篩選出表達(dá)量較高的1個(gè)分泌蛋白,菌毛形成蛋白(Pilus formation protein,408),與菌毛組裝相關(guān)[9]。革蘭氏陰性菌含有Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ類等8個(gè)不同類型的蛋白分泌系統(tǒng)[10]。研究表明,細(xì)菌分泌蛋白對(duì)病原菌感染宿主和引起宿主病變等方面起到重要作用[11-13]。柑桔黃龍病菌含有完整的Ⅰ類蛋白分泌系統(tǒng)和不完整的Ⅲ類和Ⅳ類蛋白分泌系統(tǒng)[14]。
本研究從感染HLB的海南綠橙中擴(kuò)增出408蛋白基因,序列分析表明,408基因與柑桔黃龍病菌亞洲種psy62 株系(GenBank登錄號(hào):CP001677.5)的408基因序列一致[15]。對(duì)該蛋白進(jìn)行原核表達(dá)及抗血清制備,得到了特異性強(qiáng)的408抗血清,工作效價(jià)在1∶500~1∶10 000之間。本研究制備的408多抗血清為408蛋白的功能研究和柑桔黃龍病菌的蛋白檢測(cè)產(chǎn)品開發(fā)提供重要基礎(chǔ)。
感染柑桔黃龍病的綠橙葉片采自海南省瓊海市,-80℃保存;pET32a載體由本實(shí)驗(yàn)室保存;E. coliBL21 (DE3)菌株購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;EcoRⅤ和XhoⅠ均購(gòu)自大連寶生物公司;HSTMMIX購(gòu)自東盛生物公司;植物基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自天根生化科技有限公司;BCIP/NBT底物顯色試劑盒、氨芐青霉素(Ampicillin)、Isopropyl β-D-Thiogalactoside(IPTG)、丙烯酰胺、N,N′-亞甲基雙丙烯酰胺、三羥甲基氨基甲烷(Tris)購(gòu)自Solarbio公司;十二烷基硫酸鈉(SDS)、甘氨酸、考馬斯亮藍(lán)R-250均購(gòu)自海南愛(ài)斯科坦生物公司;PCR產(chǎn)物回收試劑盒購(gòu)自O(shè)MEGA公司;堿性磷酸酯酶(AP)標(biāo)記山羊抗小鼠IgG購(gòu)自Biosharp生物公司;辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記山羊抗小鼠IgG購(gòu)自碧云天生物技術(shù)公司;其他化學(xué)試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.2.1 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)柑桔黃龍病菌408分泌蛋白基因(GenBank登錄號(hào):CP001677.5)編碼區(qū)核苷酸序列和pET32a載體多克隆酶切位點(diǎn)設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,408-F (5’-CCG GAT ATC TTG CAT CGT AAG CGC CAA AGA G-3’,下劃線為EcoRⅤ酶切位點(diǎn))和408-R (5’-CCGTCC TGA CGG GAG GAG AGG AGG-3’,下劃線為XhoⅠ酶切位點(diǎn)),由深圳華大基因股份有限公司(BGI)合成。
1.2.2 總DNA的提取及408基因的克隆 以感染HLB的綠橙葉片為材料,參照天根植物基因組DNA提取試劑盒操作說(shuō)明進(jìn)行總DNA的提取,用408-F和 408-R引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系為:DNA模板2 μL,正反引物各 2 μL(10 μmol/L),dNTPs 4 μL,5×TaqBuffer 10 μL,TaqDNA polymerase 1 μL,加ddH2O到50 μL。PCR程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸40 s,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。取5 μL PCR產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
1.2.3 pET32a-408表達(dá)載體的構(gòu)建 利用OMEGA公司的膠回收試劑盒對(duì)408目的基因進(jìn)行回收,對(duì)回收的408基因產(chǎn)物和pET32a載體進(jìn)行EcoRⅤ和XhoⅠ雙酶切,經(jīng)T4DNA連接酶將408基因連接到pET32a載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH 5α菌株,涂布于含50 μg/mL氨芐(Amp)抗性的固體LB平板上,37℃培養(yǎng)箱過(guò)夜培養(yǎng)進(jìn)行抗性篩選。挑取平板上的單克隆菌落,利用408-F和 408-R引物進(jìn)行菌液PCR鑒定,隨機(jī)選取3個(gè)大小正確的單克隆菌落送往賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序。對(duì)測(cè)序正確的單克隆菌落提取重組載體,進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證。將經(jīng)過(guò)測(cè)序和雙酶切驗(yàn)證的重組載體命名為pET32a-408。
1.2.4 408蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及可溶性分析 對(duì)測(cè)序正確的重組載體轉(zhuǎn)化E .coliBL21 (DE3)菌株,挑取平板上的單克隆菌落接種到液體LB培養(yǎng)基(含100 μg/mL的Amp),37℃于200 r/min培養(yǎng)過(guò)夜。以1∶50的比例將過(guò)夜培養(yǎng)的菌液接種到150 mL液體LB培養(yǎng)基中(含100 μg/mL的Amp),37℃、200 r/min繼續(xù)培養(yǎng),期間取樣測(cè)菌液OD600值,待菌液OD600達(dá)到0.6~1.0,加入IPTG使其終濃度為1 mmol/L,繼續(xù)培養(yǎng)6 h。菌液于12 000 r/min離心,收集沉淀,溶于15 mL的1×PBS緩沖液中,超聲波破碎20 min(連續(xù)循環(huán)工作4 s,停止8 s);12 000 r/min 離心5 min,分別取上清和沉淀(溶于8 mol/L尿素的15 mL Lysis buffer)10 μL與等量體積的2×SDS loading buffer混合后,100℃煮沸10 min,進(jìn)行12%SDS-PAGE凝膠電泳(90 V, 2 h)。
1.2.5 融合蛋白的純化 用含8 mol/L尿素的15 mL Lysis buffer溶解超聲波破碎后的沉淀,8 000 r/min離心除去不溶性物質(zhì),上清過(guò)0.45 μm濾膜,然后通過(guò)Ni2+-NTA親和層析柱進(jìn)行純化,經(jīng)washing buffer溶液洗去雜蛋白后,用不同濃度的咪唑(50、100、150、200、250 mmol/L)洗脫液進(jìn)行洗脫,于12% SDS-PAGE凝膠電泳檢測(cè)。將純化后的蛋白于-20℃保存。
1.2.6 抗血清的制備 取純化后溶于150 mmol/L咪唑的408蛋白溶液20 μL與80 μL 1×PBS緩沖液混合,再與100 μL的弗氏不完全佐劑混勻,腹腔免疫小白鼠;而后每隔7 d再次腹腔免疫小白鼠4次(使用弗氏完全佐劑)。最后一次免疫4 d后,對(duì)小白鼠進(jìn)行眼球取血,室溫放置30 min后,于4℃靜置過(guò)夜。5 000 r/min離心10 min,取上層血清,分裝后于-80℃保存。同時(shí),使用1×PBS緩沖液作為對(duì)照免疫小白鼠,即對(duì)照血清。
1.2.7 抗體效價(jià)檢測(cè)及特異性檢測(cè) 使用間接ELISA法測(cè)定408多抗血清的效價(jià)[16]。將獲得408多抗血清分別按1∶500、1∶1 000、1∶5 000、1∶10 000、1∶50 000、1∶100 000的比例進(jìn)行稀釋。將純化后的408蛋白(用包被液1∶1 000稀釋)100 μL加入到96孔板中,37℃孵育2 h;1×PBST緩沖液洗滌3次后,加入200 μL的1%BSA封閉液,37℃封閉2 h;重復(fù)洗滌3次后,加入100 μL稀釋后的血清,37℃孵育1 h;重復(fù)洗滌3次后,加入100 μL HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG(1∶3 000),37℃孵育30 min;重復(fù)洗滌3次后,加入100 μL TMB底物顯色液,避光條件顯色15 min后,加入50 μL的濃鹽酸終止反應(yīng),使用酶標(biāo)儀測(cè)定OD450的值。
取純化后溶于150 mmol/L咪唑的408蛋白溶液20 μL與等量體積的2×SDS loading buffer混合,100℃煮沸10 min變性,于12%的SDS-PAGE凝膠電泳。電泳結(jié)束后,將蛋白凝膠和硝酸纖維素膜(NC膜)預(yù)先用轉(zhuǎn)膜液浸泡5 min,放入半干轉(zhuǎn)膜儀中,電流1A轉(zhuǎn)膜25 min。轉(zhuǎn)膜完成后用1×TBST緩沖液清洗NC膜3次;5%脫脂奶粉封閉液進(jìn)行封閉2 h;1×TBST緩沖液清洗3次后,置于408多抗血清(1∶1 000)孵育1 h;1×TBST緩沖液清洗3次后,置于堿性磷酸酯酶(AP)標(biāo)記山羊抗小鼠IgG稀釋液(1∶2 000)孵育30 min;1×TBST緩沖液清洗3次后,使用BCIP/NBT顯色試劑盒顯色,拍照保存。
以HLB感染的綠橙總DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,電泳結(jié)果見(jiàn)圖1A,在250~500 bp之間有一條特異性DNA條帶,大小為400 bp左右,與目的基因大小一致。測(cè)序結(jié)果經(jīng)NCBI blastn分析表明,該基因?yàn)楦探埸S龍病菌的408分泌蛋白基因,與Duan等報(bào)道的柑桔黃龍病菌亞洲種psy62 株系(GenBank登錄號(hào):CP001677.5)的408基因序列一致[15],大小為408 bp,編碼135個(gè)氨基酸,分子量大小為14.95 ku。
圖1 408基因擴(kuò)增及pET32a-408質(zhì)粒酶切驗(yàn)證
圖2 柑桔黃龍病菌408同源蛋白的多重序列比對(duì)
氨基酸比對(duì)分析表明,海南柑桔黃龍病菌408蛋白與柑桔黃龍病菌亞洲種的408蛋白同源性為69.7%~100%;與馬鈴薯斑紋病菌(CandidatusLiberibacter solanacearum)的408蛋白同源性在35.2%~48.9%。NCBI保守結(jié)構(gòu)域(NCBI conserved domain)預(yù)測(cè)分析表明,本研究獲得的408蛋白含有1個(gè)高度可信的菌毛形成蛋白N端結(jié)構(gòu)域(Pilus formation protein N terminal domain),以及C端含有兩個(gè)高度保守的基序,Motif 1和Motif 2;對(duì)菌毛形成蛋白N端結(jié)構(gòu)域進(jìn)行同源比較,結(jié)果表明,本研究獲得的408蛋白其菌毛形成蛋白N端結(jié)構(gòu)域與其他柑桔黃龍病菌亞洲種408蛋白的該結(jié)構(gòu)域同源性均為100%,而與馬鈴薯斑紋病菌408蛋白的該結(jié)構(gòu)域同源性為60.2%~63%,說(shuō)明該結(jié)構(gòu)域具有高度保守的種屬特異性(圖2)。
測(cè)序結(jié)果表明,3個(gè)單克隆菌中的408基因插入片段大小正確,堿基無(wú)缺失、突變發(fā)生,且編碼框無(wú)移位。雙酶切驗(yàn)證如圖1B所示,特異性獲得酶切后的408基因和pET32a載體片段。將經(jīng)過(guò)測(cè)序和雙酶切驗(yàn)證的重組載體命名為pET32a-408,作為后續(xù)原核表達(dá)的重組質(zhì)粒。
將pET32a-408重組載體轉(zhuǎn)化BL21 (DE3)表達(dá)菌,挑取轉(zhuǎn)化平板上的單克隆菌落接種到含氨芐抗性的LB液體培養(yǎng)基進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),分離上清和沉淀進(jìn)行可溶性分析。12% SDSPAGE凝膠電泳表明,與未誘導(dǎo)的重組菌相比,經(jīng)1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)6 h后的重組菌在分子量大小約34 ku處,出現(xiàn)一條清晰的蛋白條帶(圖3A),與預(yù)測(cè)的408融合蛋白33.82 ku大小基本一致,即408融合蛋白??扇苄苑治鼋Y(jié)果表明,408融合蛋白主要以沉淀形式(包涵體)表達(dá)(圖3B)。
圖3 408融合蛋白的原核表達(dá)及可溶性分析
由于408融合蛋白含有His標(biāo)簽,可經(jīng)過(guò)Ni2+-NTA親和層析柱純化。將含有408融合蛋白的包涵體沉淀溶解,用不同咪唑濃度的洗脫液洗脫純化,最后用SDS×PAGE分析該蛋白在不同咪唑濃度洗脫液中的分布情況,結(jié)果見(jiàn)圖4,經(jīng)100 mmol/L咪唑的洗脫液洗脫后,Ni2+-NTA親和層析柱上的雜蛋白可除去大部分;再經(jīng)150 mmol/L咪唑的洗脫液洗脫后,大部分408融合蛋白從Ni2+-NTA親和層析柱中洗脫下來(lái),而在200、250 mmol/L咪唑的洗脫液中分布很少。由此可見(jiàn),經(jīng)不同咪唑濃度的洗脫液洗脫后,408融合蛋白主要在150 mmol/L咪唑的洗脫液中分布,于-20℃保存,備用。
圖4 不同濃度咪唑溶液對(duì)408融合蛋白的洗脫
對(duì)408多抗血清進(jìn)行不同比例稀釋,以純化后的408融合蛋白(1∶1 000稀釋)為抗原,通過(guò)ELISA方法對(duì)408多抗血清進(jìn)行效價(jià)測(cè)定。結(jié)果分析表明,與對(duì)照血清相比,408多抗血清在稀釋 500、1 000、5 000、10 000倍時(shí),408多抗血清呈明顯的陽(yáng)性反應(yīng)(判斷標(biāo)準(zhǔn)為408 PcAb的OD450值/PBS PcAb的OD450值>2.1);而408多抗血清在稀釋10 000倍以上均不能很好地呈陽(yáng)性反應(yīng)(圖5)。Western blotting結(jié)果分析表明,408多抗血清能與純化后的融合蛋白起特異性反應(yīng),無(wú)其他明顯雜帶(圖6)。
圖5 408多抗血清效價(jià)檢測(cè)
圖6 Western blot檢測(cè)408抗體的特異性
前期,我們通過(guò)PCR、qPCR和RT-qPCR的方法從感染HLB的海南綠橙樣品中篩選出1個(gè)表達(dá)量高的柑桔黃龍病菌分泌蛋白408,參與菌毛的組裝。將408蛋白基因構(gòu)建到GV1300植物雙向表達(dá)載體,通過(guò)農(nóng)桿菌注射煙草進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá),共聚焦顯微鏡觀察表明,在煙草細(xì)胞的細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)種觀察到綠色熒光,說(shuō)明408蛋白定位于煙草細(xì)胞的細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中[9]。序列分析表明,408蛋白除了含有菌毛形成蛋白N端結(jié)構(gòu)域外,其C端還含有兩個(gè)高度保守的基序,Motif 1和Motif 2。這兩個(gè)高度保守的基序可能與其在宿主細(xì)胞的功能相關(guān),調(diào)控宿主的相關(guān)代謝或重要通路。但是,408蛋白在宿主體內(nèi)具體的功能和機(jī)理有待進(jìn)一步研究。
目前,柑桔黃龍病的有效檢測(cè)方法包括PCR[17]、環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)[18]、熒光定量PCR[19]、重組酶聚合酶擴(kuò)增方法(RPA)[20]等診斷技術(shù)。雖然柑桔黃龍病菌相關(guān)蛋白基因的單克隆和多克隆制備也已報(bào)道[14,21-23],但是目前尚無(wú)商業(yè)化的蛋白檢測(cè)產(chǎn)品。408蛋白是柑桔黃龍病菌的分泌蛋白,是菌毛蛋白的重要組成成分,因此,它的含量是病菌含量的幾千倍甚至是幾萬(wàn)倍以上。另外,我們通過(guò)對(duì)408蛋白的免疫原性分析發(fā)現(xiàn),其N端到C端的免疫原性較好。本研究不但豐富了制備HLB蛋白檢測(cè)產(chǎn)品的選擇,同時(shí)使用該蛋白制備的單克隆抗體或多克隆抗體產(chǎn)品具有更高的效價(jià)和靈敏度。
柑桔黃龍病病菌根據(jù)病原的傳播媒介、序列特征和熱敏性等可分為亞洲種、非洲種和美洲種。根據(jù)408蛋白基因的序列分析,感染海南綠橙的黃龍病菌為亞洲種,與我國(guó)其他地區(qū)柑桔類作物上報(bào)道的黃龍病菌屬于同一個(gè)種[24]。因此,使用本研究制備的抗體不但能用于海南綠橙黃龍病的檢測(cè),也可用于我國(guó)其他柑桔類黃龍病的檢測(cè)。