王梅林 牛精鈴 金若其 徐瑩瑩 蔡晶晶 陳群力
(河南科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院,洛陽(yáng) 471023)
小G蛋白是一類廣泛存在于真核生物中的單體GTP結(jié)合蛋白,分子量為20-40 kD。小G蛋白家族成員數(shù)目龐大,超過(guò)150多個(gè),根據(jù)其序列結(jié)構(gòu)特征,可被分為5個(gè)主要的亞家族:Ras、Rho、Rab、Arf和Ran[1-2]。RhoB基因?qū)儆赗ho亞家族,該亞家族蛋白在細(xì)胞骨架重組、基因表達(dá)及細(xì)胞周期等的調(diào)控中起到重要作用[3]。
RhoB與其同家族成員RhoA和RhoC的氨基酸序列同源性高達(dá)86%,生物學(xué)功能也有重合,如RhoA、RhoB和RhoC協(xié)同調(diào)控細(xì)胞骨架運(yùn)動(dòng)[4-5],但更多的證據(jù)顯示,RhoB具有許多獨(dú)特于RhoA和RhoC的性質(zhì)和功能。例如,RhoA和RhoC在細(xì)胞中為組成性表達(dá),而RhoB則表現(xiàn)為誘導(dǎo)型表達(dá)[6]??拱┧幬锾幚恚ㄈ珥樸K、洛伐他?。⒆贤饩€照射、EGF或PDGF刺激等均可使RhoB的表達(dá)水平迅速上調(diào)[7-11]。又如RhoA和RhoC均可促進(jìn)細(xì)胞增殖,而RhoB具有促進(jìn)細(xì)胞凋亡的功能[12-13]。
RhoB在不同癌癥的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中表現(xiàn)出截然不同的功能。例如,在惡性膠質(zhì)瘤、非小細(xì)胞肺癌和前列腺癌等腫瘤中的相關(guān)研究顯示,其具有原癌基因的功能,可以促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)或遷移[14-16]。而在腎細(xì)胞癌和胰腺癌等癌癥中,RhoB表現(xiàn)出抑癌基因的性質(zhì),其蛋白表達(dá)水平呈下降趨勢(shì)[17-18]。因此,深入研究RhoB蛋白的生理功能尤其是在癌癥發(fā)展進(jìn)程中的功能具有十分重要的意義。本實(shí)驗(yàn)旨在擴(kuò)增人RhoB基因的ORF序列,構(gòu)建獲得真核表達(dá)質(zhì)粒Flag-RhoB,并研究所構(gòu)建質(zhì)粒在真核細(xì)胞的表達(dá)情況和細(xì)胞亞定位,旨為進(jìn)一步研究RhoB蛋白的功能奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 人乳腺癌MCF7細(xì)胞、宮頸癌HeLa細(xì)胞、結(jié)直腸癌HCT116細(xì)胞、水貂肺上皮細(xì)胞Mv.1.Lu細(xì)胞、菌株DH5α為本實(shí)驗(yàn)室保存;真核表達(dá)載體pCMV5作者實(shí)驗(yàn)室保存并改造,在多克隆位點(diǎn)前插入了Flag標(biāo)簽的編碼序列。
1.1.2 試劑 總RNA提取試劑盒、PrimeScrip Ⅱ 1st Strand cDNA合成試劑盒、質(zhì)粒抽提試劑盒和膠回收試劑,TaKaRa公司;1 kb plus DNA ladder,天根公司;pfuDNA聚合酶、dNTP、SalⅠ、XbaⅠ、T4 DNA連接酶、標(biāo)準(zhǔn)蛋白marker,F(xiàn)ermentas公司;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS),Gibco公司;牛血清白蛋白(BSA)、Flag M2抗體、辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記山羊抗兔IgG和Alexa FluorR 488標(biāo)記的羊抗兔IgG,DAPI,Sigma公司;Lipofectamine 3000,Texas red-phalloidin,Thermo Fisher公司;酵母粉、蛋白胨和ECL顯色液,廈門(mén)鷺隆生物科技有限公司;氨芐青霉素、Trypsin以及其他化學(xué)試劑均購(gòu)自上海生工。
1.1.3 儀器設(shè)備 PCR儀、核酸電泳儀、蛋白電泳及轉(zhuǎn)膜系統(tǒng)、ChemiDoc XRS+ 化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng),Bio-Rad;CO2培養(yǎng)箱、制冰機(jī)、-80℃冰箱,SANYO;GSD-8000成像及分析系統(tǒng),美國(guó)UVP;NanoDrop 2000超微量分光光度計(jì)、微量臺(tái)式高速離心機(jī),Thermo Fisher;氣浴恒溫振蕩器,金壇市迅生儀器廠,A1R/A1激光共聚焦顯微鏡,日本Nikon公司產(chǎn)品。
1.2.1 人HEK-293T細(xì)胞總RNA的提取和cDNA第一鏈的合成 培養(yǎng)在6孔板匯合度為90%的HEK-293T細(xì)胞,1×PBS洗一次;加入0.5 mL的RNAiso Plus,輕輕搖勻,然后使用移液槍吹打細(xì)胞使其脫落;轉(zhuǎn)移至離心管中,用移液槍反復(fù)吹吸至裂解液中無(wú)明顯沉淀,室溫靜置5 min。加入氯仿0.1 mL,蓋緊離心管蓋,用手劇烈震蕩15 s,待溶液充分乳化無(wú)分相現(xiàn)象后,再室溫靜置5 min。12 000 r/min 低溫離心15 min。吸取上清液0.15 mL,加入等體積的異丙醇,上下顛倒離心管混勻,在室溫靜置10 min。12 000 r/min 低溫離心10 min。取出試管后小心棄去上清,緩慢的沿離心管壁加入75%的乙醇1 mL,輕輕上下顛倒洗滌離心管管壁,12 000 r/min 低溫離心5 min后小心棄去乙醇。開(kāi)蓋室溫干燥沉淀3 min,加入20 μL RNase-free水溶解沉淀,待沉淀完全溶解后直接反轉(zhuǎn)錄。
cDNA第一鏈的合成過(guò)程如下。在PCR管中首先配置下列反應(yīng)混合液:Oligo dT引物 2 μL,dNTP混 合 物(10 mmol/L)2 μL,RNA 2 μL,RNase free水 4 μL。65℃ 變性5 min后,冰上迅速冷卻。簡(jiǎn)短離心后,繼續(xù)配置逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液:上述變性后反應(yīng)液 10 μL,5×PrimeScriptTMⅡ緩沖液 4 μL,RNase 抑制劑 0.5 μL,逆轉(zhuǎn)錄酶 1 μL,RNase free 水 4.5 μL。緩慢混勻后簡(jiǎn)短離心。42℃ 逆轉(zhuǎn)錄30 min。70℃ 酶滅活15 min后冰上冷卻待用。
1.2.2 獲得RhoB基因片段 從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得人RhoB基因的mRNA序列,DNAMAN軟件對(duì)該序列進(jìn)行限制性酶切圖譜分析,設(shè)計(jì)引物并由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。所設(shè)計(jì)的上游引物序列為5'-GCCGGGTCGACAAGCGGCCA TCCGCAAGA AGC -3',包含限制性內(nèi)切酶SalⅠ的識(shí)別位點(diǎn);下游引物序列為5'-GCGTCTAGA TTATAGCACCTTGCAGCAGTTGA -3',包含限制性內(nèi)切酶XbaI的識(shí)別位點(diǎn)。培養(yǎng)HEK-293T細(xì)胞,收集并提取總RNA,逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,PCR擴(kuò)增RhoB基因。PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性35 s,60℃退火30 s,72℃延伸40 s,共30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7 min。用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物。割膠后用膠回收試劑盒回收目的片段,用于后續(xù)連接。
1.2.3 真核表達(dá)重組質(zhì)粒Flag-RhoB的構(gòu)建及雙酶切鑒定 將PCR產(chǎn)物純化以利于后續(xù)酶切。純化方法為 :取 45 μL PCR 產(chǎn)物加入 5 μL NaAc(3 mol/L)和100 μL無(wú)水乙醇,混勻后-20℃沉淀1 h;沉淀后離心,12 000 r/min 10 min;棄上清,沉淀用70%無(wú)水乙醇洗2次,35 μL無(wú)菌水溶解沉淀備用。
取 15 μL 回收的 PCR 產(chǎn)物和 1 μg pCMV5空載體用SalⅠ、XbaⅠ雙酶切,37℃,3 h。酶切體系如 下 :SalⅠ 0.5 μL,XbaⅠ 0.5 μL,10×buffer 4μL,加入PCR產(chǎn)物或空載體后用水補(bǔ)至40 μL。
酶切后電泳回收,T4 DNA連接酶進(jìn)行連接(16℃,6 h),連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α涂布于LB平板,平板含有氨芐青霉素(Amp+)。37℃培養(yǎng)過(guò)夜后挑取單克隆,牙簽法小提質(zhì)粒并用雙酶切篩選符合預(yù)期的克隆。將符合預(yù)期的克隆再次轉(zhuǎn)化DH5α挑單克隆培養(yǎng)后用堿裂解法提質(zhì)粒,用SalⅠ和XbaⅠ再次雙酶切檢測(cè),檢測(cè)符合預(yù)期的重組子送南京金斯特生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序鑒定。
1.2.4Flag-RhoB表達(dá)產(chǎn)物的Western Blotting鑒定 將重組質(zhì)粒用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染密度為70%的乳腺癌MCF7細(xì)胞、宮頸癌HeLa細(xì)胞或結(jié)直腸癌HCT116細(xì)胞,轉(zhuǎn)染6 h后換液,24 h后裂解細(xì)胞,提取總蛋白并測(cè)定濃度,取25 mg蛋白進(jìn)行Western Blotting分析。用12%的SDS-PAGE凝膠進(jìn)行電泳分離后轉(zhuǎn)膜(PVDF膜,400 mA,1.5 h)。5%的BSA室溫封閉30 min;5% BSA配制的Flag一抗室溫孵育1 h;TBST buffer洗3次,每次5 min;1% BSA配制的二抗室溫孵育1 h;TBST buffer洗3次,每次5 min;加入ECL顯色液,用化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)檢測(cè)。
1.2.5 Flag-RhoB表達(dá)產(chǎn)物的免疫熒光分析 6孔細(xì)胞培養(yǎng)板中放入潔凈蓋玻片,接種Mv.1.Lu細(xì)胞,接種密度為5×104/孔,培養(yǎng)12 h后轉(zhuǎn)染;轉(zhuǎn)染24h后PBS洗2遍,4%的多聚甲醛室溫固定15 min;PBS洗2遍,0.25% Triton X-100室溫通透5 min;PBS洗2遍,5%的BSA室溫封閉30 min;Flag抗體按1∶200稀釋,室溫孵育2 h;PBS洗4遍,避光條件下,Alexa Fluor 488標(biāo)記的驢抗兔二抗室溫孵育1 h;PBS洗4遍,5 μg/mL Phalloidin(使用前用PBS新鮮配置)室溫孵育30 min;PBS洗4遍,避光條件下,1 μg/mL DAPI(使用前用PBS新鮮配置)室溫孵育5 min;PBS洗兩遍,封片,鏡檢。RhoB蛋白的表達(dá)用Flag抗體檢測(cè),人IgG作陰性對(duì)照,Phalloidin染色顯示細(xì)胞骨架,DAPI染色顯示細(xì)胞核結(jié)構(gòu)。
提取HEK-293T細(xì)胞總RNA,電泳結(jié)果(圖1)顯示成功獲得高純度的總RNA。使用PrimeScripⅡ 1st Strand cDNA合成試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制備人HEK-293T細(xì)胞cDNA。
圖1 人HEK-293T細(xì)胞總RNA的提取
以制備好的cDNA為模板,以設(shè)計(jì)好的引物PCR擴(kuò)增RhoB基因,電泳結(jié)果顯示擴(kuò)增出的片段大小約為590 bp,大小符合預(yù)期(圖2)。
圖2 RhoB基因PCR產(chǎn)物電泳圖
用SalⅠ和XbaⅠ同時(shí)將擴(kuò)增獲得的目的片段和pCMV5空載體酶切處理,膠回收后連接并轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果(圖3)顯示,雙酶切后的載體和片段大小分別為4.8 kb(載體)和590 bp(目的片段),符合預(yù)期。測(cè)序結(jié)果顯示連入的RhoB基因與GenBank上的序列完全一致,表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖3 重組質(zhì)粒SalⅠ和XbaⅠ雙酶切鑒定圖
將空載體和重組質(zhì)粒Flag-RhoB分別轉(zhuǎn)染MCF7細(xì)胞、HeLa細(xì)胞或HCT116細(xì)胞進(jìn)行Western Blotting分析。結(jié)果(圖4)顯示,轉(zhuǎn)染了重組質(zhì)粒的樣品中檢測(cè)到大小約為25 kD的蛋白條帶,而轉(zhuǎn)染了空載體的對(duì)照組無(wú)任何信號(hào)。說(shuō)明插入載體的RhoB基因成功表達(dá),且表達(dá)良好。
圖4 重組質(zhì)粒在細(xì)胞中的表達(dá)檢測(cè)
將重組質(zhì)粒Flag-RhoB轉(zhuǎn)染Mv.1.Lu細(xì)胞,細(xì)胞免疫熒光實(shí)驗(yàn)初步分析RhoB蛋白在Mv.1.Lu細(xì)胞中的定位情況。免疫熒光結(jié)果(圖5)顯示,F(xiàn)lag抗體可以檢測(cè)到較強(qiáng)的熒光信號(hào),說(shuō)明重組質(zhì)粒表達(dá)良好。結(jié)果顯示RhoB在細(xì)胞中主要定位于細(xì)胞膜上,少量定位于細(xì)胞質(zhì)中。
圖5 免疫熒光檢測(cè)RhoB在細(xì)胞中的定位
盡管RhoB在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中表現(xiàn)出兩面性[4],但筆者認(rèn)為更多的數(shù)據(jù)支持RhoB抑癌基因的特性。例如,Calvayrac等[19]研究發(fā)現(xiàn)定位于細(xì)胞質(zhì)中的細(xì)胞周期蛋白激酶抑制因子p27Kip1通過(guò)結(jié)合并抑制RhoB蛋白的活性促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生。Zou等[20]報(bào)道過(guò)表達(dá)RhoB通過(guò)上調(diào)PP2A的表達(dá)水平導(dǎo)致AKT1的去磷酸化失活,進(jìn)而抑制骨肉瘤細(xì)胞的肺轉(zhuǎn)移。
另有文獻(xiàn)報(bào)道,敲低內(nèi)源的RhoB后,人胃癌細(xì)胞NUGC-3對(duì)抗癌藥物表現(xiàn)出明顯的藥物不敏感性[21],人咽喉癌細(xì)胞也表現(xiàn)出對(duì)順鉑的抗藥性[22]。這些研究表明某些癌癥在治療過(guò)程中出現(xiàn)的抗藥性很可能是由于RhoB表達(dá)量下調(diào)引起的,提示可以在癌癥治療過(guò)程中人為提高RhoB的表達(dá)量或者以RhoB為靶點(diǎn)篩選合適的抗癌藥物。因此,深入闡明RhoB活性調(diào)控方式或者鑒定新的RhoB特異性效應(yīng)因子有可能為癌癥提供有效的治療靶點(diǎn)。
本實(shí)驗(yàn)通過(guò)PCR技術(shù)構(gòu)建了上游帶有Flag標(biāo)簽的RhoB真核表達(dá)質(zhì)粒,可以方便開(kāi)展有關(guān)RhoB的功能研究。將該質(zhì)粒轉(zhuǎn)染MCF7細(xì)胞、HeLa細(xì)胞和HCT116細(xì)胞,Western blotting結(jié)果表明該質(zhì)粒在細(xì)胞中可以順利表達(dá)。免疫熒光實(shí)驗(yàn)可以幫助判斷過(guò)表達(dá)的RhoB在細(xì)胞中的亞定位,結(jié)果顯示其主要定位于細(xì)胞膜上,胞質(zhì)和胞核中也有少量分布。
在該質(zhì)粒構(gòu)建過(guò)程時(shí),RhoB基因的3'端選擇的是限制性內(nèi)切酶XbaI。該酶的識(shí)別序列為T(mén)CTAGA,與RhoB基因的終止密碼子TGA相連會(huì)產(chǎn)生一段TGATCTAGA序列。這段序列中含有GATC序列,所以需要考慮到原核生物Dam甲基化的問(wèn)題。所以在設(shè)計(jì)引物時(shí),將RhoB的終止密碼子替換成了TAA,以避免GATC序列的產(chǎn)生。
成功擴(kuò)增出長(zhǎng)度為590 bp的RhoB基因的ORF序列,并成功將其連入真核表達(dá)載體pCMV5。將重組真核表達(dá)質(zhì)粒Flag-RhoB轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,能夠表達(dá)出大小為25 kD的蛋白。通過(guò)激光共聚焦顯微鏡觀察到RhoB在細(xì)胞中主要定位于細(xì)胞膜上。